mirror of
https://github.com/pfloos/quack
synced 2024-12-22 20:34:46 +01:00
new files
This commit is contained in:
parent
3059085d57
commit
ca96c59429
135
src/MCQC/AOtoMO_oooooo.f90
Normal file
135
src/MCQC/AOtoMO_oooooo.f90
Normal file
@ -0,0 +1,135 @@
|
|||||||
|
subroutine AOtoMO_oooooo(nBas,nO,cO,O,oooOooo)
|
||||||
|
|
||||||
|
! AO to MO transformation of three-electron integrals for the block oooooo
|
||||||
|
! Semi-direct O(N^7) algorithm
|
||||||
|
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
|
! Input variables
|
||||||
|
|
||||||
|
integer,intent(in) :: nBas,nO
|
||||||
|
double precision,intent(in) :: cO(nBas,nO),O(nBas,nBas,nBas,nBas,nBas,nBas)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Local variables
|
||||||
|
|
||||||
|
double precision,allocatable :: scr1(:,:,:,:,:,:),scr2(:,:,:,:,:,:)
|
||||||
|
integer :: mu,nu,la,si,ka,ta,i,j,k,l,m,n
|
||||||
|
|
||||||
|
! Output variables
|
||||||
|
|
||||||
|
double precision,intent(out) :: oooOooo(nO,nO,nO,nO,nO,nO)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Memory allocation
|
||||||
|
allocate(scr1(nBas,nBas,nBas,nBas,nBas,nBas),scr2(nBas,nBas,nBas,nBas,nBas,nBas))
|
||||||
|
|
||||||
|
write(*,*)
|
||||||
|
write(*,'(A42)') '------------------------------------------'
|
||||||
|
write(*,'(A42)') ' AO to MO transformation for oooooo block '
|
||||||
|
write(*,'(A42)') '------------------------------------------'
|
||||||
|
write(*,*)
|
||||||
|
|
||||||
|
scr1 = 0d0
|
||||||
|
do mu=1,nBas
|
||||||
|
do nu=1,nBas
|
||||||
|
do la=1,nBas
|
||||||
|
do si=1,nBas
|
||||||
|
do ka=1,nBas
|
||||||
|
do ta=1,nBas
|
||||||
|
do n=1,nO
|
||||||
|
scr1(mu,nu,la,si,ka,n) = scr1(mu,nu,la,si,ka,n) + O(mu,nu,la,si,ka,ta)*cO(ta,n)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
scr2 = 0d0
|
||||||
|
do mu=1,nBas
|
||||||
|
do nu=1,nBas
|
||||||
|
do la=1,nBas
|
||||||
|
do si=1,nBas
|
||||||
|
do ka=1,nBas
|
||||||
|
do i=1,nO
|
||||||
|
do n=1,nO
|
||||||
|
scr2(i,nu,la,si,ka,n) = scr2(i,nu,la,si,ka,n) + cO(mu,i)*scr1(mu,nu,la,si,ka,n)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
scr1 = 0d0
|
||||||
|
do nu=1,nBas
|
||||||
|
do la=1,nBas
|
||||||
|
do si=1,nBas
|
||||||
|
do ka=1,nBas
|
||||||
|
do i=1,nO
|
||||||
|
do m=1,nO
|
||||||
|
do n=1,nO
|
||||||
|
scr1(i,nu,la,si,m,n) = scr1(i,nu,la,si,m,n) + scr2(i,nu,la,si,m,n)*cO(ka,m)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
scr2 = 0d0
|
||||||
|
do nu=1,nBas
|
||||||
|
do la=1,nBas
|
||||||
|
do si=1,nBas
|
||||||
|
do i=1,nO
|
||||||
|
do j=1,nO
|
||||||
|
do m=1,nO
|
||||||
|
do n=1,nO
|
||||||
|
scr2(i,j,la,si,m,n) = scr2(i,j,la,si,m,n) + cO(nu,j)*scr1(i,nu,la,si,m,n)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
scr1 = 0d0
|
||||||
|
do la=1,nBas
|
||||||
|
do si=1,nBas
|
||||||
|
do i=1,nO
|
||||||
|
do j=1,nO
|
||||||
|
do l=1,nO
|
||||||
|
do m=1,nO
|
||||||
|
do n=1,nO
|
||||||
|
scr1(i,j,la,l,m,n) = scr1(i,j,la,l,m,n) + cO(si,l)*scr2(i,j,la,si,m,n)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
oooOooo = 0d0
|
||||||
|
do si=1,nBas
|
||||||
|
do i=1,nO
|
||||||
|
do j=1,nO
|
||||||
|
do k=1,nO
|
||||||
|
do l=1,nO
|
||||||
|
do m=1,nO
|
||||||
|
do n=1,nO
|
||||||
|
oooOooo(i,j,k,l,m,n) = oooOooo(i,j,k,l,m,n) + cO(la,k)*scr1(i,j,la,k,m,n)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
deallocate(scr1,scr2)
|
||||||
|
|
||||||
|
end subroutine AOtoMO_oooooo
|
@ -55,6 +55,7 @@ subroutine MP2F12(nBas,nC,nO,nV,ERI,F12,Yuk,FC,EHF,EcMP2,c,EcMP2F12)
|
|||||||
! Compute the three-electron part of the MP2-F12 energy
|
! Compute the three-electron part of the MP2-F12 energy
|
||||||
|
|
||||||
allocate(oooFCooo(nO,nO,nO,nO,nO,nO))
|
allocate(oooFCooo(nO,nO,nO,nO,nO,nO))
|
||||||
|
call AOtoMO_oooooo(nBas,nO,cO,FC,oooFCooo)
|
||||||
|
|
||||||
E3a = 0d0
|
E3a = 0d0
|
||||||
E3b = 0d0
|
E3b = 0d0
|
||||||
|
29
src/MCQC/NormCoeff.f90
Normal file
29
src/MCQC/NormCoeff.f90
Normal file
@ -0,0 +1,29 @@
|
|||||||
|
function NormCoeff(alpha,a)
|
||||||
|
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
|
! Input variables
|
||||||
|
|
||||||
|
double precision,intent(in) :: alpha
|
||||||
|
integer,intent(in) :: a(3)
|
||||||
|
|
||||||
|
! local variable
|
||||||
|
double precision :: pi,dfa(3),dfac
|
||||||
|
integer :: atot
|
||||||
|
|
||||||
|
! Output variable
|
||||||
|
double precision NormCoeff
|
||||||
|
|
||||||
|
pi = 4d0*atan(1d0)
|
||||||
|
atot = a(1) + a(2) + a(3)
|
||||||
|
|
||||||
|
dfa(1) = dfac(2*a(1))/(2d0**a(1)*dfac(a(1)))
|
||||||
|
dfa(2) = dfac(2*a(2))/(2d0**a(2)*dfac(a(2)))
|
||||||
|
dfa(3) = dfac(2*a(3))/(2d0**a(3)*dfac(a(3)))
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
NormCoeff = (2d0*alpha/pi)**(3d0/2d0)*(4d0*alpha)**atot
|
||||||
|
NormCoeff = NormCoeff/(dfa(1)*dfa(2)*dfa(3))
|
||||||
|
NormCoeff = sqrt(NormCoeff)
|
||||||
|
|
||||||
|
end function NormCoeff
|
170
src/MCQC/elements.f90
Normal file
170
src/MCQC/elements.f90
Normal file
@ -0,0 +1,170 @@
|
|||||||
|
function element_number(element_name)
|
||||||
|
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
|
integer,parameter :: nelement_max = 103
|
||||||
|
character(len=2),intent(in) :: element_name
|
||||||
|
integer :: element_number
|
||||||
|
character(len=2),parameter :: element_list(nelement_max) = &
|
||||||
|
(/' H', 'He', & ! 2
|
||||||
|
'Li','Be', ' B',' C',' N',' O',' F','Ne', & ! 10
|
||||||
|
'Na','Mg', 'Al','Si',' P',' S','Cl','Ar', & ! 18
|
||||||
|
' K','Ca','Sc','Ti',' V','Cr','Mn','Fe','Co','Ni','Cu','Zn','Ga','Ge','As','Se','Br','Kr', & ! 36
|
||||||
|
'Rb','Sr',' Y','Zr','Nb','Mo','Tc','Ru','Rh','Pd','Ag','Cd','In','Sn','Sb','Te',' I','Xe', & ! 54
|
||||||
|
'Cs','Ba', & ! 56
|
||||||
|
'La','Ce','Pr','Nd','Pm','Sm','Eu','Gd','Tb','Dy','Ho','Er','Tm','Yb', & ! 70
|
||||||
|
'Lu','Hf','Ta',' W','Re','Os','Ir','Pt','Au','Hg','Tl','Pb','Bi','Po','At','Rn', & ! 86
|
||||||
|
'Fr','Ra', & ! 88
|
||||||
|
'Ac','Th','Pa',' U','Np','Pu','Am','Cm','Bk','Cf','Es','Fm','Md','No', & ! 102
|
||||||
|
'Lr' & ! 103
|
||||||
|
/)
|
||||||
|
|
||||||
|
!=====
|
||||||
|
integer :: ielement
|
||||||
|
!=====
|
||||||
|
|
||||||
|
ielement=1
|
||||||
|
do while( ADJUSTL(element_name) /= ADJUSTL(element_list(ielement)) )
|
||||||
|
if( ielement == nelement_max ) then
|
||||||
|
write(*,'(a,a)') ' Input symbol ',element_name
|
||||||
|
write(*,'(a,i3,a)') ' Element symbol is not one of first ',nelement_max,' elements'
|
||||||
|
write(*,*) '!!! element symbol not understood !!!'
|
||||||
|
stop
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
ielement = ielement + 1
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
element_number = ielement
|
||||||
|
|
||||||
|
end function element_number
|
||||||
|
|
||||||
|
function element_core(zval,zatom)
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
double precision,intent(in) :: zval
|
||||||
|
double precision,intent(in) :: zatom
|
||||||
|
integer :: element_core
|
||||||
|
!=====
|
||||||
|
|
||||||
|
!
|
||||||
|
! If zval /= zatom, this is certainly an effective core potential
|
||||||
|
! and no core states should be frozen.
|
||||||
|
if( ABS(zval - zatom) > 1d0-3 ) then
|
||||||
|
element_core = 0
|
||||||
|
else
|
||||||
|
|
||||||
|
if( zval <= 4.00001d0 ) then ! up to Be
|
||||||
|
element_core = 0
|
||||||
|
else if( zval <= 12.00001d0 ) then ! up to Mg
|
||||||
|
element_core = 1
|
||||||
|
else if( zval <= 30.00001d0 ) then ! up to Ca
|
||||||
|
element_core = 5
|
||||||
|
else if( zval <= 48.00001d0 ) then ! up to Sr
|
||||||
|
element_core = 9
|
||||||
|
else
|
||||||
|
write(*,*) '!!! not imlemented in element_core !!!'
|
||||||
|
stop
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
end function element_core
|
||||||
|
|
||||||
|
function element_covalent_radius(zatom)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Return covalent radius of an atom
|
||||||
|
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
include 'parameters.h'
|
||||||
|
|
||||||
|
integer,intent(in) :: zatom
|
||||||
|
double precision :: element_covalent_radius
|
||||||
|
|
||||||
|
!
|
||||||
|
! Data from Cambridge Structural Database
|
||||||
|
! http://en.wikipedia.org/wiki/Covalent_radius
|
||||||
|
!
|
||||||
|
! Values are first given in picometer
|
||||||
|
! They will be converted in bohr later on
|
||||||
|
select case(zatom)
|
||||||
|
case( 1)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 31.
|
||||||
|
case( 2)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 28.
|
||||||
|
case( 3)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 128.
|
||||||
|
case( 4)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 96.
|
||||||
|
case( 5)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 84.
|
||||||
|
case( 6)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 73.
|
||||||
|
case( 7)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 71.
|
||||||
|
case( 8)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 66.
|
||||||
|
case( 9)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 57.
|
||||||
|
case(10) ! Ne.
|
||||||
|
element_covalent_radius = 58.
|
||||||
|
case(11)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 166.
|
||||||
|
case(12)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 141.
|
||||||
|
case(13)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 121.
|
||||||
|
case(14)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 111.
|
||||||
|
case(15)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 107.
|
||||||
|
case(16)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 105.
|
||||||
|
case(17)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 102.
|
||||||
|
case(18) ! Ar.
|
||||||
|
element_covalent_radius = 106.
|
||||||
|
case(19)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 203.
|
||||||
|
case(20)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 176.
|
||||||
|
case(21)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 170.
|
||||||
|
case(22)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 160.
|
||||||
|
case(23)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 153.
|
||||||
|
case(24)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 139.
|
||||||
|
case(25)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 145.
|
||||||
|
case(26)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 145.
|
||||||
|
case(27)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 140.
|
||||||
|
case(28)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 124.
|
||||||
|
case(29)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 132.
|
||||||
|
case(30)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 122.
|
||||||
|
case(31)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 120.
|
||||||
|
case(32)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 119.
|
||||||
|
case(34)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 120.
|
||||||
|
case(35)
|
||||||
|
element_covalent_radius = 120.
|
||||||
|
case(36) ! Kr.
|
||||||
|
element_covalent_radius = 116.
|
||||||
|
case default
|
||||||
|
write(*,*) '!!! covalent radius not available !!!'
|
||||||
|
stop
|
||||||
|
end select
|
||||||
|
|
||||||
|
! pm to bohr conversion
|
||||||
|
element_covalent_radius = element_covalent_radius*pmtoau
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
end function element_covalent_radius
|
||||||
|
|
118
src/MCQC/read_basis.f90
Normal file
118
src/MCQC/read_basis.f90
Normal file
@ -0,0 +1,118 @@
|
|||||||
|
subroutine read_basis(nAt,rAt,nBas,nO,nV,nShell,TotAngMomShell,CenterShell,KShell,DShell,ExpShell)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Read basis set information
|
||||||
|
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
include 'parameters.h'
|
||||||
|
|
||||||
|
! Input variables
|
||||||
|
|
||||||
|
integer,intent(in) :: nAt,nO
|
||||||
|
double precision,intent(in) :: rAt(nAt,ncart)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Local variables
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: nShAt,iAt,iShell
|
||||||
|
integer :: i,j,k
|
||||||
|
character :: shelltype
|
||||||
|
|
||||||
|
! Output variables
|
||||||
|
|
||||||
|
integer,intent(out) :: nShell,nBas
|
||||||
|
double precision,intent(out) :: CenterShell(maxShell,ncart)
|
||||||
|
integer,intent(out) :: TotAngMomShell(maxShell),KShell(maxShell)
|
||||||
|
double precision,intent(out) :: DShell(maxShell,maxK),ExpShell(maxShell,maxK)
|
||||||
|
integer,intent(out) :: nV
|
||||||
|
|
||||||
|
!------------------------------------------------------------------------
|
||||||
|
! Primary basis set information
|
||||||
|
!------------------------------------------------------------------------
|
||||||
|
|
||||||
|
! Open file with basis set specification
|
||||||
|
|
||||||
|
open(unit=2,file='input/basis')
|
||||||
|
|
||||||
|
! Read basis information
|
||||||
|
|
||||||
|
write(*,'(A28)') 'Gaussian basis set'
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
|
||||||
|
nShell = 0
|
||||||
|
do i=1,nAt
|
||||||
|
read(2,*) iAt,nShAt
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'Atom n. ',iAt
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'number of shells ',nShAt
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
|
||||||
|
! Basis function centers
|
||||||
|
|
||||||
|
do j=1,nShAt
|
||||||
|
nShell = nShell + 1
|
||||||
|
do k=1,ncart
|
||||||
|
CenterShell(nShell,k) = rAt(iAt,k)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
! Shell type and contraction degree
|
||||||
|
|
||||||
|
read(2,*) shelltype,KShell(nShell)
|
||||||
|
if(shelltype == "S") then
|
||||||
|
TotAngMomShell(nShell) = 0
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 's-type shell with K = ',KShell(nShell)
|
||||||
|
elseif(shelltype == "P") then
|
||||||
|
TotAngMomShell(nShell) = 1
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'p-type shell with K = ',KShell(nShell)
|
||||||
|
elseif(shelltype == "D") then
|
||||||
|
TotAngMomShell(nShell) = 2
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'd-type shell with K = ',KShell(nShell)
|
||||||
|
elseif(shelltype == "F") then
|
||||||
|
TotAngMomShell(nShell) = 3
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'f-type shell with K = ',KShell(nShell)
|
||||||
|
elseif(shelltype == "G") then
|
||||||
|
TotAngMomShell(nShell) = 4
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'g-type shell with K = ',KShell(nShell)
|
||||||
|
elseif(shelltype == "H") then
|
||||||
|
TotAngMomShell(nShell) = 5
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'h-type shell with K = ',KShell(nShell)
|
||||||
|
elseif(shelltype == "I") then
|
||||||
|
TotAngMomShell(nShell) = 6
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'i-type shell with K = ',KShell(nShell)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
! Read exponents and contraction coefficients
|
||||||
|
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,A16,A16)') '','Exponents','Contraction'
|
||||||
|
do k=1,Kshell(nShell)
|
||||||
|
read(2,*) ExpShell(nShell,k),DShell(nShell,k)
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,F16.10,F16.10)') '',ExpShell(nShell,k),DShell(nShell,k)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
! Total number of shells
|
||||||
|
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'Number of shells',nShell
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
write(*,*)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Close file with basis set specification
|
||||||
|
|
||||||
|
close(unit=2)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Calculate number of basis functions
|
||||||
|
|
||||||
|
nBas = 0
|
||||||
|
do iShell=1,nShell
|
||||||
|
nBas = nBas + (TotAngMomShell(iShell)*TotAngMomShell(iShell) + 3*TotAngMomShell(iShell) + 2)/2
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'Number of basis functions',NBas
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
write(*,*)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Number of virtual orbitals
|
||||||
|
|
||||||
|
nV = nBas - nO
|
||||||
|
|
||||||
|
end subroutine read_basis
|
68
src/MCQC/read_geometry.f90
Normal file
68
src/MCQC/read_geometry.f90
Normal file
@ -0,0 +1,68 @@
|
|||||||
|
subroutine read_geometry(nAt,ZNuc,rA,ENuc)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Read molecular geometry
|
||||||
|
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
|
include 'parameters.h'
|
||||||
|
|
||||||
|
! Ouput variables
|
||||||
|
|
||||||
|
integer,intent(in) :: nAt
|
||||||
|
|
||||||
|
! Local variables
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: i,j
|
||||||
|
double precision :: RAB
|
||||||
|
character(len=2) :: El
|
||||||
|
integer,external :: element_number
|
||||||
|
|
||||||
|
! Ouput variables
|
||||||
|
|
||||||
|
double precision,intent(out) :: ZNuc(NAt),rA(nAt,ncart),ENuc
|
||||||
|
|
||||||
|
! Open file with geometry specification
|
||||||
|
|
||||||
|
open(unit=1,file='input/molecule')
|
||||||
|
|
||||||
|
! Read geometry
|
||||||
|
|
||||||
|
read(1,*)
|
||||||
|
read(1,*)
|
||||||
|
read(1,*)
|
||||||
|
|
||||||
|
do i=1,nAt
|
||||||
|
read(1,*) El,rA(i,1),rA(i,2),rA(i,3)
|
||||||
|
ZNuc(i) = element_number(El)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
! Compute nuclear repulsion energy
|
||||||
|
|
||||||
|
ENuc = 0
|
||||||
|
|
||||||
|
do i=1,nAt-1
|
||||||
|
do j=i+1,nAt
|
||||||
|
RAB = (rA(i,1)-rA(j,1))**2 + (rA(i,2)-rA(j,2))**2 + (rA(i,3)-rA(j,3))**2
|
||||||
|
ENuc = ENuc + ZNuc(i)*ZNuc(j)/sqrt(RAB)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
! Close file with geometry specification
|
||||||
|
close(unit=1)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Print geometry
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
write(*,'(A28)') 'Molecular geometry'
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
do i=1,NAt
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'Atom n. ',i
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,F16.10)') 'Z = ',ZNuc(i)
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,F16.10,F16.10,F16.10)') 'Atom coordinates:',(rA(i,j),j=1,ncart)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
write(*,*)
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,F16.10)') 'Nuclear repulsion energy = ',ENuc
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '------------------'
|
||||||
|
write(*,*)
|
||||||
|
|
||||||
|
end subroutine read_geometry
|
39
src/MCQC/read_molecule.f90
Normal file
39
src/MCQC/read_molecule.f90
Normal file
@ -0,0 +1,39 @@
|
|||||||
|
subroutine read_molecule(nAt,nEl,nO,nCore,nRyd)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Read number of atoms nAt and number of electrons nEl
|
||||||
|
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
|
include 'parameters.h'
|
||||||
|
|
||||||
|
! Input variables
|
||||||
|
|
||||||
|
integer,intent(out) :: nAt,nEl,nO,nCore,nRyd
|
||||||
|
|
||||||
|
! Open file with geometry specification
|
||||||
|
|
||||||
|
open(unit=1,file='input/molecule')
|
||||||
|
|
||||||
|
! Read number of atoms and number of electrons
|
||||||
|
|
||||||
|
read(1,*)
|
||||||
|
read(1,*) nAt,nEl,nCore,nRyd
|
||||||
|
|
||||||
|
nO = nEl/2
|
||||||
|
|
||||||
|
! Print results
|
||||||
|
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '----------------------'
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'Number of atoms',nAt
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '----------------------'
|
||||||
|
write(*,*)
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '----------------------'
|
||||||
|
write(*,'(A28,1X,I16)') 'Number of electrons',nEl
|
||||||
|
write(*,'(A28)') '----------------------'
|
||||||
|
write(*,*)
|
||||||
|
|
||||||
|
! Close file with geometry specification
|
||||||
|
|
||||||
|
close(unit=1)
|
||||||
|
|
||||||
|
end subroutine read_molecule
|
Loading…
Reference in New Issue
Block a user