mirror of
https://github.com/LCPQ/quantum_package
synced 2024-07-22 18:57:31 +02:00
Added Bi-electronic integrals module
This commit is contained in:
parent
b4904d65df
commit
cd418ee484
0
src/BiInts/ASSUMPTIONS.rst
Normal file
0
src/BiInts/ASSUMPTIONS.rst
Normal file
8
src/BiInts/Makefile
Normal file
8
src/BiInts/Makefile
Normal file
@ -0,0 +1,8 @@
|
|||||||
|
default: all
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|
# Define here all new external source files and objects.Don't forget to prefix the
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|
# object files with IRPF90_temp/
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SRC=
|
||||||
|
OBJ=
|
||||||
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|
||||||
|
include $(QPACKAGE_ROOT)/src/Makefile.common
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1
src/BiInts/NEEDED_MODULES
Normal file
1
src/BiInts/NEEDED_MODULES
Normal file
@ -0,0 +1 @@
|
|||||||
|
AOs Bitmask Electrons Ezfio_files MOs Nuclei Output Utils MonoInts
|
||||||
27
src/BiInts/README.rst
Normal file
27
src/BiInts/README.rst
Normal file
@ -0,0 +1,27 @@
|
|||||||
|
=============
|
||||||
|
BiInts Module
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=============
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Here, all bi-electronic integrals (:math:`1/r_{12}`) are computed. As they have
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4 indices and many are zero, they are stored in a map.
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|
To fetch an AO integral, use the ``get_ao_bielec_integral(i,j,k,l,ao_integrals_map)``
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||||||
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function, and to fetch and MO integral, use
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||||||
|
.
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||||||
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|
||||||
|
Needed Modules
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==============
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.. Do not edit this section. It was auto-generated from the
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||||||
|
.. NEEDED_MODULES file.
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|
* `AOs <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/AOs>`_
|
||||||
|
* `Bitmask <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Bitmask>`_
|
||||||
|
* `Electrons <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Electrons>`_
|
||||||
|
* `Ezfio_files <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Ezfio_files>`_
|
||||||
|
* `MOs <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/MOs>`_
|
||||||
|
* `Nuclei <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Nuclei>`_
|
||||||
|
* `Output <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Output>`_
|
||||||
|
* `Utils <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Utils>`_
|
||||||
|
* `MonoInts <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/MonoInts>`_
|
||||||
|
|
||||||
1016
src/BiInts/ao_bi_integrals.irp.f
Normal file
1016
src/BiInts/ao_bi_integrals.irp.f
Normal file
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
8
src/BiInts/bi_integrals.ezfio_config
Normal file
8
src/BiInts/bi_integrals.ezfio_config
Normal file
@ -0,0 +1,8 @@
|
|||||||
|
bielec_integrals
|
||||||
|
read_ao_integrals logical
|
||||||
|
read_mo_integrals logical
|
||||||
|
write_ao_integrals logical
|
||||||
|
write_mo_integrals logical
|
||||||
|
threshold_ao double precision
|
||||||
|
threshold_mo double precision
|
||||||
|
|
||||||
57
src/BiInts/gauss_legendre.irp.f
Normal file
57
src/BiInts/gauss_legendre.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,57 @@
|
|||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ double precision, gauleg_t2, (n_pt_max_integrals,n_pt_max_integrals/2) ]
|
||||||
|
&BEGIN_PROVIDER [ double precision, gauleg_w, (n_pt_max_integrals,n_pt_max_integrals/2) ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! t_w(i,1,k) = w(i)
|
||||||
|
! t_w(i,2,k) = t(i)
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer :: i,j,l
|
||||||
|
l=0
|
||||||
|
do i = 2,n_pt_max_integrals,2
|
||||||
|
l = l+1
|
||||||
|
call gauleg(0.d0,1.d0,gauleg_t2(1,l),gauleg_w(1,l),i)
|
||||||
|
do j=1,i
|
||||||
|
gauleg_t2(j,l) *= gauleg_t2(j,l)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine gauleg(x1,x2,x,w,n)
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Gauss-Legendre
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer, intent(in) :: n
|
||||||
|
double precision, intent(in) :: x1, x2
|
||||||
|
double precision, intent (out) :: x(n),w(n)
|
||||||
|
double precision, parameter :: eps=3.d-14
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: m,i,j
|
||||||
|
double precision :: xm, xl, z, z1, p1, p2, p3, pp, dn
|
||||||
|
m=(n+1)/2
|
||||||
|
xm=0.5d0*(x2+x1)
|
||||||
|
xl=0.5d0*(x2-x1)
|
||||||
|
dn = dble(n)
|
||||||
|
do i=1,m
|
||||||
|
z=dcos(3.141592654d0*(dble(i)-.25d0)/(dble(n)+.5d0))
|
||||||
|
z1 = z+1.d0
|
||||||
|
do while (dabs(z-z1) > eps)
|
||||||
|
p1=1.d0
|
||||||
|
p2=0.d0
|
||||||
|
do j=1,n
|
||||||
|
p3=p2
|
||||||
|
p2=p1
|
||||||
|
p1=(dble(j+j-1)*z*p2-dble(j-1)*p3)/j
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
pp=dn*(z*p1-p2)/(z*z-1.d0)
|
||||||
|
z1=z
|
||||||
|
z=z1-p1/pp
|
||||||
|
end do
|
||||||
|
x(i)=xm-xl*z
|
||||||
|
x(n+1-i)=xm+xl*z
|
||||||
|
w(i)=(xl+xl)/((1.d0-z*z)*pp*pp)
|
||||||
|
w(n+1-i)=w(i)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
334
src/BiInts/map_integrals.irp.f
Normal file
334
src/BiInts/map_integrals.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,334 @@
|
|||||||
|
use map_module
|
||||||
|
|
||||||
|
!! AO Map
|
||||||
|
!! ======
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ type(map_type), ao_integrals_map ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! AO integrals
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer*8 :: sze
|
||||||
|
call bielec_integrals_index(ao_num,ao_num,ao_num,ao_num,sze)
|
||||||
|
call map_init(ao_integrals_map,sze)
|
||||||
|
write(output_BiInts,*) 'AO map initialized'
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine bielec_integrals_index(i,j,k,l,i1)
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer, intent(in) :: i,j,k,l
|
||||||
|
integer*8, intent(out) :: i1
|
||||||
|
integer*8 :: p,q,r,s,i2
|
||||||
|
p = min(i,k)
|
||||||
|
r = max(i,k)
|
||||||
|
p = p+ishft(r*r-r,-1)
|
||||||
|
q = min(j,l)
|
||||||
|
s = max(j,l)
|
||||||
|
q = q+ishft(s*s-s,-1)
|
||||||
|
i1 = min(p,q)
|
||||||
|
i2 = max(p,q)
|
||||||
|
i1 = i1+ishft(i2*i2-i2,-1)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
double precision function get_ao_bielec_integral(i,j,k,l,map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Gets one AO bi-electronic integral from the AO map
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer, intent(in) :: i,j,k,l
|
||||||
|
integer*8 :: idx
|
||||||
|
type(map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
real(integral_kind) :: tmp
|
||||||
|
PROVIDE ao_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
!DIR$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call bielec_integrals_index(i,j,k,l,idx)
|
||||||
|
call map_get(map,idx,tmp)
|
||||||
|
get_ao_bielec_integral = tmp
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine get_ao_bielec_integrals(j,k,l,sze,out_val)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Gets multiple AO bi-electronic integral from the AO map .
|
||||||
|
! All i are retrieved for j,k,l fixed.
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer, intent(in) :: j,k,l, sze
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(out) :: out_val(sze)
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: i
|
||||||
|
integer*8 :: hash
|
||||||
|
double precision :: thresh
|
||||||
|
PROVIDE ao_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
thresh = ao_integrals_threshold
|
||||||
|
|
||||||
|
if (ao_overlap_abs(j,l) < thresh) then
|
||||||
|
out_val = 0.d0
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
do i=1,sze
|
||||||
|
if (ao_overlap_abs(i,k)*ao_overlap_abs(j,l) < thresh ) then
|
||||||
|
out_val(i) = 0.d0
|
||||||
|
else
|
||||||
|
!DIR$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call bielec_integrals_index(i,j,k,l,hash)
|
||||||
|
call map_get(ao_integrals_map, hash, out_val(i))
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine get_ao_bielec_integrals_non_zero(j,k,l,sze,out_val,out_val_index,non_zero_int)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Gets multiple AO bi-electronic integral from the AO map .
|
||||||
|
! All non-zero i are retrieved for j,k,l fixed.
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer, intent(in) :: j,k,l, sze
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(out) :: out_val(sze)
|
||||||
|
integer, intent(out) :: out_val_index(sze),non_zero_int
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: i
|
||||||
|
integer*8 :: hash
|
||||||
|
double precision :: thresh,tmp
|
||||||
|
PROVIDE ao_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
thresh = ao_integrals_threshold
|
||||||
|
|
||||||
|
if (ao_overlap_abs(j,l) < thresh) then
|
||||||
|
out_val = 0.d0
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
non_zero_int = 0
|
||||||
|
do i=1,sze
|
||||||
|
!DIR$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call bielec_integrals_index(i,j,k,l,hash)
|
||||||
|
call map_get(ao_integrals_map, hash,tmp)
|
||||||
|
if (dabs(tmp) < thresh ) cycle
|
||||||
|
non_zero_int = non_zero_int+1
|
||||||
|
out_val_index(non_zero_int) = i
|
||||||
|
out_val(non_zero_int) = tmp
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
integer*8 function get_ao_map_size()
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Returns the number of elements in the AO map
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
get_ao_map_size = ao_integrals_map % n_elements
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine clear_ao_map
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Frees the memory of the AO map
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
call map_deinit(ao_integrals_map)
|
||||||
|
FREE ao_integrals_map
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
!! MO Map
|
||||||
|
!! ======
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ type(map_type), mo_integrals_map ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! MO integrals
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer*8 :: sze
|
||||||
|
call bielec_integrals_index(mo_tot_num,mo_tot_num,mo_tot_num,mo_tot_num,sze)
|
||||||
|
call map_init(mo_integrals_map,sze)
|
||||||
|
write(output_BiInts,*) 'MO map initialized'
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine insert_into_ao_integrals_map(n_integrals, &
|
||||||
|
buffer_i, buffer_values)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Create new entry into AO map
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
integer, intent(in) :: n_integrals
|
||||||
|
integer*8, intent(inout) :: buffer_i(n_integrals)
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(inout) :: buffer_values(n_integrals)
|
||||||
|
|
||||||
|
call map_append(ao_integrals_map, buffer_i, buffer_values, n_integrals)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine insert_into_mo_integrals_map(n_integrals, &
|
||||||
|
buffer_i, buffer_values, thr)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Create new entry into MO map, or accumulate in an existing entry
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
integer, intent(in) :: n_integrals
|
||||||
|
integer*8, intent(inout) :: buffer_i(n_integrals)
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(inout) :: buffer_values(n_integrals)
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(in) :: thr
|
||||||
|
call map_update(mo_integrals_map, buffer_i, buffer_values, n_integrals, thr)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
double precision function get_mo_bielec_integral(i,j,k,l,map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Returns one integral <ij|kl> in the MO basis
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer, intent(in) :: i,j,k,l
|
||||||
|
integer*8 :: idx
|
||||||
|
type(map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
real(integral_kind) :: tmp
|
||||||
|
PROVIDE mo_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
!DIR$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call bielec_integrals_index(i,j,k,l,idx)
|
||||||
|
call map_get(map,idx,tmp)
|
||||||
|
get_mo_bielec_integral = dble(tmp)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
double precision function mo_bielec_integral(i,j,k,l)
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Returns one integral <ij|kl> in the MO basis
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer, intent(in) :: i,j,k,l
|
||||||
|
double precision :: get_mo_bielec_integral
|
||||||
|
PROVIDE mo_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
mo_bielec_integral = get_mo_bielec_integral(i,j,k,l,mo_integrals_map)
|
||||||
|
return
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine get_mo_bielec_integrals(j,k,l,sze,out_val,map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Returns multiple integrals <ij|kl> in the MO basis, all
|
||||||
|
! i for j,k,l fixed.
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer, intent(in) :: j,k,l, sze
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(out) :: out_val(sze)
|
||||||
|
type(map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer :: i
|
||||||
|
integer*8 :: hash(sze)
|
||||||
|
PROVIDE mo_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
|
||||||
|
do i=1,sze
|
||||||
|
!DIR$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call bielec_integrals_index(i,j,k,l,hash(i))
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
call map_get_many(map, hash, out_val, sze)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
integer*8 function get_mo_map_size()
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Return the number of elements in the MO map
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
get_mo_map_size = mo_integrals_map % n_elements
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine clear_mo_map
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Frees the memory of the MO map
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
call map_deinit(mo_integrals_map)
|
||||||
|
FREE mo_integrals_map
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_TEMPLATE
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine dump_$ao_integrals(filename)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Save to disk the $ao integrals
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
character*(*), intent(in) :: filename
|
||||||
|
integer(cache_key_kind), pointer :: key(:)
|
||||||
|
real(integral_kind), pointer :: val(:)
|
||||||
|
integer*8 :: i,j, n
|
||||||
|
open(unit=66,file=filename,FORM='unformatted')
|
||||||
|
write(66) integral_kind, key_kind
|
||||||
|
write(66) $ao_integrals_map%sorted, $ao_integrals_map%map_size, &
|
||||||
|
$ao_integrals_map%n_elements
|
||||||
|
do i=0_8,$ao_integrals_map%map_size
|
||||||
|
write(66) $ao_integrals_map%map(i)%sorted, $ao_integrals_map%map(i)%map_size,&
|
||||||
|
$ao_integrals_map%map(i)%n_elements
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
do i=0_8,$ao_integrals_map%map_size
|
||||||
|
key => $ao_integrals_map%map(i)%key
|
||||||
|
val => $ao_integrals_map%map(i)%value
|
||||||
|
n = $ao_integrals_map%map(i)%n_elements
|
||||||
|
write(66) (key(j), j=1,n), (val(j), j=1,n)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
close(66)
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
integer function load_$ao_integrals(filename)
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Read from disk the $ao integrals
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
character*(*), intent(in) :: filename
|
||||||
|
integer*8 :: i
|
||||||
|
integer(cache_key_kind), pointer :: key(:)
|
||||||
|
real(integral_kind), pointer :: val(:)
|
||||||
|
integer :: iknd, kknd, n, j
|
||||||
|
load_$ao_integrals = 1
|
||||||
|
open(unit=66,file=filename,FORM='unformatted',STATUS='UNKNOWN')
|
||||||
|
read(66,err=98,end=98) iknd, kknd
|
||||||
|
if (iknd /= integral_kind) then
|
||||||
|
print *, 'Wrong integrals kind in file :', iknd
|
||||||
|
stop 1
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if (kknd /= key_kind) then
|
||||||
|
print *, 'Wrong key kind in file :', kknd
|
||||||
|
stop 1
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
read(66,err=98,end=98) $ao_integrals_map%sorted, $ao_integrals_map%map_size,&
|
||||||
|
$ao_integrals_map%n_elements
|
||||||
|
do i=0_8, $ao_integrals_map%map_size
|
||||||
|
read(66,err=99,end=99) $ao_integrals_map%map(i)%sorted, &
|
||||||
|
$ao_integrals_map%map(i)%map_size, $ao_integrals_map%map(i)%n_elements
|
||||||
|
call cache_map_reallocate($ao_integrals_map%map(i),$ao_integrals_map%map(i)%map_size)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
do i=0_8, $ao_integrals_map%map_size
|
||||||
|
key => $ao_integrals_map%map(i)%key
|
||||||
|
val => $ao_integrals_map%map(i)%value
|
||||||
|
n = $ao_integrals_map%map(i)%n_elements
|
||||||
|
read(66,err=99,end=99) (key(j), j=1,n), (val(j), j=1,n)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
call map_sort($ao_integrals_map)
|
||||||
|
load_$ao_integrals = 0
|
||||||
|
return
|
||||||
|
99 continue
|
||||||
|
call map_deinit($ao_integrals_map)
|
||||||
|
FREE $ao_integrals_map
|
||||||
|
if (.True.) then
|
||||||
|
PROVIDE $ao_integrals_map
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
stop 'Problem reading $ao_integrals_map file in work/'
|
||||||
|
98 continue
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
SUBST [ ao_integrals_map, ao_integrals, ao_num , get_ao_bielec_integral ]
|
||||||
|
ao_integrals_map ; ao_integrals ; ao_num ; get_ao_bielec_integral ;;
|
||||||
|
mo_integrals_map ; mo_integrals ; n_act ; get_mo_bielec_integral ;;
|
||||||
|
END_TEMPLATE
|
||||||
356
src/BiInts/mo_bi_integrals.irp.f
Normal file
356
src/BiInts/mo_bi_integrals.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,356 @@
|
|||||||
|
subroutine mo_bielec_integrals_index(i,j,k,l,i1)
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Computes an unique index for i,j,k,l integrals
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer, intent(in) :: i,j,k,l
|
||||||
|
integer*8, intent(out) :: i1
|
||||||
|
integer*8 :: p,q,r,s,i2
|
||||||
|
p = min(i,k)
|
||||||
|
r = max(i,k)
|
||||||
|
p = p+ishft(r*r-r,-1)
|
||||||
|
q = min(j,l)
|
||||||
|
s = max(j,l)
|
||||||
|
q = q+ishft(s*s-s,-1)
|
||||||
|
i1 = min(p,q)
|
||||||
|
i2 = max(p,q)
|
||||||
|
i1 = i1+ishft(i2*i2-i2,-1)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ logical, mo_bielec_integrals_in_map ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! If True, the map of MO bielectronic integrals is provided
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
mo_bielec_integrals_in_map = .True.
|
||||||
|
if (read_mo_integrals) then
|
||||||
|
integer :: load_mo_integrals
|
||||||
|
if (load_mo_integrals(trim(ezfio_filename)//'/work/mo_integrals.bin') == 0) then
|
||||||
|
write(output_BiInts,*) 'MO integrals provided'
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
call add_integrals_to_map(full_ijkl_bitmask)
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine add_integrals_to_map(mask_ijkl)
|
||||||
|
use bitmasks
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Adds integrals to tha MO map according to some bitmask
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
integer(bit_kind), intent(in) :: mask_ijkl(N_int,4)
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: i,j,k,l
|
||||||
|
integer :: i0,j0,k0,l0
|
||||||
|
double precision :: c, cpu_1, cpu_2, wall_1, wall_2
|
||||||
|
|
||||||
|
integer, allocatable :: list_ijkl(:,:)
|
||||||
|
integer :: n_i, n_j, n_k, n_l
|
||||||
|
integer, allocatable :: bielec_tmp_0_idx(:)
|
||||||
|
real(integral_kind), allocatable :: bielec_tmp_0(:,:)
|
||||||
|
double precision, allocatable :: bielec_tmp_1(:)
|
||||||
|
double precision, allocatable :: bielec_tmp_2(:,:)
|
||||||
|
double precision, allocatable :: bielec_tmp_3(:,:,:)
|
||||||
|
!DEC$ ATTRIBUTES ALIGN : 64 :: bielec_tmp_1, bielec_tmp_2, bielec_tmp_3
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: n_integrals
|
||||||
|
integer :: size_buffer
|
||||||
|
integer*8,allocatable :: buffer_i(:)
|
||||||
|
real(integral_kind),allocatable :: buffer_value(:)
|
||||||
|
real :: map_mb
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: i1,j1,k1,l1, ii1, kmax, l1_global
|
||||||
|
integer :: i2,i3,i4
|
||||||
|
double precision,parameter :: thr_coef = 0.d0
|
||||||
|
|
||||||
|
PROVIDE N_int ao_bielec_integrals_in_map ao_integrals_map mo_coef mo_coef_transp
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
!Get list of MOs for i,j,k and l
|
||||||
|
!-------------------------------
|
||||||
|
|
||||||
|
allocate(list_ijkl(mo_tot_num,4))
|
||||||
|
call bitstring_to_list( mask_ijkl(1,1), list_ijkl(1,1), n_i, N_int )
|
||||||
|
call bitstring_to_list( mask_ijkl(1,2), list_ijkl(1,2), n_j, N_int )
|
||||||
|
call bitstring_to_list( mask_ijkl(1,3), list_ijkl(1,3), n_k, N_int )
|
||||||
|
call bitstring_to_list( mask_ijkl(1,4), list_ijkl(1,4), n_l, N_int )
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
l1_global = 0
|
||||||
|
size_buffer = min(ao_num*ao_num*ao_num,16000000)
|
||||||
|
write(output_BiInts,*) 'Providing the molecular integrals '
|
||||||
|
write(output_BiInts,*) 'Buffers : ', 8.*(mo_tot_num_align*(n_j)*(n_k+1) + mo_tot_num_align +&
|
||||||
|
ao_num+ao_num*ao_num+ size_buffer*3)/(1024*1024), 'MB / core'
|
||||||
|
|
||||||
|
call wall_time(wall_1)
|
||||||
|
call cpu_time(cpu_1)
|
||||||
|
mo_integrals_threshold = 0.d0
|
||||||
|
|
||||||
|
!$OMP PARALLEL PRIVATE(l1,k1,j1,i1,i2,i3,i4,i,j,k,l,c, ii1,kmax, &
|
||||||
|
!$OMP bielec_tmp_0_idx, bielec_tmp_0, bielec_tmp_1,bielec_tmp_2,bielec_tmp_3,&
|
||||||
|
!$OMP buffer_i,buffer_value,n_integrals,wall_2,i0,j0,k0,l0) &
|
||||||
|
!$OMP DEFAULT(NONE) &
|
||||||
|
!$OMP SHARED(size_buffer,ao_num,mo_tot_num,n_i,n_j,n_k,n_l,mo_tot_num_align,&
|
||||||
|
!$OMP mo_coef_transp,output_BiInts, &
|
||||||
|
!$OMP mo_coef_transp_is_built, list_ijkl, &
|
||||||
|
!$OMP mo_coef_is_built, wall_1, &
|
||||||
|
!$OMP mo_coef,mo_integrals_threshold,l1_global,ao_integrals_map,mo_integrals_map)
|
||||||
|
n_integrals = 0
|
||||||
|
allocate(bielec_tmp_3(mo_tot_num_align, n_j, n_k), &
|
||||||
|
bielec_tmp_1(mo_tot_num_align), &
|
||||||
|
bielec_tmp_0(ao_num,ao_num), &
|
||||||
|
bielec_tmp_0_idx(ao_num), &
|
||||||
|
bielec_tmp_2(mo_tot_num_align, n_j), &
|
||||||
|
buffer_i(size_buffer), &
|
||||||
|
buffer_value(size_buffer) )
|
||||||
|
|
||||||
|
!$OMP DO SCHEDULE(guided)
|
||||||
|
do l1 = 1,ao_num
|
||||||
|
!DEC$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
bielec_tmp_3 = 0.d0
|
||||||
|
do k1 = 1,ao_num
|
||||||
|
!DEC$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
bielec_tmp_2 = 0.d0
|
||||||
|
do j1 = 1,ao_num
|
||||||
|
call get_ao_bielec_integrals(j1,k1,l1,ao_num,bielec_tmp_0(1,j1))
|
||||||
|
! call compute_ao_bielec_integrals(j1,k1,l1,ao_num,bielec_tmp_0(1,j1))
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
do j1 = 1,ao_num
|
||||||
|
kmax = 0
|
||||||
|
do i1 = 1,ao_num
|
||||||
|
c = bielec_tmp_0(i1,j1)
|
||||||
|
if (c == 0.d0) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
kmax += 1
|
||||||
|
bielec_tmp_0(kmax,j1) = c
|
||||||
|
bielec_tmp_0_idx(kmax) = i1
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
if (kmax==0) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
!DEC$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
bielec_tmp_1 = 0.d0
|
||||||
|
ii1=1
|
||||||
|
do ii1 = 1,kmax-4,4
|
||||||
|
i1 = bielec_tmp_0_idx(ii1)
|
||||||
|
i2 = bielec_tmp_0_idx(ii1+1)
|
||||||
|
i3 = bielec_tmp_0_idx(ii1+2)
|
||||||
|
i4 = bielec_tmp_0_idx(ii1+3)
|
||||||
|
do i = list_ijkl(1,1), list_ijkl(n_i,1)
|
||||||
|
bielec_tmp_1(i) = bielec_tmp_1(i) + &
|
||||||
|
mo_coef_transp(i,i1) * bielec_tmp_0(ii1,j1) + &
|
||||||
|
mo_coef_transp(i,i2) * bielec_tmp_0(ii1+1,j1) + &
|
||||||
|
mo_coef_transp(i,i3) * bielec_tmp_0(ii1+2,j1) + &
|
||||||
|
mo_coef_transp(i,i4) * bielec_tmp_0(ii1+3,j1)
|
||||||
|
enddo ! i
|
||||||
|
enddo ! ii1
|
||||||
|
|
||||||
|
i2 = ii1
|
||||||
|
do ii1 = i2,kmax
|
||||||
|
i1 = bielec_tmp_0_idx(ii1)
|
||||||
|
do i = list_ijkl(1,1), list_ijkl(n_i,1)
|
||||||
|
bielec_tmp_1(i) = bielec_tmp_1(i) + mo_coef_transp(i,i1) * bielec_tmp_0(ii1,j1)
|
||||||
|
enddo ! i
|
||||||
|
enddo ! ii1
|
||||||
|
c = 0.d0
|
||||||
|
|
||||||
|
do i = list_ijkl(1,1), list_ijkl(n_i,1)
|
||||||
|
c = max(c,abs(bielec_tmp_1(i)))
|
||||||
|
if (c>mo_integrals_threshold) exit
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
if ( c < mo_integrals_threshold ) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
do j0 = 1, n_j
|
||||||
|
j = list_ijkl(j0,2)
|
||||||
|
c = mo_coef_transp(j,j1)
|
||||||
|
if (abs(c) < thr_coef) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
do i = list_ijkl(1,1), list_ijkl(n_i,1)
|
||||||
|
bielec_tmp_2(i,j0) = bielec_tmp_2(i,j0) + c * bielec_tmp_1(i)
|
||||||
|
enddo ! i
|
||||||
|
enddo ! j
|
||||||
|
enddo !j1
|
||||||
|
if ( maxval(abs(bielec_tmp_2)) < mo_integrals_threshold ) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
do k0 = 1, n_k
|
||||||
|
k = list_ijkl(k0,3)
|
||||||
|
c = mo_coef_transp(k,k1)
|
||||||
|
if (abs(c) < thr_coef) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
do j0 = 1, n_j
|
||||||
|
j = list_ijkl(j0,2)
|
||||||
|
do i = list_ijkl(1,1), k
|
||||||
|
bielec_tmp_3(i,j0,k0) = bielec_tmp_3(i,j0,k0) + c* bielec_tmp_2(i,j0)
|
||||||
|
enddo!i
|
||||||
|
enddo !j
|
||||||
|
|
||||||
|
enddo !k
|
||||||
|
enddo !k1
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
do l0 = 1,n_l
|
||||||
|
l = list_ijkl(l0,4)
|
||||||
|
c = mo_coef_transp(l,l1)
|
||||||
|
if (abs(c) < thr_coef) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
j1 = ishft((l*l-l),-1)
|
||||||
|
do j0 = 1, n_j
|
||||||
|
j = list_ijkl(j0,2)
|
||||||
|
if (j > l) then
|
||||||
|
exit
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
j1 += 1
|
||||||
|
do k0 = 1, n_k
|
||||||
|
k = list_ijkl(k0,3)
|
||||||
|
i1 = ishft((k*k-k),-1)
|
||||||
|
if (i1<=j1) then
|
||||||
|
continue
|
||||||
|
else
|
||||||
|
exit
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
bielec_tmp_1 = 0.d0
|
||||||
|
do i0 = 1, n_i
|
||||||
|
i = list_ijkl(i0,1)
|
||||||
|
if (i>k) then
|
||||||
|
exit
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
bielec_tmp_1(i) = c*bielec_tmp_3(i,j0,k0)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
do i = 1, min(k,j1-i1)
|
||||||
|
if (abs(bielec_tmp_1(i)) < mo_integrals_threshold) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
n_integrals += 1
|
||||||
|
buffer_value(n_integrals) = bielec_tmp_1(i)
|
||||||
|
!DEC$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call mo_bielec_integrals_index(i,j,k,l,buffer_i(n_integrals))
|
||||||
|
if (n_integrals == size_buffer) then
|
||||||
|
call insert_into_mo_integrals_map(n_integrals,buffer_i,buffer_value,&
|
||||||
|
real(mo_integrals_threshold,integral_kind))
|
||||||
|
n_integrals = 0
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
!$OMP ATOMIC
|
||||||
|
l1_global +=1
|
||||||
|
call wall_time(wall_2)
|
||||||
|
write(output_BiInts,*) 100.*float(l1_global)/float(ao_num), '% in ',&
|
||||||
|
wall_2-wall_1, 's', map_mb(mo_integrals_map) ,'MB'
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
!$OMP END DO NOWAIT
|
||||||
|
deallocate (bielec_tmp_1,bielec_tmp_2,bielec_tmp_3)
|
||||||
|
|
||||||
|
call insert_into_mo_integrals_map(n_integrals,buffer_i,buffer_value,&
|
||||||
|
real(mo_integrals_threshold,integral_kind))
|
||||||
|
deallocate(buffer_i, buffer_value)
|
||||||
|
!$OMP END PARALLEL
|
||||||
|
call map_unique(mo_integrals_map)
|
||||||
|
|
||||||
|
call wall_time(wall_2)
|
||||||
|
call cpu_time(cpu_2)
|
||||||
|
integer*8 :: get_mo_map_size, mo_map_size
|
||||||
|
mo_map_size = get_mo_map_size()
|
||||||
|
|
||||||
|
deallocate(list_ijkl)
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
write(output_BiInts,*)'Molecular integrals provided:'
|
||||||
|
write(output_BiInts,*)' Size of MO map ', map_mb(mo_integrals_map) ,'MB'
|
||||||
|
write(output_BiInts,*)' Number of MO integrals: ', mo_map_size
|
||||||
|
write(output_BiInts,*)' cpu time :',cpu_2 - cpu_1, 's'
|
||||||
|
write(output_BiInts,*)' wall time :',wall_2 - wall_1, 's ( x ', (cpu_2-cpu_1)/(wall_2-wall_1), ')'
|
||||||
|
|
||||||
|
if (write_mo_integrals) then
|
||||||
|
call dump_mo_integrals(trim(ezfio_filename)//'/work/mo_integrals.bin')
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ double precision, mo_bielec_integral_jj, (mo_tot_num_align,mo_tot_num)]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Bi-electronic integrals <ij|ij>
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer :: i,j
|
||||||
|
double precision :: get_mo_bielec_integral
|
||||||
|
PROVIDE mo_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
do j= 1, mo_tot_num
|
||||||
|
!DIR$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
do i= 1, mo_tot_num
|
||||||
|
mo_bielec_integral_jj(i,j) = get_mo_bielec_integral(i,j,i,j,mo_integrals_map)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
! Padding
|
||||||
|
do i= mo_tot_num+1, mo_tot_num_align
|
||||||
|
mo_bielec_integral_jj(i,j) = 0.d0
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ double precision, mo_bielec_integral_jj_exchange, (mo_tot_num_align,mo_tot_num)]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Bi-electronic integrals <ij|ij> - <ij|ji>
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer :: i,j
|
||||||
|
double precision :: get_mo_bielec_integral
|
||||||
|
PROVIDE mo_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
|
||||||
|
do j = 1, mo_tot_num
|
||||||
|
!DIR$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
do i = 1,mo_tot_num
|
||||||
|
mo_bielec_integral_jj_exchange(i,j) = get_mo_bielec_integral(i,j,j,i,mo_integrals_map)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
! Padding
|
||||||
|
do i= mo_tot_num+1, mo_tot_num_align
|
||||||
|
mo_bielec_integral_jj_exchange(i,j) = 0.d0
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ double precision, mo_bielec_integral_jj_anti, (mo_tot_num_align,mo_tot_num)]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! Bi-electronic integrals <ij|ij> - <ij|ji>
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
integer :: i,j
|
||||||
|
PROVIDE mo_bielec_integrals_in_map
|
||||||
|
|
||||||
|
do j = 1, mo_tot_num
|
||||||
|
!DIR$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
do i = 1,mo_tot_num_align
|
||||||
|
mo_bielec_integral_jj_anti(i,j) = mo_bielec_integral_jj(i,j) - mo_bielec_integral_jj_exchange(i,j)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
109
src/BiInts/options.irp.f
Normal file
109
src/BiInts/options.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,109 @@
|
|||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ logical, write_mo_integrals ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! If true, write MO integrals in EZFIO
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
logical :: has
|
||||||
|
PROVIDE ezfio_filename
|
||||||
|
call ezfio_has_bielec_integrals_write_mo_integrals(has)
|
||||||
|
if (has) then
|
||||||
|
call ezfio_get_bielec_integrals_write_mo_integrals(write_mo_integrals)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
write_mo_integrals = .False.
|
||||||
|
call ezfio_set_bielec_integrals_write_mo_integrals(write_mo_integrals)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ logical, write_ao_integrals ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! If true, write AO integrals in EZFIO
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
logical :: has
|
||||||
|
PROVIDE ezfio_filename
|
||||||
|
call ezfio_has_bielec_integrals_write_ao_integrals(has)
|
||||||
|
if (has) then
|
||||||
|
call ezfio_get_bielec_integrals_write_ao_integrals(write_ao_integrals)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
write_ao_integrals = .False.
|
||||||
|
call ezfio_set_bielec_integrals_write_ao_integrals(write_ao_integrals)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ logical, read_mo_integrals ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! If true, read MO integrals in EZFIO
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
logical :: has
|
||||||
|
PROVIDE ezfio_filename
|
||||||
|
call ezfio_has_bielec_integrals_read_mo_integrals(has)
|
||||||
|
if (has) then
|
||||||
|
call ezfio_get_bielec_integrals_read_mo_integrals(read_mo_integrals)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
read_mo_integrals = .False.
|
||||||
|
call ezfio_set_bielec_integrals_read_mo_integrals(read_mo_integrals)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ logical, read_ao_integrals ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! If true, read AO integrals in EZFIO
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
logical :: has
|
||||||
|
PROVIDE ezfio_filename
|
||||||
|
call ezfio_has_bielec_integrals_read_ao_integrals(has)
|
||||||
|
if (has) then
|
||||||
|
call ezfio_get_bielec_integrals_read_ao_integrals(read_ao_integrals)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
read_ao_integrals = .False.
|
||||||
|
call ezfio_set_bielec_integrals_read_ao_integrals(read_ao_integrals)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_integrals_threshold ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! If <pq|rs> < ao_integrals_threshold, <pq|rs> = 0
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
logical :: has
|
||||||
|
PROVIDE ezfio_filename
|
||||||
|
call ezfio_has_bielec_integrals_threshold_ao(has)
|
||||||
|
if (has) then
|
||||||
|
call ezfio_get_bielec_integrals_threshold_ao(ao_integrals_threshold)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
ao_integrals_threshold = 1.d-15
|
||||||
|
call ezfio_set_bielec_integrals_threshold_ao(ao_integrals_threshold)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [ double precision, mo_integrals_threshold ]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! If <ij|kl> < mo_integrals_threshold, <ij|kl> = 0
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
|
||||||
|
logical :: has
|
||||||
|
PROVIDE ezfio_filename
|
||||||
|
call ezfio_has_bielec_integrals_threshold_mo(has)
|
||||||
|
if (has) then
|
||||||
|
call ezfio_get_bielec_integrals_threshold_mo(mo_integrals_threshold)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
mo_integrals_threshold = 1.d-11
|
||||||
|
call ezfio_set_bielec_integrals_threshold_mo(mo_integrals_threshold)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
33
src/BiInts/tests/Makefile
Normal file
33
src/BiInts/tests/Makefile
Normal file
@ -0,0 +1,33 @@
|
|||||||
|
OPENMP =1
|
||||||
|
PROFILE =0
|
||||||
|
DEBUG = 0
|
||||||
|
|
||||||
|
IRPF90+= -I tests
|
||||||
|
|
||||||
|
REF_FILES=$(subst %.irp.f, %.ref, $(wildcard *.irp.f))
|
||||||
|
|
||||||
|
.PHONY: clean executables serial_tests parallel_tests
|
||||||
|
|
||||||
|
all: clean executables serial_tests parallel_tests
|
||||||
|
|
||||||
|
parallel_tests: $(REF_FILES)
|
||||||
|
@echo ; echo " ---- Running parallel tests ----" ; echo
|
||||||
|
@OMP_NUM_THREADS=10 ${QPACKAGE_ROOT}/scripts/run_tests.py
|
||||||
|
|
||||||
|
serial_tests: $(REF_FILES)
|
||||||
|
@echo ; echo " ---- Running serial tests ----" ; echo
|
||||||
|
@OMP_NUM_THREADS=1 ${QPACKAGE_ROOT}/scripts/run_tests.py
|
||||||
|
|
||||||
|
executables: $(wildcard *.irp.f) veryclean
|
||||||
|
$(MAKE) -C ..
|
||||||
|
|
||||||
|
%.ref: $(wildcard $(QPACKAGE_ROOT)/data/inputs/*.md5) executables
|
||||||
|
$(QPACKAGE_ROOT)/scripts/create_test_ref.sh $*
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) -C .. clean
|
||||||
|
|
||||||
|
veryclean:
|
||||||
|
$(MAKE) -C .. veryclean
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
424
src/BiInts/tests/test_ao.ref
Normal file
424
src/BiInts/tests/test_ao.ref
Normal file
@ -0,0 +1,424 @@
|
|||||||
|
data = {
|
||||||
|
'AlCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Al.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Al+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'AlH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'AlH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'AlH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Be.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Be+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeF.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeOH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'B.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'B+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H2+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H3+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H4.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H4+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H5.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H6.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CF.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2_1A1.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2_3B1.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH3-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH4.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH4+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH2+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClSiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CN-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CN.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'COS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CP.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CSi.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FAl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FCl+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FH+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FMg.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FNa.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FP.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FSi.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FSiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2CNH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2CO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2CPH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2CS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2NNH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2PPH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3CCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3CF.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3CNH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3COH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3CSH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3SiSiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HBO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HBS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HCF.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HCN.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HCO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HCP.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HNO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOF.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOMg.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HONa.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOOH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HSSH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Li2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Li.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Li+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiF.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiN.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiOH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'MgCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Mg.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Mg+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'MgH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'MgS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'N2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'N2+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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|
||||||
|
},
|
||||||
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|
||||||
|
},
|
||||||
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|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Na+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NaH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'N.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'N+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NF.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH2-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'NH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'NH3+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'NH4+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NO-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NO.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'NP.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'NS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'NSi.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'O2Cl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'O2-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'O2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'O2+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'O2S.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O2Si.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'O3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'OCl.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'O-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'O.ezfio' : {
|
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|
},
|
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|
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|
||||||
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|
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|
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|
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'OH-.ezfio' : {
|
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|
},
|
||||||
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'OH.ezfio' : {
|
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|
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'OH+.ezfio' : {
|
||||||
|
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|
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'OMg.ezfio' : {
|
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|
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|
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'ONa.ezfio' : {
|
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'OP-.ezfio' : {
|
||||||
|
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|
||||||
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'OP.ezfio' : {
|
||||||
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},
|
||||||
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'OPH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
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'OS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'OSi.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
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'P2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'P2+.ezfio' : {
|
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|
},
|
||||||
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'PCl.ezfio' : {
|
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|
},
|
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|
'P-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'P.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'PH2-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'PH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH2+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH3+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'PH4+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PS.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'S2-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'SH2.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'SH2+.ezfio' : {
|
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},
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|
||||||
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},
|
||||||
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'SH-.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'SH.ezfio' : {
|
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|
},
|
||||||
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'SH+.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'Si2.ezfio' : {
|
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|
},
|
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'SiCl.ezfio' : {
|
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|
},
|
||||||
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'Si-.ezfio' : {
|
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|
},
|
||||||
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'Si.ezfio' : {
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||||||
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},
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},
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|
||||||
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},
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||||||
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|
||||||
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|
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},
|
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'SiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
},
|
||||||
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'SiH4.ezfio' : {
|
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},
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|
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'SiH.ezfio' : {
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|
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},
|
||||||
|
}
|
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35
src/BiInts/tests/test_ao_map.irp.f
Normal file
35
src/BiInts/tests/test_ao_map.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,35 @@
|
|||||||
|
program test_ao_map
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer :: i,j,k,l
|
||||||
|
double precision :: get_ao_bielec_integral, tmp
|
||||||
|
double precision, allocatable :: buffer_value(:,:)
|
||||||
|
double precision :: ao_bielec_integral,tmp2
|
||||||
|
integer :: non_zero_int
|
||||||
|
double precision :: s
|
||||||
|
integer :: OK
|
||||||
|
|
||||||
|
allocate(buffer_value(ao_num,2))
|
||||||
|
|
||||||
|
OK = 1
|
||||||
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do l=1,ao_num,7
|
||||||
|
s = 0.d0
|
||||||
|
do k=1, ao_num
|
||||||
|
do j=1,l
|
||||||
|
call compute_ao_bielec_integrals(j,k,l,ao_num,buffer_value(1,1))
|
||||||
|
call get_ao_bielec_integrals(j,k,l,ao_num,buffer_value(1,2))
|
||||||
|
do i=1,k
|
||||||
|
s += (buffer_value(i,1)-buffer_value(i,2))*(buffer_value(i,1)-buffer_value(i,2))
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
if (s > 1.d-20) then
|
||||||
|
print *, l, ' : ', s
|
||||||
|
OK=0
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
deallocate(buffer_value)
|
||||||
|
print *, ' OK : ', OK
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
635
src/BiInts/tests/test_ao_map.ref
Normal file
635
src/BiInts/tests/test_ao_map.ref
Normal file
@ -0,0 +1,635 @@
|
|||||||
|
data = {
|
||||||
|
'AlCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'Al.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'Al+.ezfio' : {
|
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|
'OK' : 1,
|
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|
},
|
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'AlH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
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'AlH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
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'AlH.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
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'BCl.ezfio' : {
|
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'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BeCl.ezfio' : {
|
||||||
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'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'Be.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'Be+.ezfio' : {
|
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'OK' : 1,
|
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},
|
||||||
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'BeF.ezfio' : {
|
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'OK' : 1,
|
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|
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'BeH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BeH.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BeO.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BeOH.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BeS.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'B.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'B+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BH.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BO.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'BS.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'C2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
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|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H3.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H3+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H4.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H4+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H5.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H6.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C-.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CF.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2_1A1.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2_3B1.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH3-.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH4.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH4+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH-.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl-.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClS.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClSiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CN-.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CN.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'COS.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CP.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CSi.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F2.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FAl.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FCl+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F-.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FH.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FH+.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FMg.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FNa.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FP.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'FS.ezfio' : {
|
||||||
|
'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'FSi.ezfio' : {
|
||||||
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'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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|
||||||
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'OK' : 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
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'H2CNH.ezfio' : {
|
||||||
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'OK' : 1,
|
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|
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|
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|
||||||
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'OK' : 1,
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|
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|
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|
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|
||||||
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|
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|
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|
||||||
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|
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|
||||||
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'OK' : 1,
|
||||||
|
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|
||||||
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|
||||||
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'OK' : 1,
|
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|
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|
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'OK' : 1,
|
||||||
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|
||||||
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|
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'OK' : 1,
|
||||||
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|
||||||
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|
||||||
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'OK' : 1,
|
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|
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|
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'OK' : 1,
|
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|
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|
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'HCF.ezfio' : {
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'OK' : 1,
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'OK' : 1,
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'OK' : 1,
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'OK' : 1,
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'Li.ezfio' : {
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'OK' : 1,
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15
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|
enddo
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print *,'closed EE 1 : ',accu
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print *,'closed EE 2 : ',accu3
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|
end
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846
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846
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Normal file
@ -0,0 +1,846 @@
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||||||
|
'closed EE 2' : 208.669206621826,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 195.478154262549,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 195.478154262549,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Be.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 4.48960803917240,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 4.48960803917240,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Be+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 2.27296598314244,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 2.27296598314244,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeF.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 55.2667378076567,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 55.2667378076567,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 7.91863331588170,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 7.91863331588170,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 4.60494282657902,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 4.60494282657902,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 47.0178059698967,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 47.0178059698967,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeOH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 47.4095700462092,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 47.4095700462092,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BeS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 177.044582851287,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 177.044582851287,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'B.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 5.87051480040891,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 5.87051480040891,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'B+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 6.08872058329241,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 6.08872058329241,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 9.82092714954701,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 9.82092714954701,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 15.1738039588984,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 15.1738039588984,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 9.89523045878027,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 9.89523045878027,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 49.5244841428460,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 49.5244841428460,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'BS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 179.847811135927,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 179.847811135927,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 40.1266484535661,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 40.1266484535661,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 50.0072453359780,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 50.0072453359780,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 38.8813663363468,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 38.8813663363468,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 47.7960364243417,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 47.7960364243417,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H3+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 49.4483058762631,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 49.4483058762631,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H4.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 58.5930731008834,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 58.5930731008834,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H4+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 46.8050385693024,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 46.8050385693024,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H5.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 55.8648362479812,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 55.8648362479812,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H6.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 67.4231505770701,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 67.4231505770701,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C2H.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 39.7941997946625,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 39.7941997946625,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 211.332787485635,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 211.332787485635,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 7.05668474724391,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 7.05668474724391,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 7.22275234701424,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 7.22275234701424,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'C+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 7.43316493990123,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 7.43316493990123,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CF.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 67.5749607457798,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 67.5749607457798,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2_1A1.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 18.6032101860148,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 18.6032101860148,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2_3B1.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 11.7811748791077,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 11.7811748791077,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 17.4224231187863,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 17.4224231187863,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH3-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 25.0349104359763,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 25.0349104359763,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 18.1595297280646,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 18.1595297280646,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH4.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 26.0266830207216,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 26.0266830207216,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH4+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 18.4285252097398,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 18.4285252097398,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 11.4343449775700,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 11.4343449775700,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 12.0838764958443,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 12.0838764958443,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 402.671444472536,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 402.671444472536,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 425.050531461454,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 425.050531461454,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 403.762363169362,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 403.762363169362,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 182.327075272228,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 182.327075272228,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 165.731725346204,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 165.731725346204,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Cl+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 149.193201694481,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 149.193201694481,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 182.780324107490,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 182.780324107490,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 182.691147725717,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 182.691147725717,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClH+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 165.325459132812,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 165.325459132812,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 385.435861712905,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 385.435861712905,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ClSiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 372.487466205289,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 372.487466205289,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CN-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 55.3766122391237,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 55.3766122391237,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CN.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 45.1366654659749,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 45.1366654659749,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 126.003917383945,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 126.003917383945,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 62.7345020629198,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 62.7345020629198,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CO+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 52.0257806106742,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 52.0257806106742,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'COS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 270.518850152602,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 270.518850152602,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CP.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 165.996004819480,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 165.996004819480,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 423.926547892897,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 423.926547892897,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 196.955019712066,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 196.955019712066,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CS+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 183.101079356045,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 183.101079356045,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'CSi.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 136.339370158432,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 136.339370158432,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 109.589586860957,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 109.589586860957,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FAl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 172.329074560241,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 172.329074560241,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 263.250821798940,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 263.250821798940,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FCl+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 243.398671131879,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 243.398671131879,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 45.5127217885110,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 45.5127217885110,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 32.5100994559105,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 32.5100994559105,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'F+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 21.0616333765295,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 21.0616333765295,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 45.4165968585922,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 45.4165968585922,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FH+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 32.0966404042882,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 32.0966404042882,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FMg.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 147.723081703366,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 147.723081703366,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FNa.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 136.229809908309,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 136.229809908309,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FP.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 195.769918393858,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 195.769918393858,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 226.988766049930,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 226.988766049930,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FSi.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 184.557018579786,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 184.557018579786,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'FSiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 213.848410787899,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 213.848410787899,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2CNH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 64.8118892917432,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 64.8118892917432,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2CO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 72.1212876559760,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 72.1212876559760,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2CPH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 191.727599087985,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 191.727599087985,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2CS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 209.231104868214,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 209.231104868214,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 0.658003361873990,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 0.658003361873990,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2NNH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 80.4177432036452,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 80.4177432036452,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H2PPH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 348.965444263036,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 348.965444263036,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3CCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 239.272625318642,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 239.272625318642,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3CF.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 89.9110566746969,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 89.9110566746969,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3CNH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 74.0553942748957,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 74.0553942748957,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3COH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 81.4464317182977,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 81.4464317182977,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3CSH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 220.631290723648,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 220.631290723648,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H3SiSiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 313.726268238800,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 313.726268238800,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HBO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 58.0559325869888,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 58.0559325869888,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HBS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 191.322628710909,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 191.322628710909,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HCF.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 79.0947411389797,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 79.0947411389797,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HCN.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 55.7130916664010,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 55.7130916664010,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HCO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 60.6786870182187,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 60.6786870182187,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HCP.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 180.296919079404,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 180.296919079404,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'H.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 0.000000000000000E+000,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 0.000000000000000E+000,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HNO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 77.5573550103421,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 77.5573550103421,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 253.799452346657,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 253.799452346657,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOF.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 101.663005370608,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 101.663005370608,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOMg.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 138.443726972836,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 138.443726972836,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HONa.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 126.747456382832,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 126.747456382832,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 79.4438064643797,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 79.4438064643797,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HOOH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 93.6527230199755,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 93.6527230199755,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'HSSH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 387.218345293825,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 387.218345293825,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Li2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 6.46521052077037,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 6.46521052077037,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 193.091759412769,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 193.091759412769,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Li.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 1.64991166351969,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 1.64991166351969,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Li+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 1.65066035543863,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 1.65066035543863,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiF.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 53.4448357111712,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 53.4448357111712,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 3.45968704863106,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 3.45968704863106,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiN.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 19.4901024446162,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 19.4901024446162,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 33.6641656402794,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 33.6641656402794,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'LiOH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 45.3987062615096,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 45.3987062615096,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'MgCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 297.457458920467,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 297.457458920467,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Mg.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 79.8152268844060,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 79.8152268844060,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Mg+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 72.1282818471152,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 72.1282818471152,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'MgH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 79.3190204144503,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 79.3190204144503,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'MgS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 279.954838755823,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 279.954838755823,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'N2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 61.5022395201583,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 61.5022395201583,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'N2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 48.5010781414573,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 48.5010781414573,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Na2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 153.459222056420,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 153.459222056420,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NaCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 285.552878597068,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 285.552878597068,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Na.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 63.1438465495254,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 63.1438465495254,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Na+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 63.1844537555369,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 63.1844537555369,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NaH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 69.3524887715318,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 69.3524887715318,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'N.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 8.56327997038596,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 8.56327997038596,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'N+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 8.76869142211657,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 8.76869142211657,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NF.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 69.0051111837754,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 69.0051111837754,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 30.6309164550511,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 30.6309164550511,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 21.9260220960358,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 21.9260220960358,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 31.4406045429538,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 31.4406045429538,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH3+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 22.1802907966178,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 22.1802907966178,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH4+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 31.8659857288766,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 31.8659857288766,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 21.6689399304262,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 21.6689399304262,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 14.2929080048555,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 14.2929080048555,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NO-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 61.7198631648835,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 61.7198631648835,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NO.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 64.6696341812441,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 64.6696341812441,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NP.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 187.100108926969,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 187.100108926969,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 200.128710693974,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 200.128710693974,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'NSi.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 155.279906480313,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 155.279906480313,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O2Cl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 301.747915430568,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 301.747915430568,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 79.2328963139684,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 79.2328963139684,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 66.1914541099256,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 66.1914541099256,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 69.4144048026520,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 69.4144048026520,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O2S.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 312.243487598150,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 312.243487598150,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O2Si.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 257.255582658461,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 257.255582658461,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 152.241108922056,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 152.241108922056,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 236.412413075442,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 236.412413075442,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 26.9389565391700,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 26.9389565391700,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 17.7360424805971,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 17.7360424805971,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'O+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 10.1017140483289,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 10.1017140483289,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 37.8440317785205,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 37.8440317785205,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OH2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 26.6519594351168,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 26.6519594351168,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OH3+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 38.1275235387040,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 38.1275235387040,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OH-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 37.4117044437012,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 37.4117044437012,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 26.7707296794756,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 26.7707296794756,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OH+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 17.2889916223005,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 17.2889916223005,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OMg.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 138.801601522175,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 138.801601522175,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'ONa.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 112.111906727576,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 112.111906727576,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OP-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 188.573528250670,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 188.573528250670,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OP.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 191.910766225339,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 191.910766225339,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OPH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 208.214788904911,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 208.214788904911,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 203.101155235861,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 203.101155235861,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'OSi.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 179.456084306272,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 179.456084306272,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'P2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 323.782785949801,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 323.782785949801,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'P2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 301.882738442470,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 301.882738442470,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 349.890715378447,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 349.890715378447,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'P-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 122.657805807297,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 122.657805807297,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'P.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 111.445647659427,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 111.445647659427,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 147.249988541779,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 147.249988541779,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 134.714659285095,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 134.714659285095,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 136.440910105336,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 136.440910105336,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 148.202871342844,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 148.202871342844,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH3+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 134.975246396259,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 134.975246396259,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH4+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 148.989370984817,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 148.989370984817,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 134.328964674983,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 134.328964674983,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 122.455536217569,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 122.455536217569,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'PS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 337.453574046369,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 337.453574046369,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 366.675175225190,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 366.675175225190,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 349.448868216573,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 349.448868216573,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 149.700149385399,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 149.700149385399,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 135.897852467643,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 135.897852467643,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'S+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 122.164730812357,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 122.164730812357,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SH2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 164.906914972667,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 164.906914972667,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SH2+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 149.596440849195,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 149.596440849195,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SH3+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 165.246577302836,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 165.246577302836,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SH-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 164.245517624070,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 164.245517624070,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 149.754586732578,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 149.754586732578,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SH+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 135.225667181454,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 135.225667181454,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Si2.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 252.066473929603,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 252.066473929603,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiCl.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 337.640041152210,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 337.640041152210,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Si-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 100.662878826237,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 100.662878826237,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'Si.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 101.098004923652,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 101.098004923652,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH2_1A1.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 121.587026002297,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 121.587026002297,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH2_3B1.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 109.761390873831,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 109.761390873831,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH2-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 120.021930833955,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 120.021930833955,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH3-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 131.352511652808,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 131.352511652808,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH3.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 120.791742854126,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 120.791742854126,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH4.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 132.863104887314,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 132.863104887314,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH4+.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 121.801965974605,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 121.801965974605,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH-.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 109.783147473057,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 109.783147473057,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiH.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 110.775916738616,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 110.775916738616,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
'SiS.ezfio' : {
|
||||||
|
'closed EE 1' : 324.574435129198,
|
||||||
|
'closed EE 2' : 324.574435129198,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
}
|
||||||
@ -1,4 +1,6 @@
|
|||||||
* ``bit_kind_shift``, ``bit_kind_size`` and ``bit_kind`` are coherent::
|
``bit_kind_shift``, ``bit_kind_size`` and ``bit_kind`` are coherent:
|
||||||
|
|
||||||
|
.. code_block:: fortran
|
||||||
|
|
||||||
2**bit_kind_shift = bit_kind_size
|
2**bit_kind_shift = bit_kind_size
|
||||||
bit_kind = bit_kind_size / 8
|
bit_kind = bit_kind_size / 8
|
||||||
|
|||||||
@ -24,7 +24,9 @@ Assumptions
|
|||||||
.. Do not edit this section. It was auto-generated from the
|
.. Do not edit this section. It was auto-generated from the
|
||||||
.. ASSUMPTIONS.rst file.
|
.. ASSUMPTIONS.rst file.
|
||||||
|
|
||||||
* ``bit_kind_shift``, ``bit_kind_size`` and ``bit_kind`` are coherent::
|
``bit_kind_shift``, ``bit_kind_size`` and ``bit_kind`` are coherent:
|
||||||
|
|
||||||
|
.. code_block:: fortran
|
||||||
|
|
||||||
2**bit_kind_shift = bit_kind_size
|
2**bit_kind_shift = bit_kind_size
|
||||||
bit_kind = bit_kind_size / 8
|
bit_kind = bit_kind_size / 8
|
||||||
|
|||||||
0
src/MOGuess/ASSUMPTIONS.rst
Normal file
0
src/MOGuess/ASSUMPTIONS.rst
Normal file
11
src/MOGuess/H_CORE_guess.irp.f
Normal file
11
src/MOGuess/H_CORE_guess.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,11 @@
|
|||||||
|
program H_CORE_guess
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
character*(64) :: label
|
||||||
|
mo_coef = ao_ortho_lowdin_coef
|
||||||
|
TOUCH mo_coef
|
||||||
|
label = "H_CORE_GUESS"
|
||||||
|
call mo_as_eigvectors_of_mo_matrix(mo_mono_elec_integral,size(mo_mono_elec_integral,1),size(mo_mono_elec_integral,2),label)
|
||||||
|
call save_mos
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
8
src/MOGuess/Makefile
Normal file
8
src/MOGuess/Makefile
Normal file
@ -0,0 +1,8 @@
|
|||||||
|
default: all
|
||||||
|
|
||||||
|
# Define here all new external source files and objects.Don't forget to prefix the
|
||||||
|
# object files with IRPF90_temp/
|
||||||
|
SRC=
|
||||||
|
OBJ=
|
||||||
|
|
||||||
|
include $(QPACKAGE_ROOT)/src/Makefile.common
|
||||||
4
src/MOGuess/README.rst
Normal file
4
src/MOGuess/README.rst
Normal file
@ -0,0 +1,4 @@
|
|||||||
|
==============
|
||||||
|
MOGuess Module
|
||||||
|
==============
|
||||||
|
|
||||||
114
src/MOGuess/localize.irp.f
Normal file
114
src/MOGuess/localize.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,114 @@
|
|||||||
|
!TODO Ecrire un cholesky avec bitmask
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine localize_mos(mask, nint)
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
use bitmasks
|
||||||
|
integer, intent(in) :: nint
|
||||||
|
integer(bit_kind), intent(in) :: mask(nint)
|
||||||
|
integer :: i,j,k,l
|
||||||
|
double precision, allocatable :: DM(:,:)
|
||||||
|
double precision, allocatable :: mo_coef_new(:,:), R(:,:)
|
||||||
|
integer :: n
|
||||||
|
!DIR$ ATTRIBUTES ALIGN : $IRP_ALIGN :: DM, mo_coef_new, R
|
||||||
|
integer :: rank
|
||||||
|
integer, parameter :: n_core = 2
|
||||||
|
|
||||||
|
allocate(R(mo_tot_num,mo_tot_num))
|
||||||
|
allocate(DM(ao_num_align,ao_num))
|
||||||
|
allocate(mo_coef_new(ao_num_align,mo_tot_num))
|
||||||
|
n = ao_num
|
||||||
|
mo_coef_new = mo_coef
|
||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_TEMPLATE
|
||||||
|
DM = 0.d0
|
||||||
|
if ($START < $END) then
|
||||||
|
do k=$START, $END
|
||||||
|
do j=1,n
|
||||||
|
!DEC$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
do i=1,n
|
||||||
|
DM(i,j) += mo_coef_new(i,k)*mo_coef_new(j,k)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
call cholesky_mo(n,$END-$START+1,DM,mo_coef_new(1,$START),size(mo_coef_new,1),-1.d0,rank)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
SUBST [ START, END ]
|
||||||
|
1 ; n_core ;;
|
||||||
|
END_TEMPLATE
|
||||||
|
|
||||||
|
deallocate(DM)
|
||||||
|
call find_rotation(mo_coef,ao_num_align,mo_coef_new,ao_num,R,mo_tot_num)
|
||||||
|
mo_coef = mo_coef_new
|
||||||
|
deallocate(mo_coef_new)
|
||||||
|
|
||||||
|
double precision,allocatable :: mo_energy_new(:)
|
||||||
|
integer, allocatable :: iorder(:)
|
||||||
|
allocate(mo_energy_new(mo_tot_num),iorder(mo_tot_num))
|
||||||
|
|
||||||
|
do i=1,mo_tot_num
|
||||||
|
iorder(i) = i
|
||||||
|
mo_energy_new(i) = 0.d0
|
||||||
|
do k=1,mo_tot_num
|
||||||
|
mo_energy_new(i) += R(k,i)*R(k,i)*mo_energy(k)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
mo_energy = mo_energy_new
|
||||||
|
call dsort(mo_energy(1),iorder(1),n_core)
|
||||||
|
allocate (mo_coef_new(ao_num_align,mo_tot_num))
|
||||||
|
mo_coef_new = mo_coef
|
||||||
|
do j=1,mo_tot_num
|
||||||
|
do i=1,ao_num
|
||||||
|
mo_coef(i,j) = mo_coef_new(i,iorder(j))
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
deallocate (mo_coef_new,R)
|
||||||
|
deallocate(mo_energy_new,iorder)
|
||||||
|
mo_label = 'localized'
|
||||||
|
|
||||||
|
SOFT_TOUCH mo_coef mo_energy mo_label
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine cholesky_mo(n,m,P,C,LDC,tol_in,rank)
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer, intent(in) :: n,m, LDC
|
||||||
|
double precision, intent(in) :: P(LDC,n)
|
||||||
|
double precision, intent(out) :: C(LDC,m)
|
||||||
|
double precision, intent(in) :: tol_in
|
||||||
|
integer, intent(out) :: rank
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: info
|
||||||
|
integer :: i,k
|
||||||
|
integer :: ipiv(n)
|
||||||
|
double precision:: tol
|
||||||
|
double precision, allocatable :: W(:,:), work(:)
|
||||||
|
!DEC$ ATTRIBUTES ALIGN: 32 :: W
|
||||||
|
!DEC$ ATTRIBUTES ALIGN: 32 :: work
|
||||||
|
!DEC$ ATTRIBUTES ALIGN: 32 :: ipiv
|
||||||
|
|
||||||
|
allocate(W(LDC,n),work(2*n))
|
||||||
|
tol=tol_in
|
||||||
|
|
||||||
|
info = 0
|
||||||
|
do i=1,n
|
||||||
|
do k=1,i
|
||||||
|
W(i,k) = P(i,k)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
do k=i+1,n
|
||||||
|
W(i,k) = 0.
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
call DPSTRF('L', n, W, LDC, ipiv, rank, tol, work, info )
|
||||||
|
do i=1,n
|
||||||
|
do k=1,min(m,rank)
|
||||||
|
C(ipiv(i),k) = W(i,k)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
deallocate(W,work)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
46
src/MOGuess/mo_ortho_lowdin.irp.f
Normal file
46
src/MOGuess/mo_ortho_lowdin.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,46 @@
|
|||||||
|
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [double precision, ao_ortho_lowdin_coef, (ao_num_align,ao_num)]
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! matrix of the coefficients of the mos generated by the
|
||||||
|
! orthonormalization by the S^{-1/2} canonical transformation of the aos
|
||||||
|
! ao_ortho_lowdin_coef(i,j) = coefficient of the ith ao on the jth ao_ortho_lowdin orbital
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer :: i,j,k,l
|
||||||
|
double precision :: tmp_matrix(ao_num_align,ao_num),accu
|
||||||
|
do i = 1, ao_num
|
||||||
|
do j = 1, ao_num
|
||||||
|
tmp_matrix(i,j) = 0.d0
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
do i = 1, ao_num
|
||||||
|
tmp_matrix(i,i) = 1.d0
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
call ortho_lowdin(ao_overlap,ao_num_align,ao_num,tmp_matrix,ao_num_align,ao_num)
|
||||||
|
do i = 1, ao_num
|
||||||
|
do j = 1, ao_num
|
||||||
|
ao_ortho_lowdin_coef(j,i) = tmp_matrix(i,j)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
BEGIN_PROVIDER [double precision, ao_ortho_lowdin_overlap, (ao_num_align,ao_num)]
|
||||||
|
BEGIN_DOC
|
||||||
|
! overlap matrix of the ao_ortho_lowdin
|
||||||
|
! supposed to be the Identity
|
||||||
|
END_DOC
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer :: i,j,k,l
|
||||||
|
double precision :: accu
|
||||||
|
do i = 1, ao_num
|
||||||
|
do j = 1, ao_num
|
||||||
|
accu = 0.d0
|
||||||
|
do k = 1, ao_num
|
||||||
|
do l = 1, ao_num
|
||||||
|
accu = accu + ao_ortho_lowdin_coef(i,k) * ao_ortho_lowdin_coef(j,l) * ao_overlap(k,l)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
ao_ortho_lowdin_overlap(i,j) = accu
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
25
src/MOGuess/pot_mo_ortho_lowdin_ints.irp.f
Normal file
25
src/MOGuess/pot_mo_ortho_lowdin_ints.irp.f
Normal file
@ -0,0 +1,25 @@
|
|||||||
|
BEGIN_PROVIDER [double precision, ao_ortho_lowdin_nucl_elec_integral, (mo_tot_num_align,mo_tot_num)]
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer :: i1,j1,i,j
|
||||||
|
double precision :: c_i1,c_j1
|
||||||
|
|
||||||
|
ao_ortho_lowdin_nucl_elec_integral = 0.d0
|
||||||
|
!$OMP PARALLEL DO DEFAULT(none) &
|
||||||
|
!$OMP PRIVATE(i,j,i1,j1,c_j1,c_i1) &
|
||||||
|
!$OMP SHARED(mo_tot_num,ao_num,ao_ortho_lowdin_coef, &
|
||||||
|
!$OMP ao_ortho_lowdin_nucl_elec_integral, ao_nucl_elec_integral)
|
||||||
|
do i = 1, mo_tot_num
|
||||||
|
do j = 1, mo_tot_num
|
||||||
|
do i1 = 1,ao_num
|
||||||
|
c_i1 = ao_ortho_lowdin_coef(i1,i)
|
||||||
|
do j1 = 1,ao_num
|
||||||
|
c_j1 = c_i1*ao_ortho_lowdin_coef(j1,j)
|
||||||
|
ao_ortho_lowdin_nucl_elec_integral(j,i) = ao_ortho_lowdin_nucl_elec_integral(j,i) + &
|
||||||
|
c_j1 * ao_nucl_elec_integral(j1,i1)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||||
|
END_PROVIDER
|
||||||
|
|
||||||
33
src/MOGuess/tests/Makefile
Normal file
33
src/MOGuess/tests/Makefile
Normal file
@ -0,0 +1,33 @@
|
|||||||
|
OPENMP =1
|
||||||
|
PROFILE =0
|
||||||
|
DEBUG = 0
|
||||||
|
|
||||||
|
IRPF90+= -I tests
|
||||||
|
|
||||||
|
REF_FILES=$(subst %.irp.f, %.ref, $(wildcard *.irp.f))
|
||||||
|
|
||||||
|
.PHONY: clean executables serial_tests parallel_tests
|
||||||
|
|
||||||
|
all: clean executables serial_tests parallel_tests
|
||||||
|
|
||||||
|
parallel_tests: $(REF_FILES)
|
||||||
|
@echo ; echo " ---- Running parallel tests ----" ; echo
|
||||||
|
@OMP_NUM_THREADS=10 ${QPACKAGE_ROOT}/scripts/run_tests.py
|
||||||
|
|
||||||
|
serial_tests: $(REF_FILES)
|
||||||
|
@echo ; echo " ---- Running serial tests ----" ; echo
|
||||||
|
@OMP_NUM_THREADS=1 ${QPACKAGE_ROOT}/scripts/run_tests.py
|
||||||
|
|
||||||
|
executables: $(wildcard *.irp.f) veryclean
|
||||||
|
$(MAKE) -C ..
|
||||||
|
|
||||||
|
%.ref: $(wildcard $(QPACKAGE_ROOT)/data/inputs/*.md5) executables
|
||||||
|
$(QPACKAGE_ROOT)/scripts/create_test_ref.sh $*
|
||||||
|
|
||||||
|
clean:
|
||||||
|
$(MAKE) -C .. clean
|
||||||
|
|
||||||
|
veryclean:
|
||||||
|
$(MAKE) -C .. veryclean
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
@ -2,7 +2,7 @@ default: all
|
|||||||
|
|
||||||
# Define here all new external source files and objects.Don't forget to prefix the
|
# Define here all new external source files and objects.Don't forget to prefix the
|
||||||
# object files with IRPF90_temp/
|
# object files with IRPF90_temp/
|
||||||
SRC=
|
SRC=map_module.f90
|
||||||
OBJ=
|
OBJ=IRPF90_temp/map_module.o
|
||||||
|
|
||||||
include $(QPACKAGE_ROOT)/src/Makefile.common
|
include $(QPACKAGE_ROOT)/src/Makefile.common
|
||||||
|
|||||||
640
src/Utils/map_module.f90
Normal file
640
src/Utils/map_module.f90
Normal file
@ -0,0 +1,640 @@
|
|||||||
|
module map_module
|
||||||
|
|
||||||
|
use omp_lib
|
||||||
|
|
||||||
|
integer, parameter :: integral_kind = 8
|
||||||
|
|
||||||
|
integer, parameter :: cache_key_kind = 2
|
||||||
|
integer, parameter :: cache_map_size_kind = 4
|
||||||
|
|
||||||
|
integer, parameter :: key_kind = 8
|
||||||
|
integer, parameter :: map_size_kind = 8
|
||||||
|
|
||||||
|
integer, parameter :: map_shift = -15
|
||||||
|
integer*8, parameter :: map_mask = ibset(0_8,15)-1_8
|
||||||
|
|
||||||
|
type cache_map_type
|
||||||
|
integer(cache_key_kind), pointer :: key(:)
|
||||||
|
real(integral_kind), pointer :: value(:)
|
||||||
|
logical :: sorted
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: map_size
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: n_elements
|
||||||
|
integer(omp_lock_kind) :: lock
|
||||||
|
end type cache_map_type
|
||||||
|
|
||||||
|
type map_type
|
||||||
|
type(cache_map_type), allocatable :: map(:)
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: map_size
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: n_elements
|
||||||
|
logical :: sorted
|
||||||
|
integer(omp_lock_kind) :: lock
|
||||||
|
end type map_type
|
||||||
|
|
||||||
|
end module map_module
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
real function map_mb(map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
use omp_lib
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(in) :: map
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: i
|
||||||
|
|
||||||
|
map_mb = 8+map_size_kind+map_size_kind+omp_lock_kind+4
|
||||||
|
do i=0,map%map_size
|
||||||
|
map_mb = map_mb + map%map(i)%map_size*(cache_key_kind+integral_kind) + &
|
||||||
|
8+8+4+cache_map_size_kind+cache_map_size_kind+omp_lock_kind
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
map_mb = map_mb / (1024.d0*1024.d0)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine cache_map_init(map,sze)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (cache_map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: sze
|
||||||
|
call omp_init_lock(map%lock)
|
||||||
|
call omp_set_lock(map%lock)
|
||||||
|
map%n_elements = 0_8
|
||||||
|
map%map_size = 0_8
|
||||||
|
map%sorted = .True.
|
||||||
|
NULLIFY(map%value, map%key)
|
||||||
|
call cache_map_reallocate(map,sze)
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%lock)
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_init(map,keymax)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer*8, intent(in) :: keymax
|
||||||
|
type (map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: i
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: sze
|
||||||
|
integer :: err
|
||||||
|
|
||||||
|
call omp_init_lock(map%lock)
|
||||||
|
call omp_set_lock(map%lock)
|
||||||
|
|
||||||
|
map%n_elements = 0_8
|
||||||
|
map%map_size = ishft(keymax,map_shift)
|
||||||
|
|
||||||
|
allocate(map%map(0_8:map%map_size),stat=err)
|
||||||
|
if (err /= 0) then
|
||||||
|
print *, 'Unable to allocate map'
|
||||||
|
stop 5
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
!sze = max(sqrt(map%map_size/16.d0),2048.d0)
|
||||||
|
sze = 2
|
||||||
|
do i=0_8,map%map_size
|
||||||
|
call cache_map_init(map%map(i),sze)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
map%sorted = .True.
|
||||||
|
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%lock)
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine cache_map_reallocate(map,sze)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), intent(in) :: sze
|
||||||
|
type (cache_map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
|
||||||
|
integer(cache_key_kind), pointer :: key_new(:)
|
||||||
|
real(integral_kind), pointer :: value_new(:)
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: i
|
||||||
|
integer :: err
|
||||||
|
!DIR$ ATTRIBUTES ALIGN : 64 :: key_new, value_new
|
||||||
|
|
||||||
|
if (sze < map%n_elements) then
|
||||||
|
print *, 'Unable to resize map : map too large'
|
||||||
|
stop 3
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
! Resize keys
|
||||||
|
allocate( key_new(sze), stat=err )
|
||||||
|
if (err /= 0) then
|
||||||
|
print *, 'Unable to allocate map', sze
|
||||||
|
stop 1
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if (associated(map%key)) then
|
||||||
|
do i=1_8,min(size(map%key),map%n_elements)
|
||||||
|
key_new(i) = map%key(i)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
deallocate(map%key)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
! Resize values
|
||||||
|
allocate( value_new(sze), stat=err )
|
||||||
|
if (err /= 0) then
|
||||||
|
print *, 'Unable to allocate map', sze
|
||||||
|
stop 2
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if (associated(map%value)) then
|
||||||
|
do i=1_8,min(size(map%key),map%n_elements)
|
||||||
|
value_new(i) = map%value(i)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
deallocate(map%value)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
! Set new pointers
|
||||||
|
map%key => key_new
|
||||||
|
map%value => value_new
|
||||||
|
map%map_size = sze
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine cache_map_deinit(map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (cache_map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: err
|
||||||
|
|
||||||
|
if (associated( map % value )) then
|
||||||
|
deallocate( map % value, stat=err )
|
||||||
|
if (err /= 0) then
|
||||||
|
print *, 'Unable to deallocate map'
|
||||||
|
stop 2
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
NULLIFY(map%value)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
if (associated( map % key )) then
|
||||||
|
deallocate( map % key, stat=err )
|
||||||
|
if (err /= 0) then
|
||||||
|
print *, 'Unable to deallocate map'
|
||||||
|
stop 4
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
NULLIFY(map%key)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
map%n_elements = 0_8
|
||||||
|
map%map_size = 0_8
|
||||||
|
call omp_destroy_lock(map%lock)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_deinit(map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer :: err
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: i
|
||||||
|
|
||||||
|
if (allocated( map % map )) then
|
||||||
|
do i=0_8, map%map_size
|
||||||
|
call cache_map_deinit(map%map(i))
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
deallocate( map % map, stat=err )
|
||||||
|
if (err /= 0) then
|
||||||
|
print *, 'Unable to deallocate map'
|
||||||
|
stop 6
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
map%n_elements = 0_8
|
||||||
|
map%map_size = 0_8
|
||||||
|
call omp_destroy_lock(map%lock)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine cache_map_sort(map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (cache_map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), allocatable :: iorder(:)
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: i
|
||||||
|
!DIR$ ATTRIBUTES ALIGN : 64 :: iorder
|
||||||
|
|
||||||
|
if (.not.map%sorted) then
|
||||||
|
allocate(iorder(map%n_elements))
|
||||||
|
do i=1,map%n_elements
|
||||||
|
iorder(i) = i
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
if (cache_key_kind == 2) then
|
||||||
|
call i2radix_sort(map%key,iorder,map%n_elements,-1)
|
||||||
|
else if (cache_key_kind == 4) then
|
||||||
|
call iradix_sort(map%key,iorder,map%n_elements,-1)
|
||||||
|
else if (cache_key_kind == 8) then
|
||||||
|
call i8radix_sort(map%key,iorder,map%n_elements,-1)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if (integral_kind == 4) then
|
||||||
|
call set_order(map%value,iorder,map%n_elements)
|
||||||
|
else if (integral_kind == 8) then
|
||||||
|
call dset_order(map%value,iorder,map%n_elements)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
deallocate(iorder)
|
||||||
|
map%sorted = .True.
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_sort(map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: i
|
||||||
|
|
||||||
|
if (.not.map%sorted) then
|
||||||
|
!$OMP PARALLEL DO SCHEDULE(static,1024) DEFAULT(SHARED) PRIVATE(i)
|
||||||
|
do i=0_8,map%map_size
|
||||||
|
call omp_set_lock(map%map(i)%lock)
|
||||||
|
call cache_map_sort(map%map(i))
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%map(i)%lock)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||||
|
map%sorted = .True.
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine cache_map_unique(map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (cache_map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer(cache_key_kind) :: prev_key
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: i, j
|
||||||
|
|
||||||
|
call cache_map_sort(map)
|
||||||
|
prev_key = -1_8
|
||||||
|
j=0
|
||||||
|
do i=1,map%n_elements
|
||||||
|
if (map%key(i) /= prev_key) then
|
||||||
|
j = j+1
|
||||||
|
map%value(j) = map%value(i)
|
||||||
|
map%key(j) = map%key(i)
|
||||||
|
prev_key = map%key(i)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
map%value(j) = map%value(j)+map%value(i)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
map%n_elements = j
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine cache_map_shrink(map,thr)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (cache_map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
real(integral_kind) , intent(in) :: thr
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: i,j
|
||||||
|
|
||||||
|
j=0
|
||||||
|
do i=1,map%n_elements
|
||||||
|
if (abs(map%value(i)) > thr) then
|
||||||
|
j = j+1
|
||||||
|
map%value(j) = map%value(i)
|
||||||
|
map%key(j) = map%key(i)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
map%n_elements = j
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_unique(map)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: i
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: icount
|
||||||
|
|
||||||
|
icount = 0_8
|
||||||
|
!$OMP PARALLEL DO SCHEDULE(dynamic,1000) DEFAULT(SHARED) PRIVATE(i) &
|
||||||
|
!$OMP REDUCTION(+:icount)
|
||||||
|
do i=0_8,map%map_size
|
||||||
|
call omp_set_lock(map%map(i)%lock)
|
||||||
|
call cache_map_unique(map%map(i))
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%map(i)%lock)
|
||||||
|
icount = icount + map%map(i)%n_elements
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||||
|
map%n_elements = icount
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_shrink(map,thr)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
type (map_type), intent(in) :: thr
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: i
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: icount
|
||||||
|
|
||||||
|
icount = 0_8
|
||||||
|
!$OMP PARALLEL DO SCHEDULE(dynamic,1000) DEFAULT(SHARED) PRIVATE(i) &
|
||||||
|
!$OMP REDUCTION(+:icount)
|
||||||
|
do i=0_8,map%map_size
|
||||||
|
call omp_set_lock(map%map(i)%lock)
|
||||||
|
call cache_map_shrink(map%map(i),thr)
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%map(i)%lock)
|
||||||
|
icount = icount + map%map(i)%n_elements
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
!$OMP END PARALLEL DO
|
||||||
|
map%n_elements = icount
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_update(map, key, value, sze, thr)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer, intent(in) :: sze
|
||||||
|
integer(key_kind), intent(inout) :: key(sze)
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(inout):: value(sze)
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(in) :: thr
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: i
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: idx_cache, idx_cache_new
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: idx
|
||||||
|
integer :: sze2
|
||||||
|
integer(cache_key_kind) :: cache_key
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: n_elements_temp
|
||||||
|
type (cache_map_type) :: local_map
|
||||||
|
logical :: map_sorted
|
||||||
|
|
||||||
|
sze2 = sze
|
||||||
|
map_sorted = .True.
|
||||||
|
|
||||||
|
n_elements_temp = 0_8
|
||||||
|
n_elements_temp = n_elements_temp + 1_8
|
||||||
|
do while (sze2>0)
|
||||||
|
i=1
|
||||||
|
do while (i<=sze)
|
||||||
|
if (key(i) /= 0_8) then
|
||||||
|
idx_cache = ishft(key(i),map_shift)
|
||||||
|
if (omp_test_lock(map%map(idx_cache)%lock)) then
|
||||||
|
local_map%key => map%map(idx_cache)%key
|
||||||
|
local_map%value => map%map(idx_cache)%value
|
||||||
|
local_map%sorted = map%map(idx_cache)%sorted
|
||||||
|
local_map%map_size = map%map(idx_cache)%map_size
|
||||||
|
local_map%n_elements = map%map(idx_cache)%n_elements
|
||||||
|
do
|
||||||
|
!DIR$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call search_key_big_interval(key(i),local_map%key, local_map%n_elements, idx, 1_8, local_map%n_elements)
|
||||||
|
if (idx > 0_8) then
|
||||||
|
local_map%value(idx) = local_map%value(idx) + value(i)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
! Assert that the map has a proper size
|
||||||
|
if (local_map%n_elements == local_map%map_size) then
|
||||||
|
call cache_map_unique(local_map)
|
||||||
|
call cache_map_reallocate(local_map, local_map%n_elements + local_map%n_elements)
|
||||||
|
call cache_map_shrink(local_map,thr)
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
cache_key = iand(key(i),map_mask)
|
||||||
|
local_map%n_elements = local_map%n_elements + 1_8
|
||||||
|
local_map%value(local_map%n_elements) = value(i)
|
||||||
|
local_map%key(local_map%n_elements) = cache_key
|
||||||
|
local_map%sorted = .False.
|
||||||
|
n_elements_temp = n_elements_temp + 1_8
|
||||||
|
endif ! idx > 0
|
||||||
|
key(i) = 0_8
|
||||||
|
i = i+1
|
||||||
|
sze2 = sze2-1
|
||||||
|
if (i>sze) then
|
||||||
|
i=1
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if ( (ishft(key(i),map_shift) /= idx_cache).or.(key(i)==0_8)) then
|
||||||
|
exit
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%key => local_map%key
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%value => local_map%value
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%sorted = local_map%sorted
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%n_elements = local_map%n_elements
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%map_size = local_map%map_size
|
||||||
|
map_sorted = map_sorted .and. local_map%sorted
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%map(idx_cache)%lock)
|
||||||
|
endif ! omp_test_lock
|
||||||
|
else
|
||||||
|
i=i+1
|
||||||
|
endif ! key = 0
|
||||||
|
enddo ! i
|
||||||
|
enddo ! sze2 > 0
|
||||||
|
call omp_set_lock(map%lock)
|
||||||
|
map%n_elements = map%n_elements + n_elements_temp
|
||||||
|
map%sorted = map%sorted .and. map_sorted
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%lock)
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_append(map, key, value, sze)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer, intent(in) :: sze
|
||||||
|
integer(key_kind), intent(inout) :: key(sze)
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(inout):: value(sze)
|
||||||
|
|
||||||
|
integer :: i
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: n_elements
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: idx_cache
|
||||||
|
integer(cache_key_kind) :: cache_key
|
||||||
|
|
||||||
|
do i=1,sze
|
||||||
|
idx_cache = ishft(key(i),map_shift)
|
||||||
|
call omp_set_lock(map%map(idx_cache)%lock)
|
||||||
|
n_elements = map%map(idx_cache)%n_elements + 1
|
||||||
|
! Assert that the map has a proper size
|
||||||
|
if (n_elements == map%map(idx_cache)%map_size) then
|
||||||
|
call cache_map_reallocate(map%map(idx_cache), n_elements+ ishft(n_elements,-1))
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
cache_key = iand(key(i),map_mask)
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%value(n_elements) = value(i)
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%key(n_elements) = cache_key
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%n_elements = n_elements
|
||||||
|
if (map%map(idx_cache)%sorted.and.n_elements > 1) then
|
||||||
|
map%map(idx_cache)%sorted = (map%map(idx_cache)%key(n_elements-1) <= cache_key)
|
||||||
|
map%sorted = map%sorted .and. map%map(idx_cache)%sorted
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%map(idx_cache)%lock)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
call omp_set_lock(map%lock)
|
||||||
|
map%n_elements = map%n_elements + sze
|
||||||
|
call omp_unset_lock(map%lock)
|
||||||
|
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_get(map, key, value)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(in) :: map
|
||||||
|
integer(key_kind), intent(in) :: key
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(out) :: value
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: idx_cache
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: idx
|
||||||
|
|
||||||
|
idx_cache = ishft(key,map_shift)
|
||||||
|
!DIR$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call cache_map_get_interval(map%map(idx_cache), key, value, 1, map%map(idx_cache)%n_elements,idx)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine cache_map_get_interval(map, key, value, ibegin, iend, idx)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (cache_map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer(key_kind), intent(in) :: key
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), intent(in) :: ibegin, iend
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(out) :: value
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), intent(in) :: idx
|
||||||
|
|
||||||
|
call search_key_big_interval(key,map%key, map%n_elements, idx, ibegin, iend)
|
||||||
|
if (idx > 0) then
|
||||||
|
value = map%value(idx)
|
||||||
|
else
|
||||||
|
value = 0.
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine map_get_many(map, key, value, sze)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
type (map_type), intent(inout) :: map
|
||||||
|
integer, intent(in) :: sze
|
||||||
|
integer(key_kind), intent(in) :: key(sze)
|
||||||
|
real(integral_kind), intent(out) :: value(sze)
|
||||||
|
integer :: i
|
||||||
|
integer(map_size_kind) :: idx_cache, idx_cache_prev
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: ibegin, iend
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), allocatable :: idx(:)
|
||||||
|
!DIR$ ATTRIBUTES ALIGN : 64 :: idx
|
||||||
|
|
||||||
|
allocate(idx(sze))
|
||||||
|
do i=1,sze
|
||||||
|
idx_cache = ishft(key(i),map_shift)
|
||||||
|
iend = map%map(idx_cache)%n_elements
|
||||||
|
!DIR$ FORCEINLINE
|
||||||
|
call search_key_big_interval(key(i),map%map(idx_cache)%key, iend, idx(i), 1, iend)
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
do i=1,sze
|
||||||
|
idx_cache = ishft(key(i),map_shift)
|
||||||
|
if (idx(i) > 0) then
|
||||||
|
value(i) = map%map(idx_cache)%value(idx(i))
|
||||||
|
else
|
||||||
|
value(i) = 0.
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
deallocate(idx)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine search_key_big(key,X,sze,idx)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), intent(in) :: sze
|
||||||
|
integer(key_kind) , intent(in) :: key
|
||||||
|
integer(cache_key_kind) , intent(in) :: X(sze)
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), intent(out) :: idx
|
||||||
|
|
||||||
|
call search_key_big_interval(key,X,sze,idx,1,sze)
|
||||||
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
subroutine search_key_big_interval(key,X,sze,idx,ibegin_in,iend_in)
|
||||||
|
use map_module
|
||||||
|
implicit none
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), intent(in) :: sze
|
||||||
|
integer(key_kind) , intent(in) :: key
|
||||||
|
integer(cache_key_kind) , intent(in) :: X(sze)
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), intent(in) :: ibegin_in, iend_in
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind), intent(out) :: idx
|
||||||
|
|
||||||
|
integer(cache_map_size_kind) :: istep, ibegin, iend, i
|
||||||
|
integer(cache_key_kind) :: cache_key
|
||||||
|
|
||||||
|
if (sze /= 0) then
|
||||||
|
continue
|
||||||
|
else
|
||||||
|
idx = -1
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
cache_key = iand(key,map_mask)
|
||||||
|
ibegin = min(ibegin_in,sze)
|
||||||
|
iend = min(iend_in,sze)
|
||||||
|
if ((cache_key > X(ibegin)) .and. (cache_key < X(iend))) then
|
||||||
|
|
||||||
|
istep = ishft(iend-ibegin,-1)
|
||||||
|
idx = ibegin + istep
|
||||||
|
do while (istep > 32)
|
||||||
|
idx = ibegin + istep
|
||||||
|
if (cache_key < X(idx)) then
|
||||||
|
iend = idx
|
||||||
|
istep = ishft(idx-ibegin,-1)
|
||||||
|
idx = ibegin + istep
|
||||||
|
if (cache_key < X(idx)) then
|
||||||
|
iend = idx
|
||||||
|
istep = ishft(idx-ibegin,-1)
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
else if (cache_key > X(idx)) then
|
||||||
|
ibegin = idx
|
||||||
|
istep = ishft(iend-idx,-1)
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
else
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
else if (cache_key > X(idx)) then
|
||||||
|
ibegin = idx
|
||||||
|
istep = ishft(iend-idx,-1)
|
||||||
|
idx = idx + istep
|
||||||
|
if (cache_key < X(idx)) then
|
||||||
|
iend = idx
|
||||||
|
istep = ishft(idx-ibegin,-1)
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
else if (cache_key > X(idx)) then
|
||||||
|
ibegin = idx
|
||||||
|
istep = ishft(iend-idx,-1)
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
else
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
else
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
enddo
|
||||||
|
idx = ibegin
|
||||||
|
if (min(iend_in,sze) > ibegin+64) then
|
||||||
|
iend = ibegin+64
|
||||||
|
!DIR$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
do while (cache_key > X(idx))
|
||||||
|
idx = idx+1
|
||||||
|
end do
|
||||||
|
else
|
||||||
|
!DIR$ VECTOR ALIGNED
|
||||||
|
do while (cache_key > X(idx))
|
||||||
|
idx = idx+1
|
||||||
|
if (idx /= iend) then
|
||||||
|
cycle
|
||||||
|
else
|
||||||
|
exit
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
end do
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if (cache_key /= X(idx)) then
|
||||||
|
idx = 1-idx
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
return
|
||||||
|
|
||||||
|
else
|
||||||
|
|
||||||
|
if (cache_key < X(ibegin)) then
|
||||||
|
idx = -ibegin
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if (cache_key > X(iend)) then
|
||||||
|
idx = -iend
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if (cache_key == X(ibegin)) then
|
||||||
|
idx = ibegin
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
|
||||||
|
if (cache_key == X(iend)) then
|
||||||
|
idx = iend
|
||||||
|
return
|
||||||
|
endif
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