mirror of
https://github.com/QuantumPackage/qp2.git
synced 2024-12-22 19:43:32 +01:00
added the point charges
This commit is contained in:
parent
7eb14fc0f8
commit
8ea1b5c023
@ -204,7 +204,7 @@ BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_integrals_pt_chrg, (ao_num,ao_num)]
|
|||||||
!$OMP DEFAULT (NONE) &
|
!$OMP DEFAULT (NONE) &
|
||||||
!$OMP PRIVATE (i,j,k,l,m,alpha,beta,A_center,B_center,C_center,power_A,power_B,&
|
!$OMP PRIVATE (i,j,k,l,m,alpha,beta,A_center,B_center,C_center,power_A,power_B,&
|
||||||
!$OMP num_A,num_B,Z,c,c1,n_pt_in) &
|
!$OMP num_A,num_B,Z,c,c1,n_pt_in) &
|
||||||
!$OMP SHARED (ao_num,ao_prim_num,ao_expo_ordered_transp,ao_power,ao_nucl,pts_charge_coord,ao_coef_normalized_ordered_transp,&
|
!$OMP SHARED (ao_num,ao_prim_num,ao_expo_ordered_transp,ao_power,ao_nucl,pts_charge_coord,ao_coef_normalized_ordered_transp,nucl_coord,&
|
||||||
!$OMP n_pt_max_integrals,ao_integrals_pt_chrg,n_pts_charge,pts_charge_z)
|
!$OMP n_pt_max_integrals,ao_integrals_pt_chrg,n_pts_charge,pts_charge_z)
|
||||||
|
|
||||||
n_pt_in = n_pt_max_integrals
|
n_pt_in = n_pt_max_integrals
|
||||||
@ -214,13 +214,13 @@ BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_integrals_pt_chrg, (ao_num,ao_num)]
|
|||||||
do j = 1, ao_num
|
do j = 1, ao_num
|
||||||
num_A = ao_nucl(j)
|
num_A = ao_nucl(j)
|
||||||
power_A(1:3)= ao_power(j,1:3)
|
power_A(1:3)= ao_power(j,1:3)
|
||||||
A_center(1:3) = pts_charge_coord(num_A,1:3)
|
A_center(1:3) = nucl_coord(num_A,1:3)
|
||||||
|
|
||||||
do i = 1, ao_num
|
do i = 1, ao_num
|
||||||
|
|
||||||
num_B = ao_nucl(i)
|
num_B = ao_nucl(i)
|
||||||
power_B(1:3)= ao_power(i,1:3)
|
power_B(1:3)= ao_power(i,1:3)
|
||||||
B_center(1:3) = pts_charge_coord(num_B,1:3)
|
B_center(1:3) = nucl_coord(num_B,1:3)
|
||||||
|
|
||||||
do l=1,ao_prim_num(j)
|
do l=1,ao_prim_num(j)
|
||||||
alpha = ao_expo_ordered_transp(l,j)
|
alpha = ao_expo_ordered_transp(l,j)
|
||||||
@ -240,7 +240,7 @@ BEGIN_PROVIDER [ double precision, ao_integrals_pt_chrg, (ao_num,ao_num)]
|
|||||||
c1 = NAI_pol_mult( A_center, B_center, power_A, power_B &
|
c1 = NAI_pol_mult( A_center, B_center, power_A, power_B &
|
||||||
, alpha, beta, C_center, n_pt_in )
|
, alpha, beta, C_center, n_pt_in )
|
||||||
|
|
||||||
c = c - Z * c1
|
c = c + Z * c1
|
||||||
|
|
||||||
enddo
|
enddo
|
||||||
ao_integrals_pt_chrg(i,j) = ao_integrals_pt_chrg(i,j) &
|
ao_integrals_pt_chrg(i,j) = ao_integrals_pt_chrg(i,j) &
|
||||||
|
@ -2,6 +2,11 @@
|
|||||||
import os
|
import os
|
||||||
import sys
|
import sys
|
||||||
|
|
||||||
|
# First argument is the EZFIO file
|
||||||
|
# It reads a file EZFIO_point_charges.xyz written in this way:
|
||||||
|
# charge x y z (Angstrom)
|
||||||
|
# for all charges
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
def zip_in_ezfio(ezfio,tmp):
|
def zip_in_ezfio(ezfio,tmp):
|
||||||
tmpzip=tmp+".gz"
|
tmpzip=tmp+".gz"
|
||||||
@ -22,9 +27,10 @@ EZFIO=EZFIO.replace("/", "")
|
|||||||
print(EZFIO)
|
print(EZFIO)
|
||||||
|
|
||||||
# Reading the point charges and convert the Angstrom geometry in Bohr for QP
|
# Reading the point charges and convert the Angstrom geometry in Bohr for QP
|
||||||
f = open('point_charges.xyz','r')
|
f = open(EZFIO+'_point_charges.xyz','r')
|
||||||
lines = f.readlines()
|
lines = f.readlines()
|
||||||
convert_angs_to_bohr=1.88973
|
convert_angs_to_bohr=1.8897259885789233
|
||||||
|
|
||||||
n_charges=0
|
n_charges=0
|
||||||
coord_x=[]
|
coord_x=[]
|
||||||
coord_y=[]
|
coord_y=[]
|
||||||
|
Loading…
Reference in New Issue
Block a user