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44ef244fc0
...
04f6220317
Author | SHA1 | Date | |
---|---|---|---|
04f6220317 | |||
d8a7caf967 |
@ -21,13 +21,12 @@ subroutine run
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||||
|
||||
call system('rm -rf '//trim(trexio_filename)//'.bak')
|
||||
call system('mv '//trim(trexio_filename)//' '//trim(trexio_filename)//'.bak')
|
||||
! call system('mv '//trim(trexio_filename)//' '//trim(trexio_filename)''//.bak)
|
||||
if (backend == 0) then
|
||||
f = trexio_open(trexio_filename, 'w', TREXIO_HDF5, rc)
|
||||
else if (backend == 1) then
|
||||
f = trexio_open(trexio_filename, 'w', TREXIO_TEXT, rc)
|
||||
endif
|
||||
if (f == 0) then
|
||||
if (f == 0_8) then
|
||||
print *, 'Unable to open TREXIO file for writing'
|
||||
print *, 'rc = ', rc
|
||||
stop -1
|
||||
@ -270,10 +269,7 @@ subroutine run
|
||||
call check_success(rc)
|
||||
|
||||
if (do_pseudo) then
|
||||
rc = trexio_write_ao_1e_int_ecp_local(f,ao_pseudo_integrals_local)
|
||||
call check_success(rc)
|
||||
|
||||
rc = trexio_write_ao_1e_int_ecp_non_local(f,ao_pseudo_integrals_non_local)
|
||||
rc = trexio_write_ao_1e_int_ecp(f, ao_pseudo_integrals_local + ao_pseudo_integrals_non_local)
|
||||
call check_success(rc)
|
||||
endif
|
||||
|
||||
@ -355,10 +351,7 @@ subroutine run
|
||||
call check_success(rc)
|
||||
|
||||
if (do_pseudo) then
|
||||
rc = trexio_write_mo_1e_int_ecp_local(f,mo_pseudo_integrals_local)
|
||||
call check_success(rc)
|
||||
|
||||
rc = trexio_write_mo_1e_int_ecp_non_local(f,mo_pseudo_integrals_non_local)
|
||||
rc = trexio_write_mo_1e_int_ecp(f,mo_pseudo_integrals_local)
|
||||
call check_success(rc)
|
||||
endif
|
||||
|
||||
|
137
devel/trexio/import_trexio_integrals.irp.f
Normal file
137
devel/trexio/import_trexio_integrals.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,137 @@
|
||||
program import_integrals_ao
|
||||
call run
|
||||
end
|
||||
|
||||
subroutine run
|
||||
use trexio
|
||||
use map_module
|
||||
implicit none
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||||
BEGIN_DOC
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||||
! Program to import integrals from TREXIO
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||||
END_DOC
|
||||
|
||||
integer(8) :: f ! TREXIO file handle
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||||
integer :: rc
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||||
|
||||
integer ::i,j,k,l,m
|
||||
double precision :: integral
|
||||
|
||||
integer :: n_integrals
|
||||
integer(key_kind), allocatable :: buffer_i(:)
|
||||
real(integral_kind), allocatable :: buffer_values(:)
|
||||
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: A(:,:)
|
||||
double precision, allocatable :: V(:)
|
||||
integer , allocatable :: Vi(:,:)
|
||||
double precision, allocatable :: s
|
||||
|
||||
f = trexio_open(trexio_filename, 'r', TREXIO_AUTO, rc)
|
||||
if (f == 0_8) then
|
||||
print *, 'Unable to open TREXIO file for reading'
|
||||
print *, 'rc = ', rc
|
||||
stop -1
|
||||
endif
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
if (trexio_has_nucleus_repulsion(f)) then
|
||||
rc = trexio_read_nucleus_repulsion(f, s)
|
||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
print *, irp_here
|
||||
print *, 'Error reading nuclear repulsion'
|
||||
stop -1
|
||||
endif
|
||||
call ezfio_set_nuclei_nuclear_repulsion(s)
|
||||
call ezfio_set_nuclei_io_nuclear_repulsion('Read')
|
||||
endif
|
||||
|
||||
! AO integrals
|
||||
! ------------
|
||||
|
||||
allocate(A(ao_num, ao_num))
|
||||
|
||||
|
||||
if (trexio_has_ao_1e_int_overlap(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
rc = trexio_read_ao_1e_int_overlap(f, A)
|
||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
print *, irp_here
|
||||
print *, 'Error reading AO overlap'
|
||||
stop -1
|
||||
endif
|
||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_ao_integrals_overlap(A)
|
||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_io_ao_integrals_overlap('Read')
|
||||
endif
|
||||
|
||||
if (trexio_has_ao_1e_int_kinetic(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
rc = trexio_read_ao_1e_int_kinetic(f, A)
|
||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
print *, irp_here
|
||||
print *, 'Error reading AO kinetic integrals'
|
||||
stop -1
|
||||
endif
|
||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_ao_integrals_kinetic(A)
|
||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_io_ao_integrals_kinetic('Read')
|
||||
endif
|
||||
|
||||
! if (trexio_has_ao_1e_int_ecp(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
! rc = trexio_read_ao_1e_int_ecp(f, A)
|
||||
! if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
! print *, irp_here
|
||||
! print *, 'Error reading AO ECP local integrals'
|
||||
! stop -1
|
||||
! endif
|
||||
! call ezfio_set_ao_one_e_ints_ao_integrals_pseudo(A)
|
||||
! call ezfio_set_ao_one_e_ints_io_ao_integrals_pseudo('Read')
|
||||
! endif
|
||||
|
||||
if (trexio_has_ao_1e_int_potential_n_e(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
rc = trexio_read_ao_1e_int_potential_n_e(f, A)
|
||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
print *, irp_here
|
||||
print *, 'Error reading AO potential N-e integrals'
|
||||
stop -1
|
||||
endif
|
||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_ao_integrals_n_e(A)
|
||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_io_ao_integrals_n_e('Read')
|
||||
endif
|
||||
|
||||
deallocate(A)
|
||||
|
||||
! AO 2e integrals
|
||||
! ---------------
|
||||
|
||||
allocate(buffer_i(ao_num**3), buffer_values(ao_num**3))
|
||||
allocate(Vi(4,ao_num**3), V(ao_num**3))
|
||||
|
||||
integer*8 :: offset, icount
|
||||
|
||||
offset = 0_8
|
||||
icount = 0_8
|
||||
rc = TREXIO_SUCCESS
|
||||
do while (icount == size(V))
|
||||
rc = trexio_read_ao_2e_int_eri(f, offset, icount, Vi, V)
|
||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
||||
exit
|
||||
endif
|
||||
do m=1,icount
|
||||
i = Vi(1,m)
|
||||
j = Vi(2,m)
|
||||
k = Vi(3,m)
|
||||
l = Vi(4,m)
|
||||
integral = V(m)
|
||||
call two_e_integrals_index(i, j, k, l, buffer_i(m) )
|
||||
buffer_values(m) = integral
|
||||
enddo
|
||||
call insert_into_ao_integrals_map(int(icount,4),buffer_i,buffer_values)
|
||||
offset = offset + icount
|
||||
end do
|
||||
n_integrals = offset
|
||||
|
||||
call map_sort(ao_integrals_map)
|
||||
call map_unique(ao_integrals_map)
|
||||
|
||||
call map_save_to_disk(trim(ezfio_filename)//'/work/ao_ints',ao_integrals_map)
|
||||
call ezfio_set_ao_two_e_ints_io_ao_two_e_integrals('Read')
|
||||
|
||||
end
|
@ -245,10 +245,14 @@ def write_ezfio(trexio_filename, filename):
|
||||
|
||||
labels = { "Canonical" : "Canonical",
|
||||
"RHF" : "Canonical",
|
||||
"BOYS" : "Localized",
|
||||
"ROHF" : "Canonical",
|
||||
"UHF" : "Canonical",
|
||||
"Natural": "Natural" }
|
||||
try:
|
||||
label = labels[trexio.read_mo_type(trexio_file)]
|
||||
except:
|
||||
label = "None"
|
||||
ezfio.set_mo_basis_mo_label(label)
|
||||
|
||||
try:
|
||||
|
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -2,7 +2,7 @@ subroutine write_champ_csf
|
||||
implicit none
|
||||
|
||||
integer, parameter :: istate=1
|
||||
character*(2048) :: format
|
||||
character*(2048) :: fmt
|
||||
integer :: i, n_elements, j, k
|
||||
integer, allocatable :: list(:,:)
|
||||
|
||||
@ -19,24 +19,24 @@ subroutine write_champ_csf
|
||||
! Determinants
|
||||
write(iunit, '(A, I10)') 'determinants', N_det
|
||||
|
||||
write(format,*) '(', N_det, '(F12.8, X))'
|
||||
write(iunit, format) psi_coef(1:N_det,istate)
|
||||
write(fmt,*) '(', N_det, '(F12.8, X))'
|
||||
write(iunit, fmt) psi_coef(1:N_det,istate)
|
||||
|
||||
write(format,*) '( ', elec_alpha_num, '(I4,X), 2X, ', elec_beta_num, '(I4,X))'
|
||||
write(fmt,*) '( ', elec_alpha_num, '(I4,X), 2X, ', elec_beta_num, '(I4,X))'
|
||||
allocate ( list(bit_kind_size,2) )
|
||||
do i=1, N_det
|
||||
call bitstring_to_list( psi_det(1,1,i), list(1,1), n_elements, N_int)
|
||||
call bitstring_to_list( psi_det(1,2,i), list(1,2), n_elements, N_int)
|
||||
write(iunit,format) list(1:elec_alpha_num,1), list(1:elec_beta_num,2)
|
||||
write(iunit,fmt) list(1:elec_alpha_num,1), list(1:elec_beta_num,2)
|
||||
end do
|
||||
write(iunit, '(A)') 'end'
|
||||
|
||||
! CSF
|
||||
write(iunit, '(A, I10, X, I3)') 'csf', N_csf, N_states
|
||||
|
||||
write(format,*) '(', N_csf, '(F12.8, X))'
|
||||
write(fmt,*) '(', N_csf, '(F12.8, X))'
|
||||
do i=1,N_states
|
||||
write(iunit, format) psi_csf_coef(1:N_csf,i)
|
||||
write(iunit, fmt) psi_csf_coef(1:N_csf,i)
|
||||
end do
|
||||
|
||||
write(iunit, '(A)') 'end'
|
||||
|
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