mirror of
https://gitlab.com/scemama/qp_plugins_scemama.git
synced 2024-12-22 04:13:40 +01:00
Merge branch 'master' of gitlab.com:AbdAmmar/qp_plugins_scemama
Conflicts: devel/svdwf/Evar_TruncSVD.irp.f devel/svdwf/NEED
This commit is contained in:
Abdallah Ammar
commit
7e1d1bcc9f
@ -1,4 +1,5 @@
|
||||
program export_integrals_mo
|
||||
PROVIDE mo_two_e_integrals_in_map
|
||||
call run
|
||||
end
|
||||
|
||||
@ -53,7 +54,8 @@ subroutine run
|
||||
integer :: n_integrals
|
||||
integer(key_kind) :: idx
|
||||
|
||||
double precision, external :: get_two_e_integral
|
||||
double precision, external :: mo_two_e_integral
|
||||
|
||||
|
||||
allocate (A(mo_num,mo_num))
|
||||
call ezfio_set_nuclei_nuclear_repulsion(nuclear_repulsion)
|
||||
@ -61,13 +63,15 @@ subroutine run
|
||||
call write_2d('T_mo.qp',mo_kinetic_integrals)
|
||||
call write_2d('P_mo.qp',mo_pseudo_integrals)
|
||||
call write_2d('V_mo.qp',mo_integrals_n_e)
|
||||
call write_2d('H_mo.qp',mo_one_e_integrals)
|
||||
|
||||
iunit = getunitandopen('W_mo.qp','w')
|
||||
do l=1,mo_num
|
||||
do k=1,mo_num
|
||||
do j=1,mo_num
|
||||
do i=1,mo_num
|
||||
integral = get_two_e_integral(i,j,k,l,mo_integrals_map)
|
||||
do j=l,mo_num
|
||||
do i=k,mo_num
|
||||
if (i==j .and. k<l) cycle
|
||||
integral = mo_two_e_integral(i,j,k,l)
|
||||
if (integral /= 0.d0) then
|
||||
write (iunit,'(4(I5,2X),E22.15)') i,j,k,l, integral
|
||||
endif
|
||||
|
||||
@ -17,31 +17,36 @@ subroutine run
|
||||
!
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||||
! E.qp : Contains the nuclear repulsion energy
|
||||
!
|
||||
! Tmo.qp : kinetic energy integrals
|
||||
! T_mo.qp : kinetic energy integrals
|
||||
!
|
||||
! Smo.qp : overlap matrix
|
||||
! P_mo.qp : pseudopotential integrals
|
||||
!
|
||||
! Pmo.qp : pseudopotential integrals
|
||||
! V_mo.qp : electron-nucleus potential
|
||||
!
|
||||
! Vmo.qp : electron-nucleus potential
|
||||
! H_mo.qp : core hamiltonian. If hmo exists, the other 1-e files are not read
|
||||
!
|
||||
! Wmo.qp : electron repulsion integrals
|
||||
! W_mo.qp : electron repulsion integrals
|
||||
!
|
||||
END_DOC
|
||||
|
||||
integer :: iunit
|
||||
integer :: getunitandopen
|
||||
integer :: iunit
|
||||
integer :: getunitandopen
|
||||
|
||||
integer ::i,j,k,l
|
||||
double precision :: integral
|
||||
double precision, allocatable :: A(:,:)
|
||||
integer :: i,j,k,l
|
||||
double precision :: integral
|
||||
double precision, allocatable :: A(:,:)
|
||||
|
||||
integer :: n_integrals
|
||||
integer(key_kind), allocatable :: buffer_i(:)
|
||||
integer :: n_integrals
|
||||
logical :: exists
|
||||
integer(key_kind), allocatable :: buffer_i(:)
|
||||
real(integral_kind), allocatable :: buffer_values(:)
|
||||
|
||||
allocate(buffer_i(mo_num**3), buffer_values(mo_num**3))
|
||||
allocate (A(mo_num,mo_num))
|
||||
PROVIDE mo_integrals_map
|
||||
PROVIDE mo_integrals_threshold
|
||||
|
||||
! Nuclear repulsion
|
||||
|
||||
A(1,1) = huge(1.d0)
|
||||
iunit = getunitandopen('E.qp','r')
|
||||
@ -53,70 +58,109 @@ subroutine run
|
||||
call ezfio_set_nuclei_io_nuclear_repulsion('Read')
|
||||
endif
|
||||
|
||||
A = 0.d0
|
||||
i = 1
|
||||
j = 1
|
||||
iunit = getunitandopen('Tmo.qp','r')
|
||||
do
|
||||
read (iunit,*,end=10) i,j, integral
|
||||
if (i<0 .or. i>mo_num) then
|
||||
print *, i
|
||||
stop 'i out of bounds in Tmo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (j<0 .or. j>mo_num) then
|
||||
print *, j
|
||||
stop 'j out of bounds in Tmo.qp'
|
||||
endif
|
||||
A(i,j) = integral
|
||||
enddo
|
||||
10 continue
|
||||
close(iunit)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_mo_integrals_kinetic(A)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_kinetic('Read')
|
||||
! One-electron integrals
|
||||
|
||||
A = 0.d0
|
||||
i = 1
|
||||
j = 1
|
||||
iunit = getunitandopen('Pmo.qp','r')
|
||||
do
|
||||
read (iunit,*,end=14) i,j, integral
|
||||
if (i<0 .or. i>mo_num) then
|
||||
print *, i
|
||||
stop 'i out of bounds in Pmo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (j<0 .or. j>mo_num) then
|
||||
print *, j
|
||||
stop 'j out of bounds in Pmo.qp'
|
||||
endif
|
||||
A(i,j) = integral
|
||||
enddo
|
||||
14 continue
|
||||
close(iunit)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_mo_integrals_pseudo(A)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_pseudo('Read')
|
||||
exists = .False.
|
||||
inquire(file='H_mo.qp',exist=exists)
|
||||
if (exists) then
|
||||
|
||||
A = 0.d0
|
||||
i = 1
|
||||
j = 1
|
||||
iunit = getunitandopen('Vmo.qp','r')
|
||||
do
|
||||
read (iunit,*,end=12) i,j, integral
|
||||
if (i<0 .or. i>mo_num) then
|
||||
print *, i
|
||||
stop 'i out of bounds in Vmo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (j<0 .or. j>mo_num) then
|
||||
print *, j
|
||||
stop 'j out of bounds in Vmo.qp'
|
||||
endif
|
||||
A(i,j) = integral
|
||||
enddo
|
||||
12 continue
|
||||
close(iunit)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_mo_integrals_n_e(A)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_n_e('Read')
|
||||
A = 0.d0
|
||||
i = 1
|
||||
j = 1
|
||||
iunit = getunitandopen('H_mo.qp','r')
|
||||
do
|
||||
read (iunit,*,end=8) i,j, integral
|
||||
if (i<0 .or. i>mo_num) then
|
||||
print *, i
|
||||
stop 'i out of bounds in H_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (j<0 .or. j>mo_num) then
|
||||
print *, j
|
||||
stop 'j out of bounds in H_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
A(i,j) = integral
|
||||
enddo
|
||||
8 continue
|
||||
close(iunit)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_mo_one_e_integrals(A)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_one_e_integrals('Read')
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_kinetic('None')
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_pseudo('None')
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_n_e('None')
|
||||
|
||||
iunit = getunitandopen('Wmo.qp','r')
|
||||
else
|
||||
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_one_e_integrals('None')
|
||||
|
||||
A = 0.d0
|
||||
i = 1
|
||||
j = 1
|
||||
iunit = getunitandopen('T_mo.qp','r')
|
||||
do
|
||||
read (iunit,*,end=10) i,j, integral
|
||||
if (i<0 .or. i>mo_num) then
|
||||
print *, i
|
||||
stop 'i out of bounds in T_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (j<0 .or. j>mo_num) then
|
||||
print *, j
|
||||
stop 'j out of bounds in T_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
A(i,j) = integral
|
||||
enddo
|
||||
10 continue
|
||||
close(iunit)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_mo_integrals_kinetic(A)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_kinetic('Read')
|
||||
|
||||
A = 0.d0
|
||||
i = 1
|
||||
j = 1
|
||||
iunit = getunitandopen('P_mo.qp','r')
|
||||
do
|
||||
read (iunit,*,end=14) i,j, integral
|
||||
if (i<0 .or. i>mo_num) then
|
||||
print *, i
|
||||
stop 'i out of bounds in P_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (j<0 .or. j>mo_num) then
|
||||
print *, j
|
||||
stop 'j out of bounds in P_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
A(i,j) = integral
|
||||
enddo
|
||||
14 continue
|
||||
close(iunit)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_mo_integrals_pseudo(A)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_pseudo('Read')
|
||||
|
||||
A = 0.d0
|
||||
i = 1
|
||||
j = 1
|
||||
iunit = getunitandopen('V_mo.qp','r')
|
||||
do
|
||||
read (iunit,*,end=12) i,j, integral
|
||||
if (i<0 .or. i>mo_num) then
|
||||
print *, i
|
||||
stop 'i out of bounds in V_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (j<0 .or. j>mo_num) then
|
||||
print *, j
|
||||
stop 'j out of bounds in V_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
A(i,j) = integral
|
||||
enddo
|
||||
12 continue
|
||||
close(iunit)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_mo_integrals_n_e(A)
|
||||
call ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_n_e('Read')
|
||||
|
||||
end if
|
||||
|
||||
|
||||
! Two-electron integrals
|
||||
|
||||
iunit = getunitandopen('W_mo.qp','r')
|
||||
n_integrals=0
|
||||
i = 1
|
||||
j = 1
|
||||
@ -127,26 +171,25 @@ subroutine run
|
||||
read (iunit,*,end=13) i,j,k,l, integral
|
||||
if (i<0 .or. i>mo_num) then
|
||||
print *, i
|
||||
stop 'i out of bounds in Wmo.qp'
|
||||
stop 'i out of bounds in W_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (j<0 .or. j>mo_num) then
|
||||
print *, j
|
||||
stop 'j out of bounds in Wmo.qp'
|
||||
stop 'j out of bounds in W_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (k<0 .or. k>mo_num) then
|
||||
print *, k
|
||||
stop 'k out of bounds in Wmo.qp'
|
||||
stop 'k out of bounds in W_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
if (l<0 .or. l>mo_num) then
|
||||
print *, l
|
||||
stop 'l out of bounds in Wmo.qp'
|
||||
stop 'l out of bounds in W_mo.qp'
|
||||
endif
|
||||
n_integrals += 1
|
||||
call mo_two_e_integrals_index(i, j, k, l, buffer_i(n_integrals) )
|
||||
buffer_values(n_integrals) = integral
|
||||
if (n_integrals == size(buffer_i)) then
|
||||
call insert_into_mo_integrals_map(n_integrals, buffer_i, buffer_values, &
|
||||
real(mo_integrals_threshold,integral_kind))
|
||||
call map_append(mo_integrals_map, buffer_i, buffer_values, n_integrals)
|
||||
n_integrals = 0
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
@ -154,13 +197,15 @@ subroutine run
|
||||
close(iunit)
|
||||
|
||||
if (n_integrals > 0) then
|
||||
call insert_into_mo_integrals_map(n_integrals, buffer_i, buffer_values, &
|
||||
real(mo_integrals_threshold,integral_kind))
|
||||
call map_append(mo_integrals_map, buffer_i, buffer_values, n_integrals)
|
||||
endif
|
||||
|
||||
call map_sort(mo_integrals_map)
|
||||
call map_unique(mo_integrals_map)
|
||||
|
||||
call map_save_to_disk(trim(ezfio_filename)//'/work/mo_ints',mo_integrals_map)
|
||||
call ezfio_set_mo_two_e_ints_io_mo_two_e_integrals('Read')
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@ -44,14 +44,14 @@ subroutine run
|
||||
print *, 'matrix:', m,'x',n
|
||||
print *, 'N det:', N_det
|
||||
! !!!
|
||||
r_init = 78 !!!42
|
||||
delta_r = 1
|
||||
r_init = 78
|
||||
delta_r = 5
|
||||
! !!!
|
||||
PowerIt_max = 10
|
||||
nb_oversamp = 10
|
||||
! !!!
|
||||
It_max = 10
|
||||
error_thr = 1.d-3 !not stable if less thant 0.001
|
||||
error_thr = 1.d-3 !! don't touche it but rather increase r_init
|
||||
! !!!
|
||||
! !!! ~ !!! ~ !!! ~ !!! ~ !!! ~ !!! ~ !!! ~ !!! ~ !!! !
|
||||
! !!! ~ Rank Revealing Randomized SVD ~ !!! !
|
||||
|
||||
@ -22,13 +22,17 @@ subroutine run
|
||||
|
||||
allocate(Z(m,r))
|
||||
|
||||
! Z(m,r) = A(m,n).P(n,r)
|
||||
Z(:,:) = 0.d0
|
||||
! Z(m,r) = A(m,n).P(n,r)
|
||||
do j=1,r
|
||||
do i=1,m
|
||||
Z(i,j) = 0.d0
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
allocate(P(n,r))
|
||||
|
||||
!$OMP PARALLEL DEFAULT(SHARED) PRIVATE(i,j,k,l,r1)
|
||||
allocate(r1(N_det,2))
|
||||
!$OMP DO
|
||||
!$OMP DO
|
||||
do l=1,r
|
||||
call random_number(r1)
|
||||
r1(:,1) = dsqrt(-2.d0*dlog(r1(:,1)))
|
||||
@ -36,7 +40,7 @@ subroutine run
|
||||
do k=1,N_det
|
||||
i = psi_bilinear_matrix_rows(k)
|
||||
j = psi_bilinear_matrix_columns(k)
|
||||
Z(i,l) = Z(i,l) + psi_bilinear_matrix_values(k,1) * r1(k,1)
|
||||
Z(i,l) = Z(i,l) + psi_bilinear_matrix_values(k,1) * r1(k,1)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END DO
|
||||
@ -100,7 +104,7 @@ subroutine run
|
||||
call svd(Yt,size(Yt,1),V,size(V,1),D,UYt,size(UYt,1),n,r)
|
||||
deallocate(Yt)
|
||||
|
||||
! U(m,r) = Z(m,r).UY(r,r)
|
||||
! U(m,r) = Z(m,r).UY(r,r)
|
||||
allocate(U(m,r))
|
||||
call dgemm('N','T',m,r,r,1.d0,Z,size(Z,1),UYt,size(UYt,1),0.d0,U,size(U,1))
|
||||
deallocate(UYt,Z)
|
||||
|
||||
@ -53,6 +53,10 @@ subroutine run
|
||||
print *, 'threshold: ', 2.858 * D(k/2)
|
||||
print *, 'Entropy : ', entropy
|
||||
|
||||
call ezfio_set_spindeterminants_psi_svd_alpha(U)
|
||||
call ezfio_set_spindeterminants_psi_svd_beta (Vt)
|
||||
call ezfio_set_spindeterminants_psi_svd_coefs(D)
|
||||
|
||||
! do i=1,n_det_alpha_unique
|
||||
! print '(I6,4(X,F12.8))', i, U(i,1:4)
|
||||
! enddo
|
||||
|
||||
@ -55,16 +55,16 @@ subroutine routine_s2
|
||||
integer :: i,j,k
|
||||
double precision :: accu(N_states)
|
||||
|
||||
print *, 'Weights of the SOP'
|
||||
print *, 'Weights of the CFG'
|
||||
do i=1,N_det
|
||||
print *, i, real(weight_occ_pattern(det_to_occ_pattern(i),:)), real(sum(weight_occ_pattern(det_to_occ_pattern(i),:)))
|
||||
print *, i, real(weight_configuration(det_to_configuration(i),:)), real(sum(weight_configuration(det_to_configuration(i),:)))
|
||||
enddo
|
||||
print*, 'Min weight of the occupation pattern ?'
|
||||
read(5,*) wmin
|
||||
|
||||
ndet_max = 0
|
||||
do i=1,N_det
|
||||
if (maxval(weight_occ_pattern( det_to_occ_pattern(i),:)) < wmin) cycle
|
||||
if (maxval(weight_configuration( det_to_configuration(i),:)) < wmin) cycle
|
||||
ndet_max = ndet_max+1
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
@ -73,7 +73,7 @@ subroutine routine_s2
|
||||
accu = 0.d0
|
||||
k=0
|
||||
do i = 1, N_det
|
||||
if (maxval(weight_occ_pattern( det_to_occ_pattern(i),:)) < wmin) cycle
|
||||
if (maxval(weight_configuration( det_to_configuration(i),:)) < wmin) cycle
|
||||
k = k+1
|
||||
do j = 1, N_int
|
||||
psi_det_tmp(j,1,k) = psi_det(j,1,i)
|
||||
|
||||
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