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https://github.com/QuantumPackage/qp2.git
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Started working on OCaml. Need to go further for qp_edit
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parent
df4c9431d0
commit
bc04139a54
@ -37,7 +37,9 @@ end = struct
|
||||
} [@@deriving sexp]
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let get_default = Qpackage.get_ezfio_default "determinants";;
|
||||
let get_default = Qpackage.get_ezfio_default "determinants"
|
||||
|
||||
let is_complex = lazy (Ezfio.get_nuclei_is_complex () )
|
||||
|
||||
let read_n_int () =
|
||||
if not (Ezfio.has_determinants_n_int()) then
|
||||
@ -48,12 +50,12 @@ end = struct
|
||||
;
|
||||
Ezfio.get_determinants_n_int ()
|
||||
|> N_int_number.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_n_int n =
|
||||
N_int_number.to_int n
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_n_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
let read_bit_kind () =
|
||||
@ -64,12 +66,12 @@ end = struct
|
||||
;
|
||||
Ezfio.get_determinants_bit_kind ()
|
||||
|> Bit_kind.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_bit_kind b =
|
||||
Bit_kind.to_int b
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_bit_kind
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let read_n_det () =
|
||||
if not (Ezfio.has_determinants_n_det ()) then
|
||||
@ -77,7 +79,7 @@ end = struct
|
||||
;
|
||||
Ezfio.get_determinants_n_det ()
|
||||
|> Det_number.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let read_n_det_qp_edit () =
|
||||
if not (Ezfio.has_determinants_n_det_qp_edit ()) then
|
||||
@ -87,18 +89,18 @@ end = struct
|
||||
end;
|
||||
Ezfio.get_determinants_n_det_qp_edit ()
|
||||
|> Det_number.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_n_det n =
|
||||
Det_number.to_int n
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_n_det
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_n_det_qp_edit n =
|
||||
let n_det = read_n_det () |> Det_number.to_int in
|
||||
min n_det (Det_number.to_int n)
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_n_det_qp_edit
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let read_n_states () =
|
||||
if not (Ezfio.has_determinants_n_states ()) then
|
||||
@ -106,7 +108,7 @@ end = struct
|
||||
;
|
||||
Ezfio.get_determinants_n_states ()
|
||||
|> States_number.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_n_states n =
|
||||
let n_states =
|
||||
@ -130,7 +132,7 @@ end = struct
|
||||
Ezfio.ezfio_array_of_list ~rank:1 ~dim:[| n_states |] ~data
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_state_average_weight
|
||||
end
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_state_average_weight data =
|
||||
let n_states =
|
||||
@ -143,7 +145,7 @@ end = struct
|
||||
in
|
||||
Ezfio.ezfio_array_of_list ~rank:1 ~dim:[| n_states |] ~data
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_state_average_weight
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let read_state_average_weight () =
|
||||
let n_states =
|
||||
@ -171,7 +173,7 @@ end = struct
|
||||
|> Array.map Positive_float.of_float
|
||||
in
|
||||
(write_state_average_weight data; data)
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let read_expected_s2 () =
|
||||
if not (Ezfio.has_determinants_expected_s2 ()) then
|
||||
@ -186,12 +188,12 @@ end = struct
|
||||
;
|
||||
Ezfio.get_determinants_expected_s2 ()
|
||||
|> Positive_float.of_float
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_expected_s2 s2 =
|
||||
Positive_float.to_float s2
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_expected_s2
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let read_psi_coef ~read_only () =
|
||||
if not (Ezfio.has_determinants_psi_coef ()) then
|
||||
@ -200,19 +202,36 @@ end = struct
|
||||
read_n_states ()
|
||||
|> States_number.to_int
|
||||
in
|
||||
Ezfio.ezfio_array_of_list ~rank:2 ~dim:[| 1 ; n_states |]
|
||||
~data:(List.init n_states (fun i -> if (i=0) then 1. else 0. ))
|
||||
(
|
||||
if Lazy.force is_complex then
|
||||
Ezfio.ezfio_array_of_list ~rank:2 ~dim:[| 1 ; n_states |]
|
||||
~data:(List.init (2*n_states) (fun i -> if (i=0) then 1. else 0. ))
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_psi_coef
|
||||
else
|
||||
Ezfio.ezfio_array_of_list ~rank:3 ~dim:[| 2 ; 1 ; n_states |]
|
||||
~data:(List.init n_states (fun i -> if (i=0) then 1. else 0. ))
|
||||
|> Ezfio.set_determinants_psi_coef_complex
|
||||
)
|
||||
end;
|
||||
begin
|
||||
if read_only then
|
||||
Ezfio.get_determinants_psi_coef_qp_edit ()
|
||||
begin
|
||||
if Lazy.force is_complex then
|
||||
Ezfio.get_determinants_psi_coef_complex_qp_edit ()
|
||||
else
|
||||
Ezfio.get_determinants_psi_coef_qp_edit ()
|
||||
end
|
||||
else
|
||||
Ezfio.get_determinants_psi_coef ()
|
||||
begin
|
||||
if Lazy.force is_complex then
|
||||
Ezfio.get_determinants_psi_coef_complex ()
|
||||
else
|
||||
Ezfio.get_determinants_psi_coef ()
|
||||
end
|
||||
end
|
||||
|> Ezfio.flattened_ezfio
|
||||
|> Array.map Det_coef.of_float
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_psi_coef ~n_det ~n_states c =
|
||||
let n_det = Det_number.to_int n_det
|
||||
@ -222,12 +241,23 @@ end = struct
|
||||
and n_states =
|
||||
States_number.to_int n_states
|
||||
in
|
||||
let r =
|
||||
Ezfio.ezfio_array_of_list ~rank:2 ~dim:[| n_det ; n_states |] ~data:c
|
||||
in
|
||||
Ezfio.set_determinants_psi_coef r;
|
||||
Ezfio.set_determinants_psi_coef_qp_edit r
|
||||
;;
|
||||
if Lazy.force is_complex then
|
||||
begin
|
||||
let r =
|
||||
Ezfio.ezfio_array_of_list ~rank:3 ~dim:[| 2 ; n_det ; n_states |] ~data:c
|
||||
in
|
||||
Ezfio.set_determinants_psi_coef_complex r;
|
||||
Ezfio.set_determinants_psi_coef_complex_qp_edit r
|
||||
end
|
||||
else
|
||||
begin
|
||||
let r =
|
||||
Ezfio.ezfio_array_of_list ~rank:2 ~dim:[| n_det ; n_states |] ~data:c
|
||||
in
|
||||
Ezfio.set_determinants_psi_coef r;
|
||||
Ezfio.set_determinants_psi_coef_qp_edit r
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
let read_psi_det ~read_only () =
|
||||
@ -276,7 +306,7 @@ end = struct
|
||||
|> Array.map (Determinant.of_int64_array
|
||||
~n_int:(N_int_number.of_int n_int)
|
||||
~alpha:n_alpha ~beta:n_beta )
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write_psi_det ~n_int ~n_det d =
|
||||
let data = Array.to_list d
|
||||
@ -288,7 +318,7 @@ end = struct
|
||||
in
|
||||
Ezfio.set_determinants_psi_det r;
|
||||
Ezfio.set_determinants_psi_det_qp_edit r
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
let read ?(full=true) () =
|
||||
@ -316,7 +346,7 @@ end = struct
|
||||
else
|
||||
(* No molecular orbitals, so no determinants *)
|
||||
None
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let write ?(force=false)
|
||||
{ n_int ;
|
||||
@ -341,7 +371,7 @@ end = struct
|
||||
write_psi_det ~n_int:n_int ~n_det:n_det psi_det
|
||||
end;
|
||||
write_state_average_weight state_average_weight
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
let to_rst b =
|
||||
@ -557,10 +587,8 @@ psi_det = %s
|
||||
in
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Generic_input_of_rst.evaluate_sexp t_of_sexp s
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let update_ndet n_det_new =
|
||||
Printf.printf "Reducing n_det to %d\n" (Det_number.to_int n_det_new);
|
||||
@ -596,7 +624,7 @@ psi_det = %s
|
||||
{ det with n_det = (Det_number.of_int n_det_new) }
|
||||
in
|
||||
write ~force:true new_det
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let extract_state istate =
|
||||
Printf.printf "Extracting state %d\n" (States_number.to_int istate);
|
||||
@ -628,7 +656,7 @@ psi_det = %s
|
||||
{ det with n_states = (States_number.of_int 1) }
|
||||
in
|
||||
write ~force:true new_det
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
let extract_states range =
|
||||
Printf.printf "Extracting states %s\n" (Range.to_string range);
|
||||
@ -673,7 +701,7 @@ psi_det = %s
|
||||
{ det with n_states = (States_number.of_int @@ List.length sorted_list) }
|
||||
in
|
||||
write ~force:true new_det
|
||||
;;
|
||||
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
||||
@ -43,7 +43,7 @@ end = struct
|
||||
mo_coef = Array.map (fun mo ->
|
||||
Array.init (Array.length mo)
|
||||
(fun i -> mo.(ordering.(i)))
|
||||
) b.mo_coef
|
||||
) b.mo_coef
|
||||
}
|
||||
|
||||
let read_ao_md5 () =
|
||||
@ -73,7 +73,7 @@ end = struct
|
||||
let elec_alpha_num =
|
||||
Ezfio.get_electrons_elec_alpha_num ()
|
||||
in
|
||||
let result =
|
||||
let result =
|
||||
Ezfio.get_mo_basis_mo_num ()
|
||||
in
|
||||
if result < elec_alpha_num then
|
||||
@ -116,7 +116,7 @@ end = struct
|
||||
|
||||
|
||||
let read_mo_coef () =
|
||||
let a =
|
||||
let a =
|
||||
(
|
||||
if Lazy.force is_complex then
|
||||
Ezfio.get_mo_basis_mo_coef_complex ()
|
||||
@ -129,7 +129,7 @@ end = struct
|
||||
let mo_num = read_mo_num () |> MO_number.to_int in
|
||||
let ao_num = (Array.length a)/mo_num in
|
||||
Array.init mo_num (fun j ->
|
||||
Array.sub a (j*ao_num) (ao_num)
|
||||
Array.sub a (j*ao_num) (ao_num)
|
||||
)
|
||||
|
||||
|
||||
@ -247,7 +247,7 @@ mo_coef = %s
|
||||
(b.mo_occ |> Array.to_list |> List.map
|
||||
(MO_occ.to_string) |> String.concat ", " )
|
||||
(b.mo_coef |> Array.map
|
||||
(fun x-> Array.map MO_coef.to_string x |>
|
||||
(fun x-> Array.map MO_coef.to_string x |>
|
||||
Array.to_list |> String.concat "," ) |>
|
||||
Array.to_list |> String.concat "\n" )
|
||||
|
||||
@ -285,7 +285,7 @@ mo_coef = %s
|
||||
|
||||
let write_mo_coef a =
|
||||
let mo_num = Array.length a in
|
||||
let ao_num =
|
||||
let ao_num =
|
||||
let x = Array.length a.(0) in
|
||||
if Lazy.force is_complex then x/2 else x
|
||||
in
|
||||
@ -303,7 +303,7 @@ mo_coef = %s
|
||||
|> Ezfio.set_mo_basis_mo_coef )
|
||||
|
||||
|
||||
let write
|
||||
let write
|
||||
{ mo_num : MO_number.t ;
|
||||
mo_label : MO_label.t;
|
||||
mo_class : MO_class.t array;
|
||||
|
||||
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