mirror of
https://gitlab.com/scemama/qp_plugins_scemama.git
synced 2024-11-07 14:43:41 +01:00
Allow no basis set
This commit is contained in:
parent
192f4c6913
commit
6f04cc0eb0
@ -1,8 +1,22 @@
|
|||||||
program import_integrals_ao
|
program import_integrals_ao
|
||||||
call run
|
use trexio
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer(trexio_t) :: f ! TREXIO file handle
|
||||||
|
integer(trexio_exit_code) :: rc
|
||||||
|
|
||||||
|
f = trexio_open(trexio_filename, 'r', TREXIO_AUTO, rc)
|
||||||
|
if (f == 0_8) then
|
||||||
|
print *, 'Unable to open TREXIO file for reading'
|
||||||
|
print *, 'rc = ', rc
|
||||||
|
stop -1
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
call run(f)
|
||||||
|
rc = trexio_close(f)
|
||||||
|
call trexio_assert(rc, TREXIO_SUCCESS)
|
||||||
end
|
end
|
||||||
|
|
||||||
subroutine run
|
subroutine run(f)
|
||||||
use trexio
|
use trexio
|
||||||
use map_module
|
use map_module
|
||||||
implicit none
|
implicit none
|
||||||
@ -10,7 +24,7 @@ subroutine run
|
|||||||
! Program to import integrals from TREXIO
|
! Program to import integrals from TREXIO
|
||||||
END_DOC
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
integer(trexio_t) :: f ! TREXIO file handle
|
integer(trexio_t), intent(in) :: f ! TREXIO file handle
|
||||||
integer(trexio_exit_code) :: rc
|
integer(trexio_exit_code) :: rc
|
||||||
|
|
||||||
integer ::i,j,k,l
|
integer ::i,j,k,l
|
||||||
@ -25,16 +39,6 @@ subroutine run
|
|||||||
double precision, allocatable :: V(:)
|
double precision, allocatable :: V(:)
|
||||||
integer , allocatable :: Vi(:,:)
|
integer , allocatable :: Vi(:,:)
|
||||||
double precision :: s
|
double precision :: s
|
||||||
PROVIDE ao_num
|
|
||||||
|
|
||||||
f = trexio_open(trexio_filename, 'r', TREXIO_AUTO, rc)
|
|
||||||
if (f == 0_8) then
|
|
||||||
print *, 'Unable to open TREXIO file for reading'
|
|
||||||
print *, 'rc = ', rc
|
|
||||||
stop -1
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
if (trexio_has_nucleus_repulsion(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
if (trexio_has_nucleus_repulsion(f) == TREXIO_SUCCESS) then
|
||||||
rc = trexio_read_nucleus_repulsion(f, s)
|
rc = trexio_read_nucleus_repulsion(f, s)
|
||||||
|
@ -72,6 +72,8 @@ def write_ezfio(trexio_filename, filename):
|
|||||||
|
|
||||||
print("Nuclei\t\t...\t", end=' ')
|
print("Nuclei\t\t...\t", end=' ')
|
||||||
|
|
||||||
|
charge = [0.]
|
||||||
|
if trexio.has_nucleus(trexio_file):
|
||||||
charge = trexio.read_nucleus_charge(trexio_file)
|
charge = trexio.read_nucleus_charge(trexio_file)
|
||||||
ezfio.set_nuclei_nucl_num(len(charge))
|
ezfio.set_nuclei_nucl_num(len(charge))
|
||||||
ezfio.set_nuclei_nucl_charge(charge)
|
ezfio.set_nuclei_nucl_charge(charge)
|
||||||
@ -89,6 +91,12 @@ def write_ezfio(trexio_filename, filename):
|
|||||||
label = [p.sub("", x).capitalize() for x in label]
|
label = [p.sub("", x).capitalize() for x in label]
|
||||||
ezfio.set_nuclei_nucl_label(label)
|
ezfio.set_nuclei_nucl_label(label)
|
||||||
|
|
||||||
|
else:
|
||||||
|
ezfio.set_nuclei_nucl_num(1)
|
||||||
|
ezfio.set_nuclei_nucl_charge([0.])
|
||||||
|
ezfio.set_nuclei_nucl_coord([0.,0.,0.])
|
||||||
|
ezfio.set_nuclei_nucl_label(["X"])
|
||||||
|
|
||||||
print("OK")
|
print("OK")
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
@ -104,6 +112,9 @@ def write_ezfio(trexio_filename, filename):
|
|||||||
except:
|
except:
|
||||||
num_alpha = sum(charge) - num_beta
|
num_alpha = sum(charge) - num_beta
|
||||||
|
|
||||||
|
if num_alpha == 0:
|
||||||
|
print("\n\nError: There are zero electrons in the TREXIO file.\n\n")
|
||||||
|
sys.exit(1)
|
||||||
ezfio.set_electrons_elec_alpha_num(num_alpha)
|
ezfio.set_electrons_elec_alpha_num(num_alpha)
|
||||||
ezfio.set_electrons_elec_beta_num(num_beta)
|
ezfio.set_electrons_elec_beta_num(num_beta)
|
||||||
|
|
||||||
@ -111,10 +122,11 @@ def write_ezfio(trexio_filename, filename):
|
|||||||
|
|
||||||
print("Basis\t\t...\t", end=' ')
|
print("Basis\t\t...\t", end=' ')
|
||||||
|
|
||||||
|
shell_num = 0
|
||||||
try:
|
try:
|
||||||
basis_type = trexio.read_basis_type(trexio_file)
|
basis_type = trexio.read_basis_type(trexio_file)
|
||||||
|
|
||||||
if basis_type.lower() != "gaussian":
|
if basis_type.lower() not in ["gaussian", "slater"]:
|
||||||
raise TypeError
|
raise TypeError
|
||||||
|
|
||||||
shell_num = trexio.read_basis_shell_num(trexio_file)
|
shell_num = trexio.read_basis_shell_num(trexio_file)
|
||||||
@ -173,14 +185,19 @@ def write_ezfio(trexio_filename, filename):
|
|||||||
|
|
||||||
print("AOS\t\t...\t", end=' ')
|
print("AOS\t\t...\t", end=' ')
|
||||||
|
|
||||||
ao_shell = trexio.read_ao_shell(trexio_file)
|
try:
|
||||||
cartesian = trexio.read_ao_cartesian(trexio_file)
|
cartesian = trexio.read_ao_cartesian(trexio_file)
|
||||||
|
except:
|
||||||
|
cartesian = True
|
||||||
|
|
||||||
if not cartesian:
|
if not cartesian:
|
||||||
raise TypeError('Only cartesian TREXIO files can be converted')
|
raise TypeError('Only cartesian TREXIO files can be converted')
|
||||||
|
|
||||||
ao_num = trexio.read_ao_num(trexio_file)
|
ao_num = trexio.read_ao_num(trexio_file)
|
||||||
ezfio.set_ao_basis_ao_num(ao_num)
|
ezfio.set_ao_basis_ao_num(ao_num)
|
||||||
|
|
||||||
|
if shell_num > 0:
|
||||||
|
ao_shell = trexio.read_ao_shell(trexio_file)
|
||||||
at = [ nucl_index[i]+1 for i in ao_shell ]
|
at = [ nucl_index[i]+1 for i in ao_shell ]
|
||||||
ezfio.set_ao_basis_ao_nucl(at)
|
ezfio.set_ao_basis_ao_nucl(at)
|
||||||
|
|
||||||
|
Loading…
Reference in New Issue
Block a user