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synced 2024-12-23 04:43:50 +01:00
Fixed tests
This commit is contained in:
parent
a10c1f144b
commit
2b5c93a58a
@ -273,7 +273,7 @@ subroutine H_apply_dressed_pert_monoexc(key_in, hole_1,particl_1,i_generator,ipr
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|||||||
integer,parameter :: size_max = 3072
|
integer,parameter :: size_max = 3072
|
||||||
|
|
||||||
integer, intent(in) :: Ndet_generators
|
integer, intent(in) :: Ndet_generators
|
||||||
double precision, intent(in) :: E_ref
|
double precision, intent(inout) :: E_ref
|
||||||
double precision, intent(inout) :: delta_ij_generators_(Ndet_generators,Ndet_generators)
|
double precision, intent(inout) :: delta_ij_generators_(Ndet_generators,Ndet_generators)
|
||||||
integer(bit_kind), intent(in) :: psi_det_generators_input(N_int,2,Ndet_generators)
|
integer(bit_kind), intent(in) :: psi_det_generators_input(N_int,2,Ndet_generators)
|
||||||
|
|
||||||
@ -438,7 +438,7 @@ subroutine H_apply_dressed_pert(delta_ij_generators_, Ndet_generators,psi_det_g
|
|||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
integer, intent(in) :: Ndet_generators
|
integer, intent(in) :: Ndet_generators
|
||||||
double precision, intent(in) :: E_ref
|
double precision, intent(inout) :: E_ref
|
||||||
double precision, intent(inout) :: delta_ij_generators_(Ndet_generators,Ndet_generators)
|
double precision, intent(inout) :: delta_ij_generators_(Ndet_generators,Ndet_generators)
|
||||||
integer(bit_kind), intent(in) :: psi_det_generators_input(N_int,2,Ndet_generators)
|
integer(bit_kind), intent(in) :: psi_det_generators_input(N_int,2,Ndet_generators)
|
||||||
|
|
||||||
|
|||||||
@ -1 +1 @@
|
|||||||
Perturbation Selectors_no_sorted Hartree_Fock Davidson
|
Perturbation Selectors_no_sorted Hartree_Fock Davidson CISD
|
||||||
|
|||||||
@ -15,11 +15,10 @@ subroutine routine
|
|||||||
call diagonalize_CI
|
call diagonalize_CI
|
||||||
call test_hcc
|
call test_hcc
|
||||||
call test_mulliken
|
call test_mulliken
|
||||||
! call SC2_1h1p(psi_det,psi_coef,energies, &
|
|
||||||
! diag_H_elements,size(psi_coef,1),N_det,N_states_diag,N_int,threshold_convergence_SC2)
|
|
||||||
allocate(H_matrix(N_det,N_det))
|
allocate(H_matrix(N_det,N_det))
|
||||||
call SC2_1h1p_full(psi_det,psi_coef,energies, &
|
stop 'SC2_1h1p_full is not in the git!'
|
||||||
H_matrix,size(psi_coef,1),N_det,N_states_diag,N_int,threshold_convergence_SC2)
|
! call SC2_1h1p_full(psi_det,psi_coef,energies, &
|
||||||
|
! H_matrix,size(psi_coef,1),N_det,N_states_diag,N_int,threshold_convergence_SC2)
|
||||||
deallocate(H_matrix)
|
deallocate(H_matrix)
|
||||||
integer :: i,j
|
integer :: i,j
|
||||||
double precision :: accu,coef_hf
|
double precision :: accu,coef_hf
|
||||||
|
|||||||
34
plugins/MRCC_CASSD/.gitignore
vendored
34
plugins/MRCC_CASSD/.gitignore
vendored
@ -1,34 +0,0 @@
|
|||||||
# Automatically created by $QP_ROOT/scripts/module/module_handler.py
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||||||
.ninja_deps
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.ninja_log
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AO_Basis
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Bitmask
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||||||
Determinants
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||||||
Electrons
|
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||||||
Ezfio_files
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||||||
Generators_full
|
|
||||||
Hartree_Fock
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||||||
IRPF90_man
|
|
||||||
IRPF90_temp
|
|
||||||
Integrals_Bielec
|
|
||||||
Integrals_Monoelec
|
|
||||||
MOGuess
|
|
||||||
MO_Basis
|
|
||||||
MRCC_Utils
|
|
||||||
Makefile
|
|
||||||
Makefile.depend
|
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||||||
Nuclei
|
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||||||
Perturbation
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Properties
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Pseudo
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Psiref_CAS
|
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||||||
Psiref_Utils
|
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||||||
Selectors_full
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||||||
Utils
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||||||
ZMQ
|
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||||||
ezfio_interface.irp.f
|
|
||||||
irpf90.make
|
|
||||||
irpf90_entities
|
|
||||||
mrcc_cassd
|
|
||||||
mrcc_noiter
|
|
||||||
tags
|
|
||||||
@ -1,17 +0,0 @@
|
|||||||
[energy]
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||||||
type: double precision
|
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||||||
doc: Calculated energy
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||||||
interface: ezfio
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||||||
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||||||
[thresh_mrcc]
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||||||
type: Threshold
|
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doc: Threshold on the convergence of the MRCC energy
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||||||
interface: ezfio,provider,ocaml
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||||||
default: 1.e-5
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||||||
|
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||||||
[n_it_mrcc_max]
|
|
||||||
type: Strictly_positive_int
|
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||||||
doc: Maximum number of MRCC iterations
|
|
||||||
interface: ezfio,provider,ocaml
|
|
||||||
default: 10
|
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||||||
|
|
||||||
@ -1 +0,0 @@
|
|||||||
Perturbation Selectors_full Generators_full Psiref_CAS MRCC_Utils
|
|
||||||
@ -1,80 +0,0 @@
|
|||||||
===========
|
|
||||||
MRCC Module
|
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||||||
===========
|
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||||||
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||||||
MRCC as a coupled cluster on a CAS+SD wave function.
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||||||
Needed Modules
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==============
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.. Do not edit this section. It was auto-generated from the
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.. by the `update_README.py` script.
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||||||
.. image:: tree_dependency.png
|
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||||||
* `Perturbation <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Perturbation>`_
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||||||
* `Selectors_full <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Selectors_full>`_
|
|
||||||
* `Generators_full <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Generators_full>`_
|
|
||||||
* `Psiref_CAS <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/Psiref_CAS>`_
|
|
||||||
* `MRCC_Utils <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/MRCC_Utils>`_
|
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||||||
|
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||||||
Documentation
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||||||
=============
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.. Do not edit this section. It was auto-generated from the
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.. by the `update_README.py` script.
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||||||
`mrcc <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/MRCC_CASSD/mrcc_cassd.irp.f#L1>`_
|
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Undocumented
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||||||
`print_cas_coefs <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/src/MRCC_CASSD/mrcc_cassd.irp.f#L11>`_
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||||||
Undocumented
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|
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||||||
Needed Modules
|
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==============
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.. Do not edit this section It was auto-generated
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.. by the `update_README.py` script.
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||||||
.. image:: tree_dependency.png
|
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||||||
* `Perturbation <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/Perturbation>`_
|
|
||||||
* `Selectors_full <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/Selectors_full>`_
|
|
||||||
* `Generators_full <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/Generators_full>`_
|
|
||||||
* `Psiref_CAS <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/Psiref_CAS>`_
|
|
||||||
* `MRCC_Utils <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/MRCC_Utils>`_
|
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||||||
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||||||
Documentation
|
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=============
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||||||
.. Do not edit this section It was auto-generated
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.. by the `update_README.py` script.
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||||||
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||||||
`mrcc <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/MRCC_CASSD/mrcc_cassd.irp.f#L1>`_
|
|
||||||
Undocumented
|
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||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
`mrcc_noiter <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/MRCC_CASSD/mrcc_noiter.irp.f#L1>`_
|
|
||||||
Undocumented
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
`n_it_mrcc_max <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/MRCC_CASSD/ezfio_interface.irp.f#L6>`_
|
|
||||||
Maximum number of MRCC iterations
|
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||||||
|
|
||||||
|
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||||||
`print_cas_coefs <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/MRCC_CASSD/mrcc_noiter.irp.f#L78>`_
|
|
||||||
Undocumented
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
`run <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/MRCC_CASSD/mrcc_noiter.irp.f#L17>`_
|
|
||||||
Undocumented
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
`run_pt2 <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/MRCC_CASSD/mrcc_noiter.irp.f#L36>`_
|
|
||||||
Undocumented
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
`thresh_mrcc <http://github.com/LCPQ/quantum_package/tree/master/plugins/MRCC_CASSD/ezfio_interface.irp.f#L25>`_
|
|
||||||
Threshold on the convergence of the MRCC energy
|
|
||||||
|
|
||||||
@ -1,120 +0,0 @@
|
|||||||
program mrcc
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
double precision, allocatable :: energy(:)
|
|
||||||
allocate (energy(N_states))
|
|
||||||
|
|
||||||
read_wf = .True.
|
|
||||||
SOFT_TOUCH read_wf
|
|
||||||
call print_cas_coefs
|
|
||||||
call set_generators_bitmasks_as_holes_and_particles
|
|
||||||
call run(N_states,energy)
|
|
||||||
if(do_pt2_end)then
|
|
||||||
call run_pt2(N_states,energy)
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
deallocate(energy)
|
|
||||||
end
|
|
||||||
|
|
||||||
subroutine run(N_st,energy)
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
|
|
||||||
integer, intent(in) :: N_st
|
|
||||||
double precision, intent(out) :: energy(N_st)
|
|
||||||
|
|
||||||
integer :: i
|
|
||||||
|
|
||||||
double precision :: E_new, E_old, delta_e
|
|
||||||
integer :: iteration
|
|
||||||
double precision :: E_past(4), lambda
|
|
||||||
E_new = 0.d0
|
|
||||||
delta_E = 1.d0
|
|
||||||
iteration = 0
|
|
||||||
lambda = 1.d0
|
|
||||||
do while (delta_E > thresh_mrcc)
|
|
||||||
iteration += 1
|
|
||||||
print *, '==========================='
|
|
||||||
print *, 'MRCC Iteration', iteration
|
|
||||||
print *, '==========================='
|
|
||||||
print *, ''
|
|
||||||
E_old = sum(ci_energy_dressed(1:N_st))
|
|
||||||
call write_double(6,ci_energy_dressed(1),"MRCC energy")
|
|
||||||
call diagonalize_ci_dressed(lambda)
|
|
||||||
E_new = sum(ci_energy_dressed(1:N_st))
|
|
||||||
delta_E = dabs(E_new - E_old)
|
|
||||||
call save_wavefunction
|
|
||||||
call ezfio_set_mrcc_cassd_energy(ci_energy_dressed(1))
|
|
||||||
if (iteration > n_it_mrcc_max) then
|
|
||||||
exit
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
call write_double(6,ci_energy_dressed(1),"Final MRCC energy")
|
|
||||||
energy(1:N_st) = ci_energy_dressed(1:N_st)
|
|
||||||
|
|
||||||
end
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
subroutine run_pt2(N_st,energy)
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
integer :: i,j,k
|
|
||||||
double precision, allocatable :: pt2(:), norm_pert(:), H_pert_diag(:)
|
|
||||||
integer, intent(in) :: N_st
|
|
||||||
double precision, intent(in) :: energy(N_st)
|
|
||||||
allocate (pt2(N_st), norm_pert(N_st),H_pert_diag(N_st))
|
|
||||||
pt2 = 0.d0
|
|
||||||
|
|
||||||
print*,'Last iteration only to compute the PT2'
|
|
||||||
threshold_selectors = 1.d0
|
|
||||||
threshold_generators = 0.999d0
|
|
||||||
|
|
||||||
N_det_generators = lambda_mrcc_pt2(0) + N_det_cas
|
|
||||||
do i=1,N_det_cas
|
|
||||||
do k=1,N_int
|
|
||||||
psi_det_generators(k,1,i) = psi_ref(k,1,i)
|
|
||||||
psi_det_generators(k,2,i) = psi_ref(k,2,i)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
do k=1,N_st
|
|
||||||
psi_coef_generators(i,k) = psi_ref_coef(i,k)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
do i=N_det_cas+1,N_det_generators
|
|
||||||
j = lambda_mrcc_pt2(i)
|
|
||||||
do k=1,N_int
|
|
||||||
psi_det_generators(k,1,i) = psi_non_ref(k,1,j)
|
|
||||||
psi_det_generators(k,2,i) = psi_non_ref(k,2,j)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
do k=1,N_st
|
|
||||||
psi_coef_generators(i,k) = psi_non_ref_coef(j,k)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
SOFT_TOUCH N_det_generators psi_det_generators psi_coef_generators ci_eigenvectors_dressed ci_eigenvectors_s2_dressed ci_electronic_energy_dressed
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
call H_apply_mrcc_PT2(pt2, norm_pert, H_pert_diag, N_st)
|
|
||||||
print *, 'Final step'
|
|
||||||
print *, 'N_det = ', N_det
|
|
||||||
print *, 'N_states = ', N_states
|
|
||||||
print *, 'PT2 = ', pt2
|
|
||||||
print *, 'E = ', energy
|
|
||||||
print *, 'E+PT2 = ', energy+pt2
|
|
||||||
print *, '-----'
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
call ezfio_set_full_ci_energy_pt2(energy+pt2)
|
|
||||||
deallocate(pt2,norm_pert)
|
|
||||||
|
|
||||||
end
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
subroutine print_cas_coefs
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
|
|
||||||
integer :: i,j
|
|
||||||
print *, 'CAS'
|
|
||||||
print *, '==='
|
|
||||||
do i=1,N_det_cas
|
|
||||||
print *, psi_cas_coef(i,:)
|
|
||||||
call debug_det(psi_cas(1,1,i),N_int)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
call write_double(6,ci_energy(1),"Initial CI energy")
|
|
||||||
|
|
||||||
end
|
|
||||||
|
|
||||||
@ -1,91 +0,0 @@
|
|||||||
program mrcc_noiter
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
double precision, allocatable :: energy(:)
|
|
||||||
allocate (energy(N_states))
|
|
||||||
read_wf = .True.
|
|
||||||
threshold_generators = .9999d0
|
|
||||||
SOFT_TOUCH read_wf threshold_generators
|
|
||||||
call print_cas_coefs
|
|
||||||
call set_generators_bitmasks_as_holes_and_particles
|
|
||||||
call run(N_states,energy)
|
|
||||||
if(do_pt2_end)then
|
|
||||||
call run_pt2(N_states,energy)
|
|
||||||
endif
|
|
||||||
deallocate(energy)
|
|
||||||
end
|
|
||||||
|
|
||||||
subroutine run(N_st,energy)
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
|
|
||||||
integer, intent(in) :: N_st
|
|
||||||
double precision, intent(out) :: energy(N_st)
|
|
||||||
integer :: i,j
|
|
||||||
do j=1,N_states_diag
|
|
||||||
do i=1,N_det
|
|
||||||
psi_coef(i,j) = CI_eigenvectors_dressed(i,j)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
SOFT_TOUCH psi_coef ci_energy_dressed
|
|
||||||
call write_double(6,ci_energy_dressed(1),"Final MRCC energy")
|
|
||||||
call ezfio_set_mrcc_cassd_energy(ci_energy_dressed(1))
|
|
||||||
call save_wavefunction
|
|
||||||
energy(:) = ci_energy_dressed(:)
|
|
||||||
end
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
subroutine run_pt2(N_st,energy)
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
integer :: i,j,k
|
|
||||||
double precision, allocatable :: pt2(:), norm_pert(:), H_pert_diag(:)
|
|
||||||
integer, intent(in) :: N_st
|
|
||||||
double precision, intent(in) :: energy(N_st)
|
|
||||||
allocate (pt2(N_st), norm_pert(N_st),H_pert_diag(N_st))
|
|
||||||
pt2 = 0.d0
|
|
||||||
|
|
||||||
print*,'Last iteration only to compute the PT2'
|
|
||||||
threshold_selectors = 1.d0
|
|
||||||
threshold_generators = 0.999d0
|
|
||||||
|
|
||||||
N_det_generators = lambda_mrcc_pt2(0)
|
|
||||||
do i=1,N_det_generators
|
|
||||||
j = lambda_mrcc_pt2(i)
|
|
||||||
do k=1,N_int
|
|
||||||
psi_det_generators(k,1,i) = psi_non_ref(k,1,j)
|
|
||||||
psi_det_generators(k,2,i) = psi_non_ref(k,2,j)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
do k=1,N_st
|
|
||||||
psi_coef_generators(i,k) = psi_non_ref_coef(j,k)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
SOFT_TOUCH N_det_generators psi_det_generators psi_coef_generators ci_eigenvectors_dressed ci_eigenvectors_s2_dressed ci_electronic_energy_dressed
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
call H_apply_mrcc_PT2(pt2, norm_pert, H_pert_diag, N_st)
|
|
||||||
print *, 'Final step'
|
|
||||||
print *, 'N_det = ', N_det
|
|
||||||
print *, 'N_states = ', N_states
|
|
||||||
print *, 'PT2 = ', pt2
|
|
||||||
print *, 'E = ', energy
|
|
||||||
print *, 'E+PT2 = ', energy+pt2
|
|
||||||
print *, '-----'
|
|
||||||
|
|
||||||
call ezfio_set_full_ci_energy_pt2(energy+pt2)
|
|
||||||
deallocate(pt2,norm_pert)
|
|
||||||
|
|
||||||
end
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
subroutine print_cas_coefs
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
|
|
||||||
integer :: i,j
|
|
||||||
print *, 'CAS'
|
|
||||||
print *, '==='
|
|
||||||
do i=1,N_det_cas
|
|
||||||
print *, psi_cas_coef(i,:)
|
|
||||||
call debug_det(psi_cas(1,1,i),N_int)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
call write_double(6,ci_energy(1),"Initial CI energy")
|
|
||||||
|
|
||||||
end
|
|
||||||
|
|
||||||
Binary file not shown.
|
Before Width: | Height: | Size: 144 KiB |
@ -57,7 +57,7 @@ program dressed_dmc
|
|||||||
enddo
|
enddo
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
call davidson_diag_hjj(psi_det,psi_coef,H_jj,energies,size(psi_coef,1),N_det,N_states,N_states_diag,,N_int,6)
|
call davidson_diag_hjj(psi_det,psi_coef,H_jj,energies,size(psi_coef,1),N_det,N_states,N_states_diag,N_int,6)
|
||||||
|
|
||||||
call save_wavefunction
|
call save_wavefunction
|
||||||
call write_spindeterminants
|
call write_spindeterminants
|
||||||
|
|||||||
@ -114,7 +114,7 @@ subroutine zmq_get_psi(zmq_to_qp_run_socket, worker_id, energy, size_energy)
|
|||||||
if (N_det_selectors_read > 0) then
|
if (N_det_selectors_read > 0) then
|
||||||
N_det_selectors = N_det_selectors_read
|
N_det_selectors = N_det_selectors_read
|
||||||
endif
|
endif
|
||||||
SOFT_TOUCH psi_det psi_coef N_det_selectors N_det_generators
|
SOFT_TOUCH psi_det psi_coef N_det_selectors N_det_generators psi_coef_generators psi_det_generators
|
||||||
|
|
||||||
end
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|||||||
@ -3,3 +3,31 @@ type: Positive_int
|
|||||||
doc: lambda type
|
doc: lambda type
|
||||||
interface: ezfio,provider,ocaml
|
interface: ezfio,provider,ocaml
|
||||||
default: 0
|
default: 0
|
||||||
|
|
||||||
|
[energy]
|
||||||
|
type: double precision
|
||||||
|
doc: Calculated energy
|
||||||
|
interface: ezfio
|
||||||
|
|
||||||
|
[energy_pt2]
|
||||||
|
type: double precision
|
||||||
|
doc: Calculated energy with PT2 contribution
|
||||||
|
interface: ezfio
|
||||||
|
|
||||||
|
[energy]
|
||||||
|
type: double precision
|
||||||
|
doc: Calculated energy
|
||||||
|
interface: ezfio
|
||||||
|
|
||||||
|
[thresh_dressed_ci]
|
||||||
|
type: Threshold
|
||||||
|
doc: Threshold on the convergence of the dressed CI energy
|
||||||
|
interface: ezfio,provider,ocaml
|
||||||
|
default: 1.e-4
|
||||||
|
|
||||||
|
[n_it_max_dressed_ci]
|
||||||
|
type: Strictly_positive_int
|
||||||
|
doc: Maximum number of dressed CI iterations
|
||||||
|
interface: ezfio,provider,ocaml
|
||||||
|
default: 10
|
||||||
|
|
||||||
|
|||||||
@ -17,8 +17,8 @@ subroutine run(N_st,energy)
|
|||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
thresh_mrcc = 1d-7
|
thresh_mrcc = thresh_dressed_ci
|
||||||
n_it_mrcc_max = 10
|
n_it_mrcc_max = n_it_max_dressed_ci
|
||||||
|
|
||||||
if(n_it_mrcc_max == 1) then
|
if(n_it_mrcc_max == 1) then
|
||||||
do j=1,N_states_diag
|
do j=1,N_states_diag
|
||||||
@ -48,8 +48,8 @@ subroutine run(N_st,energy)
|
|||||||
E_new = sum(ci_energy_dressed)
|
E_new = sum(ci_energy_dressed)
|
||||||
delta_E = dabs(E_new - E_old)
|
delta_E = dabs(E_new - E_old)
|
||||||
call save_wavefunction
|
call save_wavefunction
|
||||||
call ezfio_set_mrcc_cassd_energy(ci_energy_dressed(1))
|
call ezfio_set_mrcepa0_energy(ci_energy_dressed(1))
|
||||||
if (iteration > n_it_mrcc_max) then
|
if (iteration >= n_it_mrcc_max) then
|
||||||
exit
|
exit
|
||||||
endif
|
endif
|
||||||
enddo
|
enddo
|
||||||
@ -184,7 +184,7 @@ subroutine run_pt2_old(N_st,energy)
|
|||||||
print *, '-----'
|
print *, '-----'
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
! call ezfio_set_full_ci_energy_pt2(energy+pt2)
|
call ezfio_set_mrcepa0_energy_pt2(energy(1)+pt2(1))
|
||||||
|
|
||||||
end
|
end
|
||||||
|
|
||||||
@ -238,5 +238,7 @@ subroutine run_pt2(N_st,energy)
|
|||||||
print *, 'E+PT2 = ', energy+pt2
|
print *, 'E+PT2 = ', energy+pt2
|
||||||
print *, '-----'
|
print *, '-----'
|
||||||
|
|
||||||
|
call ezfio_set_mrcepa0_energy_pt2(energy(1)+pt2(1))
|
||||||
|
|
||||||
end
|
end
|
||||||
|
|
||||||
|
|||||||
@ -1,62 +0,0 @@
|
|||||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, CI_SC2_energy, (N_states_diag) ]
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
BEGIN_DOC
|
|
||||||
! N_states_diag lowest eigenvalues of the CI matrix
|
|
||||||
END_DOC
|
|
||||||
|
|
||||||
integer :: j
|
|
||||||
character*(8) :: st
|
|
||||||
call write_time(output_determinants)
|
|
||||||
do j=1,N_states_diag
|
|
||||||
CI_SC2_energy(j) = CI_SC2_electronic_energy(j) + nuclear_repulsion
|
|
||||||
write(st,'(I4)') j
|
|
||||||
call write_double(output_determinants,CI_SC2_energy(j),'Energy of state '//trim(st))
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
|
|
||||||
END_PROVIDER
|
|
||||||
|
|
||||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, threshold_convergence_SC2]
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
BEGIN_DOC
|
|
||||||
! convergence of the correlation energy of SC2 iterations
|
|
||||||
END_DOC
|
|
||||||
threshold_convergence_SC2 = 1.d-10
|
|
||||||
|
|
||||||
END_PROVIDER
|
|
||||||
|
|
||||||
BEGIN_PROVIDER [ double precision, CI_SC2_electronic_energy, (N_states_diag) ]
|
|
||||||
&BEGIN_PROVIDER [ double precision, CI_SC2_eigenvectors, (N_det,N_states_diag) ]
|
|
||||||
&BEGIN_PROVIDER [ double precision, Diag_H_elements_SC2, (N_det) ]
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
BEGIN_DOC
|
|
||||||
! Eigenvectors/values of the CI matrix
|
|
||||||
END_DOC
|
|
||||||
integer :: i,j
|
|
||||||
|
|
||||||
do j=1,N_states_diag
|
|
||||||
do i=1,N_det
|
|
||||||
CI_SC2_eigenvectors(i,j) = psi_coef(i,j)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
CI_SC2_electronic_energy(j) = CI_electronic_energy(j)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
|
|
||||||
call CISD_SC2(psi_det,CI_SC2_eigenvectors,CI_SC2_electronic_energy, &
|
|
||||||
! size(CI_SC2_eigenvectors,1),N_det,N_states_diag,N_int,threshold_convergence_SC2)
|
|
||||||
diag_H_elements_SC2,size(CI_SC2_eigenvectors,1),N_det,N_states_diag,N_int,threshold_convergence_SC2)
|
|
||||||
END_PROVIDER
|
|
||||||
|
|
||||||
subroutine diagonalize_CI_SC2
|
|
||||||
implicit none
|
|
||||||
BEGIN_DOC
|
|
||||||
! Replace the coefficients of the CI states_diag by the coefficients of the
|
|
||||||
! eigenstates of the CI matrix
|
|
||||||
END_DOC
|
|
||||||
integer :: i,j
|
|
||||||
do j=1,N_states_diag
|
|
||||||
do i=1,N_det
|
|
||||||
psi_coef(i,j) = CI_SC2_eigenvectors(i,j)
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
enddo
|
|
||||||
SOFT_TOUCH psi_coef CI_SC2_electronic_energy CI_SC2_energy CI_SC2_eigenvectors diag_h_elements_sc2
|
|
||||||
! SOFT_TOUCH psi_coef CI_SC2_electronic_energy CI_SC2_energy CI_SC2_eigenvectors
|
|
||||||
end
|
|
||||||
17
tests/bats/cassd.bats
Normal file
17
tests/bats/cassd.bats
Normal file
@ -0,0 +1,17 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env bats
|
||||||
|
|
||||||
|
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "CAS_SD H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
test_exe cas_sd_selected || skip
|
||||||
|
INPUT=h2o.ezfio
|
||||||
|
qp_edit -c $INPUT
|
||||||
|
ezfio set_file $INPUT
|
||||||
|
ezfio set perturbation do_pt2_end False
|
||||||
|
ezfio set determinants n_det_max 1000
|
||||||
|
qp_set_mo_class $INPUT -core "[1]" -inact "[2,5]" -act "[3,4,6,7]" -virt "[8-24]"
|
||||||
|
qp_run cas_sd_selected $INPUT
|
||||||
|
energy="$(ezfio get cas_sd energy)"
|
||||||
|
eq $energy -76.22213389282479 1.E-5
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
44
tests/bats/common.bats.sh
Normal file
44
tests/bats/common.bats.sh
Normal file
@ -0,0 +1,44 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env bats
|
||||||
|
|
||||||
|
# floating point number comparison
|
||||||
|
# Compare two numbers ($1, $2) with a given precision ($3)
|
||||||
|
# If the numbers are not equal, the exit code is 1 else it is 0
|
||||||
|
# So we strip the "-", is the abs value of the poor
|
||||||
|
function eq() {
|
||||||
|
declare -a diff
|
||||||
|
diff=($(awk -v d1=$1 -v d2=$2 -v n1=${1#-} -v n2=${2#-} -v p=$3 'BEGIN{ if ((n1-n2)^2 < p^2) print 0; print 1 " " (d1-d2) " " d1 " " d2 }'))
|
||||||
|
if [[ "${diff[0]}" == "0" ]]
|
||||||
|
then
|
||||||
|
return 0
|
||||||
|
else
|
||||||
|
echo "Test : " ${BATS_TEST_DESCRIPTION}
|
||||||
|
echo "Error : " ${diff[1]}
|
||||||
|
echo "Reference : " ${diff[3]}
|
||||||
|
echo "Computed : " ${diff[2]}
|
||||||
|
exit 1
|
||||||
|
fi
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
# ___
|
||||||
|
# | ._ o _|_
|
||||||
|
# _|_ | | | |_
|
||||||
|
#
|
||||||
|
source ${QP_ROOT}/install/EZFIO/Bash/ezfio.sh
|
||||||
|
TEST_DIR=${QP_ROOT}/tests/work/
|
||||||
|
|
||||||
|
mkdir -p "${TEST_DIR}"
|
||||||
|
|
||||||
|
cd "${TEST_DIR}" || exit 1
|
||||||
|
|
||||||
|
function test_exe() {
|
||||||
|
l_EXE=$(awk "/^$1 / { print \$2 }" < "${QP_ROOT}"/data/executables)
|
||||||
|
l_EXE=$(echo $l_EXE | sed "s|\$QP_ROOT|$QP_ROOT|")
|
||||||
|
if [[ -x "$l_EXE" ]]
|
||||||
|
then
|
||||||
|
return 0
|
||||||
|
else
|
||||||
|
return 127
|
||||||
|
fi
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
27
tests/bats/convert.bats
Normal file
27
tests/bats/convert.bats
Normal file
@ -0,0 +1,27 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env bats
|
||||||
|
|
||||||
|
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||||
|
|
||||||
|
#=== Convert
|
||||||
|
@test "gamess convert HBO.out" {
|
||||||
|
cp ${QP_ROOT}/tests/input/HBO.out .
|
||||||
|
qp_convert_output_to_ezfio.py HBO.out
|
||||||
|
qp_edit -c HBO.out.ezfio
|
||||||
|
ezfio set_file HBO.out.ezfio
|
||||||
|
qp_run SCF HBO.out.ezfio
|
||||||
|
# Check energy
|
||||||
|
energy="$(ezfio get hartree_fock energy)"
|
||||||
|
eq $energy -100.0185822590964 1.e-10
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "g09 convert H2O.log" {
|
||||||
|
cp ${QP_ROOT}/tests/input/h2o.log .
|
||||||
|
qp_convert_output_to_ezfio.py h2o.log
|
||||||
|
qp_edit -c h2o.log.ezfio
|
||||||
|
ezfio set_file h2o.log.ezfio
|
||||||
|
qp_run SCF h2o.log.ezfio
|
||||||
|
# Check energy
|
||||||
|
energy="$(ezfio get hartree_fock energy)"
|
||||||
|
eq $energy -76.0270218704265 1E-10
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
52
tests/bats/fci.bats
Normal file
52
tests/bats/fci.bats
Normal file
@ -0,0 +1,52 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env bats
|
||||||
|
|
||||||
|
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||||
|
|
||||||
|
function run_FCI() {
|
||||||
|
thresh=5.e-5
|
||||||
|
test_exe full_ci || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $1
|
||||||
|
ezfio set_file $1
|
||||||
|
ezfio set perturbation do_pt2_end True
|
||||||
|
ezfio set determinants n_det_max $2
|
||||||
|
ezfio set davidson threshold_davidson 1.e-10
|
||||||
|
|
||||||
|
qp_run full_ci $1
|
||||||
|
energy="$(ezfio get full_ci energy)"
|
||||||
|
eq $energy $3 $thresh
|
||||||
|
energy_pt2="$(ezfio get full_ci energy_pt2)"
|
||||||
|
eq $energy_pt2 $4 $thresh
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
function run_FCI_ZMQ() {
|
||||||
|
thresh=5.e-5
|
||||||
|
test_exe full_ci || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $1
|
||||||
|
ezfio set_file $1
|
||||||
|
ezfio set perturbation do_pt2_end True
|
||||||
|
ezfio set determinants n_det_max $2
|
||||||
|
ezfio set davidson threshold_davidson 1.e-10
|
||||||
|
|
||||||
|
qp_run fci_zmq $1
|
||||||
|
energy="$(ezfio get full_ci energy)"
|
||||||
|
eq $energy $3 $thresh
|
||||||
|
energy_pt2="$(ezfio get full_ci energy_pt2)"
|
||||||
|
eq $energy_pt2 $4 $thresh
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
#=== H2O
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "qp_set_mo_class H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
qp_set_mo_class h2o.ezfio -core "[1]" -act "[2-12]" -del "[13-24]"
|
||||||
|
}
|
||||||
|
@test "FCI H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
run_FCI h2o.ezfio 2000 -0.761255633582109E+02 -0.761258377850042E+02
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "FCI-ZMQ H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
run_FCI_ZMQ h2o.ezfio 2000 -0.761255633582109E+02 -0.761258377850042E+02
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
27
tests/bats/foboci.bats
Normal file
27
tests/bats/foboci.bats
Normal file
@ -0,0 +1,27 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env bats
|
||||||
|
|
||||||
|
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||||
|
|
||||||
|
function run_all_1h_1p() {
|
||||||
|
thresh=1.e-6
|
||||||
|
test_exe all_1h_1p || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $1
|
||||||
|
ezfio set_file $1
|
||||||
|
ezfio set determinants n_det_max $2
|
||||||
|
ezfio set perturbation pt2_max $3
|
||||||
|
ezfio set davidson threshold_davidson 1.e-10
|
||||||
|
|
||||||
|
qp_run all_1h_1p $1 | tee $1.F1h1p.out
|
||||||
|
energy="$(ezfio get all_singles energy)"
|
||||||
|
eq $energy $4 $thresh
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
#=== DHNO
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "all_1h_1p DHNO chipman-dzp" {
|
||||||
|
qp_set_mo_class -inact "[1-8]" -act "[9]" -virt "[10-64]" dhno.ezfio
|
||||||
|
run_all_1h_1p dhno.ezfio 10000 0.0000000001 -130.4466283766202
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
52
tests/bats/hf.bats
Normal file
52
tests/bats/hf.bats
Normal file
@ -0,0 +1,52 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env bats
|
||||||
|
|
||||||
|
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||||
|
|
||||||
|
function run_init() {
|
||||||
|
cp "${QP_ROOT}/tests/input/$1" .
|
||||||
|
qp_create_ezfio_from_xyz $1 -o $3 $2
|
||||||
|
qp_edit -c $3
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
function run_HF() {
|
||||||
|
thresh=1.e-7
|
||||||
|
test_exe SCF || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $1
|
||||||
|
ezfio set_file $1
|
||||||
|
ezfio set hartree_fock thresh_scf 1.e-11
|
||||||
|
qp_run SCF $1
|
||||||
|
energy="$(ezfio get hartree_fock energy)"
|
||||||
|
eq $energy $2 $thresh
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
#=== DHNO
|
||||||
|
@test "init DHNO chipman-dzp" {
|
||||||
|
run_init dhno.xyz "-b chipman-dzp -m 2" dhno.ezfio
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "SCF DHNO chipman-dzp" {
|
||||||
|
run_HF dhno.ezfio -130.4278777822
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
#=== HBO
|
||||||
|
@test "init HBO STO-3G" {
|
||||||
|
run_init HBO.xyz "-b STO-3G" hbo.ezfio
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "SCF HBO STO-3G" {
|
||||||
|
run_HF hbo.ezfio -98.8251985678084
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
#=== H2O
|
||||||
|
@test "init H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
run_init h2o.xyz "-b cc-pvdz" h2o.ezfio
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "SCF H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
run_HF h2o.ezfio -0.760270218692179E+02
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
70
tests/bats/mrcepa0.bats
Normal file
70
tests/bats/mrcepa0.bats
Normal file
@ -0,0 +1,70 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env bats
|
||||||
|
|
||||||
|
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||||
|
|
||||||
|
#=== H2O
|
||||||
|
@test "MRCC-lambda H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
INPUT=h2o.ezfio
|
||||||
|
EXE=mrcc
|
||||||
|
test_exe $EXE || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $INPUT
|
||||||
|
ezfio set_file $INPUT
|
||||||
|
ezfio set determinants threshold_generators 1.
|
||||||
|
ezfio set determinants threshold_selectors 1.
|
||||||
|
ezfio set determinants read_wf True
|
||||||
|
ezfio set mrcepa0 lambda_type 1
|
||||||
|
ezfio set mrcepa0 n_it_max_dressed_ci 3
|
||||||
|
qp_run $EXE $INPUT
|
||||||
|
energy="$(ezfio get mrcepa0 energy)"
|
||||||
|
eq $energy -76.22903276183061 1.e-4
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "MRCC H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
INPUT=h2o.ezfio
|
||||||
|
EXE=mrcc
|
||||||
|
test_exe $EXE || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $INPUT
|
||||||
|
ezfio set_file $INPUT
|
||||||
|
ezfio set determinants threshold_generators 1.
|
||||||
|
ezfio set determinants threshold_selectors 1.
|
||||||
|
ezfio set determinants read_wf True
|
||||||
|
ezfio set determinants read_wf True
|
||||||
|
ezfio set mrcepa0 lambda_type 0
|
||||||
|
ezfio set mrcepa0 n_it_max_dressed_ci 3
|
||||||
|
qp_run $EXE $INPUT
|
||||||
|
energy="$(ezfio get mrcepa0 energy)"
|
||||||
|
eq $energy -76.22899302846875 1.e-4
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "MRSC2 H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
INPUT=h2o.ezfio
|
||||||
|
EXE=mrsc2
|
||||||
|
test_exe $EXE || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $INPUT
|
||||||
|
ezfio set_file $INPUT
|
||||||
|
ezfio set determinants threshold_generators 1.
|
||||||
|
ezfio set determinants threshold_selectors 1.
|
||||||
|
ezfio set determinants read_wf True
|
||||||
|
ezfio set mrcepa0 lambda_type 0
|
||||||
|
ezfio set mrcepa0 n_it_max_dressed_ci 3
|
||||||
|
qp_run $EXE $INPUT
|
||||||
|
energy="$(ezfio get mrcepa0 energy)"
|
||||||
|
eq $energy -76.22647345292708 1.e-4
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "MRCEPA0 H2O cc-pVDZ" {
|
||||||
|
INPUT=h2o.ezfio
|
||||||
|
EXE=mrcepa0
|
||||||
|
test_exe $EXE || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $INPUT
|
||||||
|
ezfio set_file $INPUT
|
||||||
|
ezfio set determinants threshold_generators 1.
|
||||||
|
ezfio set determinants threshold_selectors 1.
|
||||||
|
ezfio set determinants read_wf True
|
||||||
|
ezfio set mrcepa0 lambda_type 0
|
||||||
|
ezfio set mrcepa0 n_it_max_dressed_ci 3
|
||||||
|
qp_run $EXE $INPUT
|
||||||
|
energy="$(ezfio get mrcepa0 energy)"
|
||||||
|
eq $energy -76.23199784430074 1.e-4
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
53
tests/bats/pseudo.bats
Normal file
53
tests/bats/pseudo.bats
Normal file
@ -0,0 +1,53 @@
|
|||||||
|
#!/usr/bin/env bats
|
||||||
|
|
||||||
|
source $QP_ROOT/tests/bats/common.bats.sh
|
||||||
|
|
||||||
|
function run_init() {
|
||||||
|
cp "${QP_ROOT}/tests/input/$1" .
|
||||||
|
qp_create_ezfio_from_xyz $1 -o $3 $2
|
||||||
|
qp_edit -c $3
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
function run_HF() {
|
||||||
|
thresh=1.e-7
|
||||||
|
test_exe SCF || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $1
|
||||||
|
ezfio set_file $1
|
||||||
|
ezfio set hartree_fock thresh_scf 1.e-11
|
||||||
|
qp_run SCF $1
|
||||||
|
energy="$(ezfio get hartree_fock energy)"
|
||||||
|
eq $energy $2 $thresh
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
function run_FCI_ZMQ() {
|
||||||
|
thresh=5.e-5
|
||||||
|
test_exe full_ci || skip
|
||||||
|
qp_edit -c $1
|
||||||
|
ezfio set_file $1
|
||||||
|
ezfio set perturbation do_pt2_end True
|
||||||
|
ezfio set determinants n_det_max $2
|
||||||
|
ezfio set davidson threshold_davidson 1.e-10
|
||||||
|
|
||||||
|
qp_run fci_zmq $1
|
||||||
|
energy="$(ezfio get full_ci energy)"
|
||||||
|
eq $energy $3 $thresh
|
||||||
|
energy_pt2="$(ezfio get full_ci energy_pt2)"
|
||||||
|
eq $energy_pt2 $4 $thresh
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
#=== H2O Pseudo
|
||||||
|
@test "init H2O VDZ pseudo" {
|
||||||
|
run_init h2o.xyz "-p bfd -b vdz-bfd" h2o_pseudo.ezfio
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "SCF H2O VDZ pseudo" {
|
||||||
|
run_HF h2o_pseudo.ezfio -16.9483703905461
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
@test "FCI H2O VDZ pseudo" {
|
||||||
|
qp_set_mo_class h2o_pseudo.ezfio -core "[1]" -act "[2-12]" -del "[13-23]"
|
||||||
|
run_FCI_ZMQ h2o_pseudo.ezfio 2000 -0.170399597228904E+02 -0.170400168816800E+02
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
@ -1,205 +0,0 @@
|
|||||||
#!/usr/bin/env bats
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# |\/| o _ _
|
|
||||||
# | | | _> (_
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# floating point number comparison
|
|
||||||
# Compare two numbers ($1, $2) with a given precision ($3)
|
|
||||||
# If the numbers are not equal, the exit code is 1 else it is 0
|
|
||||||
# So we strip the "-", is the abs value of the poor
|
|
||||||
function eq() {
|
|
||||||
declare -a diff
|
|
||||||
diff=($(awk -v d1=$1 -v d2=$2 -v n1=${1#-} -v n2=${2#-} -v p=$3 'BEGIN{ if ((n1-n2)^2 < p^2) print 0; print 1 " " (d1-d2) " " d1 " " d2 }'))
|
|
||||||
if [[ "${diff[0]}" == "0" ]]
|
|
||||||
then
|
|
||||||
return 0
|
|
||||||
else
|
|
||||||
echo "Test : " ${BATS_TEST_DESCRIPTION}
|
|
||||||
echo "Error : " ${diff[1]}
|
|
||||||
echo "Reference : " ${diff[3]}
|
|
||||||
echo "Computed : " ${diff[2]}
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
# ___
|
|
||||||
# | ._ o _|_
|
|
||||||
# _|_ | | | |_
|
|
||||||
#
|
|
||||||
source ${QP_ROOT}/install/EZFIO/Bash/ezfio.sh
|
|
||||||
TEST_DIR=${QP_ROOT}/tests/work/
|
|
||||||
|
|
||||||
mkdir -p "${TEST_DIR}"
|
|
||||||
|
|
||||||
cd "${TEST_DIR}" || exit 1
|
|
||||||
|
|
||||||
function run_init() {
|
|
||||||
cp "${QP_ROOT}/tests/input/$1" .
|
|
||||||
qp_create_ezfio_from_xyz $1 -o $3 $2
|
|
||||||
qp_edit -c $3
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
function test_exe() {
|
|
||||||
EXE=$(awk "/^$1 / { print \$2 }" < "${QP_ROOT}"/data/executables)
|
|
||||||
EXE=$(echo $EXE | sed "s|\$QP_ROOT|$QP_ROOT|")
|
|
||||||
if [[ -x "$EXE" ]]
|
|
||||||
then
|
|
||||||
return 0
|
|
||||||
else
|
|
||||||
return 127
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
function run_HF() {
|
|
||||||
thresh=1.e-7
|
|
||||||
test_exe SCF || skip
|
|
||||||
ezfio set_file $1
|
|
||||||
ezfio set hartree_fock thresh_scf 1.e-11
|
|
||||||
qp_run SCF $1
|
|
||||||
energy="$(ezfio get hartree_fock energy)"
|
|
||||||
eq $energy $2 $thresh
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
function run_FCI() {
|
|
||||||
thresh=5.e-5
|
|
||||||
test_exe full_ci || skip
|
|
||||||
ezfio set_file $1
|
|
||||||
ezfio set perturbation do_pt2_end True
|
|
||||||
ezfio set determinants n_det_max $2
|
|
||||||
ezfio set davidson threshold_davidson 1.e-10
|
|
||||||
|
|
||||||
qp_run full_ci $1
|
|
||||||
energy="$(ezfio get full_ci energy)"
|
|
||||||
eq $energy $3 $thresh
|
|
||||||
energy_pt2="$(ezfio get full_ci energy_pt2)"
|
|
||||||
eq $energy_pt2 $4 $thresh
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
function run_all_1h_1p() {
|
|
||||||
thresh=1.e-6
|
|
||||||
test_exe all_1h_1p || skip
|
|
||||||
ezfio set_file $1
|
|
||||||
ezfio set determinants n_det_max $2
|
|
||||||
ezfio set perturbation pt2_max $3
|
|
||||||
ezfio set davidson threshold_davidson 1.e-10
|
|
||||||
|
|
||||||
qp_run all_1h_1p $1 | tee $1.F1h1p.out
|
|
||||||
energy="$(ezfio get all_singles energy)"
|
|
||||||
eq $energy $4 $thresh
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
# ___
|
|
||||||
# | _ _ _|_
|
|
||||||
# | (/_ _> |_
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
#=== DHNO
|
|
||||||
@test "init DHNO chipman-dzp" {
|
|
||||||
run_init dhno.xyz "-b chipman-dzp -m 2" dhno.ezfio
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "SCF DHNO chipman-dzp" {
|
|
||||||
run_HF dhno.ezfio -130.4278777822
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "all_1h_1p DHNO chipman-dzp" {
|
|
||||||
qp_set_mo_class -inact "[1-8]" -act "[9]" -virt "[10-64]" dhno.ezfio
|
|
||||||
run_all_1h_1p dhno.ezfio 10000 0.0000000001 -130.4466283766202
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
#=== HBO
|
|
||||||
@test "init HBO STO-3G" {
|
|
||||||
run_init HBO.xyz "-b STO-3G" hbo.ezfio
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "SCF HBO STO-3G" {
|
|
||||||
run_HF hbo.ezfio -98.8251985678084
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
#=== H2O
|
|
||||||
@test "init H2O cc-pVDZ" {
|
|
||||||
run_init h2o.xyz "-b cc-pvdz" h2o.ezfio
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "SCF H2O cc-pVDZ" {
|
|
||||||
run_HF h2o.ezfio -0.760270218692179E+02
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "FCI H2O cc-pVDZ" {
|
|
||||||
qp_set_mo_class h2o.ezfio -core "[1]" -act "[2-12]" -del "[13-24]"
|
|
||||||
run_FCI h2o.ezfio 2000 -0.761255633582109E+02 -0.761258377850042E+02
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "CAS_SD H2O cc-pVDZ" {
|
|
||||||
test_exe cas_sd_selected || skip
|
|
||||||
INPUT=h2o.ezfio
|
|
||||||
ezfio set_file $INPUT
|
|
||||||
ezfio set perturbation do_pt2_end False
|
|
||||||
ezfio set determinants n_det_max 1000
|
|
||||||
qp_set_mo_class $INPUT -core "[1]" -inact "[2,5]" -act "[3,4,6,7]" -virt "[8-24]"
|
|
||||||
qp_run cas_sd_selected $INPUT
|
|
||||||
energy="$(ezfio get cas_sd energy)"
|
|
||||||
eq $energy -0.762219854008117E+02 1.E-5
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "MRCC H2O cc-pVDZ" {
|
|
||||||
test_exe mrcc_cassd || skip
|
|
||||||
INPUT=h2o.ezfio
|
|
||||||
ezfio set_file $INPUT
|
|
||||||
ezfio set determinants threshold_generators 1.
|
|
||||||
ezfio set determinants threshold_selectors 1.
|
|
||||||
ezfio set determinants read_wf True
|
|
||||||
qp_run mrcc_cassd $INPUT
|
|
||||||
energy="$(ezfio get mrcc_cassd energy)"
|
|
||||||
eq $energy -76.2288648023833 1.e-4
|
|
||||||
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
#=== H2O Pseudo
|
|
||||||
@test "init H2O VDZ pseudo" {
|
|
||||||
run_init h2o.xyz "-p bfd -b vdz-bfd" h2o_pseudo.ezfio
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "SCF H2O VDZ pseudo" {
|
|
||||||
run_HF h2o_pseudo.ezfio -16.9483703905461
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "FCI H2O VDZ pseudo" {
|
|
||||||
qp_set_mo_class h2o_pseudo.ezfio -core "[1]" -act "[2-12]" -del "[13-23]"
|
|
||||||
run_FCI h2o_pseudo.ezfio 2000 -0.170399597228904E+02 -0.170400168816800E+02
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
#=== Convert
|
|
||||||
@test "gamess convert HBO.out" {
|
|
||||||
cp ${QP_ROOT}/tests/input/HBO.out .
|
|
||||||
qp_convert_output_to_ezfio.py HBO.out
|
|
||||||
ezfio set_file HBO.out.ezfio
|
|
||||||
qp_run SCF HBO.out.ezfio
|
|
||||||
# Check energy
|
|
||||||
energy="$(ezfio get hartree_fock energy)"
|
|
||||||
eq $energy -100.0185822590964 1.e-10
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
@test "g09 convert H2O.log" {
|
|
||||||
cp ${QP_ROOT}/tests/input/h2o.log .
|
|
||||||
qp_convert_output_to_ezfio.py h2o.log
|
|
||||||
ezfio set_file h2o.log.ezfio
|
|
||||||
qp_run SCF h2o.log.ezfio
|
|
||||||
# Check energy
|
|
||||||
energy="$(ezfio get hartree_fock energy)"
|
|
||||||
eq $energy -76.0270218704265 1E-10
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
# TODO N_int = 1,2,3,4,5
|
|
||||||
# TODO mod(64) MOs
|
|
||||||
# TODO All G2 SCF energies
|
|
||||||
# TODO Long and short tests
|
|
||||||
# TODO MP2
|
|
||||||
# TODO CISD_selected
|
|
||||||
|
|
||||||
@ -1,6 +1,8 @@
|
|||||||
#!/usr/bin/env python
|
#!/usr/bin/env python
|
||||||
|
|
||||||
with open('bats/qp.bats','r') as f:
|
import sys
|
||||||
|
|
||||||
|
with open(sys.argv[1],'r') as f:
|
||||||
raw_data = f.read()
|
raw_data = f.read()
|
||||||
|
|
||||||
output = []
|
output = []
|
||||||
|
|||||||
@ -1,18 +1,39 @@
|
|||||||
#!/bin/bash
|
#!/bin/bash
|
||||||
|
|
||||||
|
LIST="
|
||||||
|
|
||||||
|
convert.bats
|
||||||
|
hf.bats
|
||||||
|
foboci.bats
|
||||||
|
pseudo.bats
|
||||||
|
fci.bats
|
||||||
|
cassd.bats
|
||||||
|
mrcepa0.bats
|
||||||
|
|
||||||
|
"
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
export QP_PREFIX="timeout -s 9 300"
|
export QP_PREFIX="timeout -s 9 300"
|
||||||
export QP_TASK_DEBUG=1
|
export QP_TASK_DEBUG=1
|
||||||
|
|
||||||
BATS_FILE=bats/qp.bats
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -rf work output
|
rm -rf work output
|
||||||
|
|
||||||
if [[ "$1" == "-v" ]]
|
|
||||||
then
|
for BATS_FILE in $LIST
|
||||||
|
do
|
||||||
|
echo
|
||||||
|
echo "-~-~-~-~-~-~"
|
||||||
|
echo
|
||||||
|
echo "Running tests for ${BATS_FILE%.bats}"
|
||||||
|
echo
|
||||||
|
BATS_FILE=bats/$BATS_FILE
|
||||||
|
if [[ "$1" == "-v" ]]
|
||||||
|
then
|
||||||
echo "Verbose mode"
|
echo "Verbose mode"
|
||||||
./bats_to_sh.py $BATS_FILE | bash
|
./bats_to_sh.py $BATS_FILE | bash
|
||||||
else
|
else
|
||||||
bats $BATS_FILE
|
bats $BATS_FILE
|
||||||
fi
|
fi
|
||||||
|
done
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|||||||
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