TREX/trexio
1
0
Fork 0
mirror of https://github.com/TREX-CoE/trexio.git synced 2025-04-26 18:34:44 +02:00
Code Issues Projects Releases Wiki Activity

check that the data object exists before reading it from the file

Browse Source
This commit is contained in:
q-posev 2021-09-10 09:38:26 +02:00
parent c63d420c7f
commit 40d5fc31fc
1 changed files with 45 additions and 28 deletions
Show Stats Download Patch File Download Diff File Expand all files Collapse all files

73
src/templates_front/templator_front.org
View File

@ -148,34 +148,36 @@ with open(path.join(__pytrexio_path__, '_version.py')) as version_file:
** Error handling
#+NAME: table-exit-codes
| Macro | Code | Description |
|------------------------------+------+--------------------------------------|
| ~TREXIO_FAILURE~ | -1 | 'Unknown failure' |
| ~TREXIO_SUCCESS~ | 0 | 'Success' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_1~ | 1 | 'Invalid argument 1' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_2~ | 2 | 'Invalid argument 2' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_3~ | 3 | 'Invalid argument 3' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_4~ | 4 | 'Invalid argument 4' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_5~ | 5 | 'Invalid argument 5' |
| ~TREXIO_END~ | 6 | 'End of file' |
| ~TREXIO_READONLY~ | 7 | 'Read-only file' |
| ~TREXIO_ERRNO~ | 8 | strerror(errno) |
| ~TREXIO_INVALID_ID~ | 9 | 'Invalid ID' |
| ~TREXIO_ALLOCATION_FAILED~ | 10 | 'Allocation failed' |
| ~TREXIO_HAS_NOT~ | 11 | 'Element absent' |
| ~TREXIO_INVALID_NUM~ | 12 | 'Invalid dimensions' |
| ~TREXIO_ATTR_ALREADY_EXISTS~ | 13 | 'Attribute (num/str) already exists' |
| ~TREXIO_DSET_ALREADY_EXISTS~ | 14 | 'Dataset already exists' |
| ~TREXIO_OPEN_ERROR~ | 15 | 'Error opening file' |
| ~TREXIO_LOCK_ERROR~ | 16 | 'Error locking file' |
| ~TREXIO_UNLOCK_ERROR~ | 17 | 'Error unlocking file' |
| ~TREXIO_FILE_ERROR~ | 18 | 'Invalid file handle' |
| ~TREXIO_GROUP_READ_ERROR~ | 19 | 'Error reading group' |
| ~TREXIO_GROUP_WRITE_ERROR~ | 20 | 'Error writing group' |
| ~TREXIO_ELEM_READ_ERROR~ | 21 | 'Error reading element' |
| ~TREXIO_ELEM_WRITE_ERROR~ | 22 | 'Error writing element' |
| ~TREXIO_UNSAFE_ARRAY_DIM~ | 23 | 'Access to memory beyond allocated' |
| ~TREXIO_INVALID_STR_LEN~ | 30 | 'Invalid max_str_len' |
| Macro | Code | Description |
|------------------------------+------+----------------------------------------|
| ~TREXIO_FAILURE~ | -1 | 'Unknown failure' |
| ~TREXIO_SUCCESS~ | 0 | 'Success' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_1~ | 1 | 'Invalid argument 1' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_2~ | 2 | 'Invalid argument 2' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_3~ | 3 | 'Invalid argument 3' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_4~ | 4 | 'Invalid argument 4' |
| ~TREXIO_INVALID_ARG_5~ | 5 | 'Invalid argument 5' |
| ~TREXIO_END~ | 6 | 'End of file' |
| ~TREXIO_READONLY~ | 7 | 'Read-only file' |
| ~TREXIO_ERRNO~ | 8 | strerror(errno) |
| ~TREXIO_INVALID_ID~ | 9 | 'Invalid ID' |
| ~TREXIO_ALLOCATION_FAILED~ | 10 | 'Allocation failed' |
| ~TREXIO_HAS_NOT~ | 11 | 'Element absent' |
| ~TREXIO_INVALID_NUM~ | 12 | 'Invalid dimensions' |
| ~TREXIO_ATTR_ALREADY_EXISTS~ | 13 | 'Attribute already exists' |
| ~TREXIO_DSET_ALREADY_EXISTS~ | 14 | 'Dataset already exists' |
| ~TREXIO_OPEN_ERROR~ | 15 | 'Error opening file' |
| ~TREXIO_LOCK_ERROR~ | 16 | 'Error locking file' |
| ~TREXIO_UNLOCK_ERROR~ | 17 | 'Error unlocking file' |
| ~TREXIO_FILE_ERROR~ | 18 | 'Invalid file handle' |
| ~TREXIO_GROUP_READ_ERROR~ | 19 | 'Error reading group' |
| ~TREXIO_GROUP_WRITE_ERROR~ | 20 | 'Error writing group' |
| ~TREXIO_ELEM_READ_ERROR~ | 21 | 'Error reading element' |
| ~TREXIO_ELEM_WRITE_ERROR~ | 22 | 'Error writing element' |
| ~TREXIO_UNSAFE_ARRAY_DIM~ | 23 | 'Access to memory beyond allocated' |
| ~TREXIO_ATTR_MISSING~ | 24 | 'Attribute does not exist in the file' |
| ~TREXIO_DSET_MISSING~ | 25 | 'Dataset does not exist in the file' |
| ~TREXIO_INVALID_STR_LEN~ | 30 | 'Invalid max_str_len' |
# We need to force Emacs not to indent the Python code:
# -*- org-src-preserve-indentation: t
@ -241,6 +243,8 @@ return '\n'.join(result)
#define TREXIO_ELEM_READ_ERROR ((trexio_exit_code) 21)
#define TREXIO_ELEM_WRITE_ERROR ((trexio_exit_code) 22)
#define TREXIO_UNSAFE_ARRAY_DIM ((trexio_exit_code) 23)
#define TREXIO_ATTR_MISSING ((trexio_exit_code) 24)
#define TREXIO_DSET_MISSING ((trexio_exit_code) 25)
#define TREXIO_INVALID_STR_LEN ((trexio_exit_code) 30)
#+end_src
@ -270,6 +274,8 @@ return '\n'.join(result)
integer(trexio_exit_code), parameter :: TREXIO_ELEM_READ_ERROR = 21
integer(trexio_exit_code), parameter :: TREXIO_ELEM_WRITE_ERROR = 22
integer(trexio_exit_code), parameter :: TREXIO_UNSAFE_ARRAY_DIM = 23
integer(trexio_exit_code), parameter :: TREXIO_ATTR_MISSING = 24
integer(trexio_exit_code), parameter :: TREXIO_DSET_MISSING = 25
integer(trexio_exit_code), parameter :: TREXIO_INVALID_STR_LEN = 30
#+end_src
@ -300,6 +306,8 @@ return '\n'.join(result)
TREXIO_ELEM_READ_ERROR = 21
TREXIO_ELEM_WRITE_ERROR = 22
TREXIO_UNSAFE_ARRAY_DIM = 23
TREXIO_ATTR_MISSING = 24
TREXIO_DSET_MISSING = 25
TREXIO_INVALID_STR_LEN = 30
#+end_src
:END:
@ -1136,6 +1144,7 @@ trexio_exit_code
trexio_read_$group_num$_64 (trexio_t* const file, int64_t* const num)
{
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if (trexio_has_$group_num$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_MISSING;
uint64_t u_num = 0;
trexio_exit_code rc = TREXIO_GROUP_READ_ERROR;
@ -1196,6 +1205,7 @@ trexio_exit_code
trexio_read_$group_num$_32 (trexio_t* const file, int32_t* const num)
{
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if (trexio_has_$group_num$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_MISSING;
uint64_t u_num = 0;
trexio_exit_code rc = TREXIO_GROUP_READ_ERROR;
@ -1477,6 +1487,7 @@ trexio_read_$group_dset$_64 (trexio_t* const file, $group_dset_dtype_double$* co
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if ($group_dset$ == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
if (trexio_has_$group_dset$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_DSET_MISSING;
trexio_exit_code rc;
int64_t $group_dset_dim$ = 0;
@ -1601,6 +1612,7 @@ trexio_read_$group_dset$_32 (trexio_t* const file, $group_dset_dtype_single$* co
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if ($group_dset$ == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
if (trexio_has_$group_dset$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_DSET_MISSING;
trexio_exit_code rc;
int64_t $group_dset_dim$ = 0;
@ -1758,6 +1770,7 @@ trexio_read_safe_$group_dset$_32 (trexio_t* const file, $group_dset_dtype_single
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if (dset_out == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
if (trexio_has_$group_dset$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_DSET_MISSING;
<<dimCheck>>
@ -1792,6 +1805,7 @@ trexio_read_safe_$group_dset$_64 (trexio_t* const file, $group_dset_dtype_double
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if (dset_out == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
if (trexio_has_$group_dset$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_DSET_MISSING;
<<dimCheck>>
@ -2266,6 +2280,7 @@ trexio_read_$group_dset$_low (trexio_t* const file, char* dset_out, const uint32
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if (dset_out == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
if (max_str_len <= 0) return TREXIO_INVALID_ARG_3;
if (trexio_has_$group_dset$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_DSET_MISSING;
trexio_exit_code rc;
int64_t $group_dset_dim$ = 0;
@ -2305,6 +2320,7 @@ trexio_read_$group_dset$ (trexio_t* const file, char** dset_out, const uint32_t
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if (dset_out == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
if (max_str_len <= 0) return TREXIO_INVALID_ARG_3;
if (trexio_has_$group_dset$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_DSET_MISSING;
assert(file->back_end < TREXIO_INVALID_BACK_END);
@ -2684,6 +2700,7 @@ trexio_read_$group_str$ (trexio_t* const file, char* const str_out, const uint32
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
if (str_out == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
if (max_str_len <= 0) return TREXIO_INVALID_ARG_3;
if (trexio_has_$group_str$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_MISSING;
switch (file->back_end) {