mirror of
https://github.com/LCPQ/quantum_package
synced 2024-09-27 03:51:01 +02:00
commit
8d75b5b609
@ -2,14 +2,15 @@
|
||||
|
||||
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||
|
||||
function run_CIS() {
|
||||
thresh=5.e-9
|
||||
function run() {
|
||||
thresh=5.e-7
|
||||
test_exe cis || skip
|
||||
qp_edit -c $1
|
||||
ezfio set_file $1
|
||||
ezfio set determinants n_states 3
|
||||
ezfio set davidson threshold_davidson 1.e-10
|
||||
|
||||
ezfio set davidson threshold_davidson 1.e-12
|
||||
# echo "Write" > $1/mo_two_e_integrals/disk_access_mo_integrals
|
||||
qp_set_frozen_core $1
|
||||
qp_run cis $1
|
||||
energy1="$(ezfio get cis energy | tr '[]' ' ' | cut -d ',' -f 1)"
|
||||
energy2="$(ezfio get cis energy | tr '[]' ' ' | cut -d ',' -f 2)"
|
||||
@ -21,18 +22,95 @@ function run_CIS() {
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
#=== H2O
|
||||
|
||||
@test "qp_set_mo_class H2O cc-pVDZ" {
|
||||
qp_set_mo_class h2o.ezfio -core "[1]" -act "[2-12]" -del "[13-24]"
|
||||
@test "HBO" {
|
||||
run hbo.ezfio -100.018582307658 -99.6982685747284 -99.6982685747283
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "CIS H2O cc-pVDZ" {
|
||||
run_CIS h2o.ezfio -76.0270218693035 -75.6812512934229 -75.6174524564961
|
||||
@test "H2O" {
|
||||
run h2o.ezfio -76.0270218681105 -75.6854407469221 -75.6196755733432
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "CIS H2O VDZ pseudo" {
|
||||
qp_set_frozen_core h2o_pseudo.ezfio
|
||||
run_CIS h2o_pseudo.ezfio -16.9483703905542 -16.5790993717898 -16.5074569116264
|
||||
@test "[Cu(NH3)4]2+" {
|
||||
run cu_nh3_4_2plus.ezfio -1862.97958709248 -1862.92454796197 -1862.91130872182
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "C2H2" {
|
||||
run c2h2.ezfio -12.1214401949631 -11.86823108084437 -11.86823108084389
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "ClO" {
|
||||
run clo.ezfio -534.263560525680 -534.256601571199 -534.062020844428
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "DHNO" {
|
||||
run dhno.ezfio -130.447228845699 -130.357180876975 -130.219625729558
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "H3COH" {
|
||||
run h3coh.ezfio -114.986503059639 -114.649121836046 -114.578365912794
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "HCN" {
|
||||
run hcn.ezfio -92.8871750003801 -92.6089719727410 -92.6089719727409
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "N2" {
|
||||
run n2.ezfio -108.9834897853049 -108.6496539410780 -108.6496539410771
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SiH2_3B1" {
|
||||
run sih2_3b1.ezfio -289.952916622430 -289.901707301173 -289.715063453770
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SO" {
|
||||
run so.ezfio -25.7502241401925 -25.5862791897799 -25.5829342971276
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "CH4" {
|
||||
run ch4.ezfio -40.1996180778616 -39.7936150141939 -39.7936150141734
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "CO2" {
|
||||
run co2.ezfio -187.650710886151 -187.291641391714 -187.291641391713
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "F2" {
|
||||
run f2.ezfio -198.764357823385 -198.575548537096 -198.575548537096
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "HCO" {
|
||||
run hco.ezfio -113.094024225042 -113.002362525915 -112.894730863318
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "NH3" {
|
||||
run nh3.ezfio -56.2178342898186 -55.9199930723028 -55.8475617160862
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SiH3" {
|
||||
run sih3.ezfio -5.45916474249436 -5.23512810272682 -5.23512806272007
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "ClF" {
|
||||
run clf.ezfio -558.844257066356 -558.664418728406 -558.664418728405
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "H2O2" {
|
||||
run h2o2.ezfio -150.780660847001 -150.546208866263 -150.483274551717
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "H2S" {
|
||||
run h2s.ezfio -398.694413042222 -398.447164835271 -398.412784774083
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "N2H4" {
|
||||
run n2h4.ezfio -111.179991667947 -110.894116344878 -110.855788839735
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "OH" {
|
||||
run oh.ezfio -75.4314648243896 -75.4254639668256 -75.2707675632313
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SO2" {
|
||||
run so2.ezfio -41.5580019075504 -41.3823293845389 -41.3551232664878
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
@ -3,101 +3,101 @@
|
||||
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||
|
||||
function run {
|
||||
INPUT=$1
|
||||
EZ=${INPUT/.xyz/.ezfio}
|
||||
EZ=${EZ/.zmt/.ezfio}
|
||||
MULT=$2
|
||||
CHARGE=$3
|
||||
BASIS=$4
|
||||
local INPUT=$1
|
||||
local EZ=${INPUT/.xyz/.ezfio}
|
||||
local EZ=${EZ/.zmt/.ezfio}
|
||||
local MULT=$2
|
||||
local CHARGE=$3
|
||||
local BASIS=$4
|
||||
if [[ -n $5 ]] ; then
|
||||
PSEUDO="-p $5"
|
||||
local PSEUDO="-p $5"
|
||||
fi
|
||||
cp ${QP_ROOT}/tests/input/$INPUT .
|
||||
rm -rf $EZ
|
||||
qp_create_ezfio_from_xyz \
|
||||
$INPUT -b "$BASIS" -m $MULT -c $CHARGE $PSEUDO -o $EZ
|
||||
qp_edit -c $EZ
|
||||
echo "Write" > ${EZ}/ao_two_e_integrals/disk_access_ao_integrals
|
||||
# echo "Write" > ${EZ}/ao_two_e_integrals/disk_access_ao_integrals
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
@test "qp_create c2h2.xyz" {
|
||||
@test "C2H2" {
|
||||
run c2h2.xyz 1 0 vdz-bfd bfd
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create clo.xyz" {
|
||||
@test "ClO" {
|
||||
run clo.xyz 2 0 cc-pvdz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create dhno.xyz" {
|
||||
run dhno.xyz 2 0 chipman-dzp
|
||||
@test "DHNO" {
|
||||
run dhno.xyz 2 0 "chipman-dzp"
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create h3coh.xyz" {
|
||||
@test "H3COH" {
|
||||
run h3coh.xyz 1 0 6-31g
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create hcn.xyz" {
|
||||
@test "HCN" {
|
||||
run hcn.xyz 1 0 aug-cc-pvdz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create n2.xyz" {
|
||||
@test "N2" {
|
||||
run n2.xyz 1 0 cc-pvtz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create sih2_3b1.xyz" {
|
||||
@test "SiH2_3B1" {
|
||||
run sih2_3b1.xyz 1 0 6-31g
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create so.xyz" {
|
||||
@test "SO" {
|
||||
run so.xyz 3 0 vdz-bfd bfd
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create ch4.xyz" {
|
||||
run ch4.xyz 1 0 aug-cc-pvtz
|
||||
@test "CH4" {
|
||||
run ch4.xyz 1 0 aug-cc-pvdz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create co2.xyz" {
|
||||
@test "CO2" {
|
||||
run co2.xyz 1 0 cc-pvdz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create f2.zmt" {
|
||||
@test "F2" {
|
||||
run f2.zmt 1 0 "Def2-TZVP"
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create hco.xyz" {
|
||||
@test "HCO" {
|
||||
run hco.xyz 2 0 "Ahlrichs VDZ"
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create nh3.xyz" {
|
||||
run nh3.xyz 1 0 cc-pvdz
|
||||
@test "NH3" {
|
||||
run nh3.xyz 1 0 cc-pvtz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create sih3.xyz" {
|
||||
@test "SiH3" {
|
||||
run sih3.xyz 2 0 vdz-bfd bfd
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create clf.xyz" {
|
||||
@test "ClF" {
|
||||
run clf.xyz 1 0 cc-pvdz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create h2o2.zmt" {
|
||||
@test "H2O2" {
|
||||
run h2o2.zmt 1 0 cc-pvdz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create h2s.xyz" {
|
||||
@test "H2S" {
|
||||
run h2s.xyz 1 0 cc-pvdz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create n2h4.zmt" {
|
||||
@test "N2H4" {
|
||||
run n2h4.zmt 1 0 cc-pvdz
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create oh.xyz" {
|
||||
@test "OH" {
|
||||
run oh.xyz 2 0 "Roos Augmented Double Zeta ANO"
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "qp_create so2.xyz" {
|
||||
@test "SO2" {
|
||||
run so2.xyz 1 0 vtz-bfd bfd
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
@ -3,23 +3,22 @@
|
||||
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||
|
||||
function run {
|
||||
INPUT=$1
|
||||
EZ=$2
|
||||
local INPUT=$1
|
||||
local EZ=$2
|
||||
cp ${QP_ROOT}/tests/input/$INPUT .
|
||||
qp_convert_output_to_ezfio $INPUT -o $EZ
|
||||
qp_edit -c $EZ
|
||||
echo "Write" > ${EZ}/ao_two_e_integrals/disk_access_ao_integrals
|
||||
}
|
||||
|
||||
#=== Convert
|
||||
@test "gamess convert hbo.gms.out" {
|
||||
@test "HBO GAMESS" {
|
||||
run hbo.gms.out hbo.ezfio
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "g09 convert h2o.log" {
|
||||
@test "H2O G09" {
|
||||
run h2o.log h2o.ezfio
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "gamess convert cu_nh3_4_2plus.gms.out" {
|
||||
@test "[Cu(NH3)4]2+ GAMESS" {
|
||||
run cu_nh3_4_2plus.gms.out cu_nh3_4_2plus.ezfio
|
||||
}
|
||||
|
@ -16,20 +16,95 @@ function run() {
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@test "SCF HBO" {
|
||||
@test "HBO" {
|
||||
run hbo.ezfio -100.018582259096
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SCF H2O" {
|
||||
@test "H2O" {
|
||||
run h2o.ezfio -0.760270218692179E+02
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SCF H2O" {
|
||||
@test "[Cu(NH3)4]2+" {
|
||||
run cu_nh3_4_2plus.ezfio -1862.97590388214
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SCF DHNO chipman-dzp" {
|
||||
@test "C2H2" {
|
||||
run c2h2.ezfio -12.12144019495306
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "ClO" {
|
||||
run clo.ezfio -534.2496714154559
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "DHNO" {
|
||||
run dhno.ezfio -130.4278777822
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "H3COH" {
|
||||
run h3coh.ezfio -114.9865030596373
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "HCN" {
|
||||
run hcn.ezfio -92.88717500035233
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "N2" {
|
||||
run n2.ezfio -108.9834897852979
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SiH2_3B1" {
|
||||
run sih2_3b1.ezfio -289.9529166224221
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SO" {
|
||||
run so.ezfio -25.71752633718843
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "CH4" {
|
||||
run ch4.ezfio -40.19961807784367
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "CO2" {
|
||||
run co2.ezfio -187.6507108861204
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "F2" {
|
||||
run f2.ezfio -198.7643578233773
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "HCO" {
|
||||
run hco.ezfio -113.0862778269114
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "NH3" {
|
||||
run nh3.ezfio -56.21783428976567
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SiH3" {
|
||||
run sih3.ezfio -5.455398769158780
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "ClF" {
|
||||
run clf.ezfio -558.8442570663570
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "H2O2" {
|
||||
run h2o2.ezfio -150.7806608469964
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "H2S" {
|
||||
run h2s.ezfio -398.6944130421982
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "N2H4" {
|
||||
run n2h4.ezfio -111.1799916679009
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "OH" {
|
||||
run oh.ezfio -75.42025413469165
|
||||
}
|
||||
|
||||
@test "SO2" {
|
||||
run so2.ezfio -41.55800190733211
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
@ -2,5 +2,4 @@
|
||||
type: Threshold
|
||||
doc: Energy HF
|
||||
interface: ezfio
|
||||
default: 0.
|
||||
|
||||
|
@ -20,7 +20,7 @@
|
||||
if (do_direct_integrals) then
|
||||
|
||||
!$OMP PARALLEL DEFAULT(NONE) &
|
||||
!$OMP PRIVATE(i,j,l,k1,k,integral,ii,jj,kk,ll,i8,keys,values,p,q,r,s,i0,j0,k0,l0, &
|
||||
!$OMP PRIVATE(i,j,l,k1,k,integral,ii,jj,kk,ll,keys,values,p,q,r,s,i0,j0,k0,l0, &
|
||||
!$OMP ao_bi_elec_integral_alpha_tmp,ao_bi_elec_integral_beta_tmp, c0, c1, c2, &
|
||||
!$OMP local_threshold)&
|
||||
!$OMP SHARED(ao_num,SCF_density_matrix_ao_alpha,SCF_density_matrix_ao_beta,&
|
||||
@ -34,7 +34,7 @@
|
||||
ao_bi_elec_integral_beta_tmp = 0.d0
|
||||
|
||||
q = ao_num*ao_num*ao_num*ao_num
|
||||
!$OMP DO SCHEDULE(dynamic)
|
||||
!$OMP DO SCHEDULE(static,1)
|
||||
do p=1_8,q
|
||||
call bielec_integrals_index_reverse(kk,ii,ll,jj,p)
|
||||
if ( (kk(1)>ao_num).or. &
|
||||
@ -100,7 +100,7 @@
|
||||
PROVIDE ao_bielec_integrals_in_map
|
||||
|
||||
integer(omp_lock_kind) :: lck(ao_num)
|
||||
integer*8 :: i8
|
||||
integer(map_size_kind) :: i8
|
||||
integer :: ii(8), jj(8), kk(8), ll(8), k2
|
||||
integer(cache_map_size_kind) :: n_elements_max, n_elements
|
||||
integer(key_kind), allocatable :: keys(:)
|
||||
@ -120,7 +120,6 @@
|
||||
ao_bi_elec_integral_beta_tmp = 0.d0
|
||||
|
||||
!$OMP DO SCHEDULE(static,1)
|
||||
!DIR$ NOVECTOR
|
||||
do i8=0_8,ao_integrals_map%map_size
|
||||
n_elements = n_elements_max
|
||||
call get_cache_map(ao_integrals_map,i8,keys,values,n_elements)
|
||||
@ -144,10 +143,12 @@
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
enddo
|
||||
!$OMP END DO NOWAIT
|
||||
!$OMP END DO
|
||||
!$OMP BARRIER
|
||||
!$OMP CRITICAL
|
||||
ao_bi_elec_integral_alpha += ao_bi_elec_integral_alpha_tmp
|
||||
!$OMP END CRITICAL
|
||||
!$OMP BARRIER
|
||||
!$OMP CRITICAL
|
||||
ao_bi_elec_integral_beta += ao_bi_elec_integral_beta_tmp
|
||||
!$OMP END CRITICAL
|
||||
|
@ -26,7 +26,7 @@ default: 500
|
||||
type: Positive_float
|
||||
doc: Energy shift on the virtual MOs to improve SCF convergence
|
||||
interface: ezfio,provider,ocaml
|
||||
default: 0.1
|
||||
default: 0.
|
||||
|
||||
[scf_algorithm]
|
||||
type: character*(32)
|
||||
|
@ -110,7 +110,11 @@ END_DOC
|
||||
do while (Delta_energy_SCF .ge. 0.d0)
|
||||
mo_coef(1:ao_num,1:mo_tot_num) = mo_coef_save
|
||||
TOUCH mo_coef
|
||||
level_shift = level_shift * 2.0d0
|
||||
if (level_shift <= 0.d0) then
|
||||
level_shift = 1.d0
|
||||
else
|
||||
level_shift = level_shift * 2.0d0
|
||||
endif
|
||||
mo_coef(1:ao_num,1:mo_tot_num) = eigenvectors_Fock_matrix_MO(1:ao_num,1:mo_tot_num)
|
||||
if(no_oa_or_av_opt)then
|
||||
call reorder_active_orb
|
||||
|
Loading…
Reference in New Issue
Block a user