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https://github.com/TREX-CoE/trexio.git
synced 2024-11-03 20:54:07 +01:00
modify front end for more general numerical attributes
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parent
418aa304cd
commit
261e7c8b84
@ -1135,70 +1135,39 @@ def close(trexio_file):
|
|||||||
(non-suffixed) API call on dimensioning variables deals with single
|
(non-suffixed) API call on dimensioning variables deals with single
|
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precision (see Table above).
|
precision (see Table above).
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||||||
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|
**** Function declarations
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#+begin_src c :tangle hrw_num_front.h :exports none
|
#+begin_src c :tangle hrw_num_front.h :exports none
|
||||||
trexio_exit_code trexio_has_$group_num$(trexio_t* const file);
|
trexio_exit_code trexio_has_$group_num$(trexio_t* const file);
|
||||||
trexio_exit_code trexio_read_$group_num$(trexio_t* const file, int32_t* const num);
|
trexio_exit_code trexio_read_$group_num$(trexio_t* const file, $group_num_dtype_default$* const num);
|
||||||
trexio_exit_code trexio_write_$group_num$(trexio_t* const file, const int32_t num);
|
trexio_exit_code trexio_write_$group_num$(trexio_t* const file, const $group_num_dtype_default$ num);
|
||||||
trexio_exit_code trexio_read_$group_num$_32(trexio_t* const file, int32_t* const num);
|
trexio_exit_code trexio_read_$group_num$_32(trexio_t* const file, $group_num_dtype_single$* const num);
|
||||||
trexio_exit_code trexio_write_$group_num$_32(trexio_t* const file, const int32_t num);
|
trexio_exit_code trexio_write_$group_num$_32(trexio_t* const file, const $group_num_dtype_single$ num);
|
||||||
trexio_exit_code trexio_read_$group_num$_64(trexio_t* const file, int64_t* const num);
|
trexio_exit_code trexio_read_$group_num$_64(trexio_t* const file, $group_num_dtype_double$* const num);
|
||||||
trexio_exit_code trexio_write_$group_num$_64(trexio_t* const file, const int64_t num);
|
trexio_exit_code trexio_write_$group_num$_64(trexio_t* const file, const $group_num_dtype_double$ num);
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
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||||||
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**** Source code for double precision functions
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||||||
#+begin_src c :tangle read_num_64_front.c
|
#+begin_src c :tangle read_num_64_front.c
|
||||||
trexio_exit_code
|
trexio_exit_code
|
||||||
trexio_read_$group_num$_64 (trexio_t* const file, int64_t* const num)
|
trexio_read_$group_num$_64 (trexio_t* const file, $group_num_dtype_double$* const num)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
|
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
|
||||||
if (trexio_has_$group_num$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_MISSING;
|
if (trexio_has_$group_num$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_MISSING;
|
||||||
|
|
||||||
uint64_t u_num = 0;
|
|
||||||
trexio_exit_code rc = TREXIO_GROUP_READ_ERROR;
|
|
||||||
|
|
||||||
switch (file->back_end) {
|
switch (file->back_end) {
|
||||||
|
|
||||||
case TREXIO_TEXT:
|
case TREXIO_TEXT:
|
||||||
rc = trexio_text_read_$group_num$(file, &u_num);
|
return trexio_text_read_$group_num$(file, num);
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
|
|
||||||
case TREXIO_HDF5:
|
case TREXIO_HDF5:
|
||||||
rc = trexio_hdf5_read_$group_num$(file, &u_num);
|
return trexio_hdf5_read_$group_num$(file, num);
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
/*
|
/*
|
||||||
case TREXIO_JSON:
|
case TREXIO_JSON:
|
||||||
rc =trexio_json_read_$group_num$(file, &u_num);
|
return trexio_json_read_$group_num$(file, num);
|
||||||
break;
|
|
||||||
,*/
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
if (rc != TREXIO_SUCCESS) return rc;
|
|
||||||
|
|
||||||
*num = (int64_t) u_num;
|
|
||||||
return TREXIO_SUCCESS;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
#+end_src
|
|
||||||
|
|
||||||
#+begin_src c :tangle write_num_64_front.c
|
|
||||||
trexio_exit_code
|
|
||||||
trexio_write_$group_num$_64 (trexio_t* const file, const int64_t num)
|
|
||||||
{
|
|
||||||
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
|
|
||||||
if (num < 0 ) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
|
|
||||||
if (trexio_has_$group_num$(file) == TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_ALREADY_EXISTS;
|
|
||||||
|
|
||||||
switch (file->back_end) {
|
|
||||||
|
|
||||||
case TREXIO_TEXT:
|
|
||||||
return trexio_text_write_$group_num$(file, (int64_t) num);
|
|
||||||
break;
|
|
||||||
|
|
||||||
case TREXIO_HDF5:
|
|
||||||
return trexio_hdf5_write_$group_num$(file, (int64_t) num);
|
|
||||||
break;
|
|
||||||
/*
|
|
||||||
case TREXIO_JSON:
|
|
||||||
return trexio_json_write_$group_num$(file, (int64_t) num);
|
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
,*/
|
,*/
|
||||||
}
|
}
|
||||||
@ -1207,60 +1176,89 @@ trexio_write_$group_num$_64 (trexio_t* const file, const int64_t num)
|
|||||||
}
|
}
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
|
|
||||||
|
#+begin_src c :tangle write_num_64_front.c
|
||||||
|
trexio_exit_code
|
||||||
|
trexio_write_$group_num$_64 (trexio_t* const file, const $group_num_dtype_double$ num)
|
||||||
|
{
|
||||||
|
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
|
||||||
|
if (trexio_has_$group_num$(file) == TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_ALREADY_EXISTS;
|
||||||
|
|
||||||
|
switch (file->back_end) {
|
||||||
|
|
||||||
|
case TREXIO_TEXT:
|
||||||
|
return trexio_text_write_$group_num$(file, num);
|
||||||
|
break;
|
||||||
|
|
||||||
|
case TREXIO_HDF5:
|
||||||
|
return trexio_hdf5_write_$group_num$(file, num);
|
||||||
|
break;
|
||||||
|
/*
|
||||||
|
case TREXIO_JSON:
|
||||||
|
return trexio_json_write_$group_num$(file, num);
|
||||||
|
break;
|
||||||
|
,*/
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
return TREXIO_FAILURE;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
#+end_src
|
||||||
|
|
||||||
|
**** Source code for single precision functions
|
||||||
|
|
||||||
#+begin_src c :tangle read_num_32_front.c
|
#+begin_src c :tangle read_num_32_front.c
|
||||||
trexio_exit_code
|
trexio_exit_code
|
||||||
trexio_read_$group_num$_32 (trexio_t* const file, int32_t* const num)
|
trexio_read_$group_num$_32 (trexio_t* const file, $group_num_dtype_single$* const num)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
|
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
|
||||||
if (trexio_has_$group_num$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_MISSING;
|
if (trexio_has_$group_num$(file) != TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_MISSING;
|
||||||
|
|
||||||
uint64_t u_num = 0;
|
$group_num_dtype_double$ num_64 = 0;
|
||||||
trexio_exit_code rc = TREXIO_GROUP_READ_ERROR;
|
trexio_exit_code rc = TREXIO_GROUP_READ_ERROR;
|
||||||
|
|
||||||
switch (file->back_end) {
|
switch (file->back_end) {
|
||||||
|
|
||||||
case TREXIO_TEXT:
|
case TREXIO_TEXT:
|
||||||
rc = trexio_text_read_$group_num$(file, &u_num);
|
rc = trexio_text_read_$group_num$(file, &num_64);
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
|
|
||||||
case TREXIO_HDF5:
|
case TREXIO_HDF5:
|
||||||
rc = trexio_hdf5_read_$group_num$(file, &u_num);
|
rc = trexio_hdf5_read_$group_num$(file, &num_64);
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
/*
|
/*
|
||||||
case TREXIO_JSON:
|
case TREXIO_JSON:
|
||||||
rc =trexio_json_read_$group_num$(file, &u_num);
|
rc =trexio_json_read_$group_num$(file, &num_64);
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
,*/
|
,*/
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
if (rc != TREXIO_SUCCESS) return rc;
|
if (rc != TREXIO_SUCCESS) return rc;
|
||||||
|
|
||||||
*num = (int32_t) u_num;
|
*num = ($group_num_dtype_single$) num_64;
|
||||||
return TREXIO_SUCCESS;
|
return TREXIO_SUCCESS;
|
||||||
}
|
}
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
|
|
||||||
#+begin_src c :tangle write_num_32_front.c
|
#+begin_src c :tangle write_num_32_front.c
|
||||||
trexio_exit_code
|
trexio_exit_code
|
||||||
trexio_write_$group_num$_32 (trexio_t* const file, const int32_t num)
|
trexio_write_$group_num$_32 (trexio_t* const file, const $group_num_dtype_single$ num)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
|
|
||||||
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
|
if (file == NULL) return TREXIO_INVALID_ARG_1;
|
||||||
if (num < 0 ) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
|
//if (num < 0 ) return TREXIO_INVALID_ARG_2;
|
||||||
if (trexio_has_$group_num$(file) == TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_ALREADY_EXISTS;
|
if (trexio_has_$group_num$(file) == TREXIO_SUCCESS) return TREXIO_ATTR_ALREADY_EXISTS;
|
||||||
|
|
||||||
switch (file->back_end) {
|
switch (file->back_end) {
|
||||||
|
|
||||||
case TREXIO_TEXT:
|
case TREXIO_TEXT:
|
||||||
return trexio_text_write_$group_num$(file, (int64_t) num);
|
return trexio_text_write_$group_num$(file, ($group_num_dtype_double$) num);
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
|
|
||||||
case TREXIO_HDF5:
|
case TREXIO_HDF5:
|
||||||
return trexio_hdf5_write_$group_num$(file, (int64_t) num);
|
return trexio_hdf5_write_$group_num$(file, ($group_num_dtype_double$) num);
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
/*
|
/*
|
||||||
case TREXIO_JSON:
|
case TREXIO_JSON:
|
||||||
return trexio_json_write_$group_num$(file, (int64_t) num);
|
return trexio_json_write_$group_num$(file, ($group_num_dtype_double$) num);
|
||||||
break;
|
break;
|
||||||
,*/
|
,*/
|
||||||
}
|
}
|
||||||
@ -1269,19 +1267,21 @@ trexio_write_$group_num$_32 (trexio_t* const file, const int32_t num)
|
|||||||
}
|
}
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
|
|
||||||
|
**** Source code for default functions
|
||||||
|
|
||||||
#+begin_src c :tangle read_num_def_front.c
|
#+begin_src c :tangle read_num_def_front.c
|
||||||
trexio_exit_code
|
trexio_exit_code
|
||||||
trexio_read_$group_num$ (trexio_t* const file, int32_t* const num)
|
trexio_read_$group_num$ (trexio_t* const file, $group_num_dtype_default$ * const num)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
return trexio_read_$group_num$_32(file, num);
|
return trexio_read_$group_num$_$default_prec$(file, num);
|
||||||
}
|
}
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
|
|
||||||
#+begin_src c :tangle write_num_def_front.c
|
#+begin_src c :tangle write_num_def_front.c
|
||||||
trexio_exit_code
|
trexio_exit_code
|
||||||
trexio_write_$group_num$ (trexio_t* const file, const int32_t num)
|
trexio_write_$group_num$ (trexio_t* const file, const $group_num_dtype_default$ num)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
return trexio_write_$group_num$_32(file, num);
|
return trexio_write_$group_num$_$default_prec$(file, num);
|
||||||
}
|
}
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
|
|
||||||
@ -1324,7 +1324,7 @@ interface
|
|||||||
integer function trexio_write_$group_num$_64 (trex_file, num) bind(C)
|
integer function trexio_write_$group_num$_64 (trex_file, num) bind(C)
|
||||||
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
||||||
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
||||||
integer(8), intent(in), value :: num
|
$group_num_f_dtype_double$, intent(in), value :: num
|
||||||
end function trexio_write_$group_num$_64
|
end function trexio_write_$group_num$_64
|
||||||
end interface
|
end interface
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
@ -1334,7 +1334,7 @@ interface
|
|||||||
integer function trexio_read_$group_num$_64 (trex_file, num) bind(C)
|
integer function trexio_read_$group_num$_64 (trex_file, num) bind(C)
|
||||||
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
||||||
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
||||||
integer(8), intent(out) :: num
|
$group_num_f_dtype_double$, intent(out) :: num
|
||||||
end function trexio_read_$group_num$_64
|
end function trexio_read_$group_num$_64
|
||||||
end interface
|
end interface
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
@ -1344,7 +1344,7 @@ interface
|
|||||||
integer function trexio_write_$group_num$_32 (trex_file, num) bind(C)
|
integer function trexio_write_$group_num$_32 (trex_file, num) bind(C)
|
||||||
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
||||||
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
||||||
integer(4), intent(in), value :: num
|
$group_num_f_dtype_single$, intent(in), value :: num
|
||||||
end function trexio_write_$group_num$_32
|
end function trexio_write_$group_num$_32
|
||||||
end interface
|
end interface
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
@ -1354,7 +1354,7 @@ interface
|
|||||||
integer function trexio_read_$group_num$_32 (trex_file, num) bind(C)
|
integer function trexio_read_$group_num$_32 (trex_file, num) bind(C)
|
||||||
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
||||||
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
||||||
integer(4), intent(out) :: num
|
$group_num_f_dtype_single$, intent(out) :: num
|
||||||
end function trexio_read_$group_num$_32
|
end function trexio_read_$group_num$_32
|
||||||
end interface
|
end interface
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
@ -1364,7 +1364,7 @@ interface
|
|||||||
integer function trexio_write_$group_num$ (trex_file, num) bind(C)
|
integer function trexio_write_$group_num$ (trex_file, num) bind(C)
|
||||||
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
||||||
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
||||||
integer(4), intent(in), value :: num
|
$group_num_f_dtype_default$, intent(in), value :: num
|
||||||
end function trexio_write_$group_num$
|
end function trexio_write_$group_num$
|
||||||
end interface
|
end interface
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
@ -1374,7 +1374,7 @@ interface
|
|||||||
integer function trexio_read_$group_num$ (trex_file, num) bind(C)
|
integer function trexio_read_$group_num$ (trex_file, num) bind(C)
|
||||||
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
use, intrinsic :: iso_c_binding
|
||||||
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
integer(8), intent(in), value :: trex_file
|
||||||
integer(4), intent(out) :: num
|
$group_num_f_dtype_default$, intent(out) :: num
|
||||||
end function trexio_read_$group_num$
|
end function trexio_read_$group_num$
|
||||||
end interface
|
end interface
|
||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
@ -1391,7 +1391,7 @@ end interface
|
|||||||
*** Python templates for front end
|
*** Python templates for front end
|
||||||
|
|
||||||
#+begin_src python :tangle write_num_front.py
|
#+begin_src python :tangle write_num_front.py
|
||||||
def write_$group_num$(trexio_file, num_w: int) -> None:
|
def write_$group_num$(trexio_file, num_w: $group_num_py_dtype$) -> None:
|
||||||
"""Write the $group_num$ variable in the TREXIO file.
|
"""Write the $group_num$ variable in the TREXIO file.
|
||||||
|
|
||||||
Parameters:
|
Parameters:
|
||||||
@ -1416,7 +1416,7 @@ def write_$group_num$(trexio_file, num_w: int) -> None:
|
|||||||
#+end_src
|
#+end_src
|
||||||
|
|
||||||
#+begin_src python :tangle read_num_front.py
|
#+begin_src python :tangle read_num_front.py
|
||||||
def read_$group_num$(trexio_file) -> int:
|
def read_$group_num$(trexio_file) -> $group_num_py_dtype$:
|
||||||
"""Read the $group_num$ variable from the TREXIO file.
|
"""Read the $group_num$ variable from the TREXIO file.
|
||||||
|
|
||||||
Parameter is a ~TREXIO File~ object that has been created by a call to ~open~ function.
|
Parameter is a ~TREXIO File~ object that has been created by a call to ~open~ function.
|
||||||
|
@ -103,7 +103,9 @@ def recursive_populate_file(fname: str, paths: dict, detailed_source: dict) -> N
|
|||||||
triggers = ['group_dset_dtype', 'group_dset_py_dtype', 'group_dset_h5_dtype', 'default_prec', 'is_index',
|
triggers = ['group_dset_dtype', 'group_dset_py_dtype', 'group_dset_h5_dtype', 'default_prec', 'is_index',
|
||||||
'group_dset_f_dtype_default', 'group_dset_f_dtype_double', 'group_dset_f_dtype_single',
|
'group_dset_f_dtype_default', 'group_dset_f_dtype_double', 'group_dset_f_dtype_single',
|
||||||
'group_dset_dtype_default', 'group_dset_dtype_double', 'group_dset_dtype_single',
|
'group_dset_dtype_default', 'group_dset_dtype_double', 'group_dset_dtype_single',
|
||||||
'group_dset_rank', 'group_dset_dim_list', 'group_dset_f_dims',
|
'group_dset_rank', 'group_dset_dim_list', 'group_dset_f_dims',
|
||||||
|
'group_num_f_dtype_default', 'group_num_f_dtype_double', 'group_num_f_dtype_single',
|
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'group_num_dtype_default', 'group_num_dtype_double', 'group_num_dtype_single', 'group_num_py_dtype',
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'group_dset', 'group_num', 'group_str', 'group']
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'group_dset', 'group_num', 'group_str', 'group']
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for item in detailed_source.keys():
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for item in detailed_source.keys():
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@ -468,6 +470,34 @@ def get_detailed_num_dict (configuration: dict) -> dict:
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tmp_dict['group_num'] = tmp_num
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tmp_dict['group_num'] = tmp_num
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num_dict[tmp_num] = tmp_dict
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num_dict[tmp_num] = tmp_dict
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# TODO the line below is the same as for group_dset and can be exported from somewhere
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if v2[0] == 'float':
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tmp_dict['datatype'] = 'double'
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tmp_dict['group_num_h5_dtype'] = 'native_double'
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tmp_dict['group_num_f_dtype_default']= 'real(8)'
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tmp_dict['group_num_f_dtype_double'] = 'real(8)'
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tmp_dict['group_num_f_dtype_single'] = 'real(4)'
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tmp_dict['group_num_dtype_default']= 'double'
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tmp_dict['group_num_dtype_double'] = 'double'
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tmp_dict['group_num_dtype_single'] = 'float'
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tmp_dict['default_prec'] = '64'
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tmp_dict['group_num_std_dtype_out'] = '24.16e'
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tmp_dict['group_num_std_dtype_in'] = 'lf'
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tmp_dict['group_num_py_dtype'] = 'float'
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elif v2[0] in ['int']:
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tmp_dict['datatype'] = 'int64_t'
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tmp_dict['group_num_h5_dtype'] = 'native_int64'
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tmp_dict['group_num_f_dtype_default']= 'integer(4)'
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tmp_dict['group_num_f_dtype_double'] = 'integer(8)'
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tmp_dict['group_num_f_dtype_single'] = 'integer(4)'
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tmp_dict['group_num_dtype_default']= 'int32_t'
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tmp_dict['group_num_dtype_double'] = 'int64_t'
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tmp_dict['group_num_dtype_single'] = 'int32_t'
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tmp_dict['default_prec'] = '32'
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tmp_dict['group_num_std_dtype_out'] = '" PRId64 "'
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tmp_dict['group_num_std_dtype_in'] = '" SCNd64 "'
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tmp_dict['group_num_py_dtype'] = 'int'
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return num_dict
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return num_dict
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