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[WIP] add C test for sparse I/O in text back end
This commit is contained in:
parent
d3ba8f3652
commit
db4b66d81d
@ -90,6 +90,7 @@ TESTS_C = \
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||||
tests/io_num_text \
|
||||
tests/io_dset_float_text \
|
||||
tests/io_dset_int_text \
|
||||
tests/io_dset_sparse_text \
|
||||
tests/io_safe_dset_float_text \
|
||||
tests/io_str_text \
|
||||
tests/io_dset_str_text \
|
||||
@ -123,6 +124,7 @@ tests_open_text_LDFLAGS = -no-install
|
||||
tests_io_num_text_LDFLAGS = -no-install
|
||||
tests_io_dset_float_text_LDFLAGS = -no-install
|
||||
tests_io_dset_int_text_LDFLAGS = -no-install
|
||||
tests_io_dset_sparse_text_LDFLAGS = -no-install
|
||||
tests_io_safe_dset_float_text_LDFLAGS = -no-install
|
||||
tests_io_str_text_LDFLAGS = -no-install
|
||||
tests_io_dset_str_text_LDFLAGS = -no-install
|
||||
@ -271,4 +273,3 @@ CLEANFILES += $(pytrexio_c) \
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||||
.PHONY: cppcheck python-test python-install python-sdist check-numpy FORCE
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||||
|
||||
endif
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||||
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||||
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@ -1,11 +1,12 @@
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||||
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||||
# ================= TESTING =================
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||||
# ================= TESTING =================
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||||
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||||
# Create a list of tests for TEXT back end.
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||||
set(Tests_text
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open_text
|
||||
io_dset_float_text
|
||||
io_dset_str_text
|
||||
io_dset_sparse_text
|
||||
io_safe_dset_float_text
|
||||
io_dset_int_text
|
||||
io_num_text
|
||||
@ -43,4 +44,3 @@ endforeach()
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||||
add_executable(test_f test_f.f90)
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||||
target_link_libraries(test_f PRIVATE trexio_f)
|
||||
add_test(NAME test_f COMMAND $<TARGET_FILE:test_f>)
|
||||
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||||
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108
tests/io_dset_sparse_text.c
Normal file
108
tests/io_dset_sparse_text.c
Normal file
@ -0,0 +1,108 @@
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||||
#include <stdint.h>
|
||||
#include <stdlib.h>
|
||||
#include <stdio.h>
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||||
#include "trexio.h"
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||||
#include <assert.h>
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||||
#define FILENAME "test_sparse.dir"
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||||
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||||
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int main(){
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uint64_t offset_f = 0;
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// create the data to write
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uint64_t size = 100;
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int32_t* index;
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double* value;
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||||
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||||
index = calloc(4L*size, sizeof(int32_t));
|
||||
value = calloc(size, sizeof(double));
|
||||
|
||||
for(int i=0; i<size; i++){
|
||||
index[4*i] = 4*i;
|
||||
index[4*i+1] = 4*i+1;
|
||||
index[4*i+2] = 4*i+2;
|
||||
index[4*i+3] = 4*i+3;
|
||||
value[i] = 3.14 + (double) i;
|
||||
}
|
||||
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||||
int rc_open;
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||||
trexio_t* trexio_file = trexio_open(FILENAME, 'w', TREXIO_TEXT, &rc_open);
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||||
assert(rc_open == TREXIO_SUCCESS);
|
||||
assert(trexio_file != NULL);
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||||
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||||
// check if the file exists
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||||
int rc;
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||||
rc = trexio_has_mo_2e_int_eri(trexio_file);
|
||||
assert(rc==TREXIO_SUCCESS || rc==TREXIO_HAS_NOT);
|
||||
|
||||
if(rc==TREXIO_HAS_NOT){
|
||||
printf("FILE DID NOT EXIST AT THE START.\n");
|
||||
} else {
|
||||
printf("FILE EXIST AT THE START.\n");
|
||||
}
|
||||
|
||||
// check that previous call to has_sparse did not create a file
|
||||
if (rc==TREXIO_HAS_NOT) {
|
||||
rc = trexio_has_mo_2e_int_eri(trexio_file);
|
||||
assert(rc==TREXIO_HAS_NOT);
|
||||
}
|
||||
|
||||
// define chunks: here they contain 20 elements, i.e. 100/5
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||||
int n_chunks = 5;
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||||
uint64_t chunk_size = size/n_chunks;
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||||
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||||
// write 5 chunks using write_sparse
|
||||
for(int i=0; i<n_chunks; ++i){
|
||||
rc = trexio_write_mo_2e_int_eri(trexio_file, offset_f, offset_f, chunk_size, index, value);
|
||||
assert(rc==TREXIO_SUCCESS);
|
||||
offset_f += chunk_size;
|
||||
}
|
||||
|
||||
rc = trexio_close(trexio_file);
|
||||
assert(rc == TREXIO_SUCCESS);
|
||||
// TODO: SHOULD NOT TREXIO_CLOSE SET TO NULL THE TREXIO_T POINTER ???
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||||
//assert(trexio_file == NULL);
|
||||
|
||||
trexio_t* trexio_file_2 = trexio_open(FILENAME, 'w', TREXIO_TEXT, &rc_open);
|
||||
assert(rc_open == TREXIO_SUCCESS);
|
||||
assert(trexio_file_2 != NULL);
|
||||
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||||
// define arrays to read into
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||||
int32_t* index_read;
|
||||
double* value_read;
|
||||
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||||
index_read = (int32_t*) calloc(4L*chunk_size,sizeof(int32_t));
|
||||
value_read = (double*) calloc(chunk_size,sizeof(double));
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||||
|
||||
// read 1 chunk of 20 elements using offset of 40( i.e. lines No. 40--59)
|
||||
uint64_t offset_f_read = 40L;
|
||||
rc = trexio_read_mo_2e_int_eri(trexio_file_2, offset_f_read, 0L, chunk_size, index_read, value_read);
|
||||
assert(rc==TREXIO_SUCCESS);
|
||||
|
||||
// print the data being read
|
||||
for(int i=0; i<chunk_size; ++i){
|
||||
printf("%d %d %d %d %lf\n",
|
||||
index_read[4*i],
|
||||
index_read[4*i+1],
|
||||
index_read[4*i+2],
|
||||
index_read[4*i+3],
|
||||
value_read[i]
|
||||
);
|
||||
}
|
||||
|
||||
// check that the file has been created
|
||||
rc = trexio_has_mo_2e_int_eri(trexio_file_2);
|
||||
assert(rc==TREXIO_SUCCESS);
|
||||
|
||||
rc = trexio_close(trexio_file_2);
|
||||
assert(rc == TREXIO_SUCCESS);
|
||||
|
||||
// free the memory
|
||||
free(index);
|
||||
free(value);
|
||||
free(index_read);
|
||||
free(value_read);
|
||||
|
||||
}
|
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