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fea8dfd891
120
ocaml/Input.ml
Normal file
120
ocaml/Input.ml
Normal file
@ -0,0 +1,120 @@
|
||||
open Qputils;;
|
||||
open Qptypes;;
|
||||
open Core.Std;;
|
||||
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||||
module Ao_basis : sig
|
||||
type t
|
||||
val read : unit -> t
|
||||
val to_string : t -> string
|
||||
end = struct
|
||||
type t =
|
||||
{ ao_basis : string ;
|
||||
ao_num : AO_number.t ;
|
||||
ao_prim_num : Strictly_positive_int.t array;
|
||||
ao_prim_num_max : Strictly_positive_int.t;
|
||||
ao_nucl : Nucl_number.t array;
|
||||
ao_power : Symmetry.Xyz.t array;
|
||||
ao_coef : float array;
|
||||
ao_expo : Positive_float.t array;
|
||||
}
|
||||
;;
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||||
|
||||
let read_ao_basis () =
|
||||
if not (Ezfio.has_ao_basis_ao_basis ()) then
|
||||
Ezfio.set_ao_basis_ao_basis ""
|
||||
;
|
||||
Ezfio.get_ao_basis_ao_basis ()
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let read_ao_num () =
|
||||
Ezfio.get_ao_basis_ao_num ()
|
||||
|> AO_number.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let read_ao_prim_num () =
|
||||
(Ezfio.get_ao_basis_ao_prim_num () ).Ezfio.data
|
||||
|> Ezfio.flattened_ezfio_data
|
||||
|> Array.map ~f:Strictly_positive_int.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let read_ao_prim_num_max () =
|
||||
(Ezfio.get_ao_basis_ao_prim_num () ).Ezfio.data
|
||||
|> Ezfio.flattened_ezfio_data
|
||||
|> Array.fold ~f:(fun x y -> if x>y then x else y) ~init:0
|
||||
|> Strictly_positive_int.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let read_ao_nucl () =
|
||||
(Ezfio.get_ao_basis_ao_nucl () ).Ezfio.data
|
||||
|> Ezfio.flattened_ezfio_data
|
||||
|> Array.map ~f:Nucl_number.of_int
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let read_ao_power () =
|
||||
let x = Ezfio.get_ao_basis_ao_power () in
|
||||
let dim = x.Ezfio.dim.(0) in
|
||||
let data = Ezfio.flattened_ezfio_data x.Ezfio.data in
|
||||
let result = Array.init dim ~f:(fun x -> "") in
|
||||
for i=1 to dim
|
||||
do
|
||||
if (data.(i-1) > 0) then
|
||||
result.(i-1) <- result.(i-1)^"x"^(Int.to_string data.(i-1));
|
||||
if (data.(dim+i-1) > 0) then
|
||||
result.(i-1) <- result.(i-1)^"y"^(Int.to_string data.(dim+i-1));
|
||||
if (data.(2*dim+i-1) > 0) then
|
||||
result.(i-1) <- result.(i-1)^"z"^(Int.to_string data.(2*dim+i-1));
|
||||
done;
|
||||
Array.map ~f:Symmetry.Xyz.of_string result
|
||||
;;
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||||
|
||||
let read_ao_coef () =
|
||||
(Ezfio.get_ao_basis_ao_coef () ).Ezfio.data
|
||||
|> Ezfio.flattened_ezfio_data
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let read_ao_expo () =
|
||||
(Ezfio.get_ao_basis_ao_expo () ).Ezfio.data
|
||||
|> Ezfio.flattened_ezfio_data
|
||||
|> Array.map ~f:Positive_float.of_float
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let read () =
|
||||
{ ao_basis = read_ao_basis ();
|
||||
ao_num = read_ao_num () ;
|
||||
ao_prim_num = read_ao_prim_num ();
|
||||
ao_prim_num_max = read_ao_prim_num_max ();
|
||||
ao_nucl = read_ao_nucl ();
|
||||
ao_power = read_ao_power ();
|
||||
ao_coef = read_ao_coef () ;
|
||||
ao_expo = read_ao_expo () ;
|
||||
}
|
||||
;;
|
||||
|
||||
let to_string b =
|
||||
Printf.sprintf "
|
||||
ao_basis = \"%s\"
|
||||
ao_num = %s
|
||||
ao_prim_num = %s
|
||||
ao_prim_num_max = %s
|
||||
ao_nucl = %s
|
||||
ao_power = %s
|
||||
ao_coef = %s
|
||||
ao_expo = %s
|
||||
"
|
||||
b.ao_basis
|
||||
(AO_number.to_string b.ao_num)
|
||||
(b.ao_prim_num |> Array.to_list |> List.map
|
||||
~f:(Strictly_positive_int.to_string) |> String.concat ~sep:", " )
|
||||
(Strictly_positive_int.to_string b.ao_prim_num_max)
|
||||
(b.ao_nucl |> Array.to_list |> List.map ~f:Nucl_number.to_string |>
|
||||
String.concat ~sep:", ")
|
||||
(b.ao_power |> Array.to_list |> List.map ~f:(fun x->
|
||||
"("^(Symmetry.Xyz.to_string x)^")" )|> String.concat ~sep:", ")
|
||||
(b.ao_coef |> Array.to_list |> List.map ~f:Float.to_string
|
||||
|> String.concat ~sep:", ")
|
||||
(b.ao_expo |> Array.to_list |> List.map ~f:Positive_float.to_string
|
||||
|> String.concat ~sep:", ")
|
||||
|
||||
end
|
||||
|
||||
|
@ -49,6 +49,13 @@ let input_data = "
|
||||
if (Ezfio.has_ao_basis_ao_num ()) then
|
||||
assert (x <= (Ezfio.get_ao_basis_ao_num ()));
|
||||
|
||||
* Nucl_number : int
|
||||
assert (x > 0) ;
|
||||
if (x > 1000) then
|
||||
warning \"More than 1000 Atoms\";
|
||||
if (Ezfio.has_nuclei_nucl_num ()) then
|
||||
assert (x <= (Ezfio.get_nuclei_nucl_num ()));
|
||||
|
||||
* N_int_number : int
|
||||
assert (x > 0) ;
|
||||
if (x > 100) then
|
||||
@ -88,7 +95,7 @@ module %s : sig
|
||||
type t
|
||||
val to_%s : t -> %s
|
||||
val of_%s : %s -> t
|
||||
val to_string : %s -> string
|
||||
val to_string : t -> string
|
||||
end = struct
|
||||
type t = %s
|
||||
let to_%s x = x
|
||||
@ -110,7 +117,7 @@ let parse_input input=
|
||||
let typ = String.strip typ
|
||||
and name = String.strip name in
|
||||
let typ_cap = String.capitalize typ in
|
||||
let newstring = Printf.sprintf template name typ typ typ typ typ typ typ typ
|
||||
let newstring = Printf.sprintf template name typ typ typ typ typ typ typ
|
||||
( String.strip text ) typ_cap
|
||||
in
|
||||
List.rev (parse (newstring::result) tail )
|
||||
|
8
ocaml/test_input.ml
Normal file
8
ocaml/test_input.ml
Normal file
@ -0,0 +1,8 @@
|
||||
let test_module () =
|
||||
Ezfio.set_file "F2.ezfio" ;
|
||||
let b = Input.Ao_basis.read ()
|
||||
in
|
||||
print_endline (Input.Ao_basis.to_string b);
|
||||
;;
|
||||
|
||||
test_module ();;
|
@ -34,6 +34,14 @@ subroutine save_dets_qmcchem
|
||||
call ezfio_set_determinants_det_occ(occ)
|
||||
call write_int(output_dets,N_det,'Determinants saved for QMC')
|
||||
deallocate(occ)
|
||||
open(unit=31,file=trim(ezfio_filename)//'/mo_basis/mo_classif')
|
||||
write(31,*) 1
|
||||
write(31,*) mo_tot_num
|
||||
do i=1,mo_tot_num
|
||||
write(31,'(A)') 'a'
|
||||
enddo
|
||||
close(31)
|
||||
call system('gzip '//trim(ezfio_filename)//'/mo_basis/mo_classif')
|
||||
end
|
||||
|
||||
program save_for_qmc
|
||||
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