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synced 2024-08-25 05:51:46 +02:00
Documentation
This commit is contained in:
parent
cd418ee484
commit
42490c6e30
@ -3,11 +3,12 @@ BiInts Module
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=============
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||||
Here, all bi-electronic integrals (:math:`1/r_{12}`) are computed. As they have
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4 indices and many are zero, they are stored in a map.
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||||
To fetch an AO integral, use the ``get_ao_bielec_integral(i,j,k,l,ao_integrals_map)``
|
||||
4 indices and many are zero, they are stored in a map, as defined in
|
||||
``Utils/map_module.f90``. To fetch an AO integral, use the
|
||||
``get_ao_bielec_integral(i,j,k,l,ao_integrals_map)`` function, and to fetch and
|
||||
MO integral, use ``get_mo_bielec_integral(i,j,k,l,mo_integrals_map)`` or
|
||||
``mo_bielec_integral(i,j,k,l)``.
|
||||
|
||||
function, and to fetch and MO integral, use
|
||||
.
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||||
Needed Modules
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==============
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||||
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@ -1,424 +0,0 @@
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||||
data = {
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||||
'AlCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Al.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Al+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'AlH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'AlH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'AlH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BeCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Be.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Be+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BeF.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BeH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BeH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BeO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BeOH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BeS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'B.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'B+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'BS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H3+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H4.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H4+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H5.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H6.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C2H.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'C+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CF.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH2_1A1.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH2_3B1.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH2-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH3-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH4.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH4+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Cl2-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Cl2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Cl2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Cl-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Cl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Cl+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'ClH2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'ClH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'ClH+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'ClS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'ClSiH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CN-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CN.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CO2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CO+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'COS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CP.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CS2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CS+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'CSi.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'F2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FAl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FCl+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'F-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'F.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'F+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FH+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FMg.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FNa.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FP.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FSi.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'FSiH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H2CNH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H2CO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H2CPH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H2CS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H2NNH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H2PPH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H3CCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H3CF.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H3CNH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H3COH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H3CSH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H3SiSiH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HBO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HBS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HCF.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HCN.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HCO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HCP.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'H.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HNO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HOCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HOF.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HOMg.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HONa.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HOO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HOOH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'HSSH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Li2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'LiCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Li.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Li+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'LiF.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'LiH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'LiN.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'LiO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'LiOH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'MgCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Mg.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Mg+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'MgH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'MgS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'N2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'N2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Na2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NaCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Na.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Na+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NaH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'N.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'N+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NF.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NH2-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NH3+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NH4+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NH-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NO-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NO.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NP.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'NSi.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O2Cl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O2-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O2S.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O2Si.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'O+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OH2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OH3+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OH-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OH+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OMg.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'ONa.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OP-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OP.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OPH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'OSi.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'P2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'P2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'P-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'P.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PH2-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PH2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PH3+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PH4+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PH-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'PS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'S2-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'S2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'S-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'S.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'S+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SH2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SH2+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SH3+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SH-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SH+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Si2.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiCl.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Si-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'Si.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH2_1A1.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH2_3B1.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH2-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH3-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH3.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH4.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH4+.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH-.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiH.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
'SiS.ezfio' : {
|
||||
},
|
||||
}
|
@ -91,7 +91,12 @@ subroutines or functions. This enables the possibility easily use the programs
|
||||
with pipes.
|
||||
|
||||
To print, you should write in an output file provided by the ``Output``
|
||||
module.
|
||||
module. Every module has its own output file. Before printing something,
|
||||
a timestamp should be put in the output with the ``write_time`` function.
|
||||
This allows an external script to read all the pieces of the output files
|
||||
and put them in a sequential order. The format of the output should be
|
||||
in ReStructured Text for easy transformation of the output data to pdf,
|
||||
HTML, man, etc.
|
||||
|
||||
|
||||
Creating a shell script
|
||||
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