mirror of
https://github.com/TREX-CoE/Sherman-Morrison.git
synced 2024-12-25 13:53:56 +01:00
- Fixed small dataset cycle 8169 to transform to replacement updates and regenerated the hdf5 file.
- Simplified makefiles.
This commit is contained in:
parent
1201718f28
commit
fad8eb2e89
24
Makefile
24
Makefile
@ -18,12 +18,13 @@ else ifeq ($(ENV),GNU)
|
||||
OPT = -O0
|
||||
DEBUG = -g
|
||||
else
|
||||
$(error No valid compiler environment set in $$ENV. First run: $$ source smvars.sh {intel | llvm | gnu})
|
||||
$(error No valid compiler environment set in $$ENV. \
|
||||
First run: $$ source smvars.sh {intel | llvm | gnu})
|
||||
endif
|
||||
CXXFLAGS = $(OPT) $(ARCH) $(DEBUG)
|
||||
CXXFLAGS = $(OPT) $(ARCH) $(DEBUG) -fPIC
|
||||
FFLAGS = $(CXXFLAGS)
|
||||
H5CXX = h5c++
|
||||
H5CXXFLAGS = $(CXXFLAGS) -fPIC
|
||||
H5CXXFLAGS = $(CXXFLAGS)
|
||||
FLIBS = -lstdc++
|
||||
|
||||
## Includes and dependencies
|
||||
@ -32,7 +33,9 @@ DEPS_CXX = $(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3.o \
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3S.o \
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_Standard.o \
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_Helpers.o
|
||||
DEPS_F = $(DEPS_CXX) $(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3_mod.o $(OBJ_DIR)/Helpers_mod.o
|
||||
DEPS_F = $(DEPS_CXX) \
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3_mod.o \
|
||||
$(OBJ_DIR)/Helpers_mod.o
|
||||
|
||||
## Directory structure
|
||||
SRC_DIR := src
|
||||
@ -70,7 +73,7 @@ $(OBJ_DIR)/%.o: $(TST_DIR)/%.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
$(OBJ_DIR)/%.o: $(SRC_DIR)/%.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) -fPIE $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
## HDF5/C++ objects
|
||||
$(OBJ_DIR)/%_h5.o: $(TST_DIR)/%_h5.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
@ -88,17 +91,6 @@ endif
|
||||
$(OBJ_DIR)/%.o: $(TST_DIR)/%.f90 | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(FC) $(FFLAGS) -I $(OBJ_DIR)/ -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
### EXPLICIT BUILD RULES
|
||||
## special compiler flag -fPIC otherwise h5c++ builds fail
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3.o: $(SRC_DIR)/SM_MaponiA3.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) -fPIC $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3S.o: $(SRC_DIR)/SM_MaponiA3S.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) -fPIC $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_Standard.o: $(SRC_DIR)/SM_Standard.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) -fPIC $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
|
||||
#### LINKING
|
||||
$(BIN_DIR)/cMaponiA3_test_3x3_3: $(OBJ_DIR)/cMaponiA3_test_3x3_3.o $(DEPS_CXX) | $(BIN_DIR)
|
||||
|
@ -4,16 +4,25 @@ CXX = verificarlo-c++
|
||||
FC = verificarlo-f
|
||||
|
||||
## Compiler flags
|
||||
H5FLAGS = "-I/usr/include/hdf5/serial -L/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5_hl_cpp.a /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5_cpp.a /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5_hl.a /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5.a -lpthread -lsz -lz -ldl -lm -Wl,-rpath -Wl,/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial"
|
||||
H5FLAGS = "-I/usr/include/hdf5/serial \
|
||||
-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial \
|
||||
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5_hl_cpp.a \
|
||||
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5_cpp.a \
|
||||
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5_hl.a \
|
||||
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5.a \
|
||||
-lpthread -lsz -lz -ldl -lm \
|
||||
-Wl,-rpath -Wl,/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial"
|
||||
CXXFLAGS = -O0 -g $(H5FLAGS)
|
||||
FFLAGS = -O0 -g $(H5FLAGS)
|
||||
FFLAGS = $(CXXFLAGS)
|
||||
|
||||
INCLUDE = -I $(INC_DIR)/
|
||||
DEPS_CXX = $(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3.o \
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3S.o \
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_Standard.o \
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_Helpers.o
|
||||
DEPS_F = $(DEPS_CXX) $(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3_mod.o $(OBJ_DIR)/Helpers_mod.o
|
||||
DEPS_F = $(DEPS_CXX) \
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3_mod.o \
|
||||
$(OBJ_DIR)/Helpers_mod.o
|
||||
FLIBS = -lstdc++
|
||||
|
||||
SRC_DIR := src
|
||||
@ -36,7 +45,7 @@ EXEC := $(BIN_DIR)/cMaponiA3_test_3x3_3 \
|
||||
all: $(EXEC)
|
||||
|
||||
clean:
|
||||
@rm -vrf $(OBJ_DIR)
|
||||
@rm -vrf $(OBJ_DIR) .*.o *.dbg *.cmdx *.cmod *.ilm *.stb
|
||||
|
||||
distclean: clean
|
||||
@rm -vrf $(BIN_DIR) \
|
||||
@ -53,7 +62,7 @@ $(OBJ_DIR)/%.o: $(TST_DIR)/%.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) $(ARCH) $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
$(OBJ_DIR)/%.o: $(SRC_DIR)/%.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) -fPIE $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
## HDF5/C++ objects
|
||||
$(OBJ_DIR)/%_h5.o: $(TST_DIR)/%_h5.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
@ -61,35 +70,19 @@ $(OBJ_DIR)/%_h5.o: $(TST_DIR)/%_h5.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
|
||||
## Fortran modules
|
||||
$(OBJ_DIR)/%_mod.o: $(SRC_DIR)/%_mod.f90 | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(FC) $(FFLAGS) $(ARCH) -module $(OBJ_DIR)/ -c -o $@ $<
|
||||
$(FC) $(FFLAGS) $(ARCH) -J $(OBJ_DIR)/ -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
## Fortran objects
|
||||
$(OBJ_DIR)/%.o: $(TST_DIR)/%.f90 | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(FC) $(FFLAGS) $(ARCH) -I $(OBJ_DIR)/ -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
### EXPLICIT BUILD RULES
|
||||
## special compiler flag -fPIC otherwise h5c++ builds fail
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3.o: $(SRC_DIR)/SM_MaponiA3.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) -fPIC $(ARCH) $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_MaponiA3S.o: $(SRC_DIR)/SM_MaponiA3S.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) -fPIC $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
$(OBJ_DIR)/SM_Standard.o: $(SRC_DIR)/SM_Standard.cpp $(INC_DIR)/* | $(OBJ_DIR)
|
||||
$(CXX) $(CXXFLAGS) -fPIC $(ARCH) $(INCLUDE) -c -o $@ $<
|
||||
|
||||
|
||||
#### LINKING
|
||||
$(BIN_DIR)/cMaponiA3_test_3x3_3: $(OBJ_DIR)/cMaponiA3_test_3x3_3.o $(DEPS_CXX) | $(BIN_DIR)
|
||||
$(CXX) -o $@ $^
|
||||
|
||||
#begin H5
|
||||
$(BIN_DIR)/test_h5: $(OBJ_DIR)/test_h5.o $(DEPS_CXX) | $(BIN_DIR)
|
||||
$(CXX) -o $@ $^ $(H5FLAGS)
|
||||
#$(BIN_DIR)/test_external_h5: $(OBJ_DIR)/test_external_h5.o $(DEPS_CXX) | $(BIN_DIR)
|
||||
# $(CXX) -o $@ $^ $(H5FLAGS)
|
||||
#end H5
|
||||
|
||||
|
||||
$(BIN_DIR)/fMaponiA3_test_3x3_3: $(DEPS_F) $(OBJ_DIR)/fMaponiA3_test_3x3_3.o | $(BIN_DIR)
|
||||
$(FC) $(FLIBS) -o $@ $^
|
||||
|
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
Binary file not shown.
@ -535,12 +535,12 @@
|
||||
(04,04) 0.100000000000000E+01 0.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_INDEX: 2
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(01): 0.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(02): -0.200000000000000E+01
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(02): -1.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(03): 0.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(04): 0.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(04): 1.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_INDEX: 4
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(01): 0.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(02): -0.100000000000000E+01
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(01): -1.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(02): -1.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(03): 0.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(04): 0.000000000000000E+00
|
||||
#COL_UPDATE_COMP_(04): -1.000000000000000E+00
|
||||
#END_PACKET
|
Binary file not shown.
@ -4,7 +4,7 @@
|
||||
#include "SM_MaponiA3S.hpp"
|
||||
#include "SM_Helpers.hpp"
|
||||
|
||||
// #define DEBUG
|
||||
#define DEBUG
|
||||
|
||||
void MaponiA3S(double *Slater_inv, unsigned int Dim,
|
||||
unsigned int N_updates, double *Updates,
|
||||
|
Loading…
Reference in New Issue
Block a user