mirror of
https://github.com/TREX-CoE/trexio.git
synced 2024-12-23 04:43:57 +01:00
Little changes in the bash script
This commit is contained in:
parent
71bb61dd5b
commit
241ae3a74a
28
src/build_trex.sh
Normal file → Executable file
28
src/build_trex.sh
Normal file → Executable file
@ -1,22 +1,30 @@
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||||
#!/bin/bash
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||||
if [[ $(basename $PWD) != "src" ]] ; then
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||||
echo "This script should run in the src directory"
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exit -1
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||||
fi
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||||
# We want the script to crash on the 1st error:
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set -e
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echo "create populated directories"
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mkdir -p templates_front/populated
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mkdir -p templates_text/populated
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mkdir -p templates_hdf5/populated
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# It is important to ad '--' to rm because it tells rm that what follows are
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# not options. It is safer.
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echo "remove existing templates"
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rm templates_front/*.c
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rm templates_text/*.c
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||||
rm templates_hdf5/*.c
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||||
rm templates_front/*.h
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||||
rm templates_text/*.h
|
||||
rm templates_hdf5/*.h
|
||||
rm -- templates_front/*.{c,h}
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||||
rm -- templates_text/*.{c,h}
|
||||
rm -- templates_hdf5/*.{c,h}
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||||
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||||
echo "clean populated directories"
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||||
rm templates_front/populated/*
|
||||
rm templates_text/populated/*
|
||||
rm templates_hdf5/populated/*
|
||||
rm -- templates_front/populated/*
|
||||
rm -- templates_text/populated/*
|
||||
rm -- templates_hdf5/populated/*
|
||||
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||||
echo "tangle org files to generate templates"
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||||
cd templates_front
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||||
@ -32,7 +40,7 @@ emacs --batch --eval "(require 'org)" --eval '(org-babel-tangle-file "templator_
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||||
cd ..
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||||
echo "run generator script to populate templates"
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||||
python generator.py
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||||
python3 generator.py
|
||||
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||||
sleep 2
|
||||
|
||||
|
||||
1501
src/trexio.c
1501
src/trexio.c
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
70
src/trexio.h
70
src/trexio.h
@ -3,8 +3,6 @@
|
||||
M-x org-babel-tangle
|
||||
*/
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||||
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||||
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||||
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||||
#ifndef _TREXIO_H
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#define _TREXIO_H
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||||
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@ -12,19 +10,19 @@
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||||
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||||
typedef int32_t trexio_exit_code;
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||||
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||||
#define TREXIO_FAILURE ( (trexio_exit_code) -1 )
|
||||
#define TREXIO_SUCCESS ( (trexio_exit_code) 0 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_1 ( (trexio_exit_code) 1 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_2 ( (trexio_exit_code) 2 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_3 ( (trexio_exit_code) 3 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_4 ( (trexio_exit_code) 4 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_5 ( (trexio_exit_code) 5 )
|
||||
#define TREXIO_END ( (trexio_exit_code) 10 )
|
||||
#define TREXIO_READONLY ( (trexio_exit_code) 11 )
|
||||
#define TREXIO_ERRNO ( (trexio_exit_code) 12 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ID ( (trexio_exit_code) 20 )
|
||||
#define TREXIO_ALLOCATION_FAILED ( (trexio_exit_code) 21 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_NUM ( (trexio_exit_code) 22 )
|
||||
#define TREXIO_FAILURE ( (trexio_exit_code) -1 )
|
||||
#define TREXIO_SUCCESS ( (trexio_exit_code) 0 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_1 ( (trexio_exit_code) 1 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_2 ( (trexio_exit_code) 2 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_3 ( (trexio_exit_code) 3 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_4 ( (trexio_exit_code) 4 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ARG_5 ( (trexio_exit_code) 5 )
|
||||
#define TREXIO_END ( (trexio_exit_code) 10 )
|
||||
#define TREXIO_READONLY ( (trexio_exit_code) 11 )
|
||||
#define TREXIO_ERRNO ( (trexio_exit_code) 12 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_ID ( (trexio_exit_code) 20 )
|
||||
#define TREXIO_ALLOCATION_FAILED ( (trexio_exit_code) 21 )
|
||||
#define TREXIO_INVALID_NUM ( (trexio_exit_code) 22 )
|
||||
|
||||
typedef int32_t back_end_t;
|
||||
|
||||
@ -38,20 +36,34 @@ typedef struct trexio_s trexio_t;
|
||||
trexio_t* trexio_open(const char* file_name, const char mode, const back_end_t back_end);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_close(trexio_t* file);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_nucleus_charge(trexio_t* file, double* nucleus_charge);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_nucleus_charge(trexio_t* file, const double* nucleus_charge);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_nucleus_coord(trexio_t* file, double* nucleus_coord);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_nucleus_coord(trexio_t* file, const double* nucleus_coord);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_lmax_plus_1(trexio_t* file, int64_t* ecp_lmax_plus_1);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_lmax_plus_1(trexio_t* file, const int64_t* ecp_lmax_plus_1);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_z_core(trexio_t* file, int64_t* ecp_z_core);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_z_core(trexio_t* file, const int64_t* ecp_z_core);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_local_n(trexio_t* file, int64_t* ecp_local_n);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_local_n(trexio_t* file, const int64_t* ecp_local_n);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_local_exponent(trexio_t* file, double* ecp_local_exponent);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_local_exponent(trexio_t* file, const double* ecp_local_exponent);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_local_coef(trexio_t* file, double* ecp_local_coef);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_local_coef(trexio_t* file, const double* ecp_local_coef);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_local_power(trexio_t* file, int64_t* ecp_local_power);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_local_power(trexio_t* file, const int64_t* ecp_local_power);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_non_local_n(trexio_t* file, int64_t* ecp_non_local_n);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_non_local_n(trexio_t* file, const int64_t* ecp_non_local_n);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_non_local_exponent(trexio_t* file, double* ecp_non_local_exponent);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_non_local_exponent(trexio_t* file, const double* ecp_non_local_exponent);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_non_local_coef(trexio_t* file, double* ecp_non_local_coef);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_non_local_coef(trexio_t* file, const double* ecp_non_local_coef);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_non_local_power(trexio_t* file, int64_t* ecp_non_local_power);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_non_local_power(trexio_t* file, const int64_t* ecp_non_local_power);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_nucleus_num(trexio_t* file, int64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_nucleus_num(trexio_t* file, const int64_t num);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_nucleus_coord(trexio_t* file, double* coord);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_nucleus_coord(trexio_t* file, const double* coord);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_nucleus_charge(trexio_t* file, double* charge);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_nucleus_charge(trexio_t* file, const double* charge);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_rdm_one_e(trexio_t* file, double* one_e);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_rdm_one_e(trexio_t* file, const double* one_e);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_buffered_read_rdm_two_e(trexio_t* file, const int64_t offset, const int64_t size, int64_t* index, double* value);
|
||||
trexio_exit_code trexio_buffered_write_rdm_two_e(trexio_t* file, const int64_t offset, const int64_t size, const int64_t* index, const double* value);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_local_num_n_max(trexio_t* file, int64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_local_num_n_max(trexio_t* file, const int64_t num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_read_ecp_non_local_num_n_max(trexio_t* file, int64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_write_ecp_non_local_num_n_max(trexio_t* file, const int64_t num);
|
||||
#endif
|
||||
|
||||
1494
src/trexio_hdf5.c
1494
src/trexio_hdf5.c
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -1,15 +1,12 @@
|
||||
/* This file was generated from the trexio.org org-mode file.
|
||||
To generate it, open trexio.org in Emacs and execute
|
||||
/* This file was generated from the org-mode file.
|
||||
To generate it, open templator_hdf5.org file in Emacs and execute
|
||||
M-x org-babel-tangle
|
||||
*/
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
#ifndef _TREXIO_HDF5_H
|
||||
#define _TREXIO_HDF5_H
|
||||
|
||||
#include "trexio.h"
|
||||
#include "trexio_private.h"
|
||||
#include "trexio_s.h"
|
||||
#include <stdint.h>
|
||||
#include <stdio.h>
|
||||
@ -20,79 +17,44 @@
|
||||
|
||||
#include "hdf5.h"
|
||||
#include "hdf5_hl.h" // needed for high-level APIs like H5LT, requires additional linking in Makefile
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||||
|
||||
typedef struct slab_s {
|
||||
uint64_t a;
|
||||
uint64_t b;
|
||||
uint64_t c;
|
||||
uint64_t d;
|
||||
} slab_t;
|
||||
|
||||
typedef struct dset_s {
|
||||
hid_t dset_id;
|
||||
hid_t dspace_id;
|
||||
hid_t dtype_id;
|
||||
uint64_t* dims;
|
||||
uint32_t rank;
|
||||
const char* dset_name;
|
||||
} dset_t;
|
||||
|
||||
typedef struct h5nucleus_s {
|
||||
uint64_t num;
|
||||
double *coord;
|
||||
double *charge;
|
||||
dset_t* h5_coord;
|
||||
dset_t* h5_charge;
|
||||
} h5nucleus_t;
|
||||
|
||||
typedef struct h5electron_s {
|
||||
uint64_t alpha_num;
|
||||
uint64_t beta_num;
|
||||
} h5electron_t;
|
||||
|
||||
typedef struct trexio_hdf5_s {
|
||||
trexio_t parent ;
|
||||
hid_t file_id;
|
||||
hid_t nucleus_group;
|
||||
hid_t electron_group;
|
||||
//... other groups' id
|
||||
hid_t ecp_group;
|
||||
const char* file_name;
|
||||
} trexio_hdf5_t;
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_init(trexio_t* file);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_finalize(trexio_t* file);
|
||||
|
||||
typedef struct one_index_s {
|
||||
double value;
|
||||
int64_t i;
|
||||
} one_index_t;
|
||||
|
||||
typedef struct two_index_s {
|
||||
double value;
|
||||
int64_t i;
|
||||
int64_t j;
|
||||
} two_index_t;
|
||||
|
||||
typedef struct three_index_s {
|
||||
double value;
|
||||
int64_t i;
|
||||
int64_t j;
|
||||
int64_t k;
|
||||
} three_index_t;
|
||||
|
||||
typedef struct four_index_s {
|
||||
double value;
|
||||
int64_t i;
|
||||
int64_t j;
|
||||
int64_t k;
|
||||
int64_t l;
|
||||
} four_index_t;
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_nucleus_num(const trexio_t* file, uint64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_nucleus_num(const trexio_t* file, const uint64_t num);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_nucleus_coord(const trexio_t* file, double* coord, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_nucleus_coord(const trexio_t* file, const double* coord, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_nucleus_num (const trexio_t* file, uint64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_nucleus_num (const trexio_t* file, const uint64_t num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_local_num_n_max (const trexio_t* file, uint64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_local_num_n_max (const trexio_t* file, const uint64_t num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_non_local_num_n_max (const trexio_t* file, uint64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_non_local_num_n_max (const trexio_t* file, const uint64_t num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_nucleus_charge(const trexio_t* file, double* nucleus_charge, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_nucleus_charge(const trexio_t* file, const double* nucleus_charge, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_nucleus_coord(const trexio_t* file, double* nucleus_coord, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_nucleus_coord(const trexio_t* file, const double* nucleus_coord, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_lmax_plus_1(const trexio_t* file, int64_t* ecp_lmax_plus_1, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_lmax_plus_1(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_lmax_plus_1, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_z_core(const trexio_t* file, int64_t* ecp_z_core, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_z_core(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_z_core, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_local_n(const trexio_t* file, int64_t* ecp_local_n, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_local_n(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_local_n, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_local_exponent(const trexio_t* file, double* ecp_local_exponent, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_local_exponent(const trexio_t* file, const double* ecp_local_exponent, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_local_coef(const trexio_t* file, double* ecp_local_coef, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_local_coef(const trexio_t* file, const double* ecp_local_coef, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_local_power(const trexio_t* file, int64_t* ecp_local_power, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_local_power(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_local_power, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_non_local_n(const trexio_t* file, int64_t* ecp_non_local_n, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_non_local_n(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_non_local_n, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_non_local_exponent(const trexio_t* file, double* ecp_non_local_exponent, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_non_local_exponent(const trexio_t* file, const double* ecp_non_local_exponent, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_non_local_coef(const trexio_t* file, double* ecp_non_local_coef, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_non_local_coef(const trexio_t* file, const double* ecp_non_local_coef, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_read_ecp_non_local_power(const trexio_t* file, int64_t* ecp_non_local_power, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_hdf5_write_ecp_non_local_power(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_non_local_power, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
#endif
|
||||
|
||||
@ -3,13 +3,10 @@
|
||||
M-x org-babel-tangle
|
||||
*/
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
#ifndef _TREXIO_S_H
|
||||
#define _TREXIO_S_H
|
||||
|
||||
#include "trexio.h"
|
||||
#include "trexio_private.h"
|
||||
#include <pthread.h>
|
||||
#include <assert.h>
|
||||
|
||||
@ -20,5 +17,4 @@ struct trexio_s {
|
||||
char mode;
|
||||
char padding[7]; /* Ensures the proper alignment of back-ends */
|
||||
};
|
||||
|
||||
#endif
|
||||
|
||||
2218
src/trexio_text.c
2218
src/trexio_text.c
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
@ -20,26 +20,53 @@
|
||||
#include <fcntl.h>
|
||||
#include <unistd.h>
|
||||
#include <sys/stat.h>
|
||||
|
||||
typedef struct nucleus_s {
|
||||
FILE* file;
|
||||
double* coord;
|
||||
double* charge;
|
||||
uint64_t num;
|
||||
uint64_t dims_charge[16];
|
||||
uint64_t dims_coord[16];
|
||||
uint32_t rank_charge;
|
||||
uint32_t rank_coord;
|
||||
double* nucleus_charge;
|
||||
double* nucleus_coord;
|
||||
uint64_t nucleus_num;
|
||||
uint64_t dims_nucleus_charge[16];
|
||||
uint64_t dims_nucleus_coord[16];
|
||||
uint32_t rank_nucleus_charge;
|
||||
uint32_t rank_nucleus_coord;
|
||||
int to_flush;
|
||||
} nucleus_t;
|
||||
|
||||
typedef struct electron_s {
|
||||
typedef struct ecp_s {
|
||||
FILE* file;
|
||||
uint64_t alpha_num;
|
||||
uint64_t beta_num;
|
||||
int to_flush;
|
||||
} electron_t;
|
||||
|
||||
int64_t* ecp_lmax_plus_1;
|
||||
int64_t* ecp_z_core;
|
||||
int64_t* ecp_local_n;
|
||||
double* ecp_local_exponent;
|
||||
double* ecp_local_coef;
|
||||
int64_t* ecp_local_power;
|
||||
int64_t* ecp_non_local_n;
|
||||
double* ecp_non_local_exponent;
|
||||
double* ecp_non_local_coef;
|
||||
int64_t* ecp_non_local_power;
|
||||
uint64_t ecp_local_num_n_max;
|
||||
uint64_t ecp_non_local_num_n_max;
|
||||
uint64_t dims_ecp_lmax_plus_1[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_z_core[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_local_n[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_local_exponent[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_local_coef[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_local_power[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_non_local_n[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_non_local_exponent[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_non_local_coef[16];
|
||||
uint64_t dims_ecp_non_local_power[16];
|
||||
uint32_t rank_ecp_lmax_plus_1;
|
||||
uint32_t rank_ecp_z_core;
|
||||
uint32_t rank_ecp_local_n;
|
||||
uint32_t rank_ecp_local_exponent;
|
||||
uint32_t rank_ecp_local_coef;
|
||||
uint32_t rank_ecp_local_power;
|
||||
uint32_t rank_ecp_non_local_n;
|
||||
uint32_t rank_ecp_non_local_exponent;
|
||||
uint32_t rank_ecp_non_local_coef;
|
||||
uint32_t rank_ecp_non_local_power;
|
||||
int to_flush;
|
||||
} ecp_t;
|
||||
typedef struct rdm_s {
|
||||
FILE* file;
|
||||
uint64_t dim_one_e;
|
||||
@ -51,12 +78,10 @@ typedef struct rdm_s {
|
||||
typedef struct trexio_text_s {
|
||||
trexio_t parent ;
|
||||
int lock_file;
|
||||
|
||||
nucleus_t* nucleus;
|
||||
electron_t* electron;
|
||||
nucleus_t* nucleus;
|
||||
ecp_t* ecp;
|
||||
rdm_t* rdm;
|
||||
} trexio_text_t;
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_init(trexio_t* file);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_lock(trexio_t* file);
|
||||
@ -64,22 +89,42 @@ trexio_exit_code trexio_text_lock(trexio_t* file);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_finalize(trexio_t* file);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_unlock(trexio_t* file);
|
||||
|
||||
nucleus_t* trexio_text_read_nucleus(trexio_text_t* file);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_flush_nucleus(const trexio_text_t* file);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_free_nucleus(trexio_text_t* file);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_free_ecp(trexio_text_t* file);
|
||||
nucleus_t* trexio_text_read_nucleus(trexio_text_t* file);
|
||||
ecp_t* trexio_text_read_ecp(trexio_text_t* file);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_flush_nucleus(const trexio_text_t* file);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_flush_ecp(const trexio_text_t* file);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_nucleus_num(const trexio_t* file, uint64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_nucleus_num(const trexio_t* file, const uint64_t num);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_nucleus_coord(const trexio_t* file, double* coord, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_nucleus_coord(const trexio_t* file, const double* coord, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_nucleus_charge(const trexio_t* file, double* charge, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_nucleus_charge(const trexio_t* file, const double* charge, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_local_num_n_max(const trexio_t* file, uint64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_local_num_n_max(const trexio_t* file, const uint64_t num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_non_local_num_n_max(const trexio_t* file, uint64_t* num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_non_local_num_n_max(const trexio_t* file, const uint64_t num);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_nucleus_charge(const trexio_t* file, double* nucleus_charge, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_nucleus_charge(const trexio_t* file, const double* nucleus_charge, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_nucleus_coord(const trexio_t* file, double* nucleus_coord, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_nucleus_coord(const trexio_t* file, const double* nucleus_coord, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_lmax_plus_1(const trexio_t* file, int64_t* ecp_lmax_plus_1, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_lmax_plus_1(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_lmax_plus_1, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_z_core(const trexio_t* file, int64_t* ecp_z_core, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_z_core(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_z_core, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_local_n(const trexio_t* file, int64_t* ecp_local_n, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_local_n(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_local_n, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_local_exponent(const trexio_t* file, double* ecp_local_exponent, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_local_exponent(const trexio_t* file, const double* ecp_local_exponent, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_local_coef(const trexio_t* file, double* ecp_local_coef, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_local_coef(const trexio_t* file, const double* ecp_local_coef, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_local_power(const trexio_t* file, int64_t* ecp_local_power, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_local_power(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_local_power, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_non_local_n(const trexio_t* file, int64_t* ecp_non_local_n, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_non_local_n(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_non_local_n, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_non_local_exponent(const trexio_t* file, double* ecp_non_local_exponent, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_non_local_exponent(const trexio_t* file, const double* ecp_non_local_exponent, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_non_local_coef(const trexio_t* file, double* ecp_non_local_coef, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_non_local_coef(const trexio_t* file, const double* ecp_non_local_coef, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_read_ecp_non_local_power(const trexio_t* file, int64_t* ecp_non_local_power, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_write_ecp_non_local_power(const trexio_t* file, const int64_t* ecp_non_local_power, const uint32_t rank, const uint64_t* dims);
|
||||
rdm_t* trexio_text_read_rdm(trexio_text_t* file);
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_flush_rdm(const trexio_text_t* file);
|
||||
@ -91,5 +136,4 @@ trexio_exit_code trexio_text_write_rdm_one_e(const trexio_t* file, const double*
|
||||
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_buffered_read_rdm_two_e(const trexio_t* file, const uint64_t offset, const uint64_t size, int64_t* index, double* value);
|
||||
trexio_exit_code trexio_text_buffered_write_rdm_two_e(const trexio_t* file, const uint64_t offset, const uint64_t size, const int64_t* index, const double* value);
|
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|
||||
#endif
|
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