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Cholesky OK
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parent
d911f4eee8
commit
487e85c6ae
@ -34,106 +34,11 @@ END_PROVIDER
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||||
! <ij|kl> = (ik|jl) = sum_a (ik|a).(a|jl)
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||||
END_DOC
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||||
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||||
type(c_ptr) :: ptr
|
||||
integer :: fd, i,j,k,l,m,rank
|
||||
double precision, pointer :: ao_integrals(:,:,:,:)
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||||
double precision, external :: ao_two_e_integral
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||||
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||||
! Store AO integrals in a memory mapped file
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||||
call mmap(trim(ezfio_work_dir)//'ao_integrals', &
|
||||
(/ int(ao_num,8), int(ao_num,8), int(ao_num,8), int(ao_num,8) /), &
|
||||
8, fd, .False., ptr)
|
||||
call c_f_pointer(ptr, ao_integrals, (/ao_num, ao_num, ao_num, ao_num/))
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||||
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||||
print*, 'Providing the AO integrals (Cholesky)'
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||||
call wall_time(wall_1)
|
||||
call cpu_time(cpu_1)
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||||
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||||
ao_integrals = 0.d0
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||||
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||||
double precision :: integral, cpu_1, cpu_2, wall_1, wall_2
|
||||
logical, external :: ao_two_e_integral_zero
|
||||
double precision, external :: get_ao_two_e_integral
|
||||
|
||||
if (read_ao_two_e_integrals) then
|
||||
PROVIDE ao_two_e_integrals_in_map
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||||
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||||
!$OMP PARALLEL DEFAULT(SHARED) PRIVATE(i,j,k,l, integral, wall_2)
|
||||
do m=0,9
|
||||
do l=1+m,ao_num,10
|
||||
!$OMP DO SCHEDULE(dynamic)
|
||||
do j=1,ao_num
|
||||
do k=1,ao_num
|
||||
do i=1,ao_num
|
||||
if (ao_two_e_integral_zero(i,j,k,l)) cycle
|
||||
integral = get_ao_two_e_integral(i,j,k,l, ao_integrals_map)
|
||||
ao_integrals(i,k,j,l) = integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
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||||
enddo
|
||||
!$OMP END DO NOWAIT
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP MASTER
|
||||
call wall_time(wall_2)
|
||||
print '(I10,'' % in'', 4X, F10.2, '' s.'')', (m+1) * 10, wall_2-wall_1
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||||
!$OMP END MASTER
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END PARALLEL
|
||||
|
||||
else
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||||
|
||||
!$OMP PARALLEL DEFAULT(SHARED) PRIVATE(i,j,k,l, integral, wall_2)
|
||||
do m=0,9
|
||||
do l=1+m,ao_num,10
|
||||
!$OMP DO SCHEDULE(dynamic)
|
||||
do j=1,l
|
||||
do k=1,ao_num
|
||||
do i=1,min(k,j)
|
||||
if (ao_two_e_integral_zero(i,j,k,l)) cycle
|
||||
integral = ao_two_e_integral(i,k,j,l)
|
||||
ao_integrals(i,k,j,l) = integral
|
||||
ao_integrals(k,i,j,l) = integral
|
||||
ao_integrals(i,k,l,j) = integral
|
||||
ao_integrals(k,i,l,j) = integral
|
||||
ao_integrals(j,l,i,k) = integral
|
||||
ao_integrals(j,l,k,i) = integral
|
||||
ao_integrals(l,j,i,k) = integral
|
||||
ao_integrals(l,j,k,i) = integral
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END DO NOWAIT
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP MASTER
|
||||
call wall_time(wall_2)
|
||||
print '(I10,'' % in'', 4X, F10.2, '' s.'')', (m+1) * 10, wall_2-wall_1
|
||||
!$OMP END MASTER
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END PARALLEL
|
||||
|
||||
call wall_time(wall_2)
|
||||
call cpu_time(cpu_2)
|
||||
print*, 'AO integrals provided:'
|
||||
print*, ' cpu time :',cpu_2 - cpu_1, 's'
|
||||
print*, ' wall time :',wall_2 - wall_1, 's ( x ', (cpu_2-cpu_1)/(wall_2-wall_1+tiny(1.d0)), ' )'
|
||||
|
||||
endif
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||||
|
||||
! Call Lapack
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||||
cholesky_ao_num = cholesky_ao_num_guess
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||||
! call pivoted_cholesky(ao_integrals, cholesky_ao_num, ao_cholesky_threshold, ao_num*ao_num, cholesky_ao)
|
||||
|
||||
call direct_cholesky(ao_integrals, cholesky_ao_num, ao_cholesky_threshold, ao_num*ao_num, cholesky_ao)
|
||||
call direct_cholesky(cholesky_ao, ao_num*ao_num, cholesky_ao_num, ao_cholesky_threshold)
|
||||
print *, 'Rank : ', cholesky_ao_num, '(', 100.d0*dble(cholesky_ao_num)/dble(ao_num*ao_num), ' %)'
|
||||
|
||||
! Remove mmap
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||||
double precision, external :: getUnitAndOpen
|
||||
call munmap( &
|
||||
(/ int(ao_num,8), int(ao_num,8), int(ao_num,8), int(ao_num,8) /), &
|
||||
8, fd, ptr)
|
||||
open(unit=99,file=trim(ezfio_work_dir)//'ao_integrals')
|
||||
close(99, status='delete')
|
||||
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, cholesky_ao_transp, (cholesky_ao_num, ao_num, ao_num) ]
|
||||
@ -152,35 +57,53 @@ BEGIN_PROVIDER [ double precision, cholesky_ao_transp, (cholesky_ao_num, ao_num,
|
||||
END_PROVIDER
|
||||
|
||||
|
||||
subroutine direct_cholesky( A, rank, tau, ndim, L)
|
||||
subroutine direct_cholesky(L, ndim, rank, tau)
|
||||
implicit none
|
||||
BEGIN_DOC
|
||||
! Cholesky-decomposed AOs.
|
||||
!
|
||||
! https://www.diva-portal.org/smash/get/diva2:396223/FULLTEXT01.pdf :
|
||||
! Page 32, section 13.5
|
||||
END_DOC
|
||||
integer :: ndim
|
||||
integer, intent(inout) :: rank
|
||||
double precision, intent(inout) :: A(ndim, ndim)
|
||||
double precision, intent(out) :: L(ndim, rank)
|
||||
integer, intent(out) :: rank
|
||||
double precision, intent(out) :: L(ndim, ndim)
|
||||
double precision, intent(in) :: tau
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||||
|
||||
double precision, parameter :: s = 1.d-2
|
||||
double precision, parameter :: dscale = 1.d0
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||||
|
||||
double precision, allocatable :: D(:), Delta(:,:)
|
||||
integer, allocatable :: Lset(:), Dset(:)
|
||||
integer, allocatable :: Lset(:), Dset(:), addr(:,:)
|
||||
|
||||
integer :: i,j,k,m,p,q, qj, dj
|
||||
integer :: N, np, nq
|
||||
|
||||
double precision :: Dmax, Dmin, Qmax, f
|
||||
allocate( D(ndim), Lset(ndim), Dset(ndim) )
|
||||
double precision, external :: get_ao_two_e_integral
|
||||
|
||||
L = 0.d0
|
||||
allocate( D(ndim), Lset(ndim), Dset(ndim) )
|
||||
allocate( addr(2,ndim) )
|
||||
|
||||
! 1.
|
||||
do i=1,ndim
|
||||
D(i) = A(i,i)
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||||
k=0
|
||||
do i=1,ao_num
|
||||
do j=1,ao_num
|
||||
k = k+1
|
||||
addr(1,k) = i
|
||||
addr(2,k) = j
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
!$OMP PARALLEL DO DEFAULT(SHARED) PRIVATE(i)
|
||||
do i=1,ndim
|
||||
D(i) = get_ao_two_e_integral(addr(1,i), addr(1,i), &
|
||||
addr(2,i), addr(2,i), &
|
||||
ao_integrals_map)
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||
|
||||
Dmax = maxval(D)
|
||||
! print *, '# 1. ', D
|
||||
! print *, '# 1. ', Dmax
|
||||
|
||||
! 2.
|
||||
np=0
|
||||
@ -190,25 +113,20 @@ subroutine direct_cholesky( A, rank, tau, ndim, L)
|
||||
Lset(np) = p
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
! print *, '# 2. ', Lset(:np)
|
||||
|
||||
! 3.
|
||||
N = 0
|
||||
! print *, '# 3. ', N
|
||||
|
||||
! 4.
|
||||
! 4.
|
||||
i = 0
|
||||
! print *, '# 4. ', i
|
||||
|
||||
! 5.
|
||||
! 5.
|
||||
do while (Dmax > tau)
|
||||
! a.
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||||
i = i+1
|
||||
! print *, '# 5.a ', i
|
||||
|
||||
! b.
|
||||
Dmin = max(s*Dmax, tau)
|
||||
! print *, '# 5.b ', Dmin
|
||||
|
||||
! c.
|
||||
nq=0
|
||||
@ -218,43 +136,42 @@ subroutine direct_cholesky( A, rank, tau, ndim, L)
|
||||
Dset(nq) = Lset(q)
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
! print *, '# 5.c ', Dset(:nq)
|
||||
|
||||
! d.
|
||||
! d., e.
|
||||
allocate(Delta(np,nq))
|
||||
!$OMP PARALLEL DO DEFAULT(SHARED) PRIVATE(m,k)
|
||||
do m=1,nq
|
||||
do k=1,np
|
||||
Delta(k,m) = A(Lset(k), Dset(m))
|
||||
Delta(k,m) = get_ao_two_e_integral( &
|
||||
addr(1,Lset(k)), &
|
||||
addr(1,Dset(m)), &
|
||||
addr(2,Lset(k)), &
|
||||
addr(2,Dset(m)), &
|
||||
ao_integrals_map)
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
! print *, '# 5.d ', Delta
|
||||
|
||||
! e.
|
||||
do m=1,nq
|
||||
do k=1,np
|
||||
do p=1,N
|
||||
Delta(k,m) = Delta(k,m) - L(Lset(k),p) * L(Dset(m),p)
|
||||
do p=1,N
|
||||
f = L(Dset(m),p)
|
||||
do k=1,np
|
||||
Delta(k,m) = Delta(k,m) - L(Lset(k),p) * f
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
! print *, '# 5.e ', Delta
|
||||
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||
|
||||
! f.
|
||||
Qmax = D(Dset(1))
|
||||
do q=1,nq
|
||||
Qmax = max(Qmax, D(Dset(q)))
|
||||
enddo
|
||||
! print *, '# 5.f ', Qmax
|
||||
|
||||
! g.
|
||||
j = 0
|
||||
! print *, '# 5.g ', j
|
||||
|
||||
do while ( (j <= nq).and.(Qmax > Dmin) )
|
||||
! i.
|
||||
j = j+1
|
||||
rank = N+j
|
||||
! print *, '# 5.h.i ', j, rank
|
||||
|
||||
! ii.
|
||||
do dj=1,nq
|
||||
@ -263,22 +180,18 @@ subroutine direct_cholesky( A, rank, tau, ndim, L)
|
||||
exit
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
! print *, ' # 5.h.ii ', qj, dj
|
||||
|
||||
! iii.
|
||||
f = 1.d0/dsqrt(Qmax)
|
||||
do p=1,np
|
||||
L(Lset(p), rank) = Delta(p,dj) * f
|
||||
enddo
|
||||
! print *, ' # 5.h.iii '
|
||||
! do k=1,20
|
||||
! print *, L(k,1:rank)
|
||||
! enddo
|
||||
|
||||
! iv.
|
||||
do m=1, nq
|
||||
f = L(Dset(m),rank)
|
||||
do k=1, np
|
||||
Delta(k,m) = Delta(k,m) - L(Lset(k),rank) * L(Dset(m),rank)
|
||||
Delta(k,m) = Delta(k,m) - L(Lset(k),rank) * f
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
@ -290,9 +203,6 @@ subroutine direct_cholesky( A, rank, tau, ndim, L)
|
||||
do q=1,np
|
||||
Qmax = max(Qmax, D(Lset(q)))
|
||||
enddo
|
||||
! print *, '# 5.h.iv ', Delta
|
||||
! print *, '# 5.h.iv ', D
|
||||
! print *, '# 5.h.iv ', Qmax
|
||||
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
@ -300,14 +210,12 @@ subroutine direct_cholesky( A, rank, tau, ndim, L)
|
||||
|
||||
! i.
|
||||
N = N+j
|
||||
! print *, '# 5.i ', N
|
||||
|
||||
! j.
|
||||
Dmax = D(Lset(1))
|
||||
do p=1,np
|
||||
Dmax = max(Dmax, D(Lset(p)))
|
||||
enddo
|
||||
! print *, '# 5.j ', Dmax
|
||||
|
||||
np=0
|
||||
do p=1,ndim
|
||||
@ -316,7 +224,7 @@ subroutine direct_cholesky( A, rank, tau, ndim, L)
|
||||
Lset(np) = p
|
||||
endif
|
||||
enddo
|
||||
! print *, '# k. ', Lset(:np)
|
||||
|
||||
enddo
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
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