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synced 2024-09-01 08:43:46 +02:00
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No commits in common. "04f622031746bf629fb605908b032cc9cf8643ce" and "44ef244fc035af3f9aef99c92c3cbcda600d7967" have entirely different histories.
04f6220317
...
44ef244fc0
@ -21,12 +21,13 @@ subroutine run
|
|||||||
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||||||
call system('rm -rf '//trim(trexio_filename)//'.bak')
|
call system('rm -rf '//trim(trexio_filename)//'.bak')
|
||||||
call system('mv '//trim(trexio_filename)//' '//trim(trexio_filename)//'.bak')
|
call system('mv '//trim(trexio_filename)//' '//trim(trexio_filename)//'.bak')
|
||||||
|
! call system('mv '//trim(trexio_filename)//' '//trim(trexio_filename)''//.bak)
|
||||||
if (backend == 0) then
|
if (backend == 0) then
|
||||||
f = trexio_open(trexio_filename, 'w', TREXIO_HDF5, rc)
|
f = trexio_open(trexio_filename, 'w', TREXIO_HDF5, rc)
|
||||||
else if (backend == 1) then
|
else if (backend == 1) then
|
||||||
f = trexio_open(trexio_filename, 'w', TREXIO_TEXT, rc)
|
f = trexio_open(trexio_filename, 'w', TREXIO_TEXT, rc)
|
||||||
endif
|
endif
|
||||||
if (f == 0_8) then
|
if (f == 0) then
|
||||||
print *, 'Unable to open TREXIO file for writing'
|
print *, 'Unable to open TREXIO file for writing'
|
||||||
print *, 'rc = ', rc
|
print *, 'rc = ', rc
|
||||||
stop -1
|
stop -1
|
||||||
@ -269,7 +270,10 @@ subroutine run
|
|||||||
call check_success(rc)
|
call check_success(rc)
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||||||
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||||||
if (do_pseudo) then
|
if (do_pseudo) then
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||||||
rc = trexio_write_ao_1e_int_ecp(f, ao_pseudo_integrals_local + ao_pseudo_integrals_non_local)
|
rc = trexio_write_ao_1e_int_ecp_local(f,ao_pseudo_integrals_local)
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||||||
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call check_success(rc)
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||||||
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||||||
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rc = trexio_write_ao_1e_int_ecp_non_local(f,ao_pseudo_integrals_non_local)
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||||||
call check_success(rc)
|
call check_success(rc)
|
||||||
endif
|
endif
|
||||||
|
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||||||
@ -351,7 +355,10 @@ subroutine run
|
|||||||
call check_success(rc)
|
call check_success(rc)
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||||||
|
|
||||||
if (do_pseudo) then
|
if (do_pseudo) then
|
||||||
rc = trexio_write_mo_1e_int_ecp(f,mo_pseudo_integrals_local)
|
rc = trexio_write_mo_1e_int_ecp_local(f,mo_pseudo_integrals_local)
|
||||||
|
call check_success(rc)
|
||||||
|
|
||||||
|
rc = trexio_write_mo_1e_int_ecp_non_local(f,mo_pseudo_integrals_non_local)
|
||||||
call check_success(rc)
|
call check_success(rc)
|
||||||
endif
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
@ -1,137 +0,0 @@
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|||||||
program import_integrals_ao
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call run
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||||||
end
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||||||
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||||||
subroutine run
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||||||
use trexio
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||||||
use map_module
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implicit none
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BEGIN_DOC
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||||||
! Program to import integrals from TREXIO
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END_DOC
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||||||
integer(8) :: f ! TREXIO file handle
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integer :: rc
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integer ::i,j,k,l,m
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double precision :: integral
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integer :: n_integrals
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integer(key_kind), allocatable :: buffer_i(:)
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real(integral_kind), allocatable :: buffer_values(:)
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||||||
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double precision, allocatable :: A(:,:)
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double precision, allocatable :: V(:)
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integer , allocatable :: Vi(:,:)
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||||||
double precision, allocatable :: s
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||||||
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||||||
f = trexio_open(trexio_filename, 'r', TREXIO_AUTO, rc)
|
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||||||
if (f == 0_8) then
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||||||
print *, 'Unable to open TREXIO file for reading'
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||||||
print *, 'rc = ', rc
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stop -1
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||||||
endif
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||||||
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||||||
|
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||||||
|
|
||||||
if (trexio_has_nucleus_repulsion(f)) then
|
|
||||||
rc = trexio_read_nucleus_repulsion(f, s)
|
|
||||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
print *, irp_here
|
|
||||||
print *, 'Error reading nuclear repulsion'
|
|
||||||
stop -1
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
call ezfio_set_nuclei_nuclear_repulsion(s)
|
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||||||
call ezfio_set_nuclei_io_nuclear_repulsion('Read')
|
|
||||||
endif
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||||||
|
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||||||
! AO integrals
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! ------------
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||||||
allocate(A(ao_num, ao_num))
|
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|
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||||||
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||||||
if (trexio_has_ao_1e_int_overlap(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
rc = trexio_read_ao_1e_int_overlap(f, A)
|
|
||||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
print *, irp_here
|
|
||||||
print *, 'Error reading AO overlap'
|
|
||||||
stop -1
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_ao_integrals_overlap(A)
|
|
||||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_io_ao_integrals_overlap('Read')
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
|
|
||||||
if (trexio_has_ao_1e_int_kinetic(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
rc = trexio_read_ao_1e_int_kinetic(f, A)
|
|
||||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
print *, irp_here
|
|
||||||
print *, 'Error reading AO kinetic integrals'
|
|
||||||
stop -1
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_ao_integrals_kinetic(A)
|
|
||||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_io_ao_integrals_kinetic('Read')
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
|
|
||||||
! if (trexio_has_ao_1e_int_ecp(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
! rc = trexio_read_ao_1e_int_ecp(f, A)
|
|
||||||
! if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
! print *, irp_here
|
|
||||||
! print *, 'Error reading AO ECP local integrals'
|
|
||||||
! stop -1
|
|
||||||
! endif
|
|
||||||
! call ezfio_set_ao_one_e_ints_ao_integrals_pseudo(A)
|
|
||||||
! call ezfio_set_ao_one_e_ints_io_ao_integrals_pseudo('Read')
|
|
||||||
! endif
|
|
||||||
|
|
||||||
if (trexio_has_ao_1e_int_potential_n_e(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
rc = trexio_read_ao_1e_int_potential_n_e(f, A)
|
|
||||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
print *, irp_here
|
|
||||||
print *, 'Error reading AO potential N-e integrals'
|
|
||||||
stop -1
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_ao_integrals_n_e(A)
|
|
||||||
call ezfio_set_ao_one_e_ints_io_ao_integrals_n_e('Read')
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
|
|
||||||
deallocate(A)
|
|
||||||
|
|
||||||
! AO 2e integrals
|
|
||||||
! ---------------
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||||||
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||||||
allocate(buffer_i(ao_num**3), buffer_values(ao_num**3))
|
|
||||||
allocate(Vi(4,ao_num**3), V(ao_num**3))
|
|
||||||
|
|
||||||
integer*8 :: offset, icount
|
|
||||||
|
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||||||
offset = 0_8
|
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||||||
icount = 0_8
|
|
||||||
rc = TREXIO_SUCCESS
|
|
||||||
do while (icount == size(V))
|
|
||||||
rc = trexio_read_ao_2e_int_eri(f, offset, icount, Vi, V)
|
|
||||||
if (rc /= TREXIO_SUCCESS) then
|
|
||||||
exit
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
do m=1,icount
|
|
||||||
i = Vi(1,m)
|
|
||||||
j = Vi(2,m)
|
|
||||||
k = Vi(3,m)
|
|
||||||
l = Vi(4,m)
|
|
||||||
integral = V(m)
|
|
||||||
call two_e_integrals_index(i, j, k, l, buffer_i(m) )
|
|
||||||
buffer_values(m) = integral
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
call insert_into_ao_integrals_map(int(icount,4),buffer_i,buffer_values)
|
|
||||||
offset = offset + icount
|
|
||||||
end do
|
|
||||||
n_integrals = offset
|
|
||||||
|
|
||||||
call map_sort(ao_integrals_map)
|
|
||||||
call map_unique(ao_integrals_map)
|
|
||||||
|
|
||||||
call map_save_to_disk(trim(ezfio_filename)//'/work/ao_ints',ao_integrals_map)
|
|
||||||
call ezfio_set_ao_two_e_ints_io_ao_two_e_integrals('Read')
|
|
||||||
|
|
||||||
end
|
|
@ -245,14 +245,10 @@ def write_ezfio(trexio_filename, filename):
|
|||||||
|
|
||||||
labels = { "Canonical" : "Canonical",
|
labels = { "Canonical" : "Canonical",
|
||||||
"RHF" : "Canonical",
|
"RHF" : "Canonical",
|
||||||
"BOYS" : "Localized",
|
|
||||||
"ROHF" : "Canonical",
|
"ROHF" : "Canonical",
|
||||||
"UHF" : "Canonical",
|
"UHF" : "Canonical",
|
||||||
"Natural": "Natural" }
|
"Natural": "Natural" }
|
||||||
try:
|
label = labels[trexio.read_mo_type(trexio_file)]
|
||||||
label = labels[trexio.read_mo_type(trexio_file)]
|
|
||||||
except:
|
|
||||||
label = "None"
|
|
||||||
ezfio.set_mo_basis_mo_label(label)
|
ezfio.set_mo_basis_mo_label(label)
|
||||||
|
|
||||||
try:
|
try:
|
||||||
|
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -2,7 +2,7 @@ subroutine write_champ_csf
|
|||||||
implicit none
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
integer, parameter :: istate=1
|
integer, parameter :: istate=1
|
||||||
character*(2048) :: fmt
|
character*(2048) :: format
|
||||||
integer :: i, n_elements, j, k
|
integer :: i, n_elements, j, k
|
||||||
integer, allocatable :: list(:,:)
|
integer, allocatable :: list(:,:)
|
||||||
|
|
||||||
@ -19,24 +19,24 @@ subroutine write_champ_csf
|
|||||||
! Determinants
|
! Determinants
|
||||||
write(iunit, '(A, I10)') 'determinants', N_det
|
write(iunit, '(A, I10)') 'determinants', N_det
|
||||||
|
|
||||||
write(fmt,*) '(', N_det, '(F12.8, X))'
|
write(format,*) '(', N_det, '(F12.8, X))'
|
||||||
write(iunit, fmt) psi_coef(1:N_det,istate)
|
write(iunit, format) psi_coef(1:N_det,istate)
|
||||||
|
|
||||||
write(fmt,*) '( ', elec_alpha_num, '(I4,X), 2X, ', elec_beta_num, '(I4,X))'
|
write(format,*) '( ', elec_alpha_num, '(I4,X), 2X, ', elec_beta_num, '(I4,X))'
|
||||||
allocate ( list(bit_kind_size,2) )
|
allocate ( list(bit_kind_size,2) )
|
||||||
do i=1, N_det
|
do i=1, N_det
|
||||||
call bitstring_to_list( psi_det(1,1,i), list(1,1), n_elements, N_int)
|
call bitstring_to_list( psi_det(1,1,i), list(1,1), n_elements, N_int)
|
||||||
call bitstring_to_list( psi_det(1,2,i), list(1,2), n_elements, N_int)
|
call bitstring_to_list( psi_det(1,2,i), list(1,2), n_elements, N_int)
|
||||||
write(iunit,fmt) list(1:elec_alpha_num,1), list(1:elec_beta_num,2)
|
write(iunit,format) list(1:elec_alpha_num,1), list(1:elec_beta_num,2)
|
||||||
end do
|
end do
|
||||||
write(iunit, '(A)') 'end'
|
write(iunit, '(A)') 'end'
|
||||||
|
|
||||||
! CSF
|
! CSF
|
||||||
write(iunit, '(A, I10, X, I3)') 'csf', N_csf, N_states
|
write(iunit, '(A, I10, X, I3)') 'csf', N_csf, N_states
|
||||||
|
|
||||||
write(fmt,*) '(', N_csf, '(F12.8, X))'
|
write(format,*) '(', N_csf, '(F12.8, X))'
|
||||||
do i=1,N_states
|
do i=1,N_states
|
||||||
write(iunit, fmt) psi_csf_coef(1:N_csf,i)
|
write(iunit, format) psi_csf_coef(1:N_csf,i)
|
||||||
end do
|
end do
|
||||||
|
|
||||||
write(iunit, '(A)') 'end'
|
write(iunit, '(A)') 'end'
|
||||||
|
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