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378
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378
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@ -1065,57 +1065,6 @@
|
||||
"$< \\phi_i | r | \\phi_i > = < \\phi_i | x | \\phi_i > + < \\phi_i | y | \\phi_i > + < \\phi_i | z | \\phi_i >$\n"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"(*\n",
|
||||
"(* Fonction calcul alpha Boys *)\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let n_ao = Mat.dim1 m_C ;;\n",
|
||||
"let n_mo = Mat.dim2 m_C ;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let multipoles = \n",
|
||||
" AOBasis.multipole ao_basis;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let m_alpha_boys multipoles = \n",
|
||||
"\n",
|
||||
" let phi_x_phi =\n",
|
||||
" Multipole.matrix_x multipoles \n",
|
||||
" |> MOBasis.mo_matrix_of_ao_matrix ~mo_coef \n",
|
||||
" in \n",
|
||||
" let phi_y_phi =\n",
|
||||
" Multipole.matrix_y multipoles \n",
|
||||
" |> MOBasis.mo_matrix_of_ao_matrix ~mo_coef \n",
|
||||
" in\n",
|
||||
" let phi_z_phi =\n",
|
||||
" Multipole.matrix_y multipoles \n",
|
||||
" |> MOBasis.mo_matrix_of_ao_matrix ~mo_coef\n",
|
||||
" in \n",
|
||||
"\n",
|
||||
" let m_b12= \n",
|
||||
" let b12 g = Mat.init_cols n_ao n_ao ( fun i j ->\n",
|
||||
" (g.{i,i} -. g.{j,j}) *. g.{i,j})\n",
|
||||
"\n",
|
||||
" in \n",
|
||||
" Mat.add (b12 phi_x_phi) ( Mat.add (b12 phi_y_phi) (b12 phi_z_phi))\n",
|
||||
" in \n",
|
||||
" let m_a12 =\n",
|
||||
" let a12 g = Mat.init_cols n_ao n_ao ( fun i j -> \n",
|
||||
" g.{i,j} *. g.{i,j} -. 0.25 *. (g.{i,i} -. g.{j,j} *. g.{i,i} -. g.{j,j}))\n",
|
||||
" in\n",
|
||||
" Mat.add (a12 phi_x_phi) ( Mat.add (a12 phi_y_phi) (a12 phi_z_phi))\n",
|
||||
" in\n",
|
||||
" Mat.init_cols n_ao n_ao ( fun i j ->\n",
|
||||
" 0.25 *. asin(m_b12.{i,j} /. sqrt((m_a12.{i,j}**2.) +. (m_b12.{i,j}**2.) )));;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"m_alpha_boys multipoles;;\n",
|
||||
"*)"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
@ -1706,12 +1655,7 @@
|
||||
"\n",
|
||||
"(****************************)\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"f_alpha_boys m_C;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let phi_x_phi =\n",
|
||||
" Multipole.matrix_x multipoles \n",
|
||||
" |> MOBasis.mo_matrix_of_ao_matrix ~mo_coef ;;\n",
|
||||
" "
|
||||
"f_alpha_boys m_C;;"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
@ -1757,78 +1701,6 @@
|
||||
"d_boys m_C;;"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"(* Test méthode de calcul de alpha *)\n",
|
||||
"let calcul_alpha_2 methode = \n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let alpha_boys = f_alpha_boys m_C\n",
|
||||
"in\n",
|
||||
"let alpha_er = f_alpha m_C\n",
|
||||
"in\n",
|
||||
"let alpha methode =\n",
|
||||
" match methode with \n",
|
||||
" | \"Boys\"\n",
|
||||
" | \"boys\" -> alpha_boys\n",
|
||||
" | \"ER\"\n",
|
||||
" | \"er\" -> alpha_er\n",
|
||||
" | _ -> invalid_arg \"Unknown method, please enter Boys or ER\"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"in \n",
|
||||
"alpha methode;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"(*************************)\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"(*\n",
|
||||
"calcul_alpha_2 \"ER\" ;;\n",
|
||||
"calcul_alpha_2 \"Boys\" ;;\n",
|
||||
"let methode = \"ER\";;\n",
|
||||
"let m_alpha = calcul_alpha_2 methode;;\n",
|
||||
"*)"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"(* Test méthode de calcul du critère de convergence *)\n",
|
||||
"let calcul_cc methode = \n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let b_boys = d_boys m_C\n",
|
||||
"in\n",
|
||||
"let d_er = s_D m_C\n",
|
||||
"in\n",
|
||||
"let cc methode =\n",
|
||||
" match methode with \n",
|
||||
" | \"Boys\"\n",
|
||||
" | \"boys\" -> b_boys\n",
|
||||
" | \"ER\"\n",
|
||||
" | \"er\" -> d_er\n",
|
||||
" | _ -> invalid_arg \"Unknown method, please enter Boys or ER\"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"in \n",
|
||||
"cc methode;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"(*************************)\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"(*\n",
|
||||
"calcul_cc \"boys\";;\n",
|
||||
"*)"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": []
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
@ -2117,6 +1989,7 @@
|
||||
" (* Fonction de calcul de la nouvelle matrice de coef après rotation d'un angle alpha *)\n",
|
||||
" let new_m_C m_C methode =\n",
|
||||
" \n",
|
||||
" (* Fonction de pattern matching en fonction de la méthode *)\n",
|
||||
" let alphad = m_alpha_d methode m_C \n",
|
||||
" in\n",
|
||||
" \n",
|
||||
@ -2204,15 +2077,6 @@
|
||||
"final_m_C m_C \"ER\" 1;;"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"final_m_C m_C \"Boys\" 10;;"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
@ -2226,6 +2090,8 @@
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"(* Ancienne boucle\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"(* Localisation de Edminstion *)\n",
|
||||
"let n_rec_alpha = 10;;\n",
|
||||
"(* Calcul de la nouvelle matrice des coefficient après n rotation d'orbitales *)\n",
|
||||
@ -2312,7 +2178,9 @@
|
||||
"(*Util.debug_matrix \"new_alpha_m\" (f_alpha m_C);*)\n",
|
||||
"(*Util.debug_matrix \"m_new_m_C\" m_new_m_C;*)\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"final_m_C m_new_m_C (n-1);;"
|
||||
"final_m_C m_new_m_C (n-1);;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"*)"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
@ -2325,13 +2193,6 @@
|
||||
"final_m_C m_C 10;;"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": []
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
@ -2826,83 +2687,6 @@
|
||||
"*)"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"source": [
|
||||
"### test"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"(*Test critère de convergence -> norme de alpha *)\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let norme m_alpha =\n",
|
||||
" let vec_alpha = \n",
|
||||
" Mat.as_vec m_alpha\n",
|
||||
" in\n",
|
||||
" let vec2_alpha = \n",
|
||||
" Vec.sqr vec_alpha\n",
|
||||
" in\n",
|
||||
" let norme2 = Vec.sum vec2_alpha\n",
|
||||
"in\n",
|
||||
"sqrt(norme2);;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"norme m_alpha;;"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"(* Test choix méthode *)\n",
|
||||
"type localisation = \n",
|
||||
" | Boys\n",
|
||||
" | Edminston \n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let toto localisation = \n",
|
||||
" match localisation with \n",
|
||||
" | Boys -> 1. +. 1.\n",
|
||||
" | Edminston -> 1. +. 2.;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"toto Boys ;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let titi lo=\n",
|
||||
"if lo=\"Boys\" then 1. else 2.;;\n",
|
||||
"titi \"Boys\";;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let alpha localisation toto = \n",
|
||||
"if localisation = 1 \n",
|
||||
"then \n",
|
||||
"\n",
|
||||
"else \n",
|
||||
"\n"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"source": [
|
||||
"## Boys"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": []
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
@ -2910,147 +2694,6 @@
|
||||
"# OLD ->"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"\n",
|
||||
"let ee_ints = AOBasis.ee_ints ao_basis;;\n",
|
||||
"let m_C = MOBasis.mo_coef mo_basis;;\n",
|
||||
"let n_ao = Mat.dim1 m_C ;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let sum a = \n",
|
||||
" Array.fold_left (fun accu x -> accu +. x) 0. a\n",
|
||||
";;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let i = 1;;\n",
|
||||
"let j = 2;;\n",
|
||||
" (*Calcul des intégrales*) \n",
|
||||
"let integral_general g i j =\n",
|
||||
"Array.map (fun a ->\n",
|
||||
" let v = \n",
|
||||
" Array.map (fun b ->\n",
|
||||
" let u = \n",
|
||||
" Array.map (fun e ->\n",
|
||||
" let t = Array.map (fun f ->\n",
|
||||
" (g a b e f i j) *. ERI.get_phys ee_ints a e b f\n",
|
||||
" ) (Util.array_range 1 n_ao)\n",
|
||||
" in sum t\n",
|
||||
" ) (Util.array_range 1 n_ao)\n",
|
||||
" in sum u\n",
|
||||
" ) (Util.array_range 1 n_ao)\n",
|
||||
" in sum v\n",
|
||||
") (Util.array_range 1 n_ao)\n",
|
||||
"|> sum\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let func_a12 = \n",
|
||||
" integral_general (fun a b e f i j ->\n",
|
||||
" m_C.{a,i} *. m_C.{b,i} *. m_C.{e,i} *. m_C.{f,j} \n",
|
||||
" -. 0.25 *. ( m_C.{e,i} *. m_C.{f,i} -. m_C.{e,j} *. m_C.{f,j} ) \n",
|
||||
" *. ( m_C.{a,i} *. m_C.{b,i} -. m_C.{a,j} *. m_C.{b,j} ) \n",
|
||||
" )\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let func_b12 = \n",
|
||||
" integral_general (fun a b e f i j ->\n",
|
||||
" ( m_C.{a,i} *. m_C.{b,i} -. m_C.{a,j} *. m_C.{b,j} ) *. m_C.{e,i} *. m_C.{f,j}\n",
|
||||
" )\n"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"let i =1;;\n",
|
||||
"let j = 2;;\n",
|
||||
"let b12 = \n",
|
||||
" integral_general (fun a b e f i j ->\n",
|
||||
" ( m_C.{a,i} *. m_C.{b,i} -. m_C.{a,j} *. m_C.{b,j} ) *. m_C.{e,i} *. m_C.{f,j}\n",
|
||||
" )"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"(*Calcul de alpha*)\n",
|
||||
"let alpha = asin(func_b12 /. sqrt((func_a12)**2. +. (func_b12)**2.));;"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "code",
|
||||
"execution_count": null,
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"outputs": [],
|
||||
"source": [
|
||||
"(*Matrice b12*)\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let m_b12 = Mat.init_cols 10 10 (fun i j -> \n",
|
||||
"integral_general (fun a b e f i j ->\n",
|
||||
" ( m_C.{a,i} *. m_C.{b,i} -. m_C.{a,j} *. m_C.{b,j} ) *. m_C.{e,i} *. m_C.{f,j}\n",
|
||||
" ) i j\n",
|
||||
" )\n",
|
||||
"\n",
|
||||
"let vec_test = Mat.as_vec m_b12\n",
|
||||
"|> iamax;;\n",
|
||||
"\n",
|
||||
" \n",
|
||||
"let test = Mat.max2 m_b12;;"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"source": [
|
||||
"$\\langle \\phi_i \\phi_j | \\phi_i \\phi_j \\rangle =\n",
|
||||
"\\sum_a c_{ai} \\langle \\chi_a \\phi_j | \\phi_i \\phi_j \\rangle =\n",
|
||||
"\\sum_a \\sum_b c_{ai} c_{bj} \\langle \\chi_a \\chi_b | \\phi_i \\phi_j \\rangle =$\n",
|
||||
"$\\left(\\sum_a c_{ai} \\sum_b \\left(c_{bj} \\sum_e \\left(c_{ei} \\sum_f \\left(c_{fj} \\langle \\chi_a \\chi_b | \\chi_e \\chi_f \\rangle \\right)\\right)\\right)\\right) =$\n",
|
||||
"$\\sum_a \\sum_b \\sum_e \\sum_f \\left( c_{ai} c_{bj} c_{ei} c_{fj} \\langle \\chi_a \\chi_b | \\chi_e \\chi_f \\rangle \\right) $"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"source": [
|
||||
"$\\phi_i ^2 = \\left( \\sum_a c_{ai} \\chi_a \\right)^2$\n",
|
||||
"$= \\sum_a c_{ai} \\sum_b c_{bi} \\chi_a \\chi_b$"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"source": [
|
||||
"$\\phi_i ^2 - \\phi_j ^2 = \\left( \\sum_a c_{ai} \\chi_a \\right)^2 - \\left( \\sum_a c_{aj} \\chi_a \\right)^2$\n",
|
||||
"$= \\sum_a c_{ai} \\sum_b c_{bi} \\chi_a \\chi_b - \\sum_a c_{aj} \\sum_b c_{bj} \\chi_a \\chi_b$"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"source": [
|
||||
"$[\\phi_i ^2 - \\phi_j ^2 | \\phi_i \\phi_j ] = [\\left( \\sum_a c_{ai} \\chi_i \\right)^2 - \\left( \\sum_a c_{aj} \\chi_j \\right)^2| \\phi_i \\phi_j ] $\n",
|
||||
"$= \\sum_a c_{ai} \\sum_b c_{bi} [\\chi_a \\chi_b| \\phi_i \\phi_j ] - \\sum_a c_{aj} \\sum_b c_{bj} [ \\chi_a \\chi_b| \\phi_i \\phi_j ] $\n",
|
||||
"$= \\left(\\sum_a c_{ai} \\sum_b c_{bi} - \\sum_a c_{aj} \\sum_b c_{bj} \\right) [ \\chi_a \\chi_b| \\phi_i \\phi_j ] $\n",
|
||||
"$= \\left(\\sum_a c_{ai} \\sum_b c_{bi} - \\sum_a c_{aj} \\sum_b c_{bj} \\right) \\sum_e \\sum_f c_{ei} c_{fj} [ \\chi_a \\chi_b| \\chi_e \\chi_f ] $"
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"cell_type": "markdown",
|
||||
"metadata": {},
|
||||
"source": [
|
||||
"$\\langle \\phi_i | x | \\phi_j \\rangle$\n",
|
||||
"$=\\langle \\sum_a c_{ia} \\chi_a | x | \\sum_b c_{jb} \\chi_b\\rangle$\n",
|
||||
"$=\\sum_a \\sum_b c_{jb} c_{ia} \\langle \\chi_a | x | \\chi_b\\rangle$"
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]
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},
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{
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"cell_type": "code",
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||||
"execution_count": null,
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@ -3060,13 +2703,6 @@
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"let ints = MOBasis.ee_ints mo_basis in\n",
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"ERI.get_phys ints 1 2 1 2;;"
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||||
]
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||||
},
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||||
{
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||||
"cell_type": "code",
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||||
"execution_count": null,
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||||
"metadata": {},
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||||
"outputs": [],
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||||
"source": []
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||||
}
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||||
],
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||||
"metadata": {
|
||||
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