mirror of
https://github.com/QuantumPackage/qp2.git
synced 2025-04-25 17:54:44 +02:00
Merge branch 'dev-stable' of github.com:QuantumPackage/qp2 into dev-stable
This commit is contained in:
commit
f6661b64c3
@ -41,6 +41,7 @@
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programmers_guide/plugins
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programmers_guide/plugins_tuto_intro
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programmers_guide/plugins_tuto_I
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||||
programmers_guide/plugins_tuto_II
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programmers_guide/new_ks
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programmers_guide/index
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@ -27,7 +27,7 @@ The |AO| coefficients are normalized as:
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.. warning::
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`ao_coef` contains the |AO| coefficients given in input. These do not
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include the normalization constant of the |AO|. The `ao_coef_normalized`
|
||||
include the normalization constant of the |AO|. The `ao_coef_normalized_factor`
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provider includes this normalization factor.
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@ -36,6 +36,19 @@ the two electron integrals.
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||||
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||||
Complex Gaussian-Type Orbitals (cGTOs)
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=====================================
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Complex Gaussian-Type Orbitals (cGTOs) are also supported:
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.. math::
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\chi_i(\mathbf{r}) = x^a y^b z^c \sum_k c_{ki} \left( e^{-\alpha_{ki} \mathbf{r}^2 - \imath \mathbf{k}_{ki} \cdot \mathbf{r} - \imath \phi_{ki}} + \text{C.C.} \right)
|
||||
|
||||
where:
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||||
- :math:`\alpha \in \mathbb{C}` and :math:`\Re(\alpha) > 0` (specified by ``ao_expo`` and ``ao_expo_im``),
|
||||
- :math:`\mathbf{k} = (k_x, k_y, k_z) \in \mathbb{R}^3` (specified by ``ao_expo_pw``),
|
||||
- :math:`\phi = \phi_x + \phi_y + \phi_z \in \mathbb{R}` (specified by ``ao_expo_phase``).
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@ -94,6 +107,39 @@ EZFIO parameters
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Default: false
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.. option:: ao_normalized
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Use normalized basis functions
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Default: true
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.. option:: primitives_normalized
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||||
Use normalized primitive functions
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||||
Default: true
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.. option:: use_cgtos
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If true, use cgtos for AO integrals
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Default: False
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.. option:: ao_expo_im
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imag part for Exponents for each primitive of each cGTOs |AO|
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.. option:: ao_expo_pw
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||||
plane wave part for each primitive GTOs |AO|
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||||
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.. option:: ao_expo_phase
|
||||
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||||
phase shift for each primitive GTOs |AO|
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||||
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||||
Providers
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||||
---------
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||||
@ -130,35 +176,9 @@ Providers
|
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.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalization_libint_factor`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered`
|
||||
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||||
.. c:var:: ao_coef_normalization_libint_factor
|
||||
|
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||||
File : :file:`ao_basis/aos.irp.f`
|
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||||
.. code:: fortran
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||||
double precision, allocatable :: ao_coef_normalization_libint_factor (ao_num)
|
||||
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||||
|AO| normalization for interfacing with libint
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|
||||
Needs:
|
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|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_l`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_coef_normalized
|
||||
|
||||
|
||||
@ -191,7 +211,6 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalization_libint_factor`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -260,13 +279,18 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`ao_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_pt_chrg`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`ao_spread_x`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_coef_normalized_ordered_transp_per_nucl
|
||||
@ -359,13 +383,18 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_pt_chrg`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`ao_spread_x`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_expo_ordered_transp_per_nucl
|
||||
@ -393,6 +422,28 @@ Providers
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_first_of_shell
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_basis/aos.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer, allocatable :: ao_first_of_shell (shell_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Index of the shell to which the AO corresponds
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||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`shell_ang_mom`
|
||||
* :c:data:`shell_num`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_l
|
||||
|
||||
|
||||
@ -422,7 +473,6 @@ Providers
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_cart_to_sphe_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalization_libint_factor`
|
||||
* :c:data:`ao_l_char_space`
|
||||
* :c:data:`nucl_list_shell_aos`
|
||||
|
||||
@ -456,7 +506,6 @@ Providers
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_cart_to_sphe_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalization_libint_factor`
|
||||
* :c:data:`ao_l_char_space`
|
||||
* :c:data:`nucl_list_shell_aos`
|
||||
|
||||
@ -513,7 +562,6 @@ Providers
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_cart_to_sphe_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalization_libint_factor`
|
||||
* :c:data:`ao_l_char_space`
|
||||
* :c:data:`nucl_list_shell_aos`
|
||||
|
||||
@ -566,13 +614,43 @@ Providers
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_cgtos_norm_ord_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_norm_cgtos`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_norm_cgtos_ord`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_cgtos_ord_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_im`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_phase`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_pw`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_shell
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_basis/aos.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer, allocatable :: ao_shell (ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Index of the shell to which the AO corresponds
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`shell_ang_mom`
|
||||
* :c:data:`shell_num`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: cart_to_sphe_0
|
||||
@ -849,10 +927,17 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_2e_cgtos_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_cgtos`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_pt_chrg`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
* :c:data:`gauleg_t2`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -881,10 +966,17 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_2e_cgtos_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_cgtos`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_pt_chrg`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
* :c:data:`gauleg_t2`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -915,7 +1007,6 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`nucl_aos_transposed`
|
||||
* :c:data:`nucl_list_shell_aos`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -938,7 +1029,6 @@ Providers
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`nucl_aos`
|
||||
* :c:data:`nucl_n_aos`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
|
||||
@ -1043,6 +1133,74 @@ Providers
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: use_cgtos
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_basis/cgtos.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: use_cgtos
|
||||
|
||||
|
||||
If true, use cgtos for AO integrals
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_deriv2_x`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: use_cosgtos
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_basis/cosgtos.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: use_cosgtos
|
||||
|
||||
|
||||
If true, use cosgtos for AO integrals
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_deriv2_x`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
@ -1069,7 +1227,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision function ao_value(i,r)
|
||||
double precision function ao_value(i, r)
|
||||
|
||||
|
||||
Returns the value of the i-th ao at point $\textbf{r}$
|
||||
@ -1094,15 +1252,17 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine give_all_aos_and_grad_and_lapl_at_r(r,aos_array,aos_grad_array,aos_lapl_array)
|
||||
subroutine give_all_aos_and_grad_and_lapl_at_r(r, aos_array, aos_grad_array, aos_lapl_array)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
input : r(1) ==> r(1) = x, r(2) = y, r(3) = z
|
||||
|
||||
output :
|
||||
|
||||
* aos_array(i) = ao(i) evaluated at $\textbf{r}$
|
||||
* aos_grad_array(1,i) = $\nabla_x$ of the ao(i) evaluated at $\textbf{r}$
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
@ -1134,9 +1294,10 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine give_all_aos_and_grad_at_r(r,aos_array,aos_grad_array)
|
||||
subroutine give_all_aos_and_grad_at_r(r, aos_array, aos_grad_array)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
input : r(1) ==> r(1) = x, r(2) = y, r(3) = z
|
||||
|
||||
output :
|
||||
@ -1175,12 +1336,14 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine give_all_aos_at_r(r,aos_array)
|
||||
subroutine give_all_aos_at_r(r, tmp_array)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
input : r == r(1) = x and so on
|
||||
|
||||
output : aos_array(i) = aos(i) evaluated in $\textbf{r}$
|
||||
output : tmp_array(i) = aos(i) evaluated in $\textbf{r}$
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
@ -1212,7 +1375,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision function primitive_value(i,j,r)
|
||||
double precision function primitive_value(i, j, r)
|
||||
|
||||
|
||||
Returns the value of the j-th primitive of the i-th |AO| at point $\textbf{r}
|
||||
|
||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -366,6 +366,7 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`average_on_top`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num_grid_becke`
|
||||
* :c:data:`energy_c_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_c_sr_lda`
|
||||
@ -424,6 +425,7 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_extra`
|
||||
* :c:data:`aos_in_r_array_extra`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -607,6 +609,7 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`average_on_top`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num_grid_becke`
|
||||
* :c:data:`energy_c_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_c_sr_lda`
|
||||
@ -665,6 +668,7 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_extra`
|
||||
* :c:data:`aos_in_r_array_extra`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -914,6 +918,7 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`average_on_top`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num_grid_becke`
|
||||
* :c:data:`energy_c_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_c_sr_lda`
|
||||
@ -972,6 +977,7 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_extra`
|
||||
* :c:data:`aos_in_r_array_extra`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -1013,6 +1019,7 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_extra`
|
||||
* :c:data:`aos_in_r_array_extra`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -1126,6 +1133,7 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`average_on_top`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num_grid_becke`
|
||||
* :c:data:`energy_c_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_c_sr_lda`
|
||||
@ -1196,6 +1204,7 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_extra`
|
||||
* :c:data:`aos_in_r_array_extra`
|
||||
* :c:data:`aos_in_r_array_extra_transp`
|
||||
* :c:data:`final_grid_points_extra`
|
||||
@ -1356,6 +1365,7 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`average_on_top`
|
||||
* :c:data:`basis_mos_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`core_density`
|
||||
* :c:data:`core_inact_act_mos_grad_in_r_array`
|
||||
@ -1371,6 +1381,9 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`energy_x_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_pbe`
|
||||
* :c:data:`f_hf_cholesky`
|
||||
* :c:data:`f_hf_cholesky_sparse`
|
||||
* :c:data:`f_hf_cholesky_sparse_bis`
|
||||
* :c:data:`f_psi_cas_ab`
|
||||
* :c:data:`f_psi_cas_ab_old`
|
||||
* :c:data:`f_psi_hf_ab`
|
||||
@ -1393,14 +1406,19 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mos_in_r_array_transp`
|
||||
* :c:data:`mos_lapl_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`mos_lapl_in_r_array_tranp`
|
||||
* :c:data:`mos_times_cholesky_r1`
|
||||
* :c:data:`mos_times_cholesky_r2`
|
||||
* :c:data:`mu_average_prov`
|
||||
* :c:data:`mu_grad_rho`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_dft`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_dft_average`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_hf`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_hf_old`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_hf_sparse`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_prov`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_psi_cas`
|
||||
* :c:data:`mu_rsc_of_r`
|
||||
* :c:data:`on_top_hf_grid`
|
||||
* :c:data:`one_e_act_density_alpha`
|
||||
* :c:data:`one_e_act_density_beta`
|
||||
* :c:data:`one_e_cas_total_density`
|
||||
|
||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -119,15 +119,15 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
* :c:data:`c0_weight`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: h_apply_cis_diexc:
|
||||
@ -328,15 +328,15 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
* :c:data:`c0_weight`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: h_apply_cis_sym_diexc:
|
||||
|
||||
@ -53,15 +53,145 @@ EZFIO parameters
|
||||
Variational |CISD| energy
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: lcc_energy
|
||||
|
||||
lccsd energy
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Programs
|
||||
--------
|
||||
|
||||
* :ref:`cisd`
|
||||
* :ref:`lccsd`
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: lccsd_coef
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`lccsd_prov.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: lccsd_coef (N_det,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: lccsd_energies (N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`davidson_sze_max`
|
||||
* :c:data:`disk_based_davidson`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`nproc`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`state_following`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: lccsd_energies
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`lccsd_prov.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: lccsd_coef (N_det,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: lccsd_energies (N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`davidson_sze_max`
|
||||
* :c:data:`disk_based_davidson`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`nproc`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`state_following`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_lccsd_2:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`lccsd.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine get_lccsd_2
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ha_to_ev`
|
||||
* :c:data:`lccsd_coef`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`save_threshold`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_cisd_lcc_energy`
|
||||
* :c:func:`save_wavefunction_truncated`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: h_apply_cisd:
|
||||
|
||||
|
||||
@ -99,6 +229,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
* :c:func:`run_cisd`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
@ -119,15 +250,15 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
* :c:data:`c0_weight`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: h_apply_cisd_diexc:
|
||||
@ -315,6 +446,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
* :c:func:`run_cisd`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
@ -335,15 +467,15 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
* :c:data:`c0_weight`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: h_apply_cisd_sym_diexc:
|
||||
@ -534,13 +666,13 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
* :c:data:`c0_weight`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
|
||||
|
||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -25,6 +25,7 @@ Providers
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_column_h (N_det,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_column_s (N_det,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_delta (N_det,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
Null dressing vectors
|
||||
@ -54,6 +55,37 @@ Providers
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_column_h (N_det,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_column_s (N_det,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_delta (N_det,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
Null dressing vectors
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ci_electronic_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: dressing_delta
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`davidson_undressed/null_dressing_vector.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_column_h (N_det,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_column_s (N_det,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: dressing_delta (N_det,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
Null dressing vectors
|
||||
|
||||
@ -40,13 +40,13 @@ EZFIO parameters
|
||||
|
||||
.. option:: no_core_density
|
||||
|
||||
if [no_core_dm] then all elements of the density matrix involving at least one orbital set as core are set to zero
|
||||
If [no_core_density] then all elements of the density matrix involving at least one orbital set as core are set to zero. The default is False in order to take all the density.
|
||||
|
||||
Default: full_density
|
||||
Default: False
|
||||
|
||||
.. option:: normalize_dm
|
||||
|
||||
if .True., then you normalize the no_core_dm to elec_alpha_num - n_core_orb and elec_beta_num - n_core_orb
|
||||
Type of density. If .True., then you normalize the no_core_dm to elec_alpha_num - n_core_orb and elec_beta_num - n_core_orb
|
||||
|
||||
Default: True
|
||||
|
||||
|
||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -47,13 +47,13 @@ EZFIO parameters
|
||||
|
||||
name of the exchange functional
|
||||
|
||||
Default: short_range_LDA
|
||||
Default: sr_pbe
|
||||
|
||||
.. option:: correlation_functional
|
||||
|
||||
name of the correlation functional
|
||||
|
||||
Default: short_range_LDA
|
||||
Default: sr_pbe
|
||||
|
||||
.. option:: HF_exchange
|
||||
|
||||
@ -61,6 +61,12 @@ EZFIO parameters
|
||||
|
||||
Default: 0.
|
||||
|
||||
.. option:: mu_dft_type
|
||||
|
||||
type of mu(r) for rsdft [ cst ]
|
||||
|
||||
Default: cst
|
||||
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
@ -39,6 +39,272 @@ In the core modules of the |QP|, two functionals are implemented:
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_effective_one_e_potential
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/effective_pot.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_effective_one_e_potential (ao_num,ao_num,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_effective_one_e_potential_without_kin (ao_num,ao_num,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
Effective_one_e_potential(i,j) = :math:`\rangle i_{AO}| v_{H}^{sr} |j_{AO}\rangle + \rangle i_{AO}| h_{core} |j_{AO}\rangle + \rangle i_{AO}|v_{xc} |j_{AO}\rangle`
|
||||
|
||||
on the |MO| basis
|
||||
|
||||
Taking the expectation value does not provide any energy, but
|
||||
|
||||
ao_effective_one_e_potential(i,j) is the potential coupling DFT and WFT parts
|
||||
|
||||
and it is used in any RS-DFT based calculations
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`effective_one_e_potential`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_effective_one_e_potential_sa`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_effective_one_e_potential_sa
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/effective_pot.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_effective_one_e_potential_sa (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_effective_one_e_potential_without_kin_sa (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
State-averaged potential in AO basis
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_effective_one_e_potential`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_effective_one_e_potential_without_kin
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/effective_pot.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_effective_one_e_potential (ao_num,ao_num,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_effective_one_e_potential_without_kin (ao_num,ao_num,N_states)
|
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|
||||
|
||||
Effective_one_e_potential(i,j) = :math:`\rangle i_{AO}| v_{H}^{sr} |j_{AO}\rangle + \rangle i_{AO}| h_{core} |j_{AO}\rangle + \rangle i_{AO}|v_{xc} |j_{AO}\rangle`
|
||||
|
||||
on the |MO| basis
|
||||
|
||||
Taking the expectation value does not provide any energy, but
|
||||
|
||||
ao_effective_one_e_potential(i,j) is the potential coupling DFT and WFT parts
|
||||
|
||||
and it is used in any RS-DFT based calculations
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Needs:
|
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.. hlist::
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:columns: 3
|
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* :c:data:`ao_num`
|
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* :c:data:`effective_one_e_potential`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
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|
||||
Needed by:
|
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|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_effective_one_e_potential_sa`
|
||||
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|
||||
.. c:var:: ao_effective_one_e_potential_without_kin_sa
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||||
|
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File : :file:`dft_one_e/effective_pot.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
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||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_effective_one_e_potential_sa (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_effective_one_e_potential_without_kin_sa (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
State-averaged potential in AO basis
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_effective_one_e_potential`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: effective_one_e_potential
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||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/effective_pot.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
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||||
|
||||
double precision, allocatable :: effective_one_e_potential (mo_num,mo_num,N_states)
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||||
double precision, allocatable :: effective_one_e_potential_without_kin (mo_num,mo_num,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
Effective_one_e_potential(i,j) = :math:`\rangle i_{MO}| v_{H}^{sr} |j_{MO}\rangle + \rangle i_{MO}| h_{core} |j_{MO}\rangle + \rangle i_{MO}|v_{xc} |j_{MO}\rangle`
|
||||
|
||||
on the |MO| basis
|
||||
|
||||
Taking the expectation value does not provide any energy, but
|
||||
|
||||
effective_one_e_potential(i,j) is the potential coupling DFT and WFT parts
|
||||
|
||||
and it is used in any RS-DFT based calculations
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`potential_c_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`short_range_hartree_operator`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_effective_one_e_potential`
|
||||
* :c:data:`effective_one_e_potential_sa`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: effective_one_e_potential_sa
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/effective_pot.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: effective_one_e_potential_sa (mo_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: effective_one_e_potential_without_kin_sa (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
State-averaged potential in MO basis
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`effective_one_e_potential`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: effective_one_e_potential_without_kin
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/effective_pot.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: effective_one_e_potential (mo_num,mo_num,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: effective_one_e_potential_without_kin (mo_num,mo_num,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
Effective_one_e_potential(i,j) = :math:`\rangle i_{MO}| v_{H}^{sr} |j_{MO}\rangle + \rangle i_{MO}| h_{core} |j_{MO}\rangle + \rangle i_{MO}|v_{xc} |j_{MO}\rangle`
|
||||
|
||||
on the |MO| basis
|
||||
|
||||
Taking the expectation value does not provide any energy, but
|
||||
|
||||
effective_one_e_potential(i,j) is the potential coupling DFT and WFT parts
|
||||
|
||||
and it is used in any RS-DFT based calculations
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`potential_c_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`short_range_hartree_operator`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_effective_one_e_potential`
|
||||
* :c:data:`effective_one_e_potential_sa`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: effective_one_e_potential_without_kin_sa
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/effective_pot.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: effective_one_e_potential_sa (mo_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: effective_one_e_potential_without_kin_sa (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
State-averaged potential in MO basis
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`effective_one_e_potential`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: energy_c
|
||||
|
||||
|
||||
@ -59,8 +325,8 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`correlation_functional`
|
||||
* :c:data:`energy_c_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_c_none`
|
||||
* :c:data:`energy_c_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_c_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_pbe`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
||||
@ -95,6 +361,7 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_pbe`
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
* :c:data:`hf_exchange`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
@ -105,6 +372,158 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mu_erf_dft
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/mu_erf_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: mu_erf_dft
|
||||
|
||||
|
||||
range separation parameter used in RS-DFT.
|
||||
|
||||
It is set to mu_erf in order to be consistent with the module "hamiltonian"
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||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mu_erf`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mu_grad_rho
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/mu_erf_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mu_grad_rho (n_points_final_grid)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`final_grid_points`
|
||||
* :c:data:`mu_erf`
|
||||
* :c:data:`n_points_final_grid`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mu_of_r_dft
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/mu_erf_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mu_of_r_dft (n_points_final_grid)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mu_dft_type`
|
||||
* :c:data:`mu_erf_dft`
|
||||
* :c:data:`mu_grad_rho`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_hf`
|
||||
* :c:data:`mu_rsc_of_r`
|
||||
* :c:data:`n_points_final_grid`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`energy_c_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_pbe`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_dft_average`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mu_of_r_dft_average
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/mu_erf_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: mu_of_r_dft_average
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`final_grid_points`
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_dft`
|
||||
* :c:data:`n_points_final_grid`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mu_rsc_of_r
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/mu_erf_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mu_rsc_of_r (n_points_final_grid)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`final_grid_points`
|
||||
* :c:data:`n_points_final_grid`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mu_of_r_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: potential_c_alpha_ao
|
||||
|
||||
|
||||
@ -265,6 +684,7 @@ Providers
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
* :c:data:`hf_exchange`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_ao_lda`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_ao_none`
|
||||
@ -335,6 +755,7 @@ Providers
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
* :c:data:`hf_exchange`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_ao_lda`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_ao_none`
|
||||
@ -521,6 +942,254 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`trace_v_xc_new`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_dft_energy_h_core
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/one_e_energy_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_kinetic (N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_nuclear_elec (N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_h_core (N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
kinetic, electron-nuclear and total h_core energy computed with the density matrix one_e_dm_mo_beta_for_dft+one_e_dm_mo_alpha_for_dft
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_dft_energy_kinetic
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/one_e_energy_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_kinetic (N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_nuclear_elec (N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_h_core (N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
kinetic, electron-nuclear and total h_core energy computed with the density matrix one_e_dm_mo_beta_for_dft+one_e_dm_mo_alpha_for_dft
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_dft_energy_nuclear_elec
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/one_e_energy_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_kinetic (N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_nuclear_elec (N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_dft_energy_h_core (N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
kinetic, electron-nuclear and total h_core energy computed with the density matrix one_e_dm_mo_beta_for_dft+one_e_dm_mo_alpha_for_dft
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: regular_range_hartree
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`dft_one_e/sr_coulomb.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: regular_range_hartree_operator (mo_num,mo_num,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: regular_range_hartree (N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
regular_range_Hartree_operator(i,j) = :math:`\int dr i(r)j(r) \int r' \rho(r') W_{ee}^{sr}`
|
||||
|
||||
regular_range_Hartree = :math:`1/2 \sum_{i,j} \rho_{ij} \mathtt{regular_range_Hartree_operator}(i,j)`
|
||||
|
||||
= :math:`1/2 \int dr \int r' \rho(r) \rho(r') W_{ee}^{sr}`
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`cholesky_mo_num`
|
||||
* :c:data:`cholesky_mo_transp`
|
||||
* :c:data:`do_mo_cholesky`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_for_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: regular_range_hartree_operator
|
||||
|
||||
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File : :file:`dft_one_e/sr_coulomb.irp.f`
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.. code:: fortran
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double precision, allocatable :: regular_range_hartree_operator (mo_num,mo_num,N_states)
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double precision, allocatable :: regular_range_hartree (N_states)
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regular_range_Hartree_operator(i,j) = :math:`\int dr i(r)j(r) \int r' \rho(r') W_{ee}^{sr}`
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regular_range_Hartree = :math:`1/2 \sum_{i,j} \rho_{ij} \mathtt{regular_range_Hartree_operator}(i,j)`
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= :math:`1/2 \int dr \int r' \rho(r) \rho(r') W_{ee}^{sr}`
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Needs:
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`cholesky_mo_num`
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* :c:data:`cholesky_mo_transp`
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* :c:data:`do_mo_cholesky`
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* :c:data:`mo_integrals_map`
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* :c:data:`mo_num`
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* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
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* :c:data:`n_states`
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* :c:data:`one_e_dm_average_mo_for_dft`
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* :c:data:`one_e_dm_mo_for_dft`
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.. c:var:: short_range_hartree
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File : :file:`dft_one_e/sr_coulomb.irp.f`
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.. code:: fortran
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double precision, allocatable :: short_range_hartree_operator (mo_num,mo_num,N_states)
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double precision, allocatable :: short_range_hartree (N_states)
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short_range_Hartree_operator(i,j) = :math:`\int dr i(r)j(r) \int r' \rho(r') W_{ee}^{sr}`
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short_range_Hartree = :math:`1/2 \sum_{i,j} \rho_{ij} \mathtt{short_range_Hartree_operator}(i,j)`
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= :math:`1/2 \int dr \int r' \rho(r) \rho(r') W_{ee}^{sr}`
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Needs:
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`cholesky_mo_num`
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* :c:data:`cholesky_mo_transp`
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* :c:data:`n_states`
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* :c:data:`one_e_dm_average_mo_for_dft`
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* :c:data:`one_e_dm_mo_for_dft`
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Needed by:
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`effective_one_e_potential`
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* :c:data:`trace_v_xc`
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.. c:var:: short_range_hartree_operator
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File : :file:`dft_one_e/sr_coulomb.irp.f`
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.. code:: fortran
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double precision, allocatable :: short_range_hartree_operator (mo_num,mo_num,N_states)
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||||
double precision, allocatable :: short_range_hartree (N_states)
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||||
short_range_Hartree_operator(i,j) = :math:`\int dr i(r)j(r) \int r' \rho(r') W_{ee}^{sr}`
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short_range_Hartree = :math:`1/2 \sum_{i,j} \rho_{ij} \mathtt{short_range_Hartree_operator}(i,j)`
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= :math:`1/2 \int dr \int r' \rho(r) \rho(r') W_{ee}^{sr}`
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Needs:
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`cholesky_mo_num`
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* :c:data:`cholesky_mo_transp`
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* :c:data:`one_e_dm_mo_for_dft`
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Needed by:
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`effective_one_e_potential`
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.. c:var:: trace_v_h
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File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -74,8 +74,13 @@ Providers
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`nsomomax`
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* :c:data:`ormas_max_e`
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* :c:data:`psi_det_hii`
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* :c:data:`psi_selectors_diag_h_mat`
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.. c:var:: elec_num_tab
|
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@ -105,6 +110,11 @@ Providers
|
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.. hlist::
|
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:columns: 3
|
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* :c:data:`cfg_seniority_index`
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* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
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* :c:data:`diagonal_h_matrix_on_psi_det`
|
||||
* :c:data:`nsomomax`
|
||||
* :c:data:`ormas_max_e`
|
||||
* :c:data:`psi_det_hii`
|
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* :c:data:`psi_selectors_diag_h_mat`
|
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@ -25,7 +25,7 @@ Providers
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.. code:: fortran
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character*(128) :: ezfio_filename
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character*(1024) :: ezfio_filename
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Name of EZFIO file. It is obtained from the QPACKAGE_INPUT environment
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@ -36,26 +36,51 @@ Providers
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.. hlist::
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:columns: 3
|
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* :c:data:`output_wall_time_0`
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Needed by:
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.. hlist::
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:columns: 3
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|
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|
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* :c:data:`ao_one_e_integrals_threshold`
|
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|
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|
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* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
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* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
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* :c:data:`cas_bitmask`
|
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* :c:data:`avoid_saddle`
|
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* :c:data:`basis`
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`criterion_casscf`
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* :c:data:`data_energy_proj`
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* :c:data:`data_energy_var`
|
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* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_ao`
|
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@ -63,67 +88,106 @@ Providers
|
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|
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* :c:data:`data_one_e_dm_beta_mo`
|
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* :c:data:`davidson_sze_max`
|
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* :c:data:`disk_access_nuclear_repulsion`
|
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* :c:data:`density_for_dft`
|
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* :c:data:`diag_hess_cas`
|
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* :c:data:`disk_based_davidson`
|
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* :c:data:`distributed_davidson`
|
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* :c:data:`do_direct_integrals`
|
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* :c:data:`do_ao_cholesky`
|
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* :c:data:`do_mom`
|
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* :c:data:`do_ormas`
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* :c:data:`do_pseudo`
|
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* :c:data:`do_pt2`
|
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* :c:data:`elec_alpha_num`
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* :c:data:`exchange_functional`
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|
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|
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* :c:data:`excitation_max`
|
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* :c:data:`excitation_ref`
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* :c:data:`ezfio_work_dir`
|
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* :c:data:`fast_2rdm`
|
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* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
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* :c:data:`generators_bitmask`
|
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* :c:data:`generators_bitmask_restart`
|
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* :c:data:`h0_type`
|
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* :c:data:`io_ao_integrals_e_n`
|
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* :c:data:`hess_cv_cv`
|
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* :c:data:`hf_exchange`
|
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* :c:data:`io_ao_cholesky`
|
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* :c:data:`io_ao_integrals_kinetic`
|
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* :c:data:`io_ao_integrals_n_e`
|
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* :c:data:`io_ao_integrals_overlap`
|
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* :c:data:`io_ao_integrals_pseudo`
|
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* :c:data:`io_ao_one_e_integrals`
|
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* :c:data:`io_ao_two_e_integrals`
|
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* :c:data:`io_ao_two_e_integrals_erf`
|
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* :c:data:`io_mo_integrals_e_n`
|
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* :c:data:`io_mo_cholesky`
|
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* :c:data:`io_mo_integrals_kinetic`
|
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* :c:data:`io_mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_pseudo`
|
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* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
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* :c:data:`io_mo_two_e_integrals`
|
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* :c:data:`io_mo_two_e_integrals_erf`
|
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* :c:data:`io_nuclear_repulsion`
|
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* :c:data:`io_two_body_rdm_ab`
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|
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* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
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* :c:data:`mu_dft_type`
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* :c:data:`no_vvvv_integrals`
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* :c:data:`pseudo_dz_kl`
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@ -139,24 +203,58 @@ Providers
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* :c:data:`psi_coef`
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* :c:data:`state_following`
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* :c:data:`target_energy`
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|
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* :c:data:`threshold_davidson`
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* :c:data:`version_avoid_saddle`
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* :c:data:`without_diagonal`
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||||
|
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|
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.. c:var:: ezfio_work_dir
|
||||
@ -166,7 +264,7 @@ Providers
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
character*(128) :: ezfio_work_dir
|
||||
character*(1024) :: ezfio_work_dir
|
||||
|
||||
|
||||
EZFIO/work/
|
||||
@ -178,6 +276,36 @@ Providers
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
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* :c:data:`cholesky_mo_num`
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* :c:data:`cholesky_mo_transp`
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* :c:data:`ezfio_work_dir_pid`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ezfio_work_dir_pid
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ezfio_files/ezfio.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
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||||
character*(1024) :: ezfio_work_dir_pid
|
||||
|
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|
||||
EZFIO/work/pid_
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_work_dir`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: file_lock
|
||||
@ -192,6 +320,40 @@ Providers
|
||||
|
||||
OpenMP Lock for I/O
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`json_filename`
|
||||
* :c:data:`json_unit`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`nthreads_pt2`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: nthreads_pt2
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ezfio_files/environment.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: nthreads_pt2
|
||||
|
||||
|
||||
Number of threads for Davidson
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`file_lock`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`nproc`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: output_cpu_time_0
|
||||
@ -212,103 +374,15 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_cartesian`
|
||||
* :c:data:`ao_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`correlation_energy_ratio_max`
|
||||
* :c:data:`data_energy_proj`
|
||||
* :c:data:`data_energy_var`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_ao`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
* :c:data:`davidson_sze_max`
|
||||
* :c:data:`disk_access_nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`disk_based_davidson`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`do_pt2`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`h0_type`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_overlap`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:data:`io_ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_guess_type`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mu_erf`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det_max`
|
||||
* :c:data:`n_det_max_full`
|
||||
* :c:data:`n_det_print_wf`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_it_scf_max`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`no_ivvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge_remove`
|
||||
* :c:data:`n_pts_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_label`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`only_expected_s2`
|
||||
* :c:data:`pseudo_dz_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_dz_kl`
|
||||
* :c:data:`pseudo_grid_rmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_grid_size`
|
||||
* :c:data:`pseudo_klocmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_kmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_lmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_n_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_n_kl`
|
||||
* :c:data:`pseudo_sym`
|
||||
* :c:data:`pseudo_v_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_v_kl`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
* :c:data:`pt2_max`
|
||||
* :c:data:`pt2_relative_error`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`scf_algorithm`
|
||||
* :c:data:`selection_factor`
|
||||
* :c:data:`state_following`
|
||||
* :c:data:`target_energy`
|
||||
* :c:data:`thresh_scf`
|
||||
* :c:data:`thresh_sym`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
* :c:data:`threshold_diis`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
* :c:data:`variance_max`
|
||||
* :c:data:`weight_one_e_dm`
|
||||
* :c:data:`weight_selection`
|
||||
* :c:data:`prim_normalization_factor`
|
||||
* :c:data:`shell_normalization_factor`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: output_wall_time_0
|
||||
@ -329,103 +403,15 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_cartesian`
|
||||
* :c:data:`ao_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`correlation_energy_ratio_max`
|
||||
* :c:data:`data_energy_proj`
|
||||
* :c:data:`data_energy_var`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_ao`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
* :c:data:`davidson_sze_max`
|
||||
* :c:data:`disk_access_nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`disk_based_davidson`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`do_pt2`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`h0_type`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_overlap`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:data:`io_ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_guess_type`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mu_erf`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det_max`
|
||||
* :c:data:`n_det_max_full`
|
||||
* :c:data:`n_det_print_wf`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_it_scf_max`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`no_ivvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge_remove`
|
||||
* :c:data:`n_pts_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_label`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`only_expected_s2`
|
||||
* :c:data:`pseudo_dz_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_dz_kl`
|
||||
* :c:data:`pseudo_grid_rmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_grid_size`
|
||||
* :c:data:`pseudo_klocmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_kmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_lmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_n_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_n_kl`
|
||||
* :c:data:`pseudo_sym`
|
||||
* :c:data:`pseudo_v_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_v_kl`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
* :c:data:`pt2_max`
|
||||
* :c:data:`pt2_relative_error`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`scf_algorithm`
|
||||
* :c:data:`selection_factor`
|
||||
* :c:data:`state_following`
|
||||
* :c:data:`target_energy`
|
||||
* :c:data:`thresh_scf`
|
||||
* :c:data:`thresh_sym`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
* :c:data:`threshold_diis`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
* :c:data:`variance_max`
|
||||
* :c:data:`weight_one_e_dm`
|
||||
* :c:data:`weight_selection`
|
||||
* :c:data:`prim_normalization_factor`
|
||||
* :c:data:`shell_normalization_factor`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: qp_kill_filename
|
||||
@ -435,8 +421,8 @@ Providers
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
character*(128) :: qp_stop_filename
|
||||
character*(128) :: qp_kill_filename
|
||||
character*(256) :: qp_stop_filename
|
||||
character*(256) :: qp_kill_filename
|
||||
integer :: qp_stop_variable
|
||||
|
||||
|
||||
@ -458,8 +444,8 @@ Providers
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
character*(128) :: qp_stop_filename
|
||||
character*(128) :: qp_kill_filename
|
||||
character*(256) :: qp_stop_filename
|
||||
character*(256) :: qp_kill_filename
|
||||
integer :: qp_stop_variable
|
||||
|
||||
|
||||
@ -481,8 +467,8 @@ Providers
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
character*(128) :: qp_stop_filename
|
||||
character*(128) :: qp_kill_filename
|
||||
character*(256) :: qp_stop_filename
|
||||
character*(256) :: qp_kill_filename
|
||||
integer :: qp_stop_variable
|
||||
|
||||
|
||||
@ -524,6 +510,57 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: lock_io:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ezfio_files/lock.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine lock_io()
|
||||
|
||||
|
||||
Needs to be called because before doing I/O because internal read and write
|
||||
are not thread safe.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`file_lock`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`davidson_slave_work`
|
||||
* :c:func:`format_w_error`
|
||||
* :c:func:`json_close`
|
||||
* :c:data:`json_filename`
|
||||
* :c:data:`json_unit`
|
||||
* :c:func:`load_mo_integrals`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`nthreads_pt2`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:func:`read_array_two_rdm`
|
||||
* :c:func:`read_array_two_trans_rdm`
|
||||
* :c:func:`resident_memory`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
* :c:func:`total_memory`
|
||||
* :c:func:`write_array_two_rdm`
|
||||
* :c:func:`write_array_two_trans_rdm`
|
||||
* :c:func:`write_cipsi_json`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`omp_set_lock`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: qp_stop:
|
||||
|
||||
|
||||
@ -544,6 +581,57 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`qp_stop_filename`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: unlock_io:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ezfio_files/lock.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine unlock_io()
|
||||
|
||||
|
||||
Needs to be called because afterdoing I/O because internal read and write
|
||||
are not thread safe.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`file_lock`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`davidson_slave_work`
|
||||
* :c:func:`format_w_error`
|
||||
* :c:func:`json_close`
|
||||
* :c:data:`json_filename`
|
||||
* :c:data:`json_unit`
|
||||
* :c:func:`load_mo_integrals`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`nthreads_pt2`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:func:`read_array_two_rdm`
|
||||
* :c:func:`read_array_two_trans_rdm`
|
||||
* :c:func:`resident_memory`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
* :c:func:`total_memory`
|
||||
* :c:func:`write_array_two_rdm`
|
||||
* :c:func:`write_array_two_trans_rdm`
|
||||
* :c:func:`write_cipsi_json`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`omp_unset_lock`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: write_bool:
|
||||
|
||||
|
||||
@ -588,9 +676,20 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef`
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:func:`damping_scf`
|
||||
* :c:func:`dav_double_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_csf_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_hjj_sjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_nonsym_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_general`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_diag_dressed_ext_rout_nonsym_b1space`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_diag_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_nonsym_b1space`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`psi_coef_max`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
@ -626,17 +725,28 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`dav_double_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_csf_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_hjj_sjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_nonsym_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_general`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_diag_dressed_ext_rout_nonsym_b1space`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_diag_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_nonsym_b1space`
|
||||
* :c:func:`make_s2_eigenfunction`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_cas_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_del_orb`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_generators_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_generators_bitmask_restart`
|
||||
* :c:data:`n_inact_orb`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`nthreads_pt2`
|
||||
* :c:data:`psi_cas`
|
||||
@ -648,6 +758,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:func:`remove_small_contributions`
|
||||
* :c:func:`save_wavefunction_general`
|
||||
* :c:func:`save_wavefunction_general_unormalized`
|
||||
* :c:func:`save_wavefunction_specified`
|
||||
* :c:func:`zmq_pt2`
|
||||
|
||||
@ -669,118 +780,40 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_cartesian`
|
||||
* :c:data:`ao_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`correlation_energy_ratio_max`
|
||||
* :c:func:`damping_scf`
|
||||
* :c:data:`data_energy_proj`
|
||||
* :c:data:`data_energy_var`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_ao`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
* :c:func:`dav_double_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_csf_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_hjj_sjj`
|
||||
* :c:data:`davidson_sze_max`
|
||||
* :c:data:`disk_access_nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`disk_based_davidson`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`do_pt2`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`h0_type`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_overlap`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:data:`io_ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_nonsym_hjj`
|
||||
* :c:func:`davidson_general`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_diag_dressed_ext_rout_nonsym_b1space`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_diag_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_dressed`
|
||||
* :c:func:`davidson_general_ext_rout_nonsym_b1space`
|
||||
* :c:func:`make_s2_eigenfunction`
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
* :c:func:`mo_as_eigvectors_of_mo_matrix`
|
||||
* :c:func:`mo_as_svd_vectors_of_mo_matrix`
|
||||
* :c:func:`mo_as_svd_vectors_of_mo_matrix_eig`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_guess_type`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mu_erf`
|
||||
* :c:func:`mo_coef_new_as_svd_vectors_of_mo_matrix_eig`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det_max`
|
||||
* :c:data:`n_det_max_full`
|
||||
* :c:data:`n_det_print_wf`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_it_scf_max`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`no_ivvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge_remove`
|
||||
* :c:data:`n_pts_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_label`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`only_expected_s2`
|
||||
* :c:data:`pseudo_dz_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_dz_kl`
|
||||
* :c:data:`pseudo_grid_rmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_grid_size`
|
||||
* :c:data:`pseudo_klocmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_kmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_lmax`
|
||||
* :c:data:`pseudo_n_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_n_kl`
|
||||
* :c:data:`pseudo_sym`
|
||||
* :c:data:`pseudo_v_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_v_kl`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
* :c:data:`pt2_max`
|
||||
* :c:data:`pt2_relative_error`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
* :c:data:`prim_normalization_factor`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`scf_algorithm`
|
||||
* :c:data:`selection_factor`
|
||||
* :c:data:`state_following`
|
||||
* :c:data:`target_energy`
|
||||
* :c:data:`thresh_scf`
|
||||
* :c:data:`thresh_sym`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
* :c:data:`threshold_diis`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
* :c:data:`variance_max`
|
||||
* :c:data:`weight_one_e_dm`
|
||||
* :c:data:`weight_selection`
|
||||
* :c:data:`shell_normalization_factor`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
||||
@ -86,93 +86,38 @@ Programs
|
||||
* :ref:`fci`
|
||||
* :ref:`pt2`
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: do_ddci
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`fci/class.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: do_only_1h1p
|
||||
logical :: do_only_cas
|
||||
logical :: do_ddci
|
||||
|
||||
|
||||
In the FCI case, all those are always false
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: do_only_1h1p
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`fci/class.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: do_only_1h1p
|
||||
logical :: do_only_cas
|
||||
logical :: do_ddci
|
||||
|
||||
|
||||
In the FCI case, all those are always false
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: do_only_cas
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`fci/class.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: do_only_1h1p
|
||||
logical :: do_only_cas
|
||||
logical :: do_ddci
|
||||
|
||||
|
||||
In the FCI case, all those are always false
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: save_energy:
|
||||
.. c:function:: write_c_ij_ab:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`fci/save_energy.irp.f`
|
||||
File : :file:`write_c_ij_ab.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine save_energy(E,pt2)
|
||||
subroutine write_c_ij_ab
|
||||
|
||||
|
||||
Saves the energy in |EZFIO|.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run_cipsi`
|
||||
* :c:func:`run_stochastic_cipsi`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_fci_energy`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_fci_energy_pt2`
|
||||
* :c:func:`routine`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -17,3 +17,334 @@ the generators as the |CAS| determinants, which can be useful to define post-CAS
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: n_det_generators
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: n_det_generators
|
||||
|
||||
|
||||
Number of generator detetrminants
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`act_bitmask`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`reunion_of_core_inact_bitmask`
|
||||
* :c:data:`virt_bitmask`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`global_selection_buffer`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`pt2_f`
|
||||
* :c:data:`pt2_j`
|
||||
* :c:data:`pt2_n_tasks`
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_u`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_coef_generators
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_generators (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_generators (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_sorted_gen (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_sorted_gen (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer, allocatable :: psi_det_sorted_gen_order (psi_det_size)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`act_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`reunion_of_core_inact_bitmask`
|
||||
* :c:data:`virt_bitmask`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_coef_sorted_gen
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_generators (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_generators (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_sorted_gen (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_sorted_gen (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer, allocatable :: psi_det_sorted_gen_order (psi_det_size)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`act_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`reunion_of_core_inact_bitmask`
|
||||
* :c:data:`virt_bitmask`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_det_generators
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_generators (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_generators (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_sorted_gen (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_sorted_gen (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer, allocatable :: psi_det_sorted_gen_order (psi_det_size)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`act_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`reunion_of_core_inact_bitmask`
|
||||
* :c:data:`virt_bitmask`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_det_sorted_gen
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_generators (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_generators (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_sorted_gen (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_sorted_gen (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer, allocatable :: psi_det_sorted_gen_order (psi_det_size)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`act_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`reunion_of_core_inact_bitmask`
|
||||
* :c:data:`virt_bitmask`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_det_sorted_gen_order
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_generators (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_generators (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_sorted_gen (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_sorted_gen (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer, allocatable :: psi_det_sorted_gen_order (psi_det_size)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`act_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`reunion_of_core_inact_bitmask`
|
||||
* :c:data:`virt_bitmask`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: select_max
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: select_max (size_select_max)
|
||||
|
||||
|
||||
Memo to skip useless selectors
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`size_select_max`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: size_select_max
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: size_select_max
|
||||
|
||||
|
||||
Size of the select_max array
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`select_max`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: extract_cas:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_cas/extract_cas.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine extract_cas
|
||||
|
||||
|
||||
Replaces the total wave function by the normalized projection on the CAS.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -42,252 +42,3 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: n_det_generators
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_full/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: n_det_generators
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the number of generators is 1 : the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`degree_max_generators`
|
||||
* :c:data:`global_selection_buffer`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`pt2_f`
|
||||
* :c:data:`pt2_j`
|
||||
* :c:data:`pt2_n_tasks`
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_u`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_coef_generators
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_full/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_generators (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_generators (psi_det_size,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`degree_max_generators`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_coef_sorted_gen
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_full/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_sorted_gen (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_sorted_gen (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer, allocatable :: psi_det_sorted_gen_order (psi_det_size)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_det_generators
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_full/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_generators (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_generators (psi_det_size,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`degree_max_generators`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_det_sorted_gen
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_full/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_sorted_gen (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_sorted_gen (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer, allocatable :: psi_det_sorted_gen_order (psi_det_size)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_det_sorted_gen_order
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_full/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer(bit_kind), allocatable :: psi_det_sorted_gen (N_int,2,psi_det_size)
|
||||
double precision, allocatable :: psi_coef_sorted_gen (psi_det_size,N_states)
|
||||
integer, allocatable :: psi_det_sorted_gen_order (psi_det_size)
|
||||
|
||||
|
||||
For Single reference wave functions, the generator is the
|
||||
Hartree-Fock determinant
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_w`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: select_max
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_full/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: select_max (size_select_max)
|
||||
|
||||
|
||||
Memo to skip useless selectors
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`size_select_max`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: size_select_max
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`generators_full/generators.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: size_select_max
|
||||
|
||||
|
||||
Size of the select_max array
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`select_max`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -51,7 +51,6 @@ Programs
|
||||
--------
|
||||
|
||||
* :ref:`scf`
|
||||
* :ref:`test`
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
@ -83,8 +82,10 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha_chol`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_ao_cholesky`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`is_periodic`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
@ -92,6 +93,8 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`read_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
* :c:data:`use_cgtos`
|
||||
* :c:data:`use_only_lr`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
@ -102,6 +105,41 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`hf_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_two_e_integral_alpha_chol
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/fock_matrix_hf.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_two_e_integral_alpha_chol (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_two_e_integral_beta_chol (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Alpha and Beta Fock matrices in AO basis set
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_two_e_integral_beta
|
||||
|
||||
|
||||
@ -129,8 +167,10 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha_chol`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_ao_cholesky`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`is_periodic`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
@ -138,6 +178,8 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`read_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
* :c:data:`use_cgtos`
|
||||
* :c:data:`use_only_lr`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
@ -148,6 +190,41 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`hf_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_two_e_integral_beta_chol
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/fock_matrix_hf.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_two_e_integral_alpha_chol (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_two_e_integral_beta_chol (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Alpha and Beta Fock matrices in AO basis set
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: extra_e_contrib_density
|
||||
|
||||
|
||||
@ -202,6 +279,7 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`mcscf_fock_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -235,6 +313,7 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`mcscf_fock_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -266,6 +345,58 @@ Providers
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: hf_kinetic_energy
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/hf_energy.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: hf_kinetic_energy
|
||||
double precision :: hf_n_e_energy
|
||||
|
||||
|
||||
Hartree-Fock energy containing the nuclear repulsion, and its one- and two-body components.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: hf_n_e_energy
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/hf_energy.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: hf_kinetic_energy
|
||||
double precision :: hf_n_e_energy
|
||||
|
||||
|
||||
Hartree-Fock energy containing the nuclear repulsion, and its one- and two-body components.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: hf_one_electron_energy
|
||||
|
||||
|
||||
@ -344,7 +475,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_coef`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_guess_type`
|
||||
@ -379,3 +509,149 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: main:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/print_scf_int.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine main()
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`print_scf_int`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_fock_diag:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/print_fock_diag.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_fock_diag
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_pseudo_overlap:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/print_pseudo_overlap.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_pseudo_overlap
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_scf_int:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/print_scf_int.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_scf_int
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`main`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: run:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/scf.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine run
|
||||
|
||||
|
||||
Run SCF calculation
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`json_int_fmt`
|
||||
* :c:data:`json_unit`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`casscf`
|
||||
* :c:func:`scf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_hartree_fock_energy`
|
||||
* :c:func:`json_close`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -13,34 +13,33 @@ the |FCI| limit.
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
EZFIO parameters
|
||||
----------------
|
||||
|
||||
.. option:: n_iter
|
||||
|
||||
Number of saved iterations
|
||||
|
||||
Default: 1
|
||||
|
||||
.. option:: n_det_iterations
|
||||
|
||||
Number of determinants at each iteration
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: energy_iterations
|
||||
|
||||
The variational energy at each iteration
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: pt2_iterations
|
||||
|
||||
The |PT2| correction at each iteration
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: energy_iterations
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`iterations/iterations.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: energy_iterations (n_states,N_iter_max)
|
||||
double precision, allocatable :: pt2_iterations (n_states,N_iter_max)
|
||||
double precision, allocatable :: extrapolated_energy (N_iter_max,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
The energy at each iteration for the extrapolations
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_iter_max`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: extrapolated_energy
|
||||
|
||||
|
||||
@ -48,10 +47,96 @@ Providers
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: extrapolated_energy (N_iter,N_states)
|
||||
double precision, allocatable :: energy_iterations (n_states,N_iter_max)
|
||||
double precision, allocatable :: pt2_iterations (n_states,N_iter_max)
|
||||
double precision, allocatable :: extrapolated_energy (N_iter_max,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
Extrapolated energy, using E_var = f(PT2) where PT2=0
|
||||
The energy at each iteration for the extrapolations
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_iter_max`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: n_iter
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`iterations/iterations.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: n_iter
|
||||
|
||||
|
||||
Number of CIPSI iterations
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: n_iter_max
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`iterations/iterations.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: n_iter_max
|
||||
|
||||
|
||||
Max number of iterations for extrapolations
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: pt2_iterations
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`iterations/iterations.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: energy_iterations (n_states,N_iter_max)
|
||||
double precision, allocatable :: pt2_iterations (n_states,N_iter_max)
|
||||
double precision, allocatable :: extrapolated_energy (N_iter_max,N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
The energy at each iteration for the extrapolations
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_iter_max`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: increment_n_iter:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`iterations/iterations.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine increment_n_iter(e, pt2_data)
|
||||
|
||||
|
||||
Does what is necessary to increment n_iter
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
@ -61,45 +146,25 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_iter_max`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: n_iter
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`iterations/io.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: n_iter
|
||||
|
||||
|
||||
number of iterations
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
* :c:func:`run_cipsi`
|
||||
* :c:func:`run_stochastic_cipsi`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extrapolated_energy`
|
||||
* :c:func:`extrapolate_data`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_extrapolated_energy:
|
||||
|
||||
|
||||
@ -117,11 +182,10 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extrapolated_energy`
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
@ -139,7 +203,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_summary(e_,pt2_data,pt2_data_err,n_det_,n_occ_pattern_,n_st,s2_)
|
||||
subroutine print_summary(e_,pt2_data,pt2_data_err,n_det_,n_configuration_,n_st,s2_)
|
||||
|
||||
|
||||
Print the extrapolated energy in the output
|
||||
@ -150,6 +214,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`do_pt2`
|
||||
* :c:data:`nsomomax`
|
||||
* :c:data:`only_expected_s2`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
@ -160,59 +226,26 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:func:`run_cipsi`
|
||||
* :c:func:`run_stochastic_cipsi`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`print_energy_components`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: save_iterations:
|
||||
.. c:function:: print_summary_tc:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`iterations/iterations.irp.f`
|
||||
File : :file:`iterations/summary_tc.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine save_iterations(e_, pt2_,n_)
|
||||
subroutine print_summary_tc(e_,pt2_data,pt2_data_err,n_det_,n_configuration_,n_st,s2_)
|
||||
|
||||
|
||||
Update the energy in the EZFIO file.
|
||||
Print the extrapolated energy in the output
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run_cipsi`
|
||||
* :c:func:`run_stochastic_cipsi`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_iterations_energy_iterations`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_iterations_n_det_iterations`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_iterations_n_iter`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_iterations_pt2_iterations`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`do_pt2`
|
||||
* :c:data:`nsomomax`
|
||||
* :c:data:`only_expected_s2`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -46,10 +46,229 @@ Programs
|
||||
--------
|
||||
|
||||
* :ref:`ks_scf`
|
||||
* :ref:`print_mos`
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_potential_alpha_xc
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`pot_functionals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_potential_alpha_xc (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_potential_beta_xc (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`potential_c_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`potential_xc_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`same_xc_func`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`ks_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_potential_beta_xc
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`pot_functionals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_potential_alpha_xc (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_potential_beta_xc (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`potential_c_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`potential_xc_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`same_xc_func`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`ks_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: e_correlation_dft
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`pot_functionals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: e_correlation_dft
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`energy_c`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
* :c:data:`ks_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: e_exchange_dft
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`pot_functionals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: e_exchange_dft
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`energy_x`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
* :c:data:`ks_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: fock_matrix_alpha_no_xc_ao
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`fock_matrix_ks.irp.f`
|
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.. code:: fortran
|
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||||
double precision, allocatable :: fock_matrix_alpha_no_xc_ao (ao_num,ao_num)
|
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double precision, allocatable :: fock_matrix_beta_no_xc_ao (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Mono electronic an Coulomb matrix in ao basis set
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Needs:
|
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`ao_num`
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* :c:data:`ao_one_e_integrals`
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* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
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Needed by:
|
||||
|
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.. hlist::
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:columns: 3
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||||
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* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
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||||
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.. c:var:: fock_matrix_beta_no_xc_ao
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||||
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||||
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||||
File : :file:`fock_matrix_ks.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
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||||
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||||
double precision, allocatable :: fock_matrix_alpha_no_xc_ao (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: fock_matrix_beta_no_xc_ao (ao_num,ao_num)
|
||||
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||||
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||||
Mono electronic an Coulomb matrix in ao basis set
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||||
Needs:
|
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.. hlist::
|
||||
:columns: 3
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||||
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||||
* :c:data:`ao_num`
|
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* :c:data:`ao_one_e_integrals`
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* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
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||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
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* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
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||||
.. c:var:: fock_matrix_energy
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ks_enery.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
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||||
double precision :: ks_energy
|
||||
double precision :: two_e_energy
|
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double precision :: one_e_energy
|
||||
double precision :: fock_matrix_energy
|
||||
double precision :: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
Kohn-Sham energy containing the nuclear repulsion energy, and the various components of this quantity.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
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* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
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* :c:data:`e_correlation_dft`
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ks_energy
|
||||
|
||||
|
||||
@ -90,6 +309,153 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_energy
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ks_enery.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: ks_energy
|
||||
double precision :: two_e_energy
|
||||
double precision :: one_e_energy
|
||||
double precision :: fock_matrix_energy
|
||||
double precision :: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
Kohn-Sham energy containing the nuclear repulsion energy, and the various components of this quantity.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
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* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`e_correlation_dft`
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
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* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ks_enery.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: ks_energy
|
||||
double precision :: two_e_energy
|
||||
double precision :: one_e_energy
|
||||
double precision :: fock_matrix_energy
|
||||
double precision :: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
Kohn-Sham energy containing the nuclear repulsion energy, and the various components of this quantity.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
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* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`e_correlation_dft`
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: two_e_energy
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ks_enery.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: ks_energy
|
||||
double precision :: two_e_energy
|
||||
double precision :: one_e_energy
|
||||
double precision :: fock_matrix_energy
|
||||
double precision :: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
Kohn-Sham energy containing the nuclear repulsion energy, and the various components of this quantity.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`e_correlation_dft`
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: check_coherence_functional:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ks_scf.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine check_coherence_functional
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`correlation_functional`
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ks_scf`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -63,264 +63,6 @@ Programs
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_potential_alpha_xc
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`pot_functionals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_potential_alpha_xc (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_potential_beta_xc (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`potential_c_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`potential_xc_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`same_xc_func`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`rs_ks_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_potential_beta_xc
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`pot_functionals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_potential_alpha_xc (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: ao_potential_beta_xc (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`potential_c_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`potential_x_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`potential_xc_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`same_xc_func`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`rs_ks_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: e_correlation_dft
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`pot_functionals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: e_correlation_dft
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`energy_c`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
* :c:data:`rs_ks_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: e_exchange_dft
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`pot_functionals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: e_exchange_dft
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`energy_x`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
* :c:data:`rs_ks_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: fock_matrix_alpha_no_xc_ao
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`fock_matrix_rs_ks.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: fock_matrix_alpha_no_xc_ao (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: fock_matrix_beta_no_xc_ao (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Mono electronic an Coulomb matrix in ao basis set
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: fock_matrix_beta_no_xc_ao
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`fock_matrix_rs_ks.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: fock_matrix_alpha_no_xc_ao (ao_num,ao_num)
|
||||
double precision, allocatable :: fock_matrix_beta_no_xc_ao (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Mono electronic an Coulomb matrix in ao basis set
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: fock_matrix_energy
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`rs_ks_energy.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: rs_ks_energy
|
||||
double precision :: two_e_energy
|
||||
double precision :: one_e_energy
|
||||
double precision :: fock_matrix_energy
|
||||
double precision :: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
Range-separated Kohn-Sham energy containing the nuclear repulsion energy, and the various components of this quantity.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`e_correlation_dft`
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_energy
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`rs_ks_energy.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: rs_ks_energy
|
||||
double precision :: two_e_energy
|
||||
double precision :: one_e_energy
|
||||
double precision :: fock_matrix_energy
|
||||
double precision :: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
Range-separated Kohn-Sham energy containing the nuclear repulsion energy, and the various components of this quantity.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`e_correlation_dft`
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: rs_ks_energy
|
||||
|
||||
|
||||
@ -361,113 +103,6 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`rs_ks_energy.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: rs_ks_energy
|
||||
double precision :: two_e_energy
|
||||
double precision :: one_e_energy
|
||||
double precision :: fock_matrix_energy
|
||||
double precision :: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
Range-separated Kohn-Sham energy containing the nuclear repulsion energy, and the various components of this quantity.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`e_correlation_dft`
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: two_e_energy
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`rs_ks_energy.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: rs_ks_energy
|
||||
double precision :: two_e_energy
|
||||
double precision :: one_e_energy
|
||||
double precision :: fock_matrix_energy
|
||||
double precision :: trace_potential_xc
|
||||
|
||||
|
||||
Range-separated Kohn-Sham energy containing the nuclear repulsion energy, and the various components of this quantity.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`e_correlation_dft`
|
||||
* :c:data:`e_exchange_dft`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extra_e_contrib_density`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: check_coherence_functional:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`rs_ks_scf.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine check_coherence_functional
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`correlation_functional`
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`rs_ks_scf`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -44,6 +44,16 @@ EZFIO parameters
|
||||
Coefficient of the i-th |AO| on the j-th |MO|
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: mo_coef_aux
|
||||
|
||||
AUX Coefficient of the i-th |AO| on the j-th |MO|
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: mo_coef_imag
|
||||
|
||||
Imaginary part of the MO coefficient of the i-th |AO| on the j-th |MO|
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: mo_label
|
||||
|
||||
Label characterizing the MOS (Local, Canonical, Natural, *etc*)
|
||||
@ -54,6 +64,11 @@ EZFIO parameters
|
||||
|MO| occupation numbers
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: mo_symmetry
|
||||
|
||||
MOs with the same integer belong to the same irrep.
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: mo_class
|
||||
|
||||
[ Core | Inactive | Active | Virtual | Deleted ], as defined by :ref:`qp_set_mo_class`
|
||||
@ -88,20 +103,19 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`full_ijkl_bitmask`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_all_but_del_orb`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`list_del`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_all_but_del_orb`
|
||||
@ -143,27 +157,65 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`attachment_orbitals`
|
||||
* :c:data:`cholesky_mo_transp`
|
||||
* :c:data:`d0tu_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`mcscf_fock_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_in_ao_ortho_basis`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_novirt`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_deriv_1_x`
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
* :c:data:`natorbsfci`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_ao_alpha_nstates`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_spin_density_ao`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_coef_aux
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_basis/mos_aux.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mo_coef_aux (ao_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_coef_imag
|
||||
@ -246,9 +298,10 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`cholesky_semi_mo_transp_simple`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_label
|
||||
@ -311,14 +364,44 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals_from_mo`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_nucl_elec_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_nucl_elec_integrals`
|
||||
* :c:data:`attachment_numbers_sorted`
|
||||
* :c:data:`attachment_orbitals`
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`bielec_pqxx_array`
|
||||
* :c:data:`bielec_pqxx_no_array`
|
||||
* :c:data:`bielec_pxxq_array`
|
||||
* :c:data:`bielec_pxxq_no_array`
|
||||
* :c:data:`bielecci`
|
||||
* :c:data:`bielecci_no`
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`cholesky_mo`
|
||||
* :c:data:`cholesky_mo_transp`
|
||||
* :c:data:`cholesky_no_1_idx_transp`
|
||||
* :c:data:`cholesky_no_total_transp`
|
||||
* :c:data:`cholesky_semi_mo_transp_simple`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator_erf`
|
||||
* :c:data:`d0tu_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
* :c:data:`difference_dm`
|
||||
* :c:data:`difference_dm_eigvect`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fapq`
|
||||
* :c:data:`fipq`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`fock_operator_closed_shell_ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`fock_wee_closed_shell`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`full_ijkl_bitmask`
|
||||
* :c:data:`h_core_ri`
|
||||
* :c:data:`int_erf_3_index`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_all_but_del_orb`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
@ -328,14 +411,21 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_inact_act`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`lowest_super_ci_coef_mo`
|
||||
* :c:data:`mcscf_fock_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`mcscf_fock_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_aux`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_begin_iteration`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_imag`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_in_ao_ortho_basis`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_deriv_1_x`
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
@ -344,22 +434,34 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_centered_x`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
* :c:data:`multi_s_deriv_1`
|
||||
* :c:data:`multi_s_dipole_moment`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_all_but_del_orb`
|
||||
* :c:data:`n_attachment`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_del_orb`
|
||||
* :c:data:`n_inact_orb`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
* :c:data:`natorbsci_mos`
|
||||
* :c:data:`natorbsfci`
|
||||
* :c:data:`neworbs`
|
||||
* :c:data:`occnum`
|
||||
* :c:data:`one_body_dm_mo_alpha_one_det`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_ao_alpha_nstates`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_alpha_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_beta_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_mo_for_dft`
|
||||
@ -376,10 +478,19 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_spin_index`
|
||||
* :c:data:`one_e_spin_density_ao`
|
||||
* :c:data:`one_e_spin_density_mo`
|
||||
* :c:data:`one_e_tr_dm_mo`
|
||||
* :c:data:`one_e_tr_dm_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`one_ints_no`
|
||||
* :c:data:`ormas_n_orb`
|
||||
* :c:data:`psi_energy_h_core`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
||||
* :c:data:`singles_alpha_csc_idx`
|
||||
* :c:data:`singles_beta_csc_idx`
|
||||
* :c:data:`super_ci_dm`
|
||||
* :c:data:`superci_natorb`
|
||||
* :c:data:`switch_mo_coef`
|
||||
* :c:data:`two_e_dm_mo`
|
||||
* :c:data:`umat`
|
||||
* :c:data:`v_ne_psi_energy`
|
||||
* :c:data:`z_dipole_moment`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_occ
|
||||
@ -469,12 +580,18 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`four_idx_novvvv`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`mcscf_fock_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_deriv_1_x`
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
@ -554,6 +671,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
subroutine give_all_mos_at_r(r,mos_array)
|
||||
|
||||
|
||||
mos_array(i) = ith MO function evaluated at "r"
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
@ -622,6 +740,16 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`create_guess`
|
||||
* :c:func:`damping_scf`
|
||||
* :c:func:`hcore_guess`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
@ -689,7 +817,9 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`set_natorb_no_ov_rot`
|
||||
* :c:func:`set_natural_mos`
|
||||
* :c:func:`set_natural_mos_canon_label`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
@ -751,7 +881,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
@ -763,7 +892,14 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`damping_scf`
|
||||
* :c:func:`hcore_guess`
|
||||
* :c:func:`huckel_guess`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
* :c:func:`run_orb_opt_trust_v2`
|
||||
* :c:func:`save_natural_mos`
|
||||
* :c:func:`save_natural_mos_canon_label`
|
||||
* :c:func:`save_natural_mos_no_ov_rot`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
@ -776,7 +912,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_label`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_num`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_occ`
|
||||
* :c:func:`system`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: save_mos_no_occ:
|
||||
@ -796,7 +931,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
@ -806,7 +940,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_coef`
|
||||
* :c:func:`system`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: save_mos_truncated:
|
||||
@ -827,7 +960,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
@ -844,5 +976,4 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_label`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_num`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_occ`
|
||||
* :c:func:`system`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -60,6 +60,7 @@ Providers
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`lin_dep_cutoff`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
@ -138,9 +139,11 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
@ -148,6 +151,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`mo_as_eigvectors_of_mo_matrix`
|
||||
* :c:func:`nullify_small_elements`
|
||||
* :c:func:`save_mos`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
@ -23,12 +23,12 @@ Note that you can find other interesting integrals related to the position opera
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||||
EZFIO parameters
|
||||
----------------
|
||||
|
||||
.. option:: mo_integrals_e_n
|
||||
.. option:: mo_integrals_n_e
|
||||
|
||||
Nucleus-electron integrals in |MO| basis set
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: io_mo_integrals_e_n
|
||||
.. option:: io_mo_integrals_n_e
|
||||
|
||||
Read/Write |MO| electron-nucleus attraction integrals from/to disk [ Write | Read | None ]
|
||||
|
||||
@ -71,6 +71,32 @@ EZFIO parameters
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_one_e_integrals_from_mo
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_one_e_ints/ao_to_mo.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
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|
||||
double precision, allocatable :: ao_one_e_integrals_from_mo (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Integrals of the one e hamiltonian obtained from the integrals on the MO basis
|
||||
|
||||
WARNING : this is equal to ao_one_e_integrals only if the AO and MO basis have the same number of functions
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||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_dipole_x
|
||||
|
||||
|
||||
@ -97,6 +123,14 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_spread_centered_x`
|
||||
* :c:data:`multi_s_dipole_moment`
|
||||
* :c:data:`z_dipole_moment`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_dipole_y
|
||||
@ -125,6 +159,14 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_spread_centered_x`
|
||||
* :c:data:`multi_s_dipole_moment`
|
||||
* :c:data:`z_dipole_moment`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_dipole_z
|
||||
@ -153,6 +195,14 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_spread_centered_x`
|
||||
* :c:data:`multi_s_dipole_moment`
|
||||
* :c:data:`z_dipole_moment`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_integrals_n_e
|
||||
@ -185,6 +235,7 @@ Providers
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask_energy`
|
||||
* :c:data:`v_ne_psi_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_integrals_n_e_per_atom
|
||||
@ -274,8 +325,12 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals_from_mo`
|
||||
* :c:data:`core_energy`
|
||||
* :c:data:`etwo`
|
||||
* :c:data:`fock_operator_closed_shell_ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`h_core_ri`
|
||||
* :c:data:`one_ints_no`
|
||||
* :c:data:`psi_energy_h_core`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask_energy`
|
||||
|
||||
@ -330,6 +385,137 @@ Providers
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_pseudo_integrals_local
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_one_e_ints/pot_mo_pseudo_ints.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mo_pseudo_integrals_local (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Pseudopotential integrals in |MO| basis
|
||||
|
||||
Needs:
|
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|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_pseudo_integrals_non_local
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_one_e_ints/pot_mo_pseudo_ints.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mo_pseudo_integrals_non_local (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Pseudopotential integrals in |MO| basis
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_spread_centered_x
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_one_e_ints/spread_dipole_mo.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_x (mo_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_y (mo_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_z (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
array of the integrals of MO_i * (x^2 - <MO_i|x|MO_j>^2) MO_j = MO_i x^2 MO_j - (MO_i x MO_j)^2
|
||||
array of the integrals of MO_i * (y^2 - <MO_i|y|MO_j>^2) MO_j = MO_i y^2 MO_j - (MO_i y MO_j)^2
|
||||
array of the integrals of MO_i * (z^2 - <MO_i|z|MO_j>^2) MO_j = MO_i z^2 MO_j - (MO_i z MO_j)^2
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_spread_centered_y
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_one_e_ints/spread_dipole_mo.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_x (mo_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_y (mo_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_z (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
array of the integrals of MO_i * (x^2 - <MO_i|x|MO_j>^2) MO_j = MO_i x^2 MO_j - (MO_i x MO_j)^2
|
||||
array of the integrals of MO_i * (y^2 - <MO_i|y|MO_j>^2) MO_j = MO_i y^2 MO_j - (MO_i y MO_j)^2
|
||||
array of the integrals of MO_i * (z^2 - <MO_i|z|MO_j>^2) MO_j = MO_i z^2 MO_j - (MO_i z MO_j)^2
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_spread_centered_z
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_one_e_ints/spread_dipole_mo.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_x (mo_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_y (mo_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: mo_spread_centered_z (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
array of the integrals of MO_i * (x^2 - <MO_i|x|MO_j>^2) MO_j = MO_i x^2 MO_j - (MO_i x MO_j)^2
|
||||
array of the integrals of MO_i * (y^2 - <MO_i|y|MO_j>^2) MO_j = MO_i y^2 MO_j - (MO_i y MO_j)^2
|
||||
array of the integrals of MO_i * (z^2 - <MO_i|z|MO_j>^2) MO_j = MO_i z^2 MO_j - (MO_i z MO_j)^2
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_spread_x
|
||||
|
||||
|
||||
@ -356,6 +542,12 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_spread_centered_x`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_spread_y
|
||||
@ -384,6 +576,12 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_spread_centered_x`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_spread_z
|
||||
@ -412,6 +610,12 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_spread_centered_x`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: s_mo_coef
|
||||
@ -436,6 +640,13 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals_from_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@ -465,6 +676,14 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals_from_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
@ -499,6 +718,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`d0tu_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft_no_core`
|
||||
|
||||
@ -537,16 +757,19 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`huckel_guess`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
* :c:func:`save_natural_mos`
|
||||
* :c:func:`save_natural_mos_canon_label`
|
||||
* :c:func:`save_natural_mos_no_ov_rot`
|
||||
* :c:func:`scf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`nullify_small_elements`
|
||||
* :c:func:`ortho_lowdin`
|
||||
* :c:func:`restore_symmetry`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
|
||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -59,19 +59,39 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`absolute_eig`
|
||||
* :c:data:`act_mos_opt`
|
||||
* :c:data:`adaptive_pt2_max`
|
||||
* :c:data:`ao_cartesian`
|
||||
* :c:data:`ao_cholesky_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_im`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_phase`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_pw`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ao_normalized`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`cas_bitmask`
|
||||
* :c:data:`avoid_saddle`
|
||||
* :c:data:`basis`
|
||||
* :c:data:`basis_nucleus_index`
|
||||
* :c:data:`calc_dipole_moment`
|
||||
* :c:data:`calc_energy_components`
|
||||
* :c:data:`calc_osc_str`
|
||||
* :c:data:`calc_tr_dipole_moment`
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`correlation_energy_ratio_max`
|
||||
* :c:data:`correlation_functional`
|
||||
* :c:data:`criterion_casscf`
|
||||
* :c:data:`csf_based`
|
||||
* :c:data:`damping_for_rs_dft`
|
||||
* :c:data:`data_energy_proj`
|
||||
* :c:data:`data_energy_var`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_ao`
|
||||
@ -79,63 +99,90 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_ao`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
* :c:data:`davidson_sze_max`
|
||||
* :c:data:`disk_access_nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`density_for_dft`
|
||||
* :c:data:`diag_hess_cas`
|
||||
* :c:data:`disk_based_davidson`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`do_ao_cholesky`
|
||||
* :c:data:`do_mom`
|
||||
* :c:data:`do_ormas`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`do_pt2`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`element_name`
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
* :c:data:`excitation_alpha_max`
|
||||
* :c:data:`excitation_beta_max`
|
||||
* :c:data:`excitation_max`
|
||||
* :c:data:`excitation_ref`
|
||||
* :c:data:`fast_2rdm`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`generators_bitmask`
|
||||
* :c:data:`generators_bitmask_restart`
|
||||
* :c:data:`h0_type`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`hess_cv_cv`
|
||||
* :c:data:`hf_exchange`
|
||||
* :c:data:`io_ao_cholesky`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_overlap`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:data:`io_ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`io_mo_cholesky`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`io_mo_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:data:`io_nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`io_two_body_rdm_aa`
|
||||
* :c:data:`io_two_body_rdm_ab`
|
||||
* :c:data:`io_two_body_rdm_bb`
|
||||
* :c:data:`io_two_body_rdm_spin_trace`
|
||||
* :c:data:`is_periodic`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`level_shift_casscf`
|
||||
* :c:data:`lin_dep_cutoff`
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_aux`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_imag`
|
||||
* :c:data:`mo_guess_type`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_shift`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mu_dft_type`
|
||||
* :c:data:`mu_erf`
|
||||
* :c:data:`n_cas_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_big_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_del_orb`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det_max`
|
||||
* :c:data:`n_det_max_full`
|
||||
* :c:data:`n_det_max_opt`
|
||||
* :c:data:`n_det_print_wf`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_generators_bitmask`
|
||||
* :c:data:`n_generators_bitmask_restart`
|
||||
* :c:data:`n_inact_orb`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_it_scf_max`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_pts_charge`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`no_ivvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
* :c:data:`nb_it_max_lambda`
|
||||
* :c:data:`nb_it_max_pre_search`
|
||||
* :c:data:`no_core_density`
|
||||
* :c:data:`no_oa_or_av_opt`
|
||||
* :c:data:`normalize_dm`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`nthreads_pt2`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
@ -144,7 +191,22 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`nucl_label`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`nucleus_shell_num`
|
||||
* :c:data:`only_expected_s2`
|
||||
* :c:data:`optimization_max_nb_iter`
|
||||
* :c:data:`optimization_method`
|
||||
* :c:data:`ormas_max_e`
|
||||
* :c:data:`ormas_min_e`
|
||||
* :c:data:`ormas_mstart`
|
||||
* :c:data:`ormas_n_space`
|
||||
* :c:data:`point_charges`
|
||||
* :c:data:`prim_coef`
|
||||
* :c:data:`prim_expo`
|
||||
* :c:data:`prim_normalization_factor`
|
||||
* :c:data:`prim_num`
|
||||
* :c:data:`primitives_normalized`
|
||||
* :c:data:`print_all_transitions`
|
||||
* :c:data:`pruning`
|
||||
* :c:data:`pseudo_dz_k`
|
||||
* :c:data:`pseudo_dz_kl`
|
||||
* :c:data:`pseudo_grid_rmax`
|
||||
@ -166,25 +228,59 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
* :c:data:`pt2_f`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
* :c:data:`pt2_max`
|
||||
* :c:data:`pt2_min_casscf`
|
||||
* :c:data:`pt2_min_parallel_tasks`
|
||||
* :c:data:`pt2_n_teeth`
|
||||
* :c:data:`pt2_relative_error`
|
||||
* :c:data:`pts_charge_coord`
|
||||
* :c:data:`pts_charge_z`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
* :c:data:`restore_symm`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`save_threshold`
|
||||
* :c:data:`save_wf_after_selection`
|
||||
* :c:data:`scf_algorithm`
|
||||
* :c:data:`selection_factor`
|
||||
* :c:data:`seniority_max`
|
||||
* :c:data:`shell_ang_mom`
|
||||
* :c:data:`shell_index`
|
||||
* :c:data:`shell_normalization_factor`
|
||||
* :c:data:`shell_num`
|
||||
* :c:data:`shell_prim_num`
|
||||
* :c:data:`small_active_space`
|
||||
* :c:data:`state_following`
|
||||
* :c:data:`state_following_casscf`
|
||||
* :c:data:`target_energy`
|
||||
* :c:data:`thresh_casscf`
|
||||
* :c:data:`thresh_cc`
|
||||
* :c:data:`thresh_delta`
|
||||
* :c:data:`thresh_eig`
|
||||
* :c:data:`thresh_model`
|
||||
* :c:data:`thresh_model_2`
|
||||
* :c:data:`thresh_opt_max_elem_grad`
|
||||
* :c:data:`thresh_rho`
|
||||
* :c:data:`thresh_rho_2`
|
||||
* :c:data:`thresh_scf`
|
||||
* :c:data:`thresh_sym`
|
||||
* :c:data:`thresh_wtg`
|
||||
* :c:data:`thresh_wtg2`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson_from_pt2`
|
||||
* :c:data:`threshold_diis`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
* :c:data:`threshold_nonsym_davidson`
|
||||
* :c:data:`twice_hierarchy_max`
|
||||
* :c:data:`typ`
|
||||
* :c:data:`use_cgtos`
|
||||
* :c:data:`use_only_lr`
|
||||
* :c:data:`variance_max`
|
||||
* :c:data:`version_avoid_saddle`
|
||||
* :c:data:`version_lambda_search`
|
||||
* :c:data:`weight_one_e_dm`
|
||||
* :c:data:`weight_selection`
|
||||
* :c:data:`without_diagonal`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mpi_rank
|
||||
|
||||
@ -49,6 +49,34 @@ EZFIO parameters
|
||||
Nuclear repulsion (Computed automaticaly or Read in the |EZFIO|)
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: is_periodic
|
||||
|
||||
If true, the calculation uses periodic boundary conditions
|
||||
|
||||
Default: false
|
||||
|
||||
.. option:: n_pts_charge
|
||||
|
||||
Number of point charges to be added to the potential
|
||||
|
||||
Default: 0
|
||||
|
||||
.. option:: pts_charge_z
|
||||
|
||||
Charge associated to each point charge
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: pts_charge_coord
|
||||
|
||||
Coordinate of each point charge.
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: point_charges
|
||||
|
||||
If |true|, point charges (see nuclei/write_pt_charges.py) are added to the one-electron potential
|
||||
|
||||
Default: False
|
||||
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
@ -216,6 +244,39 @@ Providers
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: n_pts_charge
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`nuclei/point_charges.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer :: n_pts_charge
|
||||
|
||||
|
||||
Number of point charges to be added to the potential
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_pt_chrg`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_interaction`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_nuclei_interaction`
|
||||
* :c:data:`pts_charge_coord`
|
||||
* :c:data:`pts_charge_z`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: nucl_coord
|
||||
|
||||
|
||||
@ -245,23 +306,37 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_2e_cgtos_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_norm_cgtos`
|
||||
* :c:data:`ao_deriv2_cgtos_x`
|
||||
* :c:data:`ao_deriv2_x`
|
||||
* :c:data:`ao_deriv_1_x`
|
||||
* :c:data:`ao_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_cgtos`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_pt_chrg`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_cgtos`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`ao_spread_x`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`center_of_mass`
|
||||
* :c:data:`cholesky_ao_num`
|
||||
* :c:data:`inertia_tensor`
|
||||
* :c:data:`multi_s_deriv_1`
|
||||
* :c:data:`multi_s_dipole_moment`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord_transp`
|
||||
* :c:data:`nucl_dist_2`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_nuclei_interaction`
|
||||
* :c:data:`z_dipole_moment`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: nucl_coord_transp
|
||||
@ -501,6 +576,8 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
* :c:data:`point_charges`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_nuclei_interaction`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
@ -508,8 +585,139 @@ Providers
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`ci_energy_no_diag`
|
||||
* :c:data:`core_energy`
|
||||
* :c:data:`core_energy_erf`
|
||||
* :c:data:`etwo`
|
||||
* :c:data:`hf_energy`
|
||||
* :c:data:`psi_energy_with_nucl_rep`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: pt_chrg_interaction
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`nuclei/point_charges.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: pt_chrg_interaction
|
||||
|
||||
|
||||
Interaction between the point charges
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_pts_charge`
|
||||
* :c:data:`pts_charge_coord`
|
||||
* :c:data:`pts_charge_z`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_nuclei_interaction`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: pt_chrg_nuclei_interaction
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`nuclei/point_charges.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: pt_chrg_nuclei_interaction
|
||||
|
||||
|
||||
repulsion between the point charges and the nuclei
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_pts_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
* :c:data:`point_charges`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_interaction`
|
||||
* :c:data:`pts_charge_coord`
|
||||
* :c:data:`pts_charge_z`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: pts_charge_coord
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`nuclei/point_charges.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: pts_charge_coord (n_pts_charge,3)
|
||||
|
||||
|
||||
Coordinates of each point charge.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_pts_charge`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_pt_chrg`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_interaction`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_nuclei_interaction`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: pts_charge_z
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`nuclei/point_charges.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: pts_charge_z (n_pts_charge)
|
||||
|
||||
|
||||
Charge associated to each point charge.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_pts_charge`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_pt_chrg`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_interaction`
|
||||
* :c:data:`pt_chrg_nuclei_interaction`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: slater_bragg_radii
|
||||
|
||||
@ -92,6 +92,12 @@ EZFIO parameters
|
||||
|
||||
Default: 0.0
|
||||
|
||||
.. option:: pt2_min_parallel_tasks
|
||||
|
||||
Minimum number of tasks in PT2 calculation
|
||||
|
||||
Default: 1
|
||||
|
||||
.. option:: pt2_relative_error
|
||||
|
||||
Stop stochastic |PT2| when the relative error is smaller than `pT2_relative_error`
|
||||
@ -106,7 +112,7 @@ EZFIO parameters
|
||||
|
||||
.. option:: h0_type
|
||||
|
||||
Type of denominator in PT2. [EN | SOP | HF]
|
||||
Type of denominator in PT2. [EN | CFG | HF]
|
||||
|
||||
Default: EN
|
||||
|
||||
@ -218,8 +224,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
@ -257,7 +261,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -293,7 +296,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -329,7 +331,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -365,7 +366,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -401,7 +401,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -437,7 +436,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -472,7 +470,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -509,7 +506,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -546,7 +542,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -583,7 +578,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -620,7 +614,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -657,7 +650,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
@ -737,7 +729,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
@ -783,7 +774,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
|
||||
@ -829,7 +819,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
@ -876,7 +865,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask`
|
||||
@ -922,7 +910,6 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
|
||||
@ -27,7 +27,7 @@ EZFIO parameters
|
||||
|
||||
.. option:: pseudo_n_k
|
||||
|
||||
Number of gaussians in the local component
|
||||
Powers of r - 2 in the local component
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: pseudo_v_k
|
||||
@ -52,7 +52,7 @@ EZFIO parameters
|
||||
|
||||
.. option:: pseudo_n_kl
|
||||
|
||||
Number of functions in the non-local component
|
||||
Powers of r - 2 in the non-local component
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: pseudo_v_kl
|
||||
|
||||
@ -97,16 +97,58 @@ EZFIO parameters
|
||||
Calculated HF energy
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: do_mom
|
||||
|
||||
If true, this will run a MOM calculation. The overlap will be computed at each step with respect to the initial MOs. After an initial Hartree-Fock calculation, the guess can be created by swapping molecular orbitals through the qp run swap_mos command.
|
||||
|
||||
Default: False
|
||||
|
||||
.. option:: frozen_orb_scf
|
||||
|
||||
If true, leave untouched all the orbitals defined as core and optimize all the orbitals defined as active with qp_set_mo_class
|
||||
|
||||
Default: False
|
||||
|
||||
.. option:: no_oa_or_av_opt
|
||||
|
||||
If true, you set to zero all Fock elements between the orbital set to active and all the other orbitals
|
||||
|
||||
Default: False
|
||||
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: all_shells_closed
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`scf_utils/scf_density_matrix_ao.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: all_shells_closed
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: eigenvalues_fock_matrix_ao
|
||||
|
||||
|
||||
@ -180,10 +222,15 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_inact_orb`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
* :c:data:`no_oa_or_av_opt`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@ -224,7 +271,6 @@ Providers
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`dgecon`
|
||||
* :c:func:`dgemm`
|
||||
* :c:func:`dgesv`
|
||||
* :c:func:`dgetrf`
|
||||
|
||||
@ -246,9 +292,8 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`all_shells_closed`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
@ -279,16 +324,27 @@ Providers
|
||||
Fock matrix on the MO basis.
|
||||
For open shells, the ROHF Fock Matrix is ::
|
||||
|
||||
| F-K | F + K/2 | F |
|
||||
|---------------------------------|
|
||||
| F + K/2 | F | F - K/2 |
|
||||
|---------------------------------|
|
||||
| F | F - K/2 | F + K |
|
||||
| Rcc | F^b | Fcv |
|
||||
|-----------------------|
|
||||
| F^b | Roo | F^a |
|
||||
|-----------------------|
|
||||
| Fcv | F^a | Rvv |
|
||||
|
||||
C: Core, O: Open, V: Virtual
|
||||
|
||||
F = 1/2 (Fa + Fb)
|
||||
Rcc = Acc Fcc^a + Bcc Fcc^b
|
||||
Roo = Aoo Foo^a + Boo Foo^b
|
||||
Rvv = Avv Fvv^a + Bvv Fvv^b
|
||||
Fcv = (F^a + F^b)/2
|
||||
|
||||
K = Fb - Fa
|
||||
F^a: Fock matrix alpha (MO), F^b: Fock matrix beta (MO)
|
||||
A,B: Coupling parameters
|
||||
|
||||
J. Chem. Phys. 133, 141102 (2010), https://doi.org/10.1063/1.3503173
|
||||
Coupling parameters from J. Chem. Phys. 125, 204110 (2006); https://doi.org/10.1063/1.2393223.
|
||||
cc oo vv
|
||||
A -0.5 0.5 1.5
|
||||
B 1.5 0.5 -0.5
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
@ -296,6 +352,7 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`all_shells_closed`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
@ -303,9 +360,14 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_inact_orb`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
* :c:data:`no_oa_or_av_opt`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
@ -330,16 +392,27 @@ Providers
|
||||
Fock matrix on the MO basis.
|
||||
For open shells, the ROHF Fock Matrix is ::
|
||||
|
||||
| F-K | F + K/2 | F |
|
||||
|---------------------------------|
|
||||
| F + K/2 | F | F - K/2 |
|
||||
|---------------------------------|
|
||||
| F | F - K/2 | F + K |
|
||||
| Rcc | F^b | Fcv |
|
||||
|-----------------------|
|
||||
| F^b | Roo | F^a |
|
||||
|-----------------------|
|
||||
| Fcv | F^a | Rvv |
|
||||
|
||||
C: Core, O: Open, V: Virtual
|
||||
|
||||
F = 1/2 (Fa + Fb)
|
||||
Rcc = Acc Fcc^a + Bcc Fcc^b
|
||||
Roo = Aoo Foo^a + Boo Foo^b
|
||||
Rvv = Avv Fvv^a + Bvv Fvv^b
|
||||
Fcv = (F^a + F^b)/2
|
||||
|
||||
K = Fb - Fa
|
||||
F^a: Fock matrix alpha (MO), F^b: Fock matrix beta (MO)
|
||||
A,B: Coupling parameters
|
||||
|
||||
J. Chem. Phys. 133, 141102 (2010), https://doi.org/10.1063/1.3503173
|
||||
Coupling parameters from J. Chem. Phys. 125, 204110 (2006); https://doi.org/10.1063/1.2393223.
|
||||
cc oo vv
|
||||
A -0.5 0.5 1.5
|
||||
B 1.5 0.5 -0.5
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
@ -347,6 +420,7 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`all_shells_closed`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
@ -354,9 +428,14 @@ Providers
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_inact_orb`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
* :c:data:`no_oa_or_av_opt`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
@ -498,9 +577,8 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`all_shells_closed`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
@ -509,6 +587,7 @@ Providers
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha_chol`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -539,7 +618,10 @@ Providers
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha_chol`
|
||||
* :c:data:`hf_energy`
|
||||
* :c:data:`hf_kinetic_energy`
|
||||
* :c:data:`mcscf_fock_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
|
||||
@ -571,7 +653,10 @@ Providers
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha_chol`
|
||||
* :c:data:`hf_energy`
|
||||
* :c:data:`hf_kinetic_energy`
|
||||
* :c:data:`mcscf_fock_alpha_ao`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
|
||||
@ -734,6 +819,47 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: reorder_mo_max_overlap:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`scf_utils/reorder_mo_max_overlap.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine reorder_mo_max_overlap
|
||||
|
||||
|
||||
routines that compute the projection of each MO of the current `mo_coef` on the space spanned by the occupied orbitals of `mo_coef_begin_iteration`
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_begin_iteration`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`dgemm`
|
||||
* :c:func:`dsort`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: roothaan_hall_scf:
|
||||
|
||||
|
||||
@ -753,6 +879,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`do_mom`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
@ -761,6 +888,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`json_int_fmt`
|
||||
* :c:data:`json_unit`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
@ -773,18 +902,31 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`thresh_scf`
|
||||
* :c:data:`threshold_diis_nonzero`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`dgemm`
|
||||
* :c:func:`extrapolate_fock_matrix`
|
||||
* :c:func:`initialize_mo_coef_begin_iteration`
|
||||
* :c:func:`lock_io`
|
||||
* :c:func:`mo_as_eigvectors_of_mo_matrix`
|
||||
* :c:func:`nullify_small_elements`
|
||||
* :c:func:`orthonormalize_mos`
|
||||
* :c:func:`pivoted_cholesky`
|
||||
* :c:func:`reorder_core_orb`
|
||||
* :c:func:`reorder_mo_max_overlap`
|
||||
* :c:func:`restore_symmetry`
|
||||
* :c:func:`save_mos`
|
||||
* :c:func:`sleep`
|
||||
* :c:func:`unlock_io`
|
||||
* :c:func:`write_double`
|
||||
* :c:func:`write_time`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -579,9 +579,9 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_get_n_det_selectors:
|
||||
@ -601,9 +601,9 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_put_n_det_generators:
|
||||
|
||||
@ -15,160 +15,158 @@ Useful tools are grouped in this module.
|
||||
Programs
|
||||
--------
|
||||
|
||||
* :ref:`attachement_orb`
|
||||
* :ref:`cas_complete`
|
||||
* :ref:`diagonalize_h`
|
||||
* :ref:`fcidump`
|
||||
* :ref:`fcidump_pyscf`
|
||||
* :ref:`four_idx_transform`
|
||||
* :ref:`guess_hcore`
|
||||
* :ref:`guess_huckel`
|
||||
* :ref:`molden`
|
||||
* :ref:`print_ci_vectors`
|
||||
* :ref:`print_e_conv`
|
||||
* :ref:`print_detweights`
|
||||
* :ref:`print_dipole`
|
||||
* :ref:`print_energy`
|
||||
* :ref:`print_hamiltonian`
|
||||
* :ref:`print_sorted_wf_coef`
|
||||
* :ref:`print_var_energy`
|
||||
* :ref:`print_wf`
|
||||
* :ref:`rotate_mos`
|
||||
* :ref:`save_natorb`
|
||||
* :ref:`save_natorb_no_ov_rot`
|
||||
* :ref:`save_natorb_no_ref`
|
||||
* :ref:`save_one_e_dm`
|
||||
* :ref:`save_ortho_mos`
|
||||
* :ref:`sort_by_fock_energies`
|
||||
* :ref:`sort_wf`
|
||||
* :ref:`swap_mos`
|
||||
* :ref:`truncate_wf`
|
||||
* :ref:`write_integrals_erf`
|
||||
|
||||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_energy:
|
||||
.. c:function:: molden_attachment:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`print_energy.irp.f`
|
||||
File : :file:`attachement_orb.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_energy
|
||||
subroutine molden_attachment
|
||||
|
||||
|
||||
Prints the energy of the wave function stored in the |EZFIO| directory.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_hamiltonian:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`print_hamiltonian.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_hamiltonian
|
||||
|
||||
|
||||
Prints the Hamiltonian matrix defined in the space of determinants
|
||||
present in the |EZFIO| directory.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: routine:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`write_integrals_erf.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine routine
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`diagonalize_h`
|
||||
* :c:func:`print_ci_vectors`
|
||||
* :c:func:`print_wf`
|
||||
* :c:func:`write_integrals_erf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`save_erf_two_e_integrals_ao`
|
||||
* :c:func:`save_erf_two_e_integrals_mo`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: routine_e_conv:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`print_e_conv.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine routine_e_conv
|
||||
|
||||
|
||||
routine called by :c:func:`print_e_conv`
|
||||
Produces a Molden file
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_l`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`attachment_numbers_sorted`
|
||||
* :c:data:`attachment_orbitals`
|
||||
* :c:data:`element_name`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_attachment`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_list_shell_aos`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`print_e_conv`
|
||||
* :c:func:`attachement_orb`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_get_iterations_energy_iterations`
|
||||
* :c:func:`ezfio_get_iterations_n_det_iterations`
|
||||
* :c:func:`ezfio_get_iterations_n_iter`
|
||||
* :c:func:`ezfio_get_iterations_pt2_iterations`
|
||||
* :c:func:`isort`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_exc:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`print_detweights.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_exc()
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`print_detweights`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`get_excitation_degree`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: routine_s2:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`truncate_wf.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine routine_s2
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`det_to_configuration`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`weight_configuration`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`truncate_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`save_wavefunction_general`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: routine_save_one_e_dm:
|
||||
@ -208,41 +206,3 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_aux_quantities_data_one_e_dm_beta_ao`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_aux_quantities_data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: run:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`print_hamiltonian.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine run
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`print_energy`
|
||||
* :c:func:`print_hamiltonian`
|
||||
* :c:func:`pt2`
|
||||
* :c:func:`scf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`i_h_j`
|
||||
|
||||
|
||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -381,6 +381,13 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`sscanf_ssds`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: disconnect_from_taskserver:
|
||||
|
||||
@ -414,12 +421,12 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
Disconnect from the task server
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:func:`sscanf_ss`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: end_parallel_job:
|
||||
@ -439,8 +446,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`zmq_context`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
@ -450,6 +457,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:func:`h_s2_u_0_nstates_zmq`
|
||||
* :c:func:`h_u_0_nstates_zmq`
|
||||
* :c:func:`zmq_pt2`
|
||||
* :c:func:`zmq_selection`
|
||||
|
||||
@ -555,6 +563,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:func:`ao_two_e_integrals_erf_in_map_slave`
|
||||
* :c:func:`ao_two_e_integrals_in_map_slave`
|
||||
* :c:func:`davidson_csf_run_slave`
|
||||
* :c:func:`davidson_nos2_run_slave`
|
||||
* :c:func:`davidson_run_slave`
|
||||
* :c:func:`run_pt2_slave_large`
|
||||
* :c:func:`run_pt2_slave_small`
|
||||
@ -627,6 +637,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:func:`ao_two_e_integrals_erf_in_map_slave`
|
||||
* :c:func:`ao_two_e_integrals_in_map_collector`
|
||||
* :c:func:`ao_two_e_integrals_in_map_slave`
|
||||
* :c:func:`davidson_csf_run_slave`
|
||||
* :c:func:`davidson_nos2_run_slave`
|
||||
* :c:func:`davidson_run_slave`
|
||||
* :c:func:`end_parallel_job`
|
||||
* :c:func:`pt2_collector`
|
||||
@ -655,6 +667,13 @@ Subroutines / functions
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`sscanf_sd`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_tasks_from_taskserver:
|
||||
|
||||
@ -693,9 +712,9 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
* :c:data:`zmq_context`
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
@ -705,6 +724,7 @@ Subroutines / functions
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:func:`h_s2_u_0_nstates_zmq`
|
||||
* :c:func:`h_u_0_nstates_zmq`
|
||||
* :c:func:`zmq_pt2`
|
||||
* :c:func:`zmq_selection`
|
||||
|
||||
@ -735,8 +755,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
* :c:data:`zmq_context`
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
@ -765,8 +785,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`qp_run_address`
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
* :c:data:`zmq_context`
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
@ -795,8 +815,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
* :c:data:`zmq_context`
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
@ -824,8 +844,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
* :c:data:`zmq_context`
|
||||
* :c:data:`zmq_socket_pull_tcp_address`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
@ -1185,8 +1205,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_get8_ivector:
|
||||
@ -1206,8 +1226,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_get_dmatrix:
|
||||
@ -1227,8 +1247,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_get_dvector:
|
||||
@ -1248,8 +1268,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_get_i8matrix:
|
||||
@ -1269,8 +1289,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_get_imatrix:
|
||||
@ -1290,8 +1310,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_get_int:
|
||||
@ -1311,8 +1331,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_get_int_nompi:
|
||||
@ -1352,8 +1372,8 @@ Subroutines / functions
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: zmq_port:
|
||||
|
||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -72,9 +72,13 @@ cisd
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`c0_weight`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
@ -50,15 +50,20 @@ fci
|
||||
|
||||
* :c:data:`do_pt2`
|
||||
* :c:data:`is_zmq_slave`
|
||||
* :c:data:`json_int_fmt`
|
||||
* :c:data:`json_unit`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`pt2_min_parallel_tasks`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`json_close`
|
||||
* :c:func:`run_cipsi`
|
||||
* :c:func:`run_slave_cipsi`
|
||||
* :c:func:`run_stochastic_cipsi`
|
||||
@ -72,18 +77,19 @@ fci
|
||||
* :c:data:`ci_electronic_energy`
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`ci_electronic_energy`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`c0_weight`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_configuration`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
* :c:data:`pt2_match_weight`
|
||||
|
||||
@ -24,6 +24,7 @@ four_idx_transform
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`do_mo_cholesky`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
|
||||
@ -46,10 +46,18 @@ pt2
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
* :c:data:`pt2_match_weight`
|
||||
* :c:data:`pt2_overlap`
|
||||
* :c:data:`pt2_stoch_istate`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
* :c:data:`selection_weight`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson_pt2`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
* :c:data:`variance_match_weight`
|
||||
|
||||
@ -30,7 +30,6 @@ rs_ks_scf
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`check_coherence_functional`
|
||||
* :c:func:`create_guess`
|
||||
* :c:func:`orthonormalize_mos`
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
|
||||
@ -25,6 +25,7 @@ save_natorb
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
@ -58,5 +58,9 @@ scf
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
|
||||
@ -2,6 +2,7 @@ open Qputils;;
|
||||
open Qptypes;;
|
||||
|
||||
include Input_ao_basis;;
|
||||
include Input_ao_extra_basis;;
|
||||
include Input_bitmasks;;
|
||||
include Input_determinants_by_hand;;
|
||||
include Input_electrons;;
|
||||
|
||||
104
plugins/local/ao_extra_basis/EZFIO.cfg
Normal file
104
plugins/local/ao_extra_basis/EZFIO.cfg
Normal file
@ -0,0 +1,104 @@
|
||||
[ao_extra_basis]
|
||||
type: character*(256)
|
||||
doc: Name of the |ao_extra| basis set
|
||||
interface: ezfio
|
||||
|
||||
[ao_extra_only_1s]
|
||||
type: logical
|
||||
doc: If |true|, you know that the additional AO basis is built only with 1s functions
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
default: true
|
||||
|
||||
[ao_extra_num]
|
||||
type: integer
|
||||
doc: Number of |ao_extras|
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_prim_num]
|
||||
type: integer
|
||||
doc: Number of primitives per |ao_extra|
|
||||
size: (ao_extra_basis.ao_extra_num)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_prim_num_max]
|
||||
type: integer
|
||||
doc: Maximum number of primitives
|
||||
default: =maxval(ao_extra_basis.ao_extra_prim_num)
|
||||
interface: ezfio
|
||||
|
||||
[ao_extra_nucl]
|
||||
type: integer
|
||||
doc: Index of the nucleus on which the |ao_extra| is centered
|
||||
size: (ao_extra_basis.ao_extra_num)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_power]
|
||||
type: integer
|
||||
doc: Powers of x, y and z for each |ao_extra|
|
||||
size: (ao_extra_basis.ao_extra_num,3)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_coef]
|
||||
type: double precision
|
||||
doc: Primitive coefficients, read from input. Those should not be used directly, as the MOs are expressed on the basis of **normalized** ao_extras.
|
||||
size: (ao_extra_basis.ao_extra_num,ao_extra_basis.ao_extra_prim_num_max)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_expo]
|
||||
type: double precision
|
||||
doc: Exponents for each primitive of each |ao_extra|
|
||||
size: (ao_extra_basis.ao_extra_num,ao_extra_basis.ao_extra_prim_num_max)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_md5]
|
||||
type: character*(32)
|
||||
doc: MD5 key, specific of the |ao_extra| basis
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_cartesian]
|
||||
type: logical
|
||||
doc: If |true|, use |ao_extras| in Cartesian coordinates (6d,10f,...)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
default: false
|
||||
|
||||
[ao_extra_normalized]
|
||||
type: logical
|
||||
doc: Use normalized basis functions
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
default: true
|
||||
|
||||
[primitives_normalized_extra]
|
||||
type: logical
|
||||
doc: Use normalized primitive functions
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
default: true
|
||||
|
||||
[ao_extra_expo_im]
|
||||
type: double precision
|
||||
doc: imag part for Exponents for each primitive of each cGTOs |ao_extra|
|
||||
size: (ao_extra_basis.ao_extra_num,ao_extra_basis.ao_extra_prim_num_max)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_expo_pw]
|
||||
type: double precision
|
||||
doc: plane wave part for each primitive GTOs |ao_extra|
|
||||
size: (3,ao_extra_basis.ao_extra_num,ao_extra_basis.ao_extra_prim_num_max)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_expo_phase]
|
||||
type: double precision
|
||||
doc: phase shift for each primitive GTOs |ao_extra|
|
||||
size: (3,ao_extra_basis.ao_extra_num,ao_extra_basis.ao_extra_prim_num_max)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_one_e_dm]
|
||||
type: double precision
|
||||
doc: reduced density matrix on the ao extra basis
|
||||
size: (ao_extra_basis.ao_extra_num,ao_extra_basis.ao_extra_num)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[ao_extra_center]
|
||||
type: double precision
|
||||
doc: shift with which the atoms are shifted to mimick p functions
|
||||
interface: ezfio
|
||||
|
||||
4
plugins/local/ao_extra_basis/LiH.xyz
Normal file
4
plugins/local/ao_extra_basis/LiH.xyz
Normal file
@ -0,0 +1,4 @@
|
||||
2
|
||||
|
||||
H 0. 0. 0.
|
||||
Li 0. 0. 1.0
|
||||
3
plugins/local/ao_extra_basis/NEED
Normal file
3
plugins/local/ao_extra_basis/NEED
Normal file
@ -0,0 +1,3 @@
|
||||
extra_nuclei
|
||||
basis
|
||||
ao_basis
|
||||
15
plugins/local/ao_extra_basis/README.rst
Normal file
15
plugins/local/ao_extra_basis/README.rst
Normal file
@ -0,0 +1,15 @@
|
||||
===========
|
||||
extra_basis
|
||||
===========
|
||||
|
||||
Plugin to handle an extra basis, which is attached to the extra_nuclei.
|
||||
It is essentially a duplication of all important quantities (coefficients, exponents and so on) of the usual |AO| basis.
|
||||
|
||||
An interesting feature is the possibility to fit any basis made at most with "p" functions onto a purely "s" basis.
|
||||
This is done with the various scripts here:
|
||||
|
||||
- qp_fit_1s_basis : script that creates an |EZFIO| folder corresponding to an .xyz file and a basis fitted with only "s" functions
|
||||
- qp_add_extra_fit_system : script that takes as input an |EZFIO| folder and an .xyz file and add an extra_basis and extra_nuclei with a 1s fitted basis
|
||||
|
||||
Ex:
|
||||
qp_add_extra_fit_system LiH.ezfio/ h2o.xyz # takes the EZFIO folder "LiH.ezfio" and creates all necessary additional basis and nuclei based on h2o.xyz, but only with 1s functions.
|
||||
325
plugins/local/ao_extra_basis/aos.irp.f
Normal file
325
plugins/local/ao_extra_basis/aos.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,325 @@
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, ao_extra_prim_num_max ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Max number of primitives.
|
||||
END_DOC
|
||||
ao_extra_prim_num_max = maxval(ao_extra_prim_num)
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, ao_extra_shell, (ao_extra_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Index of the shell to which the ao_extra corresponds
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i, j, k, n
|
||||
k=0
|
||||
do i=1,shell_num
|
||||
n = shell_ang_mom(i)+1
|
||||
do j=1,(n*(n+1))/2
|
||||
k = k+1
|
||||
ao_extra_shell(k) = i
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, ao_extra_first_of_shell, (shell_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Index of the shell to which the ao_extra corresponds
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i, j, k, n
|
||||
k=1
|
||||
do i=1,shell_num
|
||||
ao_extra_first_of_shell(i) = k
|
||||
n = shell_ang_mom(i)+1
|
||||
k = k+(n*(n+1))/2
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_extra_coef_normalized, (ao_extra_num,ao_extra_prim_num_max) ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_extra_coef_normalization_factor, (ao_extra_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Coefficients including the |ao_extra| normalization
|
||||
END_DOC
|
||||
double precision :: norm,overlap_x,overlap_y,overlap_z,C_A(3), c
|
||||
integer :: l, powA(3), nz
|
||||
integer :: i,j,k
|
||||
nz=100
|
||||
C_A(1) = 0.d0
|
||||
C_A(2) = 0.d0
|
||||
C_A(3) = 0.d0
|
||||
ao_extra_coef_normalized = 0.d0
|
||||
|
||||
do i=1,ao_extra_num
|
||||
|
||||
! powA(1) = ao_extra_power(i,1) + ao_extra_power(i,2) + ao_extra_power(i,3)
|
||||
! powA(2) = 0
|
||||
! powA(3) = 0
|
||||
powA(1) = ao_extra_power(i,1)
|
||||
powA(2) = ao_extra_power(i,2)
|
||||
powA(3) = ao_extra_power(i,3)
|
||||
|
||||
! Normalization of the primitives
|
||||
if (primitives_normalized_extra) then
|
||||
do j=1,ao_extra_prim_num(i)
|
||||
call overlap_gaussian_xyz(C_A,C_A,ao_extra_expo(i,j),ao_extra_expo(i,j), &
|
||||
powA,powA,overlap_x,overlap_y,overlap_z,norm,nz)
|
||||
ao_extra_coef_normalized(i,j) = ao_extra_coef(i,j)/dsqrt(norm)
|
||||
enddo
|
||||
else
|
||||
do j=1,ao_extra_prim_num(i)
|
||||
ao_extra_coef_normalized(i,j) = ao_extra_coef(i,j)
|
||||
enddo
|
||||
endif
|
||||
|
||||
! Normalization of the contracted basis functions
|
||||
if (ao_extra_normalized) then
|
||||
norm = 0.d0
|
||||
do j=1,ao_extra_prim_num(i)
|
||||
do k=1,ao_extra_prim_num(i)
|
||||
call overlap_gaussian_xyz(C_A,C_A,ao_extra_expo(i,j),ao_extra_expo(i,k),powA,powA,overlap_x,overlap_y,overlap_z,c,nz)
|
||||
norm = norm+c*ao_extra_coef_normalized(i,j)*ao_extra_coef_normalized(i,k)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
ao_extra_coef_normalization_factor(i) = 1.d0/dsqrt(norm)
|
||||
else
|
||||
ao_extra_coef_normalization_factor(i) = 1.d0
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_extra_coef_normalized_ordered, (ao_extra_num,ao_extra_prim_num_max) ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_extra_expo_ordered, (ao_extra_num,ao_extra_prim_num_max) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Sorted primitives to accelerate 4 index |MO| transformation
|
||||
END_DOC
|
||||
|
||||
integer :: iorder(ao_extra_prim_num_max)
|
||||
double precision :: d(ao_extra_prim_num_max,2)
|
||||
integer :: i,j
|
||||
do i=1,ao_extra_num
|
||||
do j=1,ao_extra_prim_num(i)
|
||||
iorder(j) = j
|
||||
d(j,1) = ao_extra_expo(i,j)
|
||||
d(j,2) = ao_extra_coef_normalized(i,j)
|
||||
enddo
|
||||
call dsort(d(1,1),iorder,ao_extra_prim_num(i))
|
||||
call dset_order(d(1,2),iorder,ao_extra_prim_num(i))
|
||||
do j=1,ao_extra_prim_num(i)
|
||||
ao_extra_expo_ordered(i,j) = d(j,1)
|
||||
ao_extra_coef_normalized_ordered(i,j) = d(j,2)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_extra_coef_normalized_ordered_transp, (ao_extra_prim_num_max,ao_extra_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Transposed :c:data:`ao_extra_coef_normalized_ordered`
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i,j
|
||||
do j=1, ao_extra_num
|
||||
do i=1, ao_extra_prim_num_max
|
||||
ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(i,j) = ao_extra_coef_normalized_ordered(j,i)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_extra_expo_ordered_transp, (ao_extra_prim_num_max,ao_extra_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Transposed :c:data:`ao_extra_expo_ordered`
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i,j
|
||||
do j=1, ao_extra_num
|
||||
do i=1, ao_extra_prim_num_max
|
||||
ao_extra_expo_ordered_transp(i,j) = ao_extra_expo_ordered(j,i)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, ao_extra_l, (ao_extra_num) ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, ao_extra_l_max ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ character*(128), ao_extra_l_char, (ao_extra_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! :math:`l` value of the |ao_extra|: :math`a+b+c` in :math:`x^a y^b z^c`
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i
|
||||
do i=1,ao_extra_num
|
||||
ao_extra_l(i) = ao_extra_power(i,1) + ao_extra_power(i,2) + ao_extra_power(i,3)
|
||||
ao_extra_l_char(i) = l_to_character(ao_extra_l(i))
|
||||
enddo
|
||||
ao_extra_l_max = maxval(ao_extra_l)
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
integer function ao_extra_power_index(nx,ny,nz)
|
||||
implicit none
|
||||
integer, intent(in) :: nx, ny, nz
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Unique index given to a triplet of powers:
|
||||
!
|
||||
! :math:`\frac{1}{2} (l-n_x) (l-n_x+1) + n_z + 1`
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: l
|
||||
l = nx + ny + nz
|
||||
ao_extra_power_index = ((l-nx)*(l-nx+1))/2 + nz + 1
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, Nucl_N_ao_extras, (extra_nucl_num)]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, N_ao_extras_max ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Number of |ao_extras| per atom
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i
|
||||
Nucl_N_ao_extras = 0
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
Nucl_N_ao_extras(ao_extra_nucl(i)) +=1
|
||||
enddo
|
||||
N_ao_extras_max = maxval(Nucl_N_ao_extras)
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, Nucl_ao_extras, (extra_nucl_num,N_ao_extras_max)]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! List of |ao_extras| centered on each atom
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i
|
||||
integer, allocatable :: nucl_tmp(:)
|
||||
allocate(nucl_tmp(nucl_num))
|
||||
nucl_tmp = 0
|
||||
Nucl_ao_extras = 0
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
nucl_tmp(ao_extra_nucl(i))+=1
|
||||
Nucl_ao_extras(ao_extra_nucl(i),nucl_tmp(ao_extra_nucl(i))) = i
|
||||
enddo
|
||||
deallocate(nucl_tmp)
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, Nucl_list_shell_ao_extras, (extra_nucl_num,N_ao_extras_max)]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, Nucl_num_shell_ao_extras, (nucl_num)]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j,k
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Index of the shell type |ao_extras| and of the corresponding |ao_extras|
|
||||
! By convention, for p,d,f and g |ao_extras|, we take the index
|
||||
! of the |ao_extra| with the the corresponding power in the x axis
|
||||
END_DOC
|
||||
do i = 1, extra_nucl_num
|
||||
Nucl_num_shell_ao_extras(i) = 0
|
||||
do j = 1, Nucl_N_ao_extras(i)
|
||||
if (ao_extra_power(Nucl_ao_extras(i,j),1) == ao_extra_l(Nucl_ao_extras(i,j))) then
|
||||
Nucl_num_shell_ao_extras(i)+=1
|
||||
Nucl_list_shell_ao_extras(i,Nucl_num_shell_ao_extras(i))=Nucl_ao_extras(i,j)
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ character*(4), ao_extra_l_char_space, (ao_extra_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Converts an l value to a string
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i
|
||||
character*(4) :: give_ao_extra_character_space
|
||||
do i=1,ao_extra_num
|
||||
|
||||
if(ao_extra_l(i)==0)then
|
||||
! S type ao_extra
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'S '
|
||||
elseif(ao_extra_l(i) == 1)then
|
||||
! P type ao_extra
|
||||
if(ao_extra_power(i,1)==1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'X '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'Y '
|
||||
else
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'Z '
|
||||
endif
|
||||
elseif(ao_extra_l(i) == 2)then
|
||||
! D type ao_extra
|
||||
if(ao_extra_power(i,1)==2)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XX '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 2)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YY '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 2)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'ZZ '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,1) == 1 .and. ao_extra_power(i,2) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XY '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,1) == 1 .and. ao_extra_power(i,3) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XZ '
|
||||
else
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YZ '
|
||||
endif
|
||||
elseif(ao_extra_l(i) == 3)then
|
||||
! F type ao_extra
|
||||
if(ao_extra_power(i,1)==3)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XXX '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 3)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YYY '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 3)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'ZZZ '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,1) == 2 .and. ao_extra_power(i,2) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XXY '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,1) == 2 .and. ao_extra_power(i,3) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XXZ '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 2 .and. ao_extra_power(i,1) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YYX '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 2 .and. ao_extra_power(i,3) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YYZ '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 2 .and. ao_extra_power(i,1) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'ZZX '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 2 .and. ao_extra_power(i,2) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'ZZY '
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 1 .and. ao_extra_power(i,2) == 1 .and. ao_extra_power(i,3) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XYZ '
|
||||
endif
|
||||
elseif(ao_extra_l(i) == 4)then
|
||||
! G type ao_extra
|
||||
if(ao_extra_power(i,1)==4)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XXXX'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 4)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YYYY'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 4)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'ZZZZ'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,1) == 3 .and. ao_extra_power(i,2) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XXXY'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,1) == 3 .and. ao_extra_power(i,3) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XXXZ'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 3 .and. ao_extra_power(i,1) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YYYX'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 3 .and. ao_extra_power(i,3) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YYYZ'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 3 .and. ao_extra_power(i,1) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'ZZZX'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 3 .and. ao_extra_power(i,2) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'ZZZY'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,1) == 2 .and. ao_extra_power(i,2) == 2)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XXYY'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 2 .and. ao_extra_power(i,3) == 2)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YYZZ'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,1) == 2 .and. ao_extra_power(i,2) == 1 .and. ao_extra_power(i,3) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'XXYZ'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,2) == 2 .and. ao_extra_power(i,1) == 1 .and. ao_extra_power(i,3) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'YYXZ'
|
||||
elseif(ao_extra_power(i,3) == 2 .and. ao_extra_power(i,1) == 1 .and. ao_extra_power(i,2) == 1)then
|
||||
give_ao_extra_character_space = 'ZZXY'
|
||||
endif
|
||||
endif
|
||||
ao_extra_l_char_space(i) = give_ao_extra_character_space
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
68
plugins/local/ao_extra_basis/aos_transp.irp.f
Normal file
68
plugins/local/ao_extra_basis/aos_transp.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,68 @@
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, Nucl_ao_extras_transposed, (N_ao_extras_max,nucl_num)]
|
||||
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! List of ao_extras attached on each atom
|
||||
END_DOC
|
||||
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i
|
||||
integer, allocatable :: nucl_tmp(:)
|
||||
|
||||
allocate(nucl_tmp(nucl_num))
|
||||
nucl_tmp = 0
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
nucl_tmp(ao_extra_nucl(i)) += 1
|
||||
Nucl_ao_extras_transposed(nucl_tmp(ao_extra_nucl(i)),ao_extra_nucl(i)) = i
|
||||
enddo
|
||||
deallocate(nucl_tmp)
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [double precision, ao_extra_expo_ordered_transp_per_nucl, (ao_extra_prim_num_max,N_ao_extras_max,nucl_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j,k,l
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
do j = 1,Nucl_N_ao_extras(i)
|
||||
k = Nucl_ao_extras_transposed(j,i)
|
||||
do l = 1, ao_extra_prim_num(k)
|
||||
ao_extra_expo_ordered_transp_per_nucl(l,j,i) = ao_extra_expo_ordered_transp(l,k)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, ao_extra_power_ordered_transp_per_nucl, (3,N_ao_extras_max,nucl_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j,k,l
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
do j = 1,Nucl_N_ao_extras(i)
|
||||
k = Nucl_ao_extras_transposed(j,i)
|
||||
do l = 1, 3
|
||||
ao_extra_power_ordered_transp_per_nucl(l,j,i) = ao_extra_power(k,l)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_extra_coef_normalized_ordered_transp_per_nucl, (ao_extra_prim_num_max,N_ao_extras_max,nucl_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j,k,l
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
do j = 1,Nucl_N_ao_extras(i)
|
||||
k = Nucl_ao_extras_transposed(j,i)
|
||||
do l = 1, ao_extra_prim_num(k)
|
||||
ao_extra_coef_normalized_ordered_transp_per_nucl(l,j,i) = ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(l,k)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
19
plugins/local/ao_extra_basis/dimensions_integrals.irp.f
Normal file
19
plugins/local/ao_extra_basis/dimensions_integrals.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,19 @@
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, n_pt_max_extra_basis_integrals ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, n_pt_max_extra_basis_i_x]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Number of points used in the numerical integrations.
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: n_pt_sup
|
||||
integer :: prim_power_l_max
|
||||
include 'utils/constants.include.F'
|
||||
prim_power_l_max = maxval(ao_extra_power)
|
||||
n_pt_max_extra_basis_integrals = 24 * prim_power_l_max + 4
|
||||
n_pt_max_extra_basis_i_x = 8 * prim_power_l_max
|
||||
ASSERT (n_pt_max_extra_basis_i_x-1 <= max_dim)
|
||||
if (n_pt_max_extra_basis_i_x-1 > max_dim) then
|
||||
print *, 'Increase max_dim in utils/constants.include.F to ', n_pt_max_extra_basis_i_x-1
|
||||
stop 1
|
||||
endif
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
16
plugins/local/ao_extra_basis/extra_basis.irp.f
Normal file
16
plugins/local/ao_extra_basis/extra_basis.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,16 @@
|
||||
program extra_basis
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! TODO : Put the documentation of the program here
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i
|
||||
print*,'extra_nucl_num = ',extra_nucl_num
|
||||
do i = 1, extra_nucl_num
|
||||
print*,'i = ',i
|
||||
print*,'extra_nucl_label = ',extra_nucl_label(i)
|
||||
print*,'extra_nucl_charge = ',extra_nucl_charge(i)
|
||||
print*,'extra_nucl_coord = '
|
||||
print*,extra_nucl_coord(i,1:3)
|
||||
enddo
|
||||
print*,ao_extra_num
|
||||
end
|
||||
41
plugins/local/ao_extra_basis/fit_1s_basis.irp.f
Normal file
41
plugins/local/ao_extra_basis/fit_1s_basis.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,41 @@
|
||||
program fit_1s_basis
|
||||
implicit none
|
||||
provide lmax_too_big
|
||||
integer :: i,j
|
||||
print*,'////////////////////////////////////////////////////'
|
||||
print*,'////////////////////////////////////////////////////'
|
||||
print*,'Fitting the original basis set on uncontracted s only functions '
|
||||
print*,'WARNING :: works for now with only P functions at most !!'
|
||||
print*,'WARNING :: otherwise it will stop '
|
||||
print*,'Writting the results in the extra_nuclei and ao_extra_basis folders of EZFIO'
|
||||
print*,'New number of atomic functions : '
|
||||
print*,'n_func_tot = ',n_func_tot
|
||||
|
||||
print*,'extra_fictious_nucl = ',extra_fictious_nucl
|
||||
do i = 1, extra_fictious_nucl
|
||||
print*,list_fict_nucl(i)
|
||||
enddo
|
||||
print*,''
|
||||
print*,''
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
print*,list_real_nucl(i)
|
||||
enddo
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_num(new_nucl_num)
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_fictious_num(extra_fictious_nucl)
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_real_num(nucl_num)
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_fictious_list(list_fict_nucl)
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_real_list(list_real_nucl)
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_real_fictious_list(extra_nucl_real_fictious_list_prov)
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_charge(new_nucl_charge_1s)
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_coord(new_nucl_coord_1s)
|
||||
call ezfio_set_extra_nuclei_extra_nucl_label(new_nucl_label_1s)
|
||||
!
|
||||
call ezfio_set_ao_extra_basis_ao_extra_num(n_func_tot)
|
||||
call ezfio_set_ao_extra_basis_ao_extra_center(ao_extra_center)
|
||||
call ezfio_set_ao_extra_basis_ao_extra_nucl(new_ao_nucl_1s)
|
||||
call ezfio_set_ao_extra_basis_ao_extra_prim_num(new_ao_prim_num_1s)
|
||||
call ezfio_set_ao_extra_basis_ao_extra_coef(new_ao_coef_1s)
|
||||
call ezfio_set_ao_extra_basis_ao_extra_expo(new_ao_expo_1s)
|
||||
call ezfio_set_ao_extra_basis_ao_extra_power(new_ao_power_1s)
|
||||
end
|
||||
|
||||
7
plugins/local/ao_extra_basis/h2o.xyz
Normal file
7
plugins/local/ao_extra_basis/h2o.xyz
Normal file
@ -0,0 +1,7 @@
|
||||
3
|
||||
|
||||
O 0.000000 -0.399441 3.000000
|
||||
H 0.761232 0.199721 3.000000
|
||||
H -0.761232 0.199721 3.000000
|
||||
|
||||
|
||||
23
plugins/local/ao_extra_basis/install
Executable file
23
plugins/local/ao_extra_basis/install
Executable file
@ -0,0 +1,23 @@
|
||||
#!/bin/bash
|
||||
|
||||
# Check if the QP_ROOT environment variable is set.
|
||||
if [[ -z ${QP_ROOT} ]]
|
||||
then
|
||||
print "The QP_ROOT environment variable is not set."
|
||||
print "Please reload the quantum_package.rc file."
|
||||
exit -1
|
||||
fi
|
||||
|
||||
# Get the absolute path of the current directory.
|
||||
currdir=${PWD}
|
||||
|
||||
# list of the scripts to be used by the module
|
||||
scripts_list="qp_copy_extra_basis qp_add_extra_fit_system qp_copy_extra_basis_to_usual_basis qp_fit_1s_basis"
|
||||
|
||||
# Make a symbolic link for all scripts to be used in the ${QP_ROOT}/scripts/
|
||||
# directory.
|
||||
for i in $scripts_list
|
||||
do
|
||||
ln --symbolic ${currdir}/$i ${QP_ROOT}/scripts/
|
||||
done
|
||||
|
||||
266
plugins/local/ao_extra_basis/prov_fit_1s.irp.f
Normal file
266
plugins/local/ao_extra_basis/prov_fit_1s.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,266 @@
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_extra_center]
|
||||
implicit none
|
||||
ao_extra_center = 0.01d0
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, n_func_tot]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! n_func_tot :: total number of functions in the fitted basis set
|
||||
!
|
||||
! returned in an uncontracted way
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i,prefact
|
||||
n_func_tot = 0
|
||||
print*,'n_func_tot '
|
||||
do i = 1, ao_num
|
||||
if(ao_l(i) == 0)then
|
||||
prefact = 1 ! s functions
|
||||
else
|
||||
! p functions are fitted with 2 functions
|
||||
! d functions are fitted with 4 functions etc ...
|
||||
prefact=2*ao_l(i)
|
||||
endif
|
||||
n_func_tot += prefact * ao_prim_num(i)
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, n_prim_tot_orig]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i
|
||||
n_prim_tot_orig = 0
|
||||
do i = 1, ao_num
|
||||
n_prim_tot_orig += ao_prim_num(i)
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ logical, lmax_too_big]
|
||||
implicit none
|
||||
if (ao_l_max.gt.1)then
|
||||
lmax_too_big = .True.
|
||||
else
|
||||
lmax_too_big = .False.
|
||||
endif
|
||||
if(lmax_too_big)then
|
||||
print*,'STOPPING !! lmax is larger than 1 !'
|
||||
print*,'Cannot yet fit with 1s functions ...'
|
||||
stop
|
||||
endif
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, n_2p_func_orig]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, n_2p_func_tot]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! n_2p_func_orig :: number of 2p functions in the original basis
|
||||
!
|
||||
! n_2p_func_tot :: total number of p functions in the fitted basis
|
||||
END_DOC
|
||||
n_2p_func_orig= 0
|
||||
n_2p_func_tot = 0
|
||||
do i = 1, ao_num
|
||||
if(ao_l(i)==1)then
|
||||
n_2p_func_orig+= 1
|
||||
n_2p_func_tot += ao_prim_num(i) * 2
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
print*,'n_2p_func_tot = ',n_2p_func_tot
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, list_2p_functions, (n_2p_func_orig)]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! list of 2p functions in the original basis
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i,j
|
||||
j=0
|
||||
do i = 1, ao_num
|
||||
if(ao_l(i)==1)then
|
||||
j+=1
|
||||
list_2p_functions(j) = i
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, extra_fictious_nucl]
|
||||
implicit none
|
||||
extra_fictious_nucl = n_2p_func_tot
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, new_nucl_num]
|
||||
implicit none
|
||||
new_nucl_num = nucl_num + n_2p_func_tot
|
||||
print*,'new_nucl_num = ',new_nucl_num
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ character*(32), new_nucl_label_1s , (new_nucl_num) ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, list_real_nucl, (nucl_num) ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, list_fict_nucl, (extra_fictious_nucl) ]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
new_nucl_label_1s(i) = nucl_label(i)
|
||||
list_real_nucl(i) = i
|
||||
enddo
|
||||
j=0
|
||||
do i = nucl_num+1,new_nucl_num
|
||||
j+=1
|
||||
new_nucl_label_1s(i) = "X"
|
||||
list_fict_nucl(j) = i
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, new_nucl_coord_1s, (new_nucl_num,3)]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
do i = 1, new_nucl_num
|
||||
new_nucl_coord_1s(i,1:3) = new_nucl_coord_1s_transp(1:3,i)
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, new_nucl_coord_1s_transp, (3,new_nucl_num)]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ double precision, new_nucl_charge_1s, (new_nucl_num)]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, extra_nucl_real_fictious_list_prov, (extra_fictious_nucl)]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! the real atoms are located in the first nucl_num entries
|
||||
!
|
||||
! then the fictious atoms are located after
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i,ii,j,i_ao,k,n_ao
|
||||
integer :: return_xyz_int,power(3),good_i
|
||||
new_nucl_charge_1s = 0.d0
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
new_nucl_coord_1s_transp(1:3,i) = nucl_coord_transp(1:3,i)
|
||||
new_nucl_charge_1s(i) = nucl_charge(i)
|
||||
enddo
|
||||
k = nucl_num
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
do ii = 1, Nucl_N_Aos(i)
|
||||
i_ao = nucl_aos_transposed(ii,i)
|
||||
if(ao_l(i_ao)==1)then
|
||||
! split the function into 2 s functions
|
||||
! one is centered in R_x + d
|
||||
power(1:3) = ao_power(i_ao,1:3)
|
||||
good_i = return_xyz_int(power)
|
||||
do j = 1, ao_prim_num(i_ao)
|
||||
k+=1
|
||||
new_nucl_coord_1s_transp(1:3,k)= nucl_coord_transp(1:3,i)
|
||||
new_nucl_coord_1s_transp(good_i,k)+= ao_extra_center
|
||||
new_nucl_charge_1s(k) = 0.d0
|
||||
extra_nucl_real_fictious_list_prov(k-nucl_num)=i
|
||||
k+=1
|
||||
! one is centered in R_x - d
|
||||
new_nucl_coord_1s_transp(1:3,k)= nucl_coord_transp(1:3,i)
|
||||
new_nucl_coord_1s_transp(good_i,k)-= ao_extra_center
|
||||
new_nucl_charge_1s(k) = 0.d0
|
||||
extra_nucl_real_fictious_list_prov(k-nucl_num)=i
|
||||
enddo
|
||||
else if(ao_l(i_ao).gt.1)then
|
||||
print*,'WARNING ! Lmax value not implemented yet !'
|
||||
print*,'stopping ...'
|
||||
stop
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, new_n_AOs_max]
|
||||
implicit none
|
||||
new_n_AOs_max = ao_prim_num_max * n_AOs_max
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, new_Nucl_N_Aos, (new_nucl_num)]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, new_nucl_aos_transposed, (new_n_AOs_max,new_nucl_num) ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ double precision, new_ao_expo_1s , (n_func_tot) ]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ integer, new_ao_nucl_1s, (n_func_tot)]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j,ii,i_ao,n_func,n_func_total,n_nucl
|
||||
double precision :: coef
|
||||
n_func_total = 0
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
n_func = 0
|
||||
do ii = 1, Nucl_N_Aos(i)
|
||||
i_ao = nucl_aos_transposed(ii,i)
|
||||
if(ao_l(i_ao)==0)then
|
||||
do j = 1, ao_prim_num(i_ao)
|
||||
coef= ao_expo(i_ao,j)
|
||||
n_func_total += 1
|
||||
n_func +=1
|
||||
new_nucl_aos_transposed(n_func,i) = n_func_total
|
||||
new_ao_expo_1s(n_func_total) = coef
|
||||
new_ao_nucl_1s(n_func_total) = i
|
||||
enddo
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
new_Nucl_N_Aos(i) = n_func
|
||||
enddo
|
||||
n_nucl=nucl_num
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
do ii = 1, Nucl_N_Aos(i)
|
||||
i_ao = nucl_aos_transposed(ii,i)
|
||||
if(ao_l(i_ao)==1)then
|
||||
do j = 1, ao_prim_num(i_ao)
|
||||
coef= ao_expo(i_ao,j)
|
||||
n_func_total+=1
|
||||
n_nucl +=1
|
||||
new_nucl_aos_transposed(1,n_nucl) = n_func_total
|
||||
new_ao_expo_1s(n_func_total) = coef
|
||||
new_Nucl_N_Aos(n_nucl)=1
|
||||
new_ao_nucl_1s(n_func_total) = n_nucl
|
||||
|
||||
n_func_total+=1
|
||||
n_nucl +=1
|
||||
new_nucl_aos_transposed(1,n_nucl) = n_func_total
|
||||
new_ao_expo_1s(n_func_total) = coef
|
||||
new_Nucl_N_Aos(n_nucl)=1
|
||||
new_ao_nucl_1s(n_func_total) = n_nucl
|
||||
enddo
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, new_ao_coef_1s , (n_func_tot) ]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Primitive coefficients, read from input. Those should not be used directly, as the MOs are expressed on the basis of **normalized** AOs.
|
||||
END_DOC
|
||||
do i = 1, n_func_tot
|
||||
new_ao_coef_1s(i) = 1.d0
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ integer, new_ao_prim_num_1s, (n_func_tot)]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i
|
||||
do i = 1, n_func_tot
|
||||
new_ao_prim_num_1s(i) = 1
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [integer, new_ao_power_1s, (n_func_tot,3)]
|
||||
implicit none
|
||||
new_ao_power_1s = 0
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
integer function return_xyz_int(power)
|
||||
implicit none
|
||||
integer,intent(in) :: power(3)
|
||||
if(power(1) == 1 .and. power(2) ==0 .and. power(3) ==0)then
|
||||
return_xyz_int = 1
|
||||
else if (power(2) == 1 .and. power(1) ==0 .and. power(3) ==0)then
|
||||
return_xyz_int = 2
|
||||
else if (power(3) == 1 .and. power(1) ==0 .and. power(1) ==0)then
|
||||
return_xyz_int = 3
|
||||
else
|
||||
return_xyz_int = -1000
|
||||
endif
|
||||
end
|
||||
19
plugins/local/ao_extra_basis/qp_add_extra_fit_system
Executable file
19
plugins/local/ao_extra_basis/qp_add_extra_fit_system
Executable file
@ -0,0 +1,19 @@
|
||||
#!/bin/bash
|
||||
# specify the QP folder
|
||||
QP=$QP_ROOT
|
||||
dir=${QP}
|
||||
# sourcing the quantum_package.rc file
|
||||
. ${QP}/quantum_package.rc
|
||||
# The main EZFIO folder
|
||||
main=${1%/}
|
||||
# The XYZ file containing the geometry of the additional system you want to add
|
||||
extra=${2%.xyz}
|
||||
basis_extra=sto-3g
|
||||
ezfio_extra=${extra}_${basis_extra}_1s
|
||||
echo $ezfio_extra
|
||||
qp_fit_1s_basis $extra $basis_extra
|
||||
qp set_file $ezfio_extra
|
||||
qp run scf | tee ${ezfio_extra}.scf.out
|
||||
qp run save_one_e_dm | tee ${ezfio_extra}.one_rdm.out
|
||||
qp_copy_extra_basis ${ezfio_extra} $main
|
||||
|
||||
67
plugins/local/ao_extra_basis/qp_copy_extra_basis
Executable file
67
plugins/local/ao_extra_basis/qp_copy_extra_basis
Executable file
@ -0,0 +1,67 @@
|
||||
#!/bin/bash
|
||||
# specify the QP folder
|
||||
QP=$QP_ROOT
|
||||
dir=${QP}
|
||||
# sourcing the quantum_package.rc file
|
||||
. ${QP}/quantum_package.rc
|
||||
# script that copy all data from |AO| basis and nuclei of EZFIO_extra to the ao_extra_basis and extra_nuclei of EZFIO_target
|
||||
# use:
|
||||
# qp_copy_extra_basis EZFIO_extra EZFIO_target
|
||||
EZFIO_extra=${1%/}
|
||||
EZFIO_extra=${EZFIO_extra%.xyz}
|
||||
EZFIO_target=${2%/}
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
echo "********** SCRIPT TO COPY DATA FROM EZFIO TO ANOTHER *********"
|
||||
echo "Extracting data from "$EZFIO_extra
|
||||
echo "and Copying data to "$EZFIO_target
|
||||
|
||||
### COPYING ALL DATA FROM $EZFIO_extra/nuclei/ to ${EZFIO_target}/extra_nuclei/
|
||||
echo "COPYING ALL DATA FROM "$EZFIO_extra"/nuclei/ to "${EZFIO_target}"/extra_nuclei/"
|
||||
direxists=false
|
||||
if [ -d ${EZFIO_target}/extra_nuclei/ ] ; then
|
||||
direxists=true
|
||||
echo "The directory extra_nuclei exists"
|
||||
else
|
||||
echo "Creating the directory extra_nuclei "
|
||||
direxists=false
|
||||
mkdir ${EZFIO_target}/extra_nuclei/
|
||||
fi
|
||||
data=`\ls $EZFIO_extra/nuclei/`
|
||||
for i in $data
|
||||
do
|
||||
echo $i
|
||||
newfile=`echo $i | sed 's/nucl/extra_nucl/g' `
|
||||
echo $newfile
|
||||
cp ${EZFIO_extra}/nuclei/$i ${EZFIO_target}/extra_nuclei/$newfile
|
||||
done
|
||||
|
||||
### COPYING ALL DATA FROM $EZFIO_extra/ao_basis/ to ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/
|
||||
direxists=false
|
||||
if [ -d ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/ ] ; then
|
||||
direxists=true
|
||||
echo "The directory exists ao_extra_basis"
|
||||
else
|
||||
echo "Creating the directory ao_extra_basis"
|
||||
direxists=false
|
||||
mkdir ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/
|
||||
fi
|
||||
echo "COPYING ALL DATA FROM "$EZFIO_extra"/ao_basis/ to "${EZFIO_target}"/ao_extra_basis/"
|
||||
data=`\ls $EZFIO_extra/ao_basis/`
|
||||
for i in $data
|
||||
do
|
||||
echo $i
|
||||
newfile=`echo $i | sed 's/ao/ao_extra/g' `
|
||||
echo $newfile
|
||||
cp ${EZFIO_extra}/ao_basis/$i ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/$newfile
|
||||
done
|
||||
i=primitives_normalized
|
||||
newfile=primitives_normalized_extra
|
||||
cp ${EZFIO_extra}/ao_basis/$i ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/$newfile
|
||||
|
||||
echo "COPYING ALL DATA FROM "$EZFIO_extra"/aux_quantities/ to "${EZFIO_target}"/ao_extra_basis/"
|
||||
i=data_one_e_dm_tot_ao.gz
|
||||
newfile=ao_extra_one_e_dm.gz
|
||||
cp ${EZFIO_extra}/aux_quantities/$i ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/$newfile
|
||||
|
||||
57
plugins/local/ao_extra_basis/qp_copy_extra_basis_to_usual_basis
Executable file
57
plugins/local/ao_extra_basis/qp_copy_extra_basis_to_usual_basis
Executable file
@ -0,0 +1,57 @@
|
||||
#!/bin/bash
|
||||
# specify the QP folder
|
||||
# script that copy all data in ao_extra_basis and extra_nuclei and copy it to ao_basis and ao_nuclei
|
||||
QP=$QP_ROOT
|
||||
dir=${QP}
|
||||
# sourcing the quantum_package.rc file
|
||||
. ${QP}/quantum_package.rc
|
||||
EZFIO_extra=${1%/}
|
||||
EZFIO_target=${2%/}
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
echo "********** SCRIPT TO COPY DATA FROM EZFIO TO ANOTHER *********"
|
||||
echo "Extracting data from "$EZFIO_extra
|
||||
echo "and Copying data to "$EZFIO_target
|
||||
|
||||
### COPYING ALL DATA FROM $EZFIO_extra/nuclei/ to ${EZFIO_target}/extra_nuclei/
|
||||
echo "COPYING ALL DATA FROM "$EZFIO_extra"/extra_nuclei/ to "${EZFIO_target}"/nuclei/"
|
||||
direxists=false
|
||||
if [ -d ${EZFIO_target}/extra_nuclei/ ] ; then
|
||||
direxists=true
|
||||
echo "The directory extra_nuclei exists"
|
||||
else
|
||||
echo "PB !!"
|
||||
direxists=false
|
||||
mkdir ${EZFIO_target}/extra_nuclei/
|
||||
fi
|
||||
data=`\ls $EZFIO_extra/extra_nuclei/`
|
||||
for i in $data
|
||||
do
|
||||
echo $i
|
||||
newfile=`echo $i | sed 's/extra_nucl/nucl/g' `
|
||||
echo $newfile
|
||||
cp ${EZFIO_extra}/extra_nuclei/$i ${EZFIO_target}/nuclei/$newfile
|
||||
done
|
||||
|
||||
### COPYING ALL DATA FROM $EZFIO_extra/ao_basis/ to ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/
|
||||
direxists=false
|
||||
if [ -d ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/ ] ; then
|
||||
direxists=true
|
||||
echo "The directory exists ao_extra_basis"
|
||||
else
|
||||
echo "PB !!"
|
||||
direxists=false
|
||||
mkdir ${EZFIO_target}/ao_extra_basis/
|
||||
fi
|
||||
echo "COPYING ALL DATA FROM "$EZFIO_extra"/ao_basis/ to "${EZFIO_target}"/ao_extra_basis/"
|
||||
data=`\ls $EZFIO_extra/ao_extra_basis/`
|
||||
for i in $data
|
||||
do
|
||||
echo $i
|
||||
newfile=`echo $i | sed 's/ao_extra/ao/g' `
|
||||
echo $newfile
|
||||
cp ${EZFIO_extra}/ao_extra_basis/$i ${EZFIO_target}/ao_basis/$newfile
|
||||
done
|
||||
|
||||
|
||||
12
plugins/local/ao_extra_basis/qp_fit_1s_basis
Executable file
12
plugins/local/ao_extra_basis/qp_fit_1s_basis
Executable file
@ -0,0 +1,12 @@
|
||||
#!/bin/bash
|
||||
## Takes as an argument an xyz file and a basis, and fit the AO basis onto an "s" basis only
|
||||
## use:
|
||||
# qp_fit_1s_basis my_xyz_file.xyz basis
|
||||
source ~/qp2/quantum_package.rc
|
||||
input=${1%.xyz}
|
||||
basis=$2
|
||||
ezfio_fit=${input}_${basis}_1s
|
||||
qp create_ezfio -b $basis $input.xyz -o $ezfio_fit
|
||||
# Fitting the original basis on 1s only basis functions
|
||||
qp run fit_1s_basis |tee ${ezfio_fit}.fit_1s.out
|
||||
qp_copy_extra_basis_to_usual_basis $ezfio_fit $ezfio_fit
|
||||
49
plugins/local/ao_extra_basis/transform_basis.irp.f
Normal file
49
plugins/local/ao_extra_basis/transform_basis.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,49 @@
|
||||
subroutine rotate_nuclei(phi,theta,psi,nucl_centers,n_nucl,nucl_centers_after)
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! routine that rotates a set of nuclei according to three axis corresponding to angles phi, theta, psi.
|
||||
END_DOC
|
||||
double precision, intent(in) :: phi,theta,psi
|
||||
double precision, intent(in) :: nucl_centers(3,n_nucl)
|
||||
integer, intent(in) :: n_nucl
|
||||
double precision, intent(out):: nucl_centers_after(3,n_nucl)
|
||||
double precision :: r_mat(3,3)
|
||||
call r_phi_theta_psi_matrix(phi,theta,psi,r_mat)
|
||||
call get_AB_prod(r_mat,3,3,nucl_centers,n_nucl,nucl_centers_after)
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
subroutine r_phi_theta_psi_matrix(phi,theta,psi,r_mat)
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! routine that creates the rotation matrix corresponding to phi,theta,psi
|
||||
!
|
||||
! according to conventions in MDFT code
|
||||
END_DOC
|
||||
double precision, intent(in) :: phi,theta,psi
|
||||
double precision, intent(out):: r_mat(3,3)
|
||||
double precision :: ctheta, stheta
|
||||
double precision :: cphi , sphi
|
||||
double precision :: cpsi , spsi
|
||||
ctheta = dcos(theta)
|
||||
cphi = dcos(phi)
|
||||
cpsi = dcos(psi)
|
||||
|
||||
stheta = dsin(theta)
|
||||
sphi = dsin(phi)
|
||||
spsi = dsin(psi)
|
||||
|
||||
r_mat(1,1) = ctheta*cphi*cpsi-sphi*spsi
|
||||
r_mat(1,2) = -ctheta*cphi*spsi-sphi*cpsi
|
||||
r_mat(1,3) = stheta*cphi
|
||||
|
||||
r_mat(2,1) = ctheta*sphi*cpsi+cphi*spsi
|
||||
r_mat(2,2) = -ctheta*sphi*spsi+cphi*cpsi
|
||||
r_mat(2,3) = stheta*sphi
|
||||
|
||||
r_mat(3,1) = -stheta*cpsi
|
||||
r_mat(3,2) = stheta*spsi
|
||||
r_mat(3,3) = ctheta
|
||||
|
||||
end
|
||||
20
plugins/local/ao_extra_basis/uninstall
Executable file
20
plugins/local/ao_extra_basis/uninstall
Executable file
@ -0,0 +1,20 @@
|
||||
#!/bin/bash
|
||||
|
||||
# Check if the QP_ROOT environment variable is set.
|
||||
if [[ -z ${QP_ROOT} ]]
|
||||
then
|
||||
print "The QP_ROOT environment variable is not set."
|
||||
print "Please reload the quantum_package.rc file."
|
||||
exit -1
|
||||
fi
|
||||
|
||||
# list of the scripts to be used by the module
|
||||
scripts_list="qp_copy_extra_basis qp_add_extra_fit_system qp_copy_extra_basis_to_usual_basis qp_fit_1s_basis"
|
||||
|
||||
# Destroy ONLY the symbolic link for the scripts to be used in the
|
||||
# ${QP_ROOT}/scripts/ directory.
|
||||
for i in $scripts_list
|
||||
do
|
||||
find ${QP_ROOT}/scripts/$i -type l -delete
|
||||
done
|
||||
|
||||
@ -180,4 +180,29 @@
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, extrapolated_on_top, (n_points_final_grid,N_states)]
|
||||
&BEGIN_PROVIDER [ double precision, average_extrapolated_on_top, (N_states)]
|
||||
implicit none
|
||||
double precision :: weight,on_top, on_top_extrap, mu_correction_of_on_top,mu
|
||||
integer :: istate, ipoint
|
||||
extrapolated_on_top = 0.d0
|
||||
average_extrapolated_on_top = 0.d0
|
||||
do istate = 1, N_states
|
||||
do ipoint = 1, n_points_final_grid
|
||||
weight = final_weight_at_r_vector(ipoint)
|
||||
mu = mu_of_r_prov(ipoint,istate)
|
||||
if(mu_of_r_potential == "cas_full")then
|
||||
! You take the on-top of the CAS wave function which is computed with mu(r)
|
||||
on_top = on_top_cas_mu_r(ipoint,istate)
|
||||
else
|
||||
! You take the on-top of the CAS wave function computed separately
|
||||
on_top = total_cas_on_top_density(ipoint,istate)
|
||||
endif
|
||||
! We take the extrapolated on-top pair density
|
||||
on_top_extrap = mu_correction_of_on_top(mu,on_top)
|
||||
extrapolated_on_top(ipoint,istate) = on_top_extrap
|
||||
average_extrapolated_on_top(istate) += on_top_extrap * weight
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
18
plugins/local/basis_correction/print_n2_related_stuff.irp.f
Normal file
18
plugins/local/basis_correction/print_n2_related_stuff.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,18 @@
|
||||
program print_n2_stuffs
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! TODO : Put the documentation of the program here
|
||||
END_DOC
|
||||
read_wf = .True.
|
||||
touch read_wf
|
||||
no_core_density = .True.
|
||||
touch no_core_density
|
||||
call routine
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine routine
|
||||
implicit none
|
||||
print*,'average_extrapolated_on_top = ',average_extrapolated_on_top
|
||||
print*,'average_on_top = ',average_on_top
|
||||
print*,'mu_average_prov = ',mu_average_prov
|
||||
end
|
||||
3
plugins/local/extra_basis_int/NEED
Normal file
3
plugins/local/extra_basis_int/NEED
Normal file
@ -0,0 +1,3 @@
|
||||
ao_extra_basis
|
||||
ao_one_e_ints
|
||||
ao_two_e_ints
|
||||
4
plugins/local/extra_basis_int/README.rst
Normal file
4
plugins/local/extra_basis_int/README.rst
Normal file
@ -0,0 +1,4 @@
|
||||
===============
|
||||
extra_basis_int
|
||||
===============
|
||||
|
||||
189
plugins/local/extra_basis_int/ao_overlap.irp.f
Normal file
189
plugins/local/extra_basis_int/ao_overlap.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,189 @@
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [double precision, ao_extra_overlap , (ao_extra_num, ao_extra_num)]
|
||||
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Overlap between atomic basis functions:
|
||||
!
|
||||
! :math:`\int \chi_i(r) \chi_j(r) dr`
|
||||
END_DOC
|
||||
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i, j, n, l, dim1, power_A(3), power_B(3)
|
||||
double precision :: overlap, overlap_x, overlap_y, overlap_z
|
||||
double precision :: alpha, beta, c
|
||||
double precision :: A_center(3), B_center(3)
|
||||
|
||||
ao_extra_overlap = 0.d0
|
||||
|
||||
dim1=100
|
||||
!$OMP PARALLEL DO SCHEDULE(GUIDED) &
|
||||
!$OMP DEFAULT(NONE) &
|
||||
!$OMP PRIVATE(A_center,B_center,power_A,power_B,&
|
||||
!$OMP overlap_x,overlap_y, overlap_z, overlap, &
|
||||
!$OMP alpha, beta,i,j,n,l,c) &
|
||||
!$OMP SHARED(extra_nucl_coord,ao_extra_power,ao_extra_prim_num, &
|
||||
!$OMP ao_extra_overlap,ao_extra_num,ao_extra_coef_normalized_ordered_transp,ao_extra_nucl, &
|
||||
!$OMP ao_extra_expo_ordered_transp,dim1)
|
||||
do j=1,ao_extra_num
|
||||
A_center(1) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(j), 1 )
|
||||
A_center(2) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(j), 2 )
|
||||
A_center(3) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(j), 3 )
|
||||
power_A(1) = ao_extra_power( j, 1 )
|
||||
power_A(2) = ao_extra_power( j, 2 )
|
||||
power_A(3) = ao_extra_power( j, 3 )
|
||||
do i= 1,ao_extra_num
|
||||
B_center(1) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(i), 1 )
|
||||
B_center(2) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(i), 2 )
|
||||
B_center(3) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(i), 3 )
|
||||
power_B(1) = ao_extra_power( i, 1 )
|
||||
power_B(2) = ao_extra_power( i, 2 )
|
||||
power_B(3) = ao_extra_power( i, 3 )
|
||||
do n = 1,ao_extra_prim_num(j)
|
||||
alpha = ao_extra_expo_ordered_transp(n,j)
|
||||
do l = 1, ao_extra_prim_num(i)
|
||||
beta = ao_extra_expo_ordered_transp(l,i)
|
||||
call overlap_gaussian_xyz(A_center,B_center,alpha,beta,power_A,power_B,overlap_x,overlap_y,overlap_z,overlap,dim1)
|
||||
c = ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(n,j) * ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(l,i)
|
||||
ao_extra_overlap(i,j) += c * overlap
|
||||
if(isnan(ao_extra_overlap(i,j)))then
|
||||
print*,'i,j',i,j
|
||||
print*,'l,n',l,n
|
||||
print*,'c,overlap',c,overlap
|
||||
print*,overlap_x,overlap_y,overlap_z
|
||||
stop
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [double precision, ao_extra_overlap_mixed , (ao_num, ao_extra_num)]
|
||||
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Overlap between atomic basis functions:
|
||||
!
|
||||
! <AO_i|AO_j extra basis>
|
||||
END_DOC
|
||||
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i, j, n, l, dim1, power_A(3), power_B(3)
|
||||
double precision :: overlap, overlap_x, overlap_y, overlap_z
|
||||
double precision :: alpha, beta, c
|
||||
double precision :: A_center(3), B_center(3)
|
||||
|
||||
ao_extra_overlap_mixed = 0.d0
|
||||
|
||||
dim1=100
|
||||
!$OMP PARALLEL DO SCHEDULE(GUIDED) &
|
||||
!$OMP DEFAULT(NONE) &
|
||||
!$OMP PRIVATE(A_center,B_center,power_A,power_B,&
|
||||
!$OMP overlap_x,overlap_y, overlap_z, overlap, &
|
||||
!$OMP alpha, beta,i,j,n,l,c) &
|
||||
!$OMP SHARED(extra_nucl_coord,ao_extra_power,ao_extra_prim_num, &
|
||||
!$OMP ao_extra_overlap_mixed,ao_extra_num,ao_extra_coef_normalized_ordered_transp,ao_extra_nucl, &
|
||||
!$OMP ao_extra_expo_ordered_transp,dim1, &
|
||||
!$OMP nucl_coord,ao_power,ao_prim_num, &
|
||||
!$OMP ao_num,ao_coef_normalized_ordered_transp,ao_nucl, &
|
||||
!$OMP ao_expo_ordered_transp)
|
||||
|
||||
do j=1,ao_extra_num
|
||||
A_center(1) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(j), 1 )
|
||||
A_center(2) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(j), 2 )
|
||||
A_center(3) = extra_nucl_coord( ao_extra_nucl(j), 3 )
|
||||
power_A(1) = ao_extra_power( j, 1 )
|
||||
power_A(2) = ao_extra_power( j, 2 )
|
||||
power_A(3) = ao_extra_power( j, 3 )
|
||||
do i= 1,ao_num
|
||||
B_center(1) = nucl_coord( ao_nucl(i), 1 )
|
||||
B_center(2) = nucl_coord( ao_nucl(i), 2 )
|
||||
B_center(3) = nucl_coord( ao_nucl(i), 3 )
|
||||
power_B(1) = ao_power( i, 1 )
|
||||
power_B(2) = ao_power( i, 2 )
|
||||
power_B(3) = ao_power( i, 3 )
|
||||
do n = 1,ao_extra_prim_num(j)
|
||||
alpha = ao_extra_expo_ordered_transp(n,j)
|
||||
do l = 1, ao_prim_num(i)
|
||||
beta = ao_expo_ordered_transp(l,i)
|
||||
call overlap_gaussian_xyz(A_center,B_center,alpha,beta,power_A,power_B,overlap_x,overlap_y,overlap_z,overlap,dim1)
|
||||
c = ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(n,j) * ao_coef_normalized_ordered_transp(l,i)
|
||||
ao_extra_overlap_mixed(i,j) += c * overlap
|
||||
if(isnan(ao_extra_overlap_mixed(i,j)))then
|
||||
print*,'i,j',i,j
|
||||
print*,'l,n',l,n
|
||||
print*,'c,overlap',c,overlap
|
||||
print*,overlap_x,overlap_y,overlap_z
|
||||
stop
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
subroutine get_ao_mixed_overlap(r_nucl,ao_mixed_overlap)
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! returns the overlap integrals between the AOs and the extra_AOs located at r_nucl
|
||||
END_DOC
|
||||
double precision, intent(in) :: r_nucl(extra_nucl_num,3)
|
||||
double precision, intent(out):: ao_mixed_overlap(ao_extra_num,ao_num)
|
||||
integer :: j,i,l,n, power_A(3), power_B(3), dim1
|
||||
double precision :: A_center(3), B_center(3), alpha, beta
|
||||
double precision :: overlap_x,overlap_y,overlap_z,overlap,c
|
||||
dim1=100
|
||||
ao_mixed_overlap = 0.d0
|
||||
|
||||
!$OMP PARALLEL DO SCHEDULE(GUIDED) &
|
||||
!$OMP DEFAULT(NONE) &
|
||||
!$OMP PRIVATE(A_center,B_center,power_A,power_B,&
|
||||
!$OMP overlap_x,overlap_y, overlap_z, overlap, &
|
||||
!$OMP alpha, beta,i,j,n,l,c) &
|
||||
!$OMP SHARED(r_nucl,ao_extra_power,ao_extra_prim_num, &
|
||||
!$OMP ao_mixed_overlap,ao_extra_num,ao_extra_coef_normalized_ordered_transp,ao_extra_nucl, &
|
||||
!$OMP ao_extra_expo_ordered_transp,dim1, &
|
||||
!$OMP nucl_coord,ao_power,ao_prim_num, &
|
||||
!$OMP ao_num,ao_coef_normalized_ordered_transp,ao_nucl, &
|
||||
!$OMP ao_expo_ordered_transp)
|
||||
do i = 1, ao_num
|
||||
B_center(1) = nucl_coord( ao_nucl(i), 1 )
|
||||
B_center(2) = nucl_coord( ao_nucl(i), 2 )
|
||||
B_center(3) = nucl_coord( ao_nucl(i), 3 )
|
||||
power_B(1) = ao_power( i, 1 )
|
||||
power_B(2) = ao_power( i, 2 )
|
||||
power_B(3) = ao_power( i, 3 )
|
||||
do l = 1, ao_prim_num(i)
|
||||
beta = ao_expo_ordered_transp(l,i)
|
||||
do j=1,ao_extra_num
|
||||
A_center(1) = r_nucl( ao_extra_nucl(j), 1 )
|
||||
A_center(2) = r_nucl( ao_extra_nucl(j), 2 )
|
||||
A_center(3) = r_nucl( ao_extra_nucl(j), 3 )
|
||||
power_A(1) = ao_extra_power( j, 1 )
|
||||
power_A(2) = ao_extra_power( j, 2 )
|
||||
power_A(3) = ao_extra_power( j, 3 )
|
||||
do n = 1,ao_extra_prim_num(j)
|
||||
alpha = ao_extra_expo_ordered_transp(n,j)
|
||||
call overlap_gaussian_xyz(A_center,B_center,alpha,beta,power_A,power_B,overlap_x,overlap_y,overlap_z,overlap,dim1)
|
||||
c = ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(n,j) * ao_coef_normalized_ordered_transp(l,i)
|
||||
ao_mixed_overlap(j,i) += c * overlap
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||
|
||||
|
||||
end
|
||||
124
plugins/local/extra_basis_int/extra_basis_int.irp.f
Normal file
124
plugins/local/extra_basis_int/extra_basis_int.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,124 @@
|
||||
program extra_basis_int
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! TODO : Put the documentation of the program here
|
||||
END_DOC
|
||||
! call test_overlap
|
||||
! call routine_test_pot_ne
|
||||
! call routine_test_pot_ne_mixed
|
||||
! call routine_pot_ne_extra
|
||||
! call routine_test_pot_ne_mixed
|
||||
! call routine_pot_ne
|
||||
call routine_test_pot_ne_extra_mixed
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine test_overlap
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
do j = 1, ao_extra_num
|
||||
write(33,*)ao_extra_overlap(j,i)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine test_overlap_mixed
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision, allocatable :: ao_mixed_overlap(:,:)
|
||||
allocate(ao_mixed_overlap(ao_extra_num,ao_num))
|
||||
call get_ao_mixed_overlap(extra_nucl_coord,ao_mixed_overlap)
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
do j = 1, ao_num
|
||||
write(33,*)dabs(ao_extra_overlap_mixed(j,i)-ao_mixed_overlap(i,j))
|
||||
write(*,*)ao_extra_overlap_mixed(j,i),ao_mixed_overlap(i,j),dabs(ao_extra_overlap_mixed(j,i)-ao_mixed_overlap(i,j))
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine routine_test_pot_ne
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: integral, C_center(3), mu_in
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf_ao_extra
|
||||
C_center(1) = 0.1d0
|
||||
C_center(2) = -0.3d0
|
||||
C_center(3) = 0.8d0
|
||||
mu_in = 1.d10
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
do j = 1, ao_extra_num
|
||||
integral = NAI_pol_mult_erf_ao_extra(i, j, mu_in, C_center)
|
||||
write(33,*)j,i,integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine routine_test_pot_mixed
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: integral, C_center(3), mu_in
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed
|
||||
C_center(1) = 0.1d0
|
||||
C_center(2) = -0.3d0
|
||||
C_center(3) = 0.8d0
|
||||
mu_in = 1.d10
|
||||
do j = 1, ao_num
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
integral = NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed(i, j, mu_in, C_center)
|
||||
write(33,*)integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine routine_pot_ne_extra
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: v_extra_nucl_extra_ao
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
do j = 1, ao_extra_num
|
||||
write(33,*)v_extra_nucl_extra_ao(i,j)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
subroutine routine_pot_ne
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: v_nucl_extra_ao
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
do j = 1, ao_extra_num
|
||||
write(33,*)v_nucl_extra_ao(i,j)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
subroutine routine_test_pot_ne_mixed
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: integral,v_extra_nucl_mixed_ao
|
||||
do j = 1, ao_num
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
integral = v_extra_nucl_mixed_ao(i,j)
|
||||
write(33,*)integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine routine_test_pot_ne_extra_mixed
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: integral,v_nucl_mixed_ao
|
||||
do j = 1, ao_num
|
||||
do i = 1, ao_extra_num
|
||||
integral = v_nucl_mixed_ao(i,j)
|
||||
write(33,*)integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
93
plugins/local/extra_basis_int/pot_ao_ints.irp.f
Normal file
93
plugins/local/extra_basis_int/pot_ao_ints.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,93 @@
|
||||
|
||||
double precision function NAI_pol_mult_erf_ao_extra(i_ao, j_ao, mu_in, C_center)
|
||||
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
!
|
||||
! Computes the following integral :
|
||||
! $\int_{-\infty}^{infty} dr \chi_i(r) \chi_j(r) \frac{\erf(\mu |r - R_C|)}{|r - R_C|}$.
|
||||
!
|
||||
!
|
||||
! where $\chi_i(r)$ AND $\chi_j(r)$ belongs to the extra basis
|
||||
END_DOC
|
||||
|
||||
implicit none
|
||||
integer, intent(in) :: i_ao, j_ao
|
||||
double precision, intent(in) :: mu_in, C_center(3)
|
||||
|
||||
integer :: i, j, num_A, num_B, power_A(3), power_B(3), n_pt_in
|
||||
double precision :: A_center(3), B_center(3), integral, alpha, beta
|
||||
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf
|
||||
|
||||
num_A = ao_extra_nucl(i_ao)
|
||||
power_A(1:3) = ao_extra_power(i_ao,1:3)
|
||||
A_center(1:3) = extra_nucl_coord(num_A,1:3)
|
||||
num_B = ao_extra_nucl(j_ao)
|
||||
power_B(1:3) = ao_extra_power(j_ao,1:3)
|
||||
B_center(1:3) = extra_nucl_coord(num_B,1:3)
|
||||
|
||||
n_pt_in = n_pt_max_extra_basis_integrals
|
||||
|
||||
NAI_pol_mult_erf_ao_extra = 0.d0
|
||||
do i = 1, ao_extra_prim_num(i_ao)
|
||||
alpha = ao_extra_expo_ordered_transp(i,i_ao)
|
||||
do j = 1, ao_extra_prim_num(j_ao)
|
||||
beta = ao_extra_expo_ordered_transp(j,j_ao)
|
||||
|
||||
integral = NAI_pol_mult_erf(A_center, B_center, power_A, power_B, alpha, beta, C_center, n_pt_in,mu_in)
|
||||
|
||||
NAI_pol_mult_erf_ao_extra += integral * ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(j,j_ao) * ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(i,i_ao)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end function NAI_pol_mult_erf_ao_extra
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
double precision function NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed(i_ao, j_ao, mu_in, C_center)
|
||||
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
!
|
||||
! Computes the following integral :
|
||||
! $\int_{-\infty}^{infty} dr \chi_i(r) \chi_j(r) \frac{\erf(\mu |r - R_C|)}{|r - R_C|}$.
|
||||
!
|
||||
!
|
||||
! where $\chi_i(r)$ belongs to the extra basis and $\chi_j(r)$ to the regular basis
|
||||
END_DOC
|
||||
|
||||
implicit none
|
||||
integer, intent(in) :: i_ao, j_ao
|
||||
double precision, intent(in) :: mu_in, C_center(3)
|
||||
|
||||
integer :: i, j, num_A, num_B, power_A(3), power_B(3), n_pt_in
|
||||
double precision :: A_center(3), B_center(3), integral, alpha, beta
|
||||
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf
|
||||
|
||||
! A = chi_i == extra basis
|
||||
num_A = ao_extra_nucl(i_ao)
|
||||
power_A(1:3) = ao_extra_power(i_ao,1:3)
|
||||
A_center(1:3) = extra_nucl_coord(num_A,1:3)
|
||||
! B = chi_j == regular basis
|
||||
num_B = ao_nucl(j_ao)
|
||||
power_B(1:3) = ao_power(j_ao,1:3)
|
||||
B_center(1:3) = nucl_coord(num_B,1:3)
|
||||
|
||||
n_pt_in = max(n_pt_max_integrals,n_pt_max_extra_basis_integrals)
|
||||
|
||||
NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed = 0.d0
|
||||
do i = 1, ao_extra_prim_num(i_ao)
|
||||
alpha = ao_extra_expo_ordered_transp(i,i_ao)
|
||||
do j = 1, ao_prim_num(j_ao)
|
||||
beta = ao_expo_ordered_transp(j,j_ao)
|
||||
|
||||
integral = NAI_pol_mult_erf(A_center, B_center, power_A, power_B, alpha, beta, C_center, n_pt_in,mu_in)
|
||||
|
||||
NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed += integral * ao_coef_normalized_ordered_transp(j,j_ao) * ao_extra_coef_normalized_ordered_transp(i,i_ao)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
115
plugins/local/extra_basis_int/ref_extra_basis.irp.f
Normal file
115
plugins/local/extra_basis_int/ref_extra_basis.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,115 @@
|
||||
program pouet
|
||||
implicit none
|
||||
! call ref_overlap
|
||||
! call ref_pot
|
||||
! call ref_pot_mixed
|
||||
! call routine_pot_ne_extra
|
||||
! call ref_pot_ne_mixed
|
||||
! call ref_pot_ne
|
||||
call ref_pot_ne_extra_mixed
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine ref_overlap
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
do i = 1, ao_num
|
||||
do j = 1, ao_num
|
||||
write(34,*)ao_overlap(j,i)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine ref_pot
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: integral, C_center(3), mu_in
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf_ao
|
||||
C_center(1) = 0.1d0
|
||||
C_center(2) = -0.3d0
|
||||
C_center(3) = 0.8d0
|
||||
mu_in = 1.d10
|
||||
do i = 1, ao_num
|
||||
do j = 1, ao_num
|
||||
integral = NAI_pol_mult_erf_ao(i, j, mu_in, C_center)
|
||||
write(34,*)j,i,integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine ref_pot_mixed
|
||||
implicit none
|
||||
integer ::i,j
|
||||
double precision :: integral, C_center(3), mu_in
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf_ao
|
||||
C_center(1) = 0.1d0
|
||||
C_center(2) = -0.3d0
|
||||
C_center(3) = 0.8d0
|
||||
mu_in = 1.d10
|
||||
do i=1, 5
|
||||
do j = 6, ao_num
|
||||
integral = NAI_pol_mult_erf_ao(i, j, mu_in, C_center)
|
||||
write(34,*)integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine routine_pot_ne_extra
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: v_extra_nucl_extra_ao
|
||||
do i = 1, ao_num
|
||||
do j = 1, ao_num
|
||||
write(34,*)ao_integrals_n_e(i,j)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
subroutine ref_pot_ne_mixed
|
||||
implicit none
|
||||
integer ::i,j,k
|
||||
double precision :: integral
|
||||
do i=1, 5
|
||||
do j = 6, ao_num
|
||||
integral = 0.d0
|
||||
do k = 2,2
|
||||
integral += ao_integrals_n_e_per_atom(i,j,k) * nucl_charge(k)
|
||||
enddo
|
||||
write(34,*)integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine ref_pot_ne
|
||||
implicit none
|
||||
integer ::i,j,k
|
||||
double precision :: integral
|
||||
do i=6,ao_num
|
||||
do j = 6, ao_num
|
||||
integral = 0.d0
|
||||
do k = 1,1
|
||||
integral += ao_integrals_n_e_per_atom(i,j,k) * nucl_charge(k)
|
||||
enddo
|
||||
write(34,*)integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine ref_pot_ne_extra_mixed
|
||||
implicit none
|
||||
integer ::i,j,k
|
||||
double precision :: integral
|
||||
do i=1, 5
|
||||
do j = 6, ao_num
|
||||
integral = 0.d0
|
||||
do k = 1,1
|
||||
integral += ao_integrals_n_e_per_atom(i,j,k) * nucl_charge(k)
|
||||
enddo
|
||||
write(34,*)integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
102
plugins/local/extra_basis_int/v_mixed_extra.irp.f
Normal file
102
plugins/local/extra_basis_int/v_mixed_extra.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,102 @@
|
||||
double precision function v_extra_nucl_extra_ao(i_ao,j_ao)
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
!
|
||||
! Computes the following integral :
|
||||
! $\int_{-\infty}^{infty} dr \chi_i(r) \chi_j(r) v_ne^{extra}(r)$.
|
||||
!
|
||||
!
|
||||
! where BOTH $\chi_i(r)$ AND $\chi_j(r)$ belongs to the EXTRA basis
|
||||
!
|
||||
! and v_ne^{extra}(r) is the Coulomb potential coming from the EXTRA nuclei
|
||||
END_DOC
|
||||
integer, intent(in) ::i_ao,j_ao
|
||||
double precision :: mu_in,charge,coord(3)
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf_ao_extra
|
||||
mu_in = 1.d10
|
||||
integer :: i
|
||||
v_extra_nucl_extra_ao = 0.d0
|
||||
do i = 1, extra_nucl_num
|
||||
charge = extra_nucl_charge(i)
|
||||
coord(1:3) = extra_nucl_coord_transp(1:3,i)
|
||||
v_extra_nucl_extra_ao -= charge * NAI_pol_mult_erf_ao_extra(i_ao, j_ao, mu_in, coord)
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
double precision function v_nucl_extra_ao(i_ao,j_ao)
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
!
|
||||
! Computes the following integral :
|
||||
! $\int_{-\infty}^{infty} dr \chi_i(r) \chi_j(r) v_ne(r)$.
|
||||
!
|
||||
!
|
||||
! where BOTH $\chi_i(r)$ AND $\chi_j(r)$ belongs to the EXTRA basis
|
||||
!
|
||||
! and v_ne(r) is the Coulomb potential coming from the REGULAR nuclei
|
||||
END_DOC
|
||||
integer, intent(in) ::i_ao,j_ao
|
||||
double precision :: mu_in,charge,coord(3)
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf_ao_extra
|
||||
mu_in = 1.d10
|
||||
integer :: i
|
||||
v_nucl_extra_ao = 0.d0
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
charge = nucl_charge(i)
|
||||
coord(1:3) = nucl_coord_transp(1:3,i)
|
||||
v_nucl_extra_ao -= charge * NAI_pol_mult_erf_ao_extra(i_ao, j_ao, mu_in, coord)
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
double precision function v_extra_nucl_mixed_ao(i_ao,j_ao)
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
!
|
||||
! Computes the following integral :
|
||||
! $\int_{-\infty}^{infty} dr \chi_i(r) \chi_j(r) v_ne^{extra}(r)$.
|
||||
!
|
||||
!
|
||||
! where $\chi_i(r)$ belongs to the EXTRA basis and $\chi_j(r)$ to the REGULAR basis
|
||||
!
|
||||
! and v_ne^{extra}(r) is the Coulomb potential coming from the EXTRA nuclei
|
||||
END_DOC
|
||||
integer, intent(in) ::i_ao,j_ao
|
||||
double precision :: mu_in,charge,coord(3)
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed
|
||||
mu_in = 1.d10
|
||||
integer :: i
|
||||
v_extra_nucl_mixed_ao = 0.d0
|
||||
do i = 1, extra_nucl_num
|
||||
charge = extra_nucl_charge(i)
|
||||
coord(1:3) = extra_nucl_coord_transp(1:3,i)
|
||||
v_extra_nucl_mixed_ao -= charge * NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed(i_ao, j_ao, mu_in, coord)
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
double precision function v_nucl_mixed_ao(i_ao,j_ao)
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
!
|
||||
! Computes the following integral :
|
||||
! $\int_{-\infty}^{infty} dr \chi_i(r) \chi_j(r) v_ne(r)$.
|
||||
!
|
||||
!
|
||||
! where $\chi_i(r)$ belongs to the EXTRA basis and $\chi_j(r)$ to the REGULAR basis
|
||||
!
|
||||
! and v_ne(r) is the Coulomb potential coming from the REGULAR nuclei
|
||||
END_DOC
|
||||
integer, intent(in) ::i_ao,j_ao
|
||||
double precision :: mu_in,charge,coord(3)
|
||||
double precision :: NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed
|
||||
mu_in = 1.d10
|
||||
integer :: i
|
||||
v_nucl_mixed_ao = 0.d0
|
||||
do i = 1, nucl_num
|
||||
charge = nucl_charge(i)
|
||||
coord(1:3) = nucl_coord_transp(1:3,i)
|
||||
v_nucl_mixed_ao -= charge * NAI_pol_mult_erf_ao_extra_mixed(i_ao, j_ao, mu_in, coord)
|
||||
enddo
|
||||
end
|
||||
|
||||
56
plugins/local/extra_nuclei/EZFIO.cfg
Normal file
56
plugins/local/extra_nuclei/EZFIO.cfg
Normal file
@ -0,0 +1,56 @@
|
||||
[extra_nucl_num]
|
||||
doc: Number of nuclei
|
||||
type: integer
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[extra_nucl_pouet]
|
||||
doc: Number of nuclei
|
||||
type: integer
|
||||
interface: ezfio, provider, ocaml
|
||||
default:1
|
||||
|
||||
[extra_nucl_label]
|
||||
doc: Nuclear labels
|
||||
type: character*(32)
|
||||
size: (extra_nuclei.extra_nucl_num)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[extra_nucl_charge]
|
||||
doc: Nuclear charges
|
||||
type:double precision
|
||||
size: (extra_nuclei.extra_nucl_num)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[extra_nucl_coord]
|
||||
doc: Nuclear coordinates in the format (:, {x,y,z})
|
||||
type: double precision
|
||||
size: (extra_nuclei.extra_nucl_num,3)
|
||||
interface: ezfio
|
||||
|
||||
[extra_nucl_real_num]
|
||||
doc: Number of real nuclei
|
||||
type: integer
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[extra_nucl_fictious_num]
|
||||
doc: Number of fictious nuclei
|
||||
type: integer
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[extra_nucl_real_fictious_list]
|
||||
doc: List of real nuclei to which fictious nuclei are attached to
|
||||
type: integer
|
||||
size: (extra_nuclei.extra_nucl_fictious_num)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[extra_nucl_fictious_list]
|
||||
doc: List of fictious nuclei
|
||||
type: integer
|
||||
size: (extra_nuclei.extra_nucl_fictious_num)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
|
||||
[extra_nucl_real_list]
|
||||
doc: List of real nuclei
|
||||
type: integer
|
||||
size: (extra_nuclei.extra_nucl_real_num)
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
3
plugins/local/extra_nuclei/NEED
Normal file
3
plugins/local/extra_nuclei/NEED
Normal file
@ -0,0 +1,3 @@
|
||||
ezfio_files
|
||||
utils
|
||||
nuclei
|
||||
4
plugins/local/extra_nuclei/README.rst
Normal file
4
plugins/local/extra_nuclei/README.rst
Normal file
@ -0,0 +1,4 @@
|
||||
============
|
||||
extra_nuclei
|
||||
============
|
||||
|
||||
7
plugins/local/extra_nuclei/extra_nuclei.irp.f
Normal file
7
plugins/local/extra_nuclei/extra_nuclei.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,7 @@
|
||||
program extra_nuclei
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! TODO : Put the documentation of the program here
|
||||
END_DOC
|
||||
print *, 'Hello world'
|
||||
end
|
||||
122
plugins/local/extra_nuclei/nuclei.irp.f
Normal file
122
plugins/local/extra_nuclei/nuclei.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,122 @@
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, extra_nucl_coord, (extra_nucl_num,3) ]
|
||||
implicit none
|
||||
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Nuclear coordinates in the format (:, {x,y,z})
|
||||
END_DOC
|
||||
PROVIDE ezfio_filename extra_nucl_label extra_nucl_charge
|
||||
|
||||
if (mpi_master) then
|
||||
double precision, allocatable :: buffer(:,:)
|
||||
extra_nucl_coord = 0.d0
|
||||
allocate (buffer(extra_nucl_num,3))
|
||||
buffer = 0.d0
|
||||
logical :: has
|
||||
call ezfio_has_extra_nuclei_extra_nucl_coord(has)
|
||||
if (.not.has) then
|
||||
print *, irp_here
|
||||
stop 1
|
||||
endif
|
||||
call ezfio_get_extra_nuclei_extra_nucl_coord(buffer)
|
||||
integer :: i,j
|
||||
|
||||
do i=1,3
|
||||
do j=1,extra_nucl_num
|
||||
extra_nucl_coord(j,i) = buffer(j,i)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
deallocate(buffer)
|
||||
|
||||
character*(64), parameter :: f = '(A16, 4(1X,F12.6))'
|
||||
character*(64), parameter :: ft= '(A16, 4(1X,A12 ))'
|
||||
double precision, parameter :: a0= 0.529177249d0
|
||||
|
||||
call write_time(6)
|
||||
write(6,'(A)') ''
|
||||
write(6,'(A)') 'Extra Nuclear Coordinates (Angstroms)'
|
||||
write(6,'(A)') '====================================='
|
||||
write(6,'(A)') ''
|
||||
write(6,ft) &
|
||||
'================','============','============','============','============'
|
||||
write(6,*) &
|
||||
' Atom Charge X Y Z '
|
||||
write(6,ft) &
|
||||
'================','============','============','============','============'
|
||||
|
||||
do i=1,extra_nucl_num
|
||||
write(6,f) extra_nucl_label(i), extra_nucl_charge(i), &
|
||||
extra_nucl_coord(i,1)*a0, &
|
||||
extra_nucl_coord(i,2)*a0, &
|
||||
extra_nucl_coord(i,3)*a0
|
||||
enddo
|
||||
write(6,ft) &
|
||||
'================','============','============','============','============'
|
||||
write(6,'(A)') ''
|
||||
|
||||
if (extra_nucl_num > 1) then
|
||||
double precision :: dist_min, x, y, z
|
||||
dist_min = huge(1.d0)
|
||||
do i=1,extra_nucl_num
|
||||
do j=i+1,extra_nucl_num
|
||||
x = extra_nucl_coord(i,1)-extra_nucl_coord(j,1)
|
||||
y = extra_nucl_coord(i,2)-extra_nucl_coord(j,2)
|
||||
z = extra_nucl_coord(i,3)-extra_nucl_coord(j,3)
|
||||
dist_min = min(x*x + y*y + z*z, dist_min)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
write(6,'(A,F12.4,A)') 'Minimal interatomic distance found: ', &
|
||||
dsqrt(dist_min)*a0,' Angstrom'
|
||||
endif
|
||||
|
||||
endif
|
||||
|
||||
IRP_IF MPI_DEBUG
|
||||
print *, irp_here, mpi_rank
|
||||
call MPI_BARRIER(MPI_COMM_WORLD, ierr)
|
||||
IRP_ENDIF
|
||||
IRP_IF MPI
|
||||
include 'mpif.h'
|
||||
integer :: ierr
|
||||
call MPI_BCAST( extra_nucl_coord, 3*extra_nucl_num, MPI_DOUBLE_PRECISION, 0, MPI_COMM_WORLD, ierr)
|
||||
if (ierr /= MPI_SUCCESS) then
|
||||
stop 'Unable to read nucl_coord with MPI'
|
||||
endif
|
||||
IRP_ENDIF
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, extra_nucl_coord_transp, (3,extra_nucl_num) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Transposed array of extra_nucl_coord
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i, k
|
||||
extra_nucl_coord_transp = 0.d0
|
||||
|
||||
do i=1,extra_nucl_num
|
||||
extra_nucl_coord_transp(1,i) = extra_nucl_coord(i,1)
|
||||
extra_nucl_coord_transp(2,i) = extra_nucl_coord(i,2)
|
||||
extra_nucl_coord_transp(3,i) = extra_nucl_coord(i,3)
|
||||
enddo
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, extra_center_of_mass, (3) ]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Center of mass of the molecule
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: i,j
|
||||
double precision :: s
|
||||
extra_center_of_mass(:) = 0.d0
|
||||
s = 0.d0
|
||||
do i=1,extra_nucl_num
|
||||
do j=1,3
|
||||
extra_center_of_mass(j) += extra_nucl_coord(i,j)* element_mass(int(extra_nucl_charge(i)))
|
||||
enddo
|
||||
s += element_mass(int(extra_nucl_charge(i)))
|
||||
enddo
|
||||
s = 1.d0/s
|
||||
extra_center_of_mass(:) = extra_center_of_mass(:)*s
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
@ -17,7 +17,7 @@ Our goals:
|
||||
We want to create a plugin to do the following things:
|
||||
1) print out one- and two-electron integrals on the AO/MO basis,
|
||||
|
||||
2) creates two providers which manipulate these objects,
|
||||
2) create two providers which manipulate these objects,
|
||||
|
||||
3) print out these providers.
|
||||
|
||||
|
||||
@ -17,6 +17,7 @@ This file is automatically generated by
|
||||
(** Keywords used to define input sections *)
|
||||
type keyword =
|
||||
| Ao_basis
|
||||
| Ao_extra_basis
|
||||
| Determinants_by_hand
|
||||
| Electrons
|
||||
| Mo_basis
|
||||
@ -27,6 +28,7 @@ type keyword =
|
||||
|
||||
let keyword_to_string = function
|
||||
| Ao_basis -> "AO basis"
|
||||
| Ao_extra_basis -> "AO extra_basis"
|
||||
| Determinants_by_hand -> "Determinants_by_hand"
|
||||
| Electrons -> "Electrons"
|
||||
| Mo_basis -> "MO basis"
|
||||
@ -76,6 +78,8 @@ let get s =
|
||||
f Electrons.(read, to_rst)
|
||||
| Nuclei_by_hand ->
|
||||
f Nuclei_by_hand.(read, to_rst)
|
||||
| Ao_extra_basis ->
|
||||
f Ao_extra_basis.(read, to_rst)
|
||||
| Ao_basis ->
|
||||
f Ao_basis.(read, to_rst)
|
||||
| Determinants_by_hand ->
|
||||
@ -123,6 +127,7 @@ let set str s =
|
||||
| Determinants_by_hand -> write Determinants_by_hand.(of_rst, write ~force:false) s
|
||||
| Nuclei_by_hand -> write Nuclei_by_hand.(of_rst, write) s
|
||||
| Ao_basis -> () (* TODO *)
|
||||
| Ao_extra_basis -> () (* TODO *)
|
||||
| Mo_basis -> () (* TODO *)
|
||||
end
|
||||
|
||||
@ -199,6 +204,22 @@ let run check_only ?ndet ?state ?read ?write ezfio_filename =
|
||||
| _ -> ()
|
||||
end;
|
||||
|
||||
(* Reorder extra basis set *)
|
||||
begin
|
||||
match Input.Ao_extra_basis.read() with
|
||||
| Some aos ->
|
||||
let ordering = Input.Ao_extra_basis.ordering aos in
|
||||
let test = Array.copy ordering in
|
||||
Array.sort compare test ;
|
||||
if test <> ordering then
|
||||
begin
|
||||
Printf.eprintf "Warning: Basis set is not properly ordered. Redordering.\n";
|
||||
let new_aos = Input.Ao_extra_basis.reorder aos in
|
||||
Input.Ao_extra_basis.write new_aos;
|
||||
end
|
||||
| _ -> ()
|
||||
end;
|
||||
|
||||
begin
|
||||
match ndet with
|
||||
| None -> ()
|
||||
@ -219,6 +240,7 @@ let run check_only ?ndet ?state ?read ?write ezfio_filename =
|
||||
let output = (file_header ezfio_filename) :: (
|
||||
List.map get [
|
||||
Ao_basis ;
|
||||
Ao_extra_basis ;
|
||||
Mo_basis ;
|
||||
])
|
||||
in
|
||||
@ -229,6 +251,7 @@ let run check_only ?ndet ?state ?read ?write ezfio_filename =
|
||||
let tasks = [
|
||||
Nuclei_by_hand ;
|
||||
Ao_basis;
|
||||
Ao_extra_basis;
|
||||
Electrons ;
|
||||
{tasks}
|
||||
Mo_basis;
|
||||
|
||||
@ -282,3 +282,23 @@ END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [logical, use_pw]
|
||||
|
||||
implicit none
|
||||
|
||||
logical :: exist
|
||||
|
||||
use_pw = .false.
|
||||
|
||||
call ezfio_has_ao_basis_ao_expo_pw(exist)
|
||||
if(exist) then
|
||||
PROVIDE ao_expo_pw_ord_transp
|
||||
if(maxval(dabs(ao_expo_pw_ord_transp(4,:,:))) .gt. 1d-15) use_pw = .true.
|
||||
endif
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
|
||||
@ -1672,5 +1672,3 @@ recursive subroutine I_x2_pol_mult_cgtos(c, B_10, B_01, B_00, C_00, D_00, d, nd,
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
! ---
|
||||
|
||||
|
||||
@ -38,3 +38,10 @@ type: double precision
|
||||
size: (ao_basis.ao_num,ao_basis.ao_num,determinants.n_states)
|
||||
|
||||
|
||||
[data_one_e_dm_tot_ao]
|
||||
interface: ezfio, provider
|
||||
doc: TOTAL (Alpha+Beta) one body density matrix on the |AO| basis computed with the wave function
|
||||
type: double precision
|
||||
size: (ao_basis.ao_num,ao_basis.ao_num,determinants.n_states)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program cas_based_on_top_density
|
||||
program cas_based_on_top
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! TODO : Small example to use the different quantities in this plugin
|
||||
@ -16,4 +16,5 @@ end
|
||||
subroutine routine
|
||||
implicit none
|
||||
provide total_cas_on_top_density
|
||||
provide average_on_top
|
||||
end
|
||||
|
||||
@ -74,3 +74,17 @@
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, average_on_top, (n_states)]
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i_point,istate
|
||||
double precision :: wall_0,wall_1,core_inact_dm,pure_act_on_top_of_r,weight
|
||||
average_on_top = 0.d0
|
||||
do istate = 1, N_states
|
||||
do i_point = 1, n_points_final_grid
|
||||
weight = final_weight_at_r_vector(i_point)
|
||||
average_on_top(istate) += total_cas_on_top_density(i_point,istate) * weight
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
print*,'Average on top pair density = ',average_on_top
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program print_2rdm
|
||||
program get_energy
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! get the active part of the bielectronic energy on a given wave function.
|
||||
|
||||
@ -1,24 +1,41 @@
|
||||
program print_mos
|
||||
implicit none
|
||||
integer :: i,nx
|
||||
double precision :: r(3), xmax, dx, accu
|
||||
double precision, allocatable :: mos_array(:)
|
||||
double precision:: alpha,envelop,dm_a,dm_b
|
||||
allocate(mos_array(mo_num))
|
||||
xmax = 5.d0
|
||||
nx = 1000
|
||||
dx=xmax/dble(nx)
|
||||
r = 0.d0
|
||||
alpha = 0.5d0
|
||||
print*,ao_kinetic_integrals(1,1)
|
||||
double precision :: xmin,xmax,dx,x,accu,gtt,g,alpha,pi,accu_norm
|
||||
pi = dacos(-1.d0)
|
||||
alpha = 2.D0
|
||||
xmin=0.d0
|
||||
xmax=5.D0
|
||||
nx=10000
|
||||
dx=(xmax-xmin)/dble(nx)
|
||||
x = 0.d0
|
||||
accu = 0.d0
|
||||
accu_norm = 0.d0
|
||||
do i = 1, nx
|
||||
call dm_dft_alpha_beta_at_r(r,dm_a,dm_b)
|
||||
call give_all_mos_at_r(r,mos_array)
|
||||
accu = mos_array(3)**2+mos_array(4)**2+mos_array(5)**2
|
||||
accu = dsqrt(accu)
|
||||
envelop = (1.d0 - dexp(-alpha * r(3)**2))
|
||||
write(33,'(100(F16.10,X))')r(3), mos_array(1), mos_array(2), accu, dm_a+dm_b, envelop
|
||||
r(3) += dx
|
||||
accu += g(x,alpha)*gtt(x,alpha)*x**2 * dx
|
||||
accu_norm += g(x,alpha)**2*x**2 * dx
|
||||
write(33,*)x,g(x,alpha),gtt(x,alpha)
|
||||
x+=dx
|
||||
enddo
|
||||
accu=accu * 4.d0 * pi
|
||||
accu_norm *= 4.d0 * pi
|
||||
print*,'accu_norm = ',accu_norm
|
||||
accu*=-0.5D0
|
||||
print*,'accu = ',accu/accu_norm
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
double precision function gtt(x,alpha)
|
||||
implicit none
|
||||
double precision, intent(in) :: x,alpha
|
||||
gtt = dexp(-alpha*x*x) * (4.D0*alpha**2*x**2 - 4.d0 * alpha)
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
double precision function g(x,alpha)
|
||||
implicit none
|
||||
double precision, intent(in) :: x,alpha
|
||||
g = dexp(-alpha*x*x)
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
@ -64,3 +64,12 @@ BEGIN_PROVIDER [ double precision, S_mo_coef, (ao_num, mo_num) ]
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_one_e_integrals_from_mo, (ao_num, ao_num)]
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Integrals of the one e hamiltonian obtained from the integrals on the MO basis
|
||||
!
|
||||
! WARNING : this is equal to ao_one_e_integrals only if the AO and MO basis have the same number of functions
|
||||
END_DOC
|
||||
call mo_to_ao(mo_one_e_integrals,mo_num,ao_one_e_integrals_from_mo,ao_num)
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program projected_operators
|
||||
program test_proj_op
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! TODO
|
||||
|
||||
@ -201,6 +201,9 @@ BEGIN_PROVIDER [ double precision, nuclear_repulsion ]
|
||||
x(2) = nucl_coord(k,2) - nucl_coord(l,2)
|
||||
x(3) = nucl_coord(k,3) - nucl_coord(l,3)
|
||||
r2 = x(1)*x(1) + x(2)*x(2) + x(3)*x(3)
|
||||
if(r2.lt.1.d-6)then
|
||||
r2 = 1.d-6
|
||||
endif
|
||||
nuclear_repulsion += Z12/dsqrt(r2)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program molden_detachment_attachment
|
||||
program attachement_orb
|
||||
implicit none
|
||||
read_wf=.True.
|
||||
touch read_wf
|
||||
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program fcidump
|
||||
program fcidump_pyscf
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Produce a regular `FCIDUMP` file from the |MOs| stored in the |EZFIO|
|
||||
|
||||
@ -1,3 +0,0 @@
|
||||
program hcore_guess_prog
|
||||
call hcore_guess
|
||||
end
|
||||
@ -1,5 +0,0 @@
|
||||
program pouet
|
||||
implicit none
|
||||
call huckel_guess
|
||||
|
||||
end
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program sort_wf
|
||||
program print_sorted_wf_coef
|
||||
implicit none
|
||||
read_wf =.True.
|
||||
call routine
|
||||
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program save_natorb
|
||||
program save_natorb_no_ov_rot
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Save natural |MOs| into the |EZFIO|.
|
||||
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program save_natorb
|
||||
program save_natorb_no_ref
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Save natural |MOs| into the |EZFIO|.
|
||||
|
||||
@ -27,4 +27,5 @@ subroutine routine_save_one_e_dm
|
||||
call ezfio_set_aux_quantities_data_one_e_dm_beta_mo(one_e_dm_mo_beta)
|
||||
call ezfio_set_aux_quantities_data_one_e_dm_alpha_ao(one_e_dm_ao_alpha)
|
||||
call ezfio_set_aux_quantities_data_one_e_dm_beta_ao(one_e_dm_ao_beta)
|
||||
call ezfio_set_aux_quantities_data_one_e_dm_tot_ao(one_e_dm_ao)
|
||||
end
|
||||
|
||||
@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
program import_integrals_ao
|
||||
program import_trexio_integrals
|
||||
use trexio
|
||||
implicit none
|
||||
integer(trexio_t) :: f ! TREXIO file handle
|
||||
|
||||
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