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ba15c91987
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vendored
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*.log
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*.lot
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*.out
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*.toc
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*.fmt
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*.fot
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*.cb
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*.cb2
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.*.lb
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## Intermediate documents:
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*.dvi
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*.xdv
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*-converted-to.*
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# these rules might exclude image files for figures etc.
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# *.ps
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# *.eps
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# *.pdf
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*.sw*
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## Generated if empty string is given at "Please type another file name for output:"
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.pdf
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## Bibliography auxiliary files (bibtex/biblatex/biber):
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*.bbl
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*.bcf
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*.blg
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*-blx.aux
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*-blx.bib
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*.run.xml
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## Build tool auxiliary files:
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*.fdb_latexmk
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*.synctex
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*.synctex(busy)
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*.synctex.gz
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*.synctex.gz(busy)
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*.pdfsync
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## Auxiliary and intermediate files from other packages:
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# algorithms
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*.alg
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*.loa
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# achemso
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# amsthm
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*.thm
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# beamer
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# endnotes
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#(r)(e)ledmac/(r)(e)ledpar
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*.?end
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*.[1-9]
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*.[1-9][0-9]
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*.[1-9][0-9][0-9]
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*.eledsec[1-9][0-9][0-9]
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*.eledsec[1-9][0-9][0-9]R
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# glossaries
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*.glg
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*.glo
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*.glsdefs
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# gnuplottex
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*-gnuplottex-*
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# hyperref
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*.brf
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# knitr
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*-concordance.tex
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# TODO Comment the next line if you want to keep your tikz graphics files
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*.tikz
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*-tikzDictionary
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# listings
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*.lol
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# makeidx
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*.ind
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*.ist
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_minted*
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# morewrites
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# Latexian
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TSWLatexianTemp*
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## Editors:
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# WinEdt
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*.bak
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*.sav
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# Texpad
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.texpadtmp
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# Kile
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*.backup
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# KBibTeX
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*~[0-9]*
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# auto folder when using emacs and auctex
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# expex forward references with \gathertags
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*-tags.tex
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# standalone packages
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*.spl
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Data/.gitignore
vendored
Normal file
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Data/.gitignore
vendored
Normal file
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## Core latex/pdflatex auxiliary files:
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*.lof
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*.log
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*.lot
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*.out
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*.toc
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*.fmt
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*.fot
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*.cb
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*.cb2
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.*.lb
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## Intermediate documents:
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*.dvi
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*.xdv
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*-converted-to.*
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# these rules might exclude image files for figures etc.
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# *.ps
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# *.eps
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# *.pdf
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*.sw*
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## Generated if empty string is given at "Please type another file name for output:"
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.pdf
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## Bibliography auxiliary files (bibtex/biblatex/biber):
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*.bbl
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*.bcf
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*.blg
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*-blx.aux
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*-blx.bib
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*.run.xml
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## Build tool auxiliary files:
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*.synctex.gz(busy)
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*.pdfsync
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## Auxiliary and intermediate files from other packages:
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# algorithms
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*.alg
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*.loa
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# achemso
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*.thm
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# changes
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*.end
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*.?end
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*.[1-9]
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*.eledsec[1-9][0-9][0-9]R
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# glossaries
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*.glg
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*-gnuplottex-*
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*.brf
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# knitr
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*-concordance.tex
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# TODO Comment the next line if you want to keep your tikz graphics files
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*.tikz
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*-tikzDictionary
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# listings
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*.lol
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# makeidx
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# minted
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_minted*
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# morewrites
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*.mw
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# nomencl
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*.nlg
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*.nlo
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*.pax
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# TikZ & PGF
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# xypic precompiled matrices
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# endfloat
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*.ttt
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*.fff
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# Latexian
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TSWLatexianTemp*
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## Editors:
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# WinEdt
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*.bak
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*.sav
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# Texpad
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# Kile
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*.backup
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# KBibTeX
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*~[0-9]*
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# auto folder when using emacs and auctex
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*.el
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# expex forward references with \gathertags
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*-tags.tex
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# standalone packages
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*.spl
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BIN
Manuscript/Cover_Letter/CNRS_logo.pdf
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BIN
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Binary file not shown.
31
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31
Manuscript/Cover_Letter/CoverLetter.tex
Normal file
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\documentclass[10pt]{letter}
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\usepackage{UPS_letterhead,color,mhchem,mathpazo,ragged2e}
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\newcommand{\alert}[1]{\textcolor{red}{#1}}
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|
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||||||
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\begin{document}
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\begin{letter}%
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{To the Editors of the Journal of X,}
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\opening{Dear Editors,}
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||||||
|
\justifying
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Please find enclosed our manuscript entitled \textit{``My article''},
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which we would like you to consider as a Regular Article in the \textit{Journal of X}.
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|
We suggest XXX as potential referees.
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We look forward to hearing from you soon.
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|
\closing{Sincerely,}
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\end{letter}
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\end{document}
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Manuscript/Cover_Letter/UPS_letterhead.sty
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Manuscript/Cover_Letter/UPS_letterhead.sty
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%ANU etterhead Yves
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%version 1.0 12/06/08
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\RequirePackage{graphicx}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% DEFINE USER-SPECIFIC MACROS BELOW %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\def\Who {Pierre-Fran\c{c}ois Loos}
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\def\What {Dr}
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\def\Address {Laboratoire de Chimie et Physique Quantiques}
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\def\CityZip {Toulouse, France}
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\def\Email {loos@irsamc.ups-tlse.fr}
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\def\TEL {+33 5 61 55 73 39}
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\def\URL {} % NOTE: use $\sim$ for tilde
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% MARGINS %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\textwidth 6in
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% ADDRESS MACRO BELOW %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\address{
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\hrulefill
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\\
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\\
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% OTHER MACROS BELOW %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\signature{\What~\Who}
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\vspace{3\parskip}
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{\raggedright \toname \\ \toaddress \par}\vspace{3\parskip}
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\noindent #1\par\raggedright\parindent 5ex\par
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}
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%I do not know what does the macro below
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%\stopbreaks
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%\noindent
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%\ifx\@empty\fromaddress\else
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\documentclass[10pt]{letter}
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\usepackage{UPS_letterhead,xcolor,mhchem,ragged2e,hyperref}
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\newcommand{\alert}[1]{\textcolor{red}{#1}}
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\definecolor{darkgreen}{HTML}{009900}
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\begin{document}
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\begin{letter}%
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{To the Editors of the Journal of X,}
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\opening{Dear Editors,}
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\justifying
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Please find attached a revised version of the manuscript entitled
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\begin{quote}
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\textit{``My article''}.
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\end{quote}
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We thank the reviewers for their constructive comments.
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Our detailed responses to their comments can be found below.
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For convenience, changes are highlighted in red in the revised version of the manuscript.
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We look forward to hearing from you.
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\closing{Sincerely, the authors.}
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\newpage
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%%% REVIEWER 1 %%%
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\noindent \textbf{\large Authors' answer to Reviewer \#1}
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\begin{enumerate}
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\item
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{This paper is good.}
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\alert{
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bla bla bla
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}
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\item
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{This paper is bad.}
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\alert{
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bla bla bla
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}
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\end{enumerate}
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%%% REVIEWER 2 %%%
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\noindent \textbf{\large Authors' answer to Reviewer \#2}
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\begin{enumerate}
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\item
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{This paper is good.}
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\\
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\alert{
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bla bla bla
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}
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\item
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|
{This paper is bad.}
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\\
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\alert{
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bla bla bla
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}
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|
\end{enumerate}
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|
\end{letter}
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\end{document}
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70
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@ -0,0 +1,70 @@
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%ANU etterhead Yves
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%version 1.0 12/06/08
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%need to be improved
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\RequirePackage{graphicx}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% DEFINE USER-SPECIFIC MACROS BELOW %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\def\Who {Pierre-Fran\c{c}ois Loos}
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\def\What {Dr}
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\def\Where {Universit\'e Paul Sabatier}
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\def\Address {Laboratoire de Chimie et Physique Quantiques}
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\def\CityZip {Toulouse, France}
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\def\Email {loos@irsamc.ups-tlse.fr}
|
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\def\TEL {+33 5 61 55 73 39}
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|
\def\URL {} % NOTE: use $\sim$ for tilde
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% MARGINS %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\textwidth 6in
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\textheight 9.25in
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% ADDRESS MACRO BELOW %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\address{
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\includegraphics[height=0.7in]{CNRS_logo.pdf} \hspace*{\fill}\includegraphics[height=0.7in]{UPS_logo.pdf}
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\hrulefill
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\\
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{\small \What~\Who\hspace*{\fill} Telephone:\ \TEL
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\\
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\Where\hspace*{\fill} Email:\ \Email
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\\
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\Address\hspace*{\fill}
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\\
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\CityZip\hspace*{\fill} \URL}
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}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% OTHER MACROS BELOW %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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%\signature{\What~\Who}
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\def\opening#1{\ifx\@empty\fromaddress
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\thispagestyle{firstpage}
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\else \thispagestyle{empty}
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{\centering\fromaddress \vspace{5\parskip} \\
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\today\hspace*{\fill}\par}
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|
\fi
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\vspace{3\parskip}
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{\raggedright \toname \\ \toaddress \par}\vspace{3\parskip}
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\noindent #1\par\raggedright\parindent 5ex\par
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}
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%I do not know what does the macro below
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%\long\def\closing#1{\par\nobreak\vspace{\parskip}
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%\stopbreaks
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%\noindent
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%\ifx\@empty\fromaddress\else
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%\ignorespaces #1\vskip .65in
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%\ifx\@empty\fromsig
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%\else \fromsig \fi\strut}
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%\vspace*{\fill}
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% \par}
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Binary file not shown.
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File diff suppressed because it is too large
Load Diff
101
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101
Manuscript/my_article.tex
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@ -0,0 +1,101 @@
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\documentclass[aip,jcp,reprint,noshowkeys,superscriptaddress]{revtex4-1}
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\usepackage{graphicx,dcolumn,bm,xcolor,microtype,multirow,amscd,amsmath,amssymb,amsfonts,physics,wrapfig,txfonts}
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\usepackage[version=4]{mhchem}
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%\usepackage{natbib}
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%\bibliographystyle{achemso}
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\newcommand{\ie}{\textit{i.e.}}
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\newcommand{\eg}{\textit{e.g.}}
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\newcommand{\alert}[1]{\textcolor{red}{#1}}
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\usepackage[normalem]{ulem}
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\newcommand{\titou}[1]{\textcolor{red}{#1}}
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|
\newcommand{\trashPFL}[1]{\textcolor{red}{\sout{#1}}}
|
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\newcommand{\PFL}[1]{\titou{(\underline{\bf PFL}: #1)}}
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\newcommand{\SI}{\textcolor{blue}{Supporting Information}}
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\newcommand{\fnm}{\footnotemark}
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\newcommand{\fnt}{\footnotetext}
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\newcommand{\tabc}[1]{\multicolumn{1}{c}{#1}}
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\newcommand{\QP}{\textsc{quantum package}}
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\newcommand{\hI}{\Hat{1}}
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\newcommand{\hH}{\Hat{H}}
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|
\newcommand{\EHF}{E_\text{HF}}
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\usepackage[
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colorlinks=true,
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citecolor=blue,
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breaklinks=true
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]{hyperref}
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\urlstyle{same}
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|
\begin{document}
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|
\newcommand{\LCPQ}{Laboratoire de Chimie et Physique Quantiques (UMR 5626), Universit\'e de Toulouse, CNRS, UPS, France}
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|
\title{My Paper}
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|
\author{Firstname1 \surname{Surname1}}
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|
\email{email1@irsamc.ups-tlse.fr}
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|
\affiliation{\LCPQ}
|
||||||
|
\author{Firstname2 \surname{Surname2}}
|
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|
\email{email2@irsamc.ups-tlse.fr}
|
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\affiliation{\LCPQ}
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% Abstract
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\begin{abstract}
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%
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%\bigskip
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%\begin{center}
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% \boxed{\includegraphics[width=0.4\linewidth]{TOC}}
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%\end{center}
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%\bigskip
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\end{abstract}
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% Title
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\maketitle
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\section{Introduction}
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\label{sec:intro}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\section{Computational details}
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\label{sec:compdet}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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We use {\QP}. \cite{Garniron_2019}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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|
\section{Results and discussion}
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|
\label{sec:res}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\section{Conclusion}
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\label{sec:ccl}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\begin{acknowledgements}
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This project has received funding from the European Research Council (ERC) under the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme (Grant agreement No.~863481).
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\end{acknowledgements}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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%\section*{Supporting information available}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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%\section*{Data availability statement}
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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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%The data that support the findings of this study are openly available in Zenodo at \href{http://doi.org/XX.XXXX/zenodo.XXXXXXX}{http://doi.org/XX.XXXX/zenodo.XXXXXXX}.
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|
||||||
|
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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||||||
|
\bibliography{my_article}
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|
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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||||||
|
|
||||||
|
\end{document}
|
243
Notebooks/.gitignore
vendored
Normal file
243
Notebooks/.gitignore
vendored
Normal file
@ -0,0 +1,243 @@
|
|||||||
|
## Core latex/pdflatex auxiliary files:
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|
*.aux
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|
*.lof
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*.log
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*.lot
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*.fls
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*.out
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*.toc
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*.fmt
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*.fot
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*.cb
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*.cb2
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.*.lb
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## Intermediate documents:
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*.dvi
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*.xdv
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*-converted-to.*
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# these rules might exclude image files for figures etc.
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# *.ps
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# *.eps
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# *.pdf
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*.sw*
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## Generated if empty string is given at "Please type another file name for output:"
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.pdf
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## Bibliography auxiliary files (bibtex/biblatex/biber):
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*.bbl
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*.bcf
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*.blg
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*-blx.aux
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*-blx.bib
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*.run.xml
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## Build tool auxiliary files:
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*.fdb_latexmk
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*.synctex
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*.synctex(busy)
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*.synctex.gz
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*.synctex.gz(busy)
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*.pdfsync
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## Auxiliary and intermediate files from other packages:
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# algorithms
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*.alg
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*.loa
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# achemso
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acs-*.bib
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# amsthm
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*.thm
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# beamer
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*.nav
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*.pre
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*.snm
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*.vrb
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||||||
|
# changes
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*.soc
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# cprotect
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*.cpt
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# elsarticle (documentclass of Elsevier journals)
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|
*.spl
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# endnotes
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*.ent
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# fixme
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*.lox
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# feynmf/feynmp
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*.mf
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*.mp
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*.t[1-9]
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*.t[1-9][0-9]
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*.tfm
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#(r)(e)ledmac/(r)(e)ledpar
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*.end
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*.?end
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*.[1-9]
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*.[1-9][0-9]
|
||||||
|
*.[1-9][0-9][0-9]
|
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|
*.[1-9]R
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|
*.[1-9][0-9]R
|
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|
*.[1-9][0-9][0-9]R
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|
*.eledsec[1-9]
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*.eledsec[1-9]R
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*.eledsec[1-9][0-9]
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||||||
|
*.eledsec[1-9][0-9]R
|
||||||
|
*.eledsec[1-9][0-9][0-9]
|
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*.eledsec[1-9][0-9][0-9]R
|
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# glossaries
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*.acn
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*.acr
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*.glg
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*.glo
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*.gls
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*.glsdefs
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# gnuplottex
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*-gnuplottex-*
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# gregoriotex
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*.gaux
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*.gtex
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# htlatex
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*.4ct
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|
*.4tc
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*.idv
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||||||
|
*.lg
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||||||
|
*.trc
|
||||||
|
*.xref
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||||||
|
|
||||||
|
# hyperref
|
||||||
|
*.brf
|
||||||
|
|
||||||
|
# knitr
|
||||||
|
*-concordance.tex
|
||||||
|
# TODO Comment the next line if you want to keep your tikz graphics files
|
||||||
|
*.tikz
|
||||||
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*-tikzDictionary
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# listings
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*.lol
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# makeidx
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*.idx
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*.ilg
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*.ind
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*.ist
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# minitoc
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*.maf
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*.mlf
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*.mlt
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*.mtc[0-9]*
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# minted
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_minted*
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*.pyg
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# morewrites
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*.mw
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# nomencl
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*.nlg
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*.nlo
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*.nls
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# pax
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*.pax
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# pdfpcnotes
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*.pdfpc
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# sagetex
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*.sagetex.sage
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*.sagetex.py
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*.sagetex.scmd
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# scrwfile
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*.wrt
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# sympy
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*.sout
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*.sympy
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sympy-plots-for-*.tex/
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# pdfcomment
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*.upa
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*.upb
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# pythontex
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*.pytxcode
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pythontex-files-*/
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# thmtools
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*.loe
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# TikZ & PGF
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*.dpth
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*.md5
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*.auxlock
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# todonotes
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*.tdo
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# easy-todo
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*.lod
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# xmpincl
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*.xmpi
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# xindy
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*.xdy
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# xypic precompiled matrices
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*.xyc
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# endfloat
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*.ttt
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*.fff
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# Latexian
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TSWLatexianTemp*
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## Editors:
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# WinEdt
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*.bak
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*.sav
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# Texpad
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.texpadtmp
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# Kile
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*.backup
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# KBibTeX
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*~[0-9]*
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# auto folder when using emacs and auctex
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./auto/*
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*.el
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# expex forward references with \gathertags
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*-tags.tex
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# standalone packages
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*.sta
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# generated if using elsarticle.cls
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*.spl
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