Update documentation
This commit is contained in:
parent
f120fb8177
commit
21d42dc7d7
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@ -1,4 +1,4 @@
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#!/usr/bin/env python2
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#!/usr/bin/env python3
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import os
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@ -24,9 +24,9 @@ copyright = '2019, A. Scemama, E. Giner'
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author = 'A. Scemama, E. Giner'
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# The short X.Y version
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version = '2.0'
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version = '2.1'
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# The full version, including alpha/beta/rc tags
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release = '2.0'
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release = '2.1'
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# -- General configuration ---------------------------------------------------
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@ -50,7 +50,6 @@
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:hidden:
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appendix/benchmarks
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appendix/research
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appendix/license
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appendix/contributors
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@ -118,10 +118,12 @@ Providers
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||||
* :c:data:`ao_coef`
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||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_normalized`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num_max`
|
||||
* :c:data:`primitives_normalized`
|
||||
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Needed by:
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@ -177,10 +179,12 @@ Providers
|
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||||
* :c:data:`ao_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_normalized`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num_max`
|
||||
* :c:data:`primitives_normalized`
|
||||
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||||
Needed by:
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||||
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@ -261,10 +265,7 @@ Providers
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|||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`ao_spread_x`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
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||||
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||||
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|
@ -363,10 +364,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`ao_spread_x`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
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||||
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|
@ -853,10 +851,7 @@ Providers
|
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||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`gauleg_t2`
|
||||
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|
@ -888,10 +883,7 @@ Providers
|
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||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`gauleg_t2`
|
||||
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||||
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|
@ -1088,10 +1080,10 @@ Subroutines / functions
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|||
:columns: 3
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||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
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||||
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||||
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|
@ -1117,14 +1109,14 @@ Subroutines / functions
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|||
.. hlist::
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||||
:columns: 3
|
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||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`nucl_n_aos`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`nucl_aos_transposed`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_n_aos`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
|
@ -1158,14 +1150,14 @@ Subroutines / functions
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|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
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||||
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||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`nucl_n_aos`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`nucl_aos_transposed`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_n_aos`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
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|
@ -1195,14 +1187,14 @@ Subroutines / functions
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|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
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||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`nucl_n_aos`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power_ordered_transp_per_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`nucl_aos_transposed`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_n_aos`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
|
@ -1233,6 +1225,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
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||||
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@ -12,12 +12,11 @@ All the one-electron integrals in the |AO| basis are here.
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The most important providers for usual quantum-chemistry calculation are:
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||||
* `ao_kinetic_integral` which are the kinetic operator integrals on the |AO| basis (see :file:`kin_ao_ints.irp.f`)
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||||
* `ao_nucl_elec_integral` which are the nuclear-elctron operator integrals on the |AO| basis (see :file:`pot_ao_ints.irp.f`)
|
||||
* `ao_one_e_integrals` which are the the h_core operator integrals on the |AO| basis (see :file:`ao_mono_ints.irp.f`)
|
||||
* `ao_kinetic_integrals` which are the kinetic operator integrals on the |AO| basis
|
||||
* `ao_integrals_n_e` which are the nuclear-elctron operator integrals on the |AO| basis
|
||||
* `ao_one_e_integrals` which are the the h_core operator integrals on the |AO| basis
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||||
Note that you can find other interesting integrals related to the position operator in :file:`spread_dipole_ao.irp.f`.
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|
@ -144,6 +143,7 @@ Providers
|
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||||
* :c:data:`ao_cart_to_sphe_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`lin_dep_cutoff`
|
||||
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||||
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||||
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||||
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|
@ -570,6 +570,8 @@ Providers
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|||
Nucleus-electron interaction, in the |AO| basis set.
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||||
:math:`\langle \chi_i | -\sum_A \frac{1}{|r-R_A|} | \chi_j \rangle`
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||||
These integrals also contain the pseudopotential integrals.
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||||
Needs:
|
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|
||||
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|
@ -582,11 +584,13 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
* :c:data:`read_ao_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`read_ao_integrals_n_e`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
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||||
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|
@ -594,11 +598,33 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_nucl_elec_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_nucl_elec_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_integrals_n_e_imag
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_one_e_ints/pot_ao_ints.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
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||||
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||||
double precision, allocatable :: ao_integrals_n_e_imag (ao_num,ao_num)
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|
||||
Nucleus-electron interaction, in the |AO| basis set.
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||||
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||||
:math:`\langle \chi_i | -\sum_A \frac{1}{|r-R_A|} | \chi_j \rangle`
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||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`read_ao_integrals_n_e`
|
||||
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||||
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||||
|
||||
.. c:var:: ao_integrals_n_e_per_atom
|
||||
|
||||
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||||
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|
@ -669,6 +695,31 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
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||||
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||||
|
||||
.. c:var:: ao_kinetic_integrals_imag
|
||||
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||||
|
||||
File : :file:`ao_one_e_ints/kin_ao_ints.irp.f`
|
||||
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||||
.. code:: fortran
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||||
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||||
double precision, allocatable :: ao_kinetic_integrals_imag (ao_num,ao_num)
|
||||
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||||
|
||||
Kinetic energy integrals in the |AO| basis.
|
||||
|
||||
:math:`\langle \chi_i |\hat{T}| \chi_j \rangle`
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`read_ao_integrals_kinetic`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_one_e_integrals
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -690,18 +741,8 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`read_ao_one_e_integrals`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`hf_energy`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_one_e_integrals_diag
|
||||
|
|
@ -725,18 +766,30 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`ao_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`read_ao_one_e_integrals`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_one_e_integrals_imag
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_one_e_ints/ao_one_e_ints.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_one_e_integrals_imag (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
One-electron Hamiltonian in the |AO| basis.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`hf_energy`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`read_ao_one_e_integrals`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_ortho_canonical_coef
|
||||
|
|
@ -764,6 +817,8 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_cartesian`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`lin_dep_cutoff`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -771,7 +826,6 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef_inv`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_nucl_elec_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_overlap`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
|
@ -830,6 +884,8 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_cartesian`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`lin_dep_cutoff`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -837,7 +893,6 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef_inv`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_nucl_elec_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_overlap`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
|
@ -906,9 +961,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_cart_to_sphe_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_overlap`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_complex`
|
||||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`s_half`
|
||||
* :c:data:`s_half_inv`
|
||||
|
|
@ -939,19 +992,69 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_complex`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`is_periodic`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_overlap_complex
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_one_e_ints/ao_overlap.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
complex*16, allocatable :: ao_overlap_complex (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Overlap for complex AOs
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_imag`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`s_inv_complex`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_overlap_imag
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_one_e_ints/ao_overlap.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: ao_overlap_imag (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Imaginary part of the overlap
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_complex`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_overlap_x
|
||||
|
|
@ -993,9 +1096,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_cart_to_sphe_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_overlap`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_complex`
|
||||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`s_half`
|
||||
* :c:data:`s_half_inv`
|
||||
|
|
@ -1042,9 +1143,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_cart_to_sphe_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_overlap`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_complex`
|
||||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`s_half`
|
||||
* :c:data:`s_half_inv`
|
||||
|
|
@ -1091,9 +1190,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_cart_to_sphe_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_overlap`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_complex`
|
||||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`s_half`
|
||||
* :c:data:`s_half_inv`
|
||||
|
|
@ -1131,7 +1228,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1688,12 +1785,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`eigenvalues_fock_matrix_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: s_inv
|
||||
|
|
@ -1715,6 +1806,30 @@ Providers
|
|||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`lin_dep_cutoff`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: s_inv_complex
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_one_e_ints/ao_overlap.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
complex*16, allocatable :: s_inv_complex (ao_num,ao_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Inverse of the overlap matrix
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_complex`
|
||||
* :c:data:`lin_dep_cutoff`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1722,6 +1837,28 @@ Providers
|
|||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_one_e_integral_zero:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_one_e_ints/screening.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical function ao_one_e_integral_zero(i,k)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`io_ao_integrals_overlap`
|
||||
* :c:data:`is_periodic`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: give_all_erf_kl_ao:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1854,12 +1991,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1949,14 +2086,14 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`overlap_bourrin_deriv_x`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: v_e_n:
|
||||
.. c:function:: v_n_e:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_one_e_ints/pot_ao_ints.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision function V_e_n(a_x,a_y,a_z,b_x,b_y,b_z,alpha,beta)
|
||||
double precision function V_n_e(a_x,a_y,a_z,b_x,b_y,b_z,alpha,beta)
|
||||
|
||||
|
||||
Primitve nuclear attraction between the two primitves centered on the same atom.
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -287,13 +287,13 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`mu_erf`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
@ -322,13 +322,13 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
@ -504,9 +504,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
|
@ -541,7 +540,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
|
||||
|
|
@ -650,10 +648,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_cache_min`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_cache`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_cache_min`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
|
||||
|
|
@ -685,7 +682,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
|
||||
|
|
@ -716,7 +712,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
|
|
@ -792,9 +787,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`gauleg_t2`
|
||||
* :c:data:`mu_erf`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`gauleg_t2`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -857,8 +852,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -894,8 +889,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -98,6 +98,7 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_periodic`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_integrals_cache_min
|
||||
|
|
@ -126,6 +127,30 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_periodic`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_integrals_cache_periodic
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
complex*16, allocatable :: ao_integrals_cache_periodic (0:64*64*64*64)
|
||||
|
||||
|
||||
Cache of AO integrals for fast access
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_integrals_map
|
||||
|
|
@ -153,9 +178,10 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_periodic`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -185,14 +211,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: ao_two_e_integrals_in_map
|
||||
|
|
@ -237,9 +255,8 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_periodic`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
|
||||
|
|
@ -341,7 +358,6 @@ Providers
|
|||
* :c:func:`i_x1_new`
|
||||
* :c:func:`i_x2_new`
|
||||
* :c:func:`integrale_new`
|
||||
* :c:func:`integrale_new_erf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -512,6 +528,84 @@ Providers
|
|||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_idx2_sq:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine ao_idx2_sq(i,j,ij)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index_2fold`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_idx2_sq_rev:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine ao_idx2_sq_rev(i,k,ik)
|
||||
|
||||
|
||||
reverse square compound index
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index_reverse_2fold`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_idx2_tri_key:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine ao_idx2_tri_key(i,j,ij)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index_2fold`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_idx2_tri_rev_key:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine ao_idx2_tri_rev_key(i,k,ik)
|
||||
|
||||
|
||||
return i<=k
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index_reverse_2fold`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_l4:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -550,12 +644,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
@ -584,13 +678,13 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_coef_normalized_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_expo_ordered_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_nucl`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
@ -601,6 +695,29 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`give_explicit_poly_and_gaussian`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_two_e_integral_zero:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/screening.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical function ao_two_e_integral_zero(i,j,k,l)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`is_periodic`
|
||||
* :c:data:`read_ao_two_e_integrals`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_two_e_integrals_in_map_collector:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -766,10 +883,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -803,9 +918,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -816,34 +929,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: dump_ao_integrals:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine dump_ao_integrals(filename)
|
||||
|
||||
|
||||
Save to disk the |AO| integrals
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_work_empty`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: eri:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -925,9 +1010,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
|
@ -941,6 +1023,37 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`two_e_integrals_index`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_ao_two_e_integral_periodic:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
complex*16 function get_ao_two_e_integral_periodic(i,j,k,l,map) result(result)
|
||||
|
||||
|
||||
Gets one AO bi-electronic integral from the AO map
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_periodic`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`map_get`
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index_2fold`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_ao_two_e_integrals:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -961,8 +1074,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
|
@ -994,9 +1105,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
|
@ -1035,8 +1144,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
@ -1067,8 +1174,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
@ -1080,6 +1185,29 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`two_e_integrals_index`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_ao_two_e_integrals_periodic:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine get_ao_two_e_integrals_periodic(j,k,l,sze,out_val)
|
||||
|
||||
|
||||
Gets multiple AO bi-electronic integral from the AO map .
|
||||
All i are retrieved for j,k,l fixed.
|
||||
physicist convention : <ij|kl>
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: give_polynom_mult_center_x:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1101,7 +1229,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`general_primitive_integral`
|
||||
* :c:func:`general_primitive_integral_erf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1141,6 +1268,31 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`i_x2_pol_mult`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: idx2_tri_int:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine idx2_tri_int(i,j,ij)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: idx2_tri_rev_int:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine idx2_tri_rev_int(i,k,ik)
|
||||
|
||||
|
||||
return i<=k
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: insert_into_ao_integrals_map:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1195,8 +1347,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`gauleg_t2`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1213,35 +1365,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`i_x1_new`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: load_ao_integrals:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
integer function load_ao_integrals(filename)
|
||||
|
||||
|
||||
Read from disk the |AO| integrals
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`cache_map_reallocate`
|
||||
* :c:func:`map_deinit`
|
||||
* :c:func:`map_sort`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: n_pt_sup:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1275,7 +1398,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ao_two_e_integrals_erf_in_map_slave`
|
||||
* :c:func:`ao_two_e_integrals_in_map_slave`
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1290,7 +1412,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
|
||||
|
||||
Gives a unique index for i,j,k,l using permtuation symmetry.
|
||||
i <-> k, j <-> l, and (i,k) <-> (j,l)
|
||||
i <-> k, j <-> l, and (i,k) <-> (j,l) for non-periodic systems
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1298,33 +1420,45 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_cache`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:func:`compute_ao_integrals_erf_jl`
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:func:`compute_ao_integrals_jl`
|
||||
* :c:func:`four_idx_novvvv`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integral`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integral_erf`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integrals_erf_non_zero`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integrals_non_zero`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integrals_non_zero_jl`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integrals_non_zero_jl_from_list`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integral_erf`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_coulomb_ii`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_erf`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_erf_coulomb_ii`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_erf_exch_ii`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_erf_i1j1`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_erf_ij`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_exch_ii`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_i1j1`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_ij`
|
||||
* :c:func:`get_two_e_integral`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:func:`test`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: two_e_integrals_index_2fold:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine two_e_integrals_index_2fold(i,j,k,l,i1)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_cache_periodic`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integral_periodic`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ao_idx2_sq`
|
||||
* :c:func:`ao_idx2_tri_key`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: two_e_integrals_index_reverse:
|
||||
|
|
@ -1347,11 +1481,23 @@ Subroutines / functions
|
|||
This rule is applied 3 times. First for the symmetry of the
|
||||
pairs (i,k) and (j,l), and then for the symmetry within each pair.
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. c:function:: two_e_integrals_index_reverse_2fold:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`ao_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine two_e_integrals_index_reverse_2fold(i,j,k,l,i1)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:func:`test`
|
||||
* :c:func:`ao_idx2_sq_rev`
|
||||
* :c:func:`ao_idx2_tri_rev_key`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -128,7 +128,7 @@ Providers
|
|||
.. c:var:: angular_quadrature_points
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`becke_numerical_grid/grid_becke.irp.f`
|
||||
File : :file:`becke_numerical_grid/angular_grid_pts.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
|
|
@ -224,31 +224,26 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_transp`
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_transp_xyz`
|
||||
* :c:data:`aos_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`aos_lapl_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num_grid_becke`
|
||||
* :c:data:`energy_c_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_c_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_c_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_sr_x_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_sr_x_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_x_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_pbe`
|
||||
* :c:data:`mos_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_at_r`
|
||||
* :c:data:`mos_in_r_array_omp`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_no_core_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: final_grid_points_per_atom
|
||||
|
|
@ -361,31 +356,26 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_transp`
|
||||
* :c:data:`aos_grad_in_r_array_transp_xyz`
|
||||
* :c:data:`aos_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`aos_lapl_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_sr_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_lda_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`aos_vxc_alpha_sr_pbe_w`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num_grid_becke`
|
||||
* :c:data:`energy_c_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_c_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_c_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_sr_x_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_sr_x_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_x_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_pbe`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_lda`
|
||||
* :c:data:`energy_x_sr_pbe`
|
||||
* :c:data:`mos_in_r_array`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_at_r`
|
||||
* :c:data:`mos_in_r_array_omp`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_no_core_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
|
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|
||||
.. c:var:: final_weight_at_r_vector_per_atom
|
||||
|
|
@ -484,7 +474,6 @@ Providers
|
|||
|
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* :c:data:`final_grid_points`
|
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* :c:data:`final_grid_points_per_atom`
|
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* :c:data:`one_e_dm_alpha_in_r`
|
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* :c:data:`weight_at_r`
|
||||
|
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|
||||
|
|
@ -556,31 +545,26 @@ Providers
|
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:columns: 3
|
||||
|
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* :c:data:`aos_grad_in_r_array`
|
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* :c:data:`aos_grad_in_r_array_transp`
|
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* :c:data:`aos_grad_in_r_array_transp_xyz`
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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.. c:var:: index_final_points_per_atom
|
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|
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@ -690,31 +674,26 @@ Providers
|
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:columns: 3
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`one_e_dm_no_core_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
|
||||
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||||
.. c:var:: m_knowles
|
||||
|
|
@ -765,43 +744,45 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
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|
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* :c:data:`pot_sr_scal_x_alpha_ao_pbe`
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|
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* :c:data:`pot_scal_xc_alpha_ao_sr_pbe`
|
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|
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* :c:data:`potential_c_alpha_ao_sr_lda`
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|
|
@ -854,6 +835,9 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
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|
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|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -869,7 +853,6 @@ Providers
|
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|
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|
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|
|
@ -896,6 +879,9 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
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|
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* :c:data:`grid_type_sgn`
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|
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Needed by:
|
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|
||||
|
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@ -911,7 +897,6 @@ Providers
|
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|
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@ -1019,7 +1004,7 @@ Providers
|
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.. c:var:: weights_angular_points
|
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|
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|
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File : :file:`becke_numerical_grid/grid_becke.irp.f`
|
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File : :file:`becke_numerical_grid/angular_grid_pts.irp.f`
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||||
|
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.. code:: fortran
|
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|
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|
|
@ -1069,10 +1054,10 @@ Subroutines / functions
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.. hlist::
|
||||
:columns: 3
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|
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* :c:data:`nucl_dist_inv`
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|
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* :c:data:`slater_bragg_type_inter_distance_ua`
|
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|
||||
|
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.. c:function:: derivative_knowles_function:
|
||||
|
|
@ -1105,11 +1090,11 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
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* :c:data:`final_weight_at_r`
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|
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|
|
|
|||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -87,20 +87,19 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
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|
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|
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* :c:data:`n_states`
|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
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* :c:data:`n_det`
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
||||
Calls:
|
||||
|
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|
|
@ -147,9 +146,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
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|
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* :c:data:`n_det`
|
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|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -185,9 +184,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
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|
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|
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* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -221,9 +220,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
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|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`n_int`
|
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|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -259,9 +258,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
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* :c:data:`n_int`
|
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|
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* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -297,20 +296,19 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
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* :c:data:`psi_coef`
|
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* :c:data:`n_states`
|
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* :c:data:`generators_bitmask`
|
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* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
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* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
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* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`s2_eig`
|
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* :c:data:`n_det_generators`
|
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* :c:data:`i_bitmask_gen`
|
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* :c:data:`n_int`
|
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* :c:data:`n_states`
|
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* :c:data:`psi_coef`
|
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|
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|
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* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
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* :c:data:`s2_eig`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -357,9 +355,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -395,9 +393,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -432,9 +430,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -470,9 +468,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -80,20 +80,26 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`generators_bitmask`
|
||||
* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`i_bitmask_gen`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run_cisd`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -140,9 +146,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -178,9 +184,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
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* :c:data:`mo_num`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -214,9 +220,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -252,9 +258,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -290,20 +296,26 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`generators_bitmask`
|
||||
* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`i_bitmask_gen`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run_cisd`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -350,9 +362,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -388,9 +400,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -425,9 +437,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -463,9 +475,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -483,3 +495,52 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`connected_to_hf`
|
||||
* :c:func:`fill_h_apply_buffer_no_selection`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: run_cisd:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`cisd_routine.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine run_cisd
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ci_electronic_energy`
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`pseudo_sym`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_cisd_energy`
|
||||
* :c:func:`h_apply_cisd`
|
||||
* :c:func:`h_apply_cisd_sym`
|
||||
* :c:func:`save_wavefunction`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
* :c:data:`c0_weight`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted_bit`
|
||||
* :c:data:`psi_occ_pattern`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -117,7 +117,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`s2_matrix_all_dets`
|
||||
* :c:data:`s_z`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
|
@ -162,7 +161,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`s2_matrix_all_dets`
|
||||
* :c:data:`s_z`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
|
@ -234,7 +232,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`s2_matrix_all_dets`
|
||||
* :c:data:`s_z`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
|
@ -245,20 +242,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: davidson_criterion
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`davidson/parameters.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
character(64) :: davidson_criterion
|
||||
|
||||
|
||||
Can be : [ energy | residual | both | wall_time | cpu_time | iterations ]
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: diag_algorithm
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -382,9 +365,9 @@ Providers
|
|||
double precision, allocatable :: psi_s2 (N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
psi_energy(i) = :math:`\langle \Psi_i | H | \Psi_i \rangle`
|
||||
psi_energy(i) = :math:`\langle \Psi_i | H | \Psi_i \rangle`
|
||||
|
||||
psi_s2(i) = :math:`\langle \Psi_i | S^2 | \Psi_i \rangle`
|
||||
psi_s2(i) = :math:`\langle \Psi_i | S^2 | \Psi_i \rangle`
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
|
|
@ -408,9 +391,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_energy_two_e`
|
||||
* :c:data:`psi_energy_with_nucl_rep`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: psi_energy_two_e
|
||||
|
|
@ -436,7 +417,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -474,9 +454,9 @@ Providers
|
|||
double precision, allocatable :: psi_s2 (N_states)
|
||||
|
||||
|
||||
psi_energy(i) = :math:`\langle \Psi_i | H | \Psi_i \rangle`
|
||||
psi_energy(i) = :math:`\langle \Psi_i | H | \Psi_i \rangle`
|
||||
|
||||
psi_s2(i) = :math:`\langle \Psi_i | S^2 | \Psi_i \rangle`
|
||||
psi_s2(i) = :math:`\langle \Psi_i | S^2 | \Psi_i \rangle`
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
|
|
@ -500,9 +480,28 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_energy_two_e`
|
||||
* :c:data:`psi_energy_with_nucl_rep`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: threshold_davidson_pt2
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`davidson/diagonalization_hs2_dressed.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision :: threshold_davidson_pt2
|
||||
|
||||
|
||||
Threshold of Davidson's algorithm, using PT2 as a guide
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -543,42 +542,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`davidson_pull_results`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: davidson_converged:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`davidson/parameters.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine davidson_converged(energy,residual,wall,iterations,cpu,N_st,converged)
|
||||
|
||||
|
||||
True if the Davidson algorithm is converged
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
* :c:data:`davidson_criterion`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`davidson_diag_hjj_sjj`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`cpu_time`
|
||||
* :c:func:`wall_time`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: davidson_diag_hjj_sjj:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -615,28 +578,30 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`dressed_column_idx`
|
||||
* :c:data:`expected_s2`
|
||||
* :c:data:`s_z`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`dressing_column_h`
|
||||
* :c:data:`ezfio_work_dir`
|
||||
* :c:data:`davidson_sze_max`
|
||||
* :c:data:`state_following`
|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`nproc`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:data:`disk_based_davidson`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
* :c:data:`only_expected_s2`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`dressed_column_idx`
|
||||
* :c:data:`dressing_column_h`
|
||||
* :c:data:`expected_s2`
|
||||
* :c:data:`ezfio_work_dir`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`nproc`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`only_expected_s2`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
* :c:data:`qp_max_mem`
|
||||
* :c:data:`s2_eig`
|
||||
* :c:data:`state_following`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson_from_pt2`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson_pt2`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -652,8 +617,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
|
||||
* :c:func:`c_f_pointer`
|
||||
* :c:func:`check_mem`
|
||||
* :c:func:`cpu_time`
|
||||
* :c:func:`davidson_converged`
|
||||
* :c:func:`dgemm`
|
||||
* :c:func:`dswap`
|
||||
* :c:func:`h_s2_u_0_nstates_openmp`
|
||||
|
|
@ -662,11 +625,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`mmap`
|
||||
* :c:func:`munmap`
|
||||
* :c:func:`normalize`
|
||||
* :c:func:`nullify_small_elements`
|
||||
* :c:func:`ortho_qr`
|
||||
* :c:func:`ortho_qr_unblocked`
|
||||
* :c:func:`random_number`
|
||||
* :c:func:`resident_memory`
|
||||
* :c:func:`sgemm`
|
||||
* :c:func:`wall_time`
|
||||
* :c:func:`write_double`
|
||||
* :c:func:`write_int`
|
||||
* :c:func:`write_time`
|
||||
|
|
@ -711,6 +675,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
|
||||
* :c:data:`dressing_column_h`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -751,8 +716,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -779,8 +744,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: davidson_push_results_async_recv:
|
||||
|
|
@ -820,8 +785,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -848,8 +813,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -907,13 +872,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
|
||||
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run_slave_main`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
|
|
@ -938,18 +896,18 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
* :c:data:`mpi_rank`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`mpi_initialized`
|
||||
* :c:data:`mpi_rank`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`nproc`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_columns_loc`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_values`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
||||
* :c:data:`nproc`
|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask_energy`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_columns_loc`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -986,24 +944,15 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`ci_electronic_energy`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`ci_electronic_energy`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`ci_electronic_energy`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:func:`remove_small_contributions`
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* :c:func:`run_cipsi`
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* :c:func:`run_stochastic_cipsi`
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Touches:
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|
@ -1040,9 +989,9 @@ Subroutines / functions
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_reverse`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
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* :c:data:`n_det`
|
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||||
Called by:
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|
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@ -1081,9 +1030,9 @@ Subroutines / functions
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.. hlist::
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:columns: 3
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* :c:data:`ref_bitmask_energy`
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* :c:data:`n_det`
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* :c:data:`n_int`
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* :c:data:`ref_bitmask_energy`
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||||
Called by:
|
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|
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@ -1108,7 +1057,7 @@ Subroutines / functions
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.. c:function:: h_s2_u_0_nstates_openmp_work_1:
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File : :file:`davidson/u0_h_u0.irp.f_template_645`
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File : :file:`davidson/u0_h_u0.irp.f_template_708`
|
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.. code:: fortran
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@ -1124,18 +1073,18 @@ Subroutines / functions
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.. hlist::
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:columns: 3
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`singles_beta_csc_idx`
|
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|
||||
Called by:
|
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|
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|
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@ -1160,7 +1109,7 @@ Subroutines / functions
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.. c:function:: h_s2_u_0_nstates_openmp_work_2:
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File : :file:`davidson/u0_h_u0.irp.f_template_708`
|
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|
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.. code:: fortran
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|
|
@ -1176,18 +1125,18 @@ Subroutines / functions
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.. hlist::
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:columns: 3
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`singles_beta_csc_idx`
|
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|
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Called by:
|
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|
||||
|
|
@ -1212,7 +1161,7 @@ Subroutines / functions
|
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.. c:function:: h_s2_u_0_nstates_openmp_work_3:
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|
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File : :file:`davidson/u0_h_u0.irp.f_template_708`
|
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|
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.. code:: fortran
|
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|
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|
|
@ -1228,18 +1177,18 @@ Subroutines / functions
|
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.. hlist::
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:columns: 3
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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Called by:
|
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|
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|
|
@ -1264,7 +1213,7 @@ Subroutines / functions
|
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.. c:function:: h_s2_u_0_nstates_openmp_work_4:
|
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|
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|
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File : :file:`davidson/u0_h_u0.irp.f_template_645`
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File : :file:`davidson/u0_h_u0.irp.f_template_708`
|
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|
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.. code:: fortran
|
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|
||||
|
|
@ -1280,18 +1229,18 @@ Subroutines / functions
|
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.. hlist::
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:columns: 3
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`singles_beta_csc_idx`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1316,7 +1265,7 @@ Subroutines / functions
|
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.. c:function:: h_s2_u_0_nstates_openmp_work_n_int:
|
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|
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|
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File : :file:`davidson/u0_h_u0.irp.f_template_645`
|
||||
File : :file:`davidson/u0_h_u0.irp.f_template_708`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
|
|
@ -1332,18 +1281,18 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
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:columns: 3
|
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|
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|
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* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
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* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
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* :c:data:`singles_beta_csc`
|
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* :c:data:`singles_beta_csc_idx`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1388,17 +1337,18 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
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* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
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* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_reverse`
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_columns_loc`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1443,9 +1393,9 @@ Subroutines / functions
|
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.. hlist::
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||||
:columns: 3
|
||||
|
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|
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|
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|
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* :c:data:`n_det`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1483,9 +1433,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask_energy`
|
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* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask_energy`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1525,16 +1475,16 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
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* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
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|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1575,16 +1525,16 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
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* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
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|
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* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_values`
|
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|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_columns_loc`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
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|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_values`
|
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|
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* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1625,16 +1575,16 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_rows_loc`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_values`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_columns_loc`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
||||
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|
||||
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|
||||
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|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
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* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1675,16 +1625,16 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_rows_loc`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_values`
|
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* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_columns_loc`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_rows_loc`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_values`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1725,16 +1675,16 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_rows_loc`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_values`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`nthreads_davidson`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_columns_loc`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_order_transp_reverse`
|
||||
* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_rows_loc`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_transp_values`
|
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* :c:data:`psi_bilinear_matrix_values`
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* :c:data:`psi_det_alpha_unique`
|
||||
* :c:data:`psi_det_beta_unique`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1774,20 +1724,13 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`print_summary`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: u_0_h_u_0:
|
||||
|
|
@ -1812,11 +1755,11 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`h_matrix_all_dets`
|
||||
* :c:data:`s2_matrix_all_dets`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`h_matrix_all_dets`
|
||||
* :c:data:`n_det_max_full`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`s2_matrix_all_dets`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1881,9 +1824,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_states_diag`
|
||||
* :c:data:`zmq_state`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -146,14 +146,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_at_r`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_in_r`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_alpha_ao_for_dft_no_core
|
||||
|
|
@ -181,12 +173,64 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft_no_core`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_average_alpha_mo_for_dft
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`density_for_dft/density_for_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: one_e_dm_average_alpha_mo_for_dft (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_no_core_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_mo_for_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_average_beta_mo_for_dft
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`density_for_dft/density_for_dft.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: one_e_dm_average_beta_mo_for_dft (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_mo_for_dft`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_average_mo_for_dft
|
||||
|
|
@ -206,16 +250,9 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_alpha_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_beta_mo_for_dft`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`short_range_hartree_operator`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_beta_ao_for_dft
|
||||
|
|
@ -246,14 +283,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_at_r`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_in_r`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_beta_ao_for_dft_no_core
|
||||
|
|
@ -281,12 +310,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft_no_core`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_no_core_and_grad_alpha_in_r`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_mo_alpha_for_dft
|
||||
|
|
@ -311,7 +334,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`density_for_dft`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
|
@ -328,11 +351,9 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_alpha_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`psi_dft_energy_kinetic`
|
||||
* :c:data:`trace_v_xc`
|
||||
* :c:data:`trace_v_xc_new`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_mo_alpha_for_dft_no_core
|
||||
|
|
@ -352,7 +373,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
|
@ -388,7 +409,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
* :c:data:`density_for_dft`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
|
@ -405,11 +426,9 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_beta_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`psi_dft_energy_kinetic`
|
||||
* :c:data:`trace_v_xc`
|
||||
* :c:data:`trace_v_xc_new`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: one_e_dm_mo_beta_for_dft_no_core
|
||||
|
|
@ -429,7 +448,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
|
@ -464,11 +483,4 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`short_range_hartree_operator`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -107,10 +107,4 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`correlation_functional`
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_potential_alpha_xc`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -76,7 +76,6 @@ Providers
|
|||
|
||||
* :c:data:`diagonal_h_matrix_on_psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_hii`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_diag_h_mat`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: elec_num_tab
|
||||
|
|
@ -108,5 +107,4 @@ Providers
|
|||
|
||||
* :c:data:`diagonal_h_matrix_on_psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_hii`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_diag_h_mat`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -97,6 +97,7 @@ Providers
|
|||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: do_only_1h1p
|
||||
logical :: do_only_cas
|
||||
logical :: do_ddci
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -112,6 +113,23 @@ Providers
|
|||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: do_only_1h1p
|
||||
logical :: do_only_cas
|
||||
logical :: do_ddci
|
||||
|
||||
|
||||
In the FCI case, all those are always false
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: do_only_cas
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`fci/class.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical :: do_only_1h1p
|
||||
logical :: do_only_cas
|
||||
logical :: do_ddci
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -86,8 +86,10 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`is_periodic`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`read_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
|
|
@ -130,8 +132,10 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`is_periodic`
|
||||
* :c:data:`n_pt_max_integrals`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`read_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
|
|
@ -339,12 +343,14 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_coef`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_guess_type`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -361,6 +367,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`ezfio_has_mo_basis_mo_coef`
|
||||
* :c:func:`huckel_guess`
|
||||
* :c:func:`mo_as_eigvectors_of_mo_matrix`
|
||||
* :c:func:`restore_symmetry`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
|
|
@ -372,51 +379,3 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: run:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`hartree_fock/scf.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine run
|
||||
|
||||
|
||||
Run SCF calculation
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`pt2`
|
||||
* :c:func:`scf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_hartree_fock_energy`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -118,10 +118,10 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`extrapolated_energy`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -139,7 +139,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_summary(e_,pt2_,error_,variance_,norm_,n_det_,n_occ_pattern_,n_st,s2_)
|
||||
subroutine print_summary(e_,pt2_data,pt2_data_err,n_det_,n_occ_pattern_,n_st,s2_)
|
||||
|
||||
|
||||
Print the extrapolated energy in the output
|
||||
|
|
@ -185,11 +185,11 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`energy_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_iter`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`pt2_iterations`
|
||||
* :c:data:`n_det_iterations`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -461,8 +461,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
* :c:data:`correlation_functional`
|
||||
* :c:data:`exchange_functional`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -68,6 +68,49 @@ EZFIO parameters
|
|||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_class
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_basis/mo_class.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
character*(32), allocatable :: mo_class (mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
[ Core | Inactive | Active | Virtual | Deleted ], as defined by :ref:`qp_set_mo_class`
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`output_wall_time_0`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`full_ijkl_bitmask`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_all_but_del_orb`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`list_del`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_all_but_del_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_del_orb`
|
||||
* :c:data:`n_inact_orb`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_coef
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -100,11 +143,8 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_in_ao_ortho_basis`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_novirt`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
|
|
@ -113,32 +153,34 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_spin_density_ao`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_coef_begin_iteration
|
||||
.. c:var:: mo_coef_imag
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_basis/track_orb.irp.f`
|
||||
File : :file:`mo_basis/mos.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mo_coef_begin_iteration (ao_num,mo_num)
|
||||
double precision, allocatable :: mo_coef_imag (ao_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
Void provider to store the coefficients of the |MO| basis at the beginning of the SCF iteration
|
||||
Molecular orbital coefficients on |AO| basis set
|
||||
|
||||
Usefull to track some orbitals
|
||||
mo_coef_imag(i,j) = coefficient of the i-th |AO| on the jth |MO|
|
||||
|
||||
mo_label : Label characterizing the |MOs| (local, canonical, natural, etc)
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
|
|
@ -146,7 +188,9 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -202,9 +246,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
|
||||
|
|
@ -269,33 +311,31 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_canonical_nucl_elec_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_ortho_lowdin_nucl_elec_integrals`
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator_erf`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_alpha_mo`
|
||||
* :c:data:`data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`fock_operator_closed_shell_ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`fock_wee_closed_shell`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`full_ijkl_bitmask`
|
||||
* :c:data:`int_erf_3_index`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_all_but_del_orb`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`list_core_inact`
|
||||
* :c:data:`list_core_inact_act`
|
||||
* :c:data:`list_del`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_inact_act`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_begin_iteration`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_imag`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_in_ao_ortho_basis`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
|
|
@ -305,21 +345,34 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integral_jj_from_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_vv_from_ao`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_all_but_del_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_del_orb`
|
||||
* :c:data:`n_inact_orb`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
* :c:data:`one_body_dm_mo_alpha_one_det`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_alpha_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_beta_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_average_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_dagger_mo_spin_index`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_average`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft_no_core`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_diff`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_spin_index`
|
||||
* :c:data:`one_e_spin_density_ao`
|
||||
* :c:data:`one_e_spin_density_mo`
|
||||
|
|
@ -408,23 +461,23 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:func:`four_idx_novvvv`
|
||||
* :c:data:`mo_dipole_x`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e_per_atom`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_spread_x`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_alpha_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_mo_beta_for_dft`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -432,6 +485,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`dgemm`
|
||||
* :c:func:`restore_symmetry`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: give_all_mos_and_grad_and_lapl_at_r:
|
||||
|
|
@ -451,8 +505,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -479,8 +533,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -507,8 +561,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -519,36 +573,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`give_all_aos_at_r`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: initialize_mo_coef_begin_iteration:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_basis/track_orb.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine initialize_mo_coef_begin_iteration
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Initialize :c:data:`mo_coef_begin_iteration` to the current :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_coef_begin_iteration`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`damping_scf`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: mix_mo_jk:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -593,20 +617,10 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`create_guess`
|
||||
* :c:func:`damping_scf`
|
||||
* :c:func:`hcore_guess`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -634,10 +648,10 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -665,10 +679,10 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -687,45 +701,36 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`write_time`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: reorder_core_orb:
|
||||
.. c:function:: mo_coef_new_as_svd_vectors_of_mo_matrix_eig:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_basis/track_orb.irp.f`
|
||||
File : :file:`mo_basis/utils.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine reorder_core_orb
|
||||
subroutine mo_coef_new_as_svd_vectors_of_mo_matrix_eig(matrix,lda,m,n,mo_coef_before,eig,mo_coef_new)
|
||||
|
||||
|
||||
routines that takes the current :c:data:`mo_coef` and reorder the core orbitals (see :c:data:`list_core` and :c:data:`n_core_orb`) according to the overlap with :c:data:`mo_coef_begin_iteration`
|
||||
You enter with matrix in the MO basis defined with the mo_coef_before.
|
||||
|
||||
You SVD the matrix and set the eigenvectors as mo_coef_new ordered by increasing singular values
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_begin_iteration`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`damping_scf`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`dsort`
|
||||
* :c:func:`dgemm`
|
||||
* :c:func:`svd`
|
||||
* :c:func:`write_time`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: save_mos:
|
||||
|
|
@ -744,28 +749,21 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`damping_scf`
|
||||
* :c:func:`hcore_guess`
|
||||
* :c:func:`huckel_guess`
|
||||
* :c:func:`roothaan_hall_scf`
|
||||
* :c:func:`rotate_mos`
|
||||
* :c:func:`save_natural_mos`
|
||||
* :c:func:`save_ortho_mos`
|
||||
* :c:func:`sort_by_fock_energies`
|
||||
* :c:func:`swap_mos`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -773,6 +771,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_ao_md5`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_class`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_coef`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_label`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_num`
|
||||
|
|
@ -780,6 +779,36 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`system`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: save_mos_no_occ:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_basis/utils.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine save_mos_no_occ
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_coef`
|
||||
* :c:func:`system`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: save_mos_truncated:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -796,12 +825,13 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -809,6 +839,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_ao_md5`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_class`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_coef`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_label`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_basis_mo_num`
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -176,7 +176,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`read_mo_integrals_e_n`
|
||||
* :c:data:`read_mo_integrals_n_e`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -264,11 +264,9 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`do_pseudo`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:data:`mo_kinetic_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_pseudo_integrals`
|
||||
* :c:data:`read_mo_one_e_integrals`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
|
@ -277,7 +275,6 @@ Providers
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`core_energy`
|
||||
* :c:data:`core_energy_erf`
|
||||
* :c:data:`fock_operator_closed_shell_ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`psi_energy_h_core`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask_energy`
|
||||
|
|
@ -331,12 +328,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`read_mo_integrals_pseudo`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_spread_x
|
||||
|
|
@ -445,12 +436,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -477,15 +462,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`s_mo_coef`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -513,8 +491,16 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft`
|
||||
* :c:data:`one_e_dm_alpha_ao_for_dft_no_core`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -540,26 +526,27 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`lin_dep_cutoff`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_overlap`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`save_ortho_mos`
|
||||
* :c:func:`scf`
|
||||
* :c:func:`save_natural_mos`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`nullify_small_elements`
|
||||
* :c:func:`ortho_lowdin`
|
||||
* :c:func:`restore_symmetry`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
|
|
@ -567,5 +554,4 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -57,7 +57,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
|
@ -82,12 +82,14 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -403,7 +405,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
|
|
@ -472,7 +473,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
|
|
@ -506,7 +506,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
|
|
@ -578,14 +577,14 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -796,8 +795,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -830,8 +829,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -925,11 +924,11 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_int_erf_jj`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: save_erf_two_e_integrals_mo:
|
||||
|
|
@ -948,9 +947,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -985,9 +984,9 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_erf_map`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -43,28 +43,40 @@ EZFIO parameters
|
|||
|
||||
Default: 1.e-15
|
||||
|
||||
.. option:: no_vvvv_integrals
|
||||
|
||||
If `True`, computes all integrals except for the integrals having 4 virtual indices
|
||||
|
||||
Default: False
|
||||
|
||||
.. option:: no_ivvv_integrals
|
||||
|
||||
Can be switched on only if `no_vvvv_integrals` is `True`, then does not compute the integrals with 3 virtual indices and 1 belonging to the core inactive active orbitals
|
||||
|
||||
Default: False
|
||||
|
||||
.. option:: no_vvv_integrals
|
||||
|
||||
Can be switched on only if `no_vvvv_integrals` is `True`, then does not compute the integrals with 3 virtual orbitals
|
||||
|
||||
Default: False
|
||||
|
||||
|
||||
Providers
|
||||
---------
|
||||
|
||||
.. c:var:: banned_excitation
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_two_e_ints/map_integrals.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
logical, allocatable :: banned_excitation (mo_num,mo_num)
|
||||
|
||||
|
||||
If true, the excitation is banned in the selection. Useful with local MOs.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_jj`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: big_array_coulomb_integrals
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -85,6 +97,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
|
|
@ -96,7 +109,6 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`coef_hf_selector`
|
||||
* :c:data:`h_matrix_all_dets`
|
||||
* :c:data:`h_matrix_cas`
|
||||
|
||||
|
|
@ -121,6 +133,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
|
|
@ -132,7 +145,6 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`coef_hf_selector`
|
||||
* :c:data:`h_matrix_all_dets`
|
||||
* :c:data:`h_matrix_cas`
|
||||
|
||||
|
|
@ -154,7 +166,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_jj`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
|
@ -179,12 +191,15 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -226,6 +241,30 @@ Providers
|
|||
* :c:func:`map_update`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_coef_novirt
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_two_e_ints/four_idx_novvvv.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
double precision, allocatable :: mo_coef_novirt (ao_num,n_core_inact_act_orb)
|
||||
|
||||
|
||||
MO coefficients without virtual MOs
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`list_core_inact_act`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`n_core_inact_act_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: mo_integrals_cache
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -417,8 +456,8 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`coef_hf_selector`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator`
|
||||
* :c:data:`fock_operator_closed_shell_ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`fock_wee_closed_shell`
|
||||
|
|
@ -453,8 +492,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
|
@ -480,12 +517,12 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`core_inact_act_bitmask_4`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`full_ijkl_bitmask_4`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_core_inact_act`
|
||||
* :c:data:`mo_class`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
|
|
@ -493,9 +530,8 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`n_core_inact_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`no_ivvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`no_vvvv_integrals`
|
||||
* :c:data:`read_mo_two_e_integrals`
|
||||
|
||||
|
|
@ -504,9 +540,12 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`act_2_rdm_aa_mo`
|
||||
* :c:data:`act_2_rdm_ab_mo`
|
||||
* :c:data:`act_2_rdm_bb_mo`
|
||||
* :c:data:`act_2_rdm_spin_trace_mo`
|
||||
* :c:data:`big_array_coulomb_integrals`
|
||||
* :c:data:`ci_electronic_energy`
|
||||
* :c:data:`coef_hf_selector`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator`
|
||||
* :c:data:`fock_operator_closed_shell_ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`fock_wee_closed_shell`
|
||||
|
|
@ -537,6 +576,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
|
|
@ -573,6 +613,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
|
|
@ -612,8 +653,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
|
@ -643,6 +682,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
|
|
@ -682,8 +722,6 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
|
|
@ -717,15 +755,13 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -754,15 +790,13 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -791,15 +825,13 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap_abs`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`do_direct_integrals`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_virt`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`n_virt_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -824,13 +856,13 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
|
@ -838,6 +870,7 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`four_idx_novvvv2`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
@ -846,7 +879,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`bitstring_to_list`
|
||||
* :c:func:`bitstring_to_str`
|
||||
* :c:func:`cpu_time`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:func:`insert_into_mo_integrals_map`
|
||||
|
|
@ -872,22 +904,15 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
|
|
@ -919,29 +944,21 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_transp`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`bitstring_to_list`
|
||||
* :c:func:`bitstring_to_str`
|
||||
* :c:func:`cpu_time`
|
||||
* :c:func:`get_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:func:`insert_into_mo_integrals_map`
|
||||
|
|
@ -950,6 +967,44 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`wall_time`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: ao_to_mo_novirt:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_two_e_ints/four_idx_novvvv.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine ao_to_mo_novirt(A_ao,LDA_ao,A_mo,LDA_mo)
|
||||
|
||||
|
||||
Transform A from the |AO| basis to the |MO| basis excluding virtuals
|
||||
|
||||
$C^\dagger.A_{ao}.C$
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef_novirt`
|
||||
* :c:data:`n_core_inact_act_orb`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`four_idx_novvvv`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`dgemm`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: clear_mo_map:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1005,6 +1060,81 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`ezfio_set_work_empty`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: four_idx_novvvv:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_two_e_ints/four_idx_novvvv.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine four_idx_novvvv
|
||||
|
||||
|
||||
Retransform MO integrals for next CAS-SCF step
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`list_core_inact_act`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_core_inact_act_orb`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ao_to_mo`
|
||||
* :c:func:`ao_to_mo_novirt`
|
||||
* :c:func:`map_append`
|
||||
* :c:func:`map_shrink`
|
||||
* :c:func:`map_sort`
|
||||
* :c:func:`map_unique`
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: four_idx_novvvv2:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`mo_two_e_ints/four_idx_novvvv.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine four_idx_novvvv2
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`core_inact_act_bitmask_4`
|
||||
* :c:data:`full_ijkl_bitmask_4`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`virt_bitmask`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`add_integrals_to_map`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_mo_map_size:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -1043,17 +1173,18 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`get_d0`
|
||||
* :c:func:`get_d1`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_i1j1`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals_ij`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1092,14 +1223,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:data:`fock_operator_closed_shell_ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`fock_wee_closed_shell`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`map_get_many`
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_mo_two_e_integrals_exch_ii:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1130,14 +1253,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:data:`fock_operator_closed_shell_ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`fock_wee_closed_shell`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`map_get_many`
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_mo_two_e_integrals_i1j1:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1159,18 +1274,13 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`i2radix_sort`
|
||||
* :c:func:`i8radix_sort`
|
||||
* :c:func:`iradix_sort`
|
||||
* :c:func:`map_get_many`
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_mo_two_e_integrals_ij:
|
||||
|
|
@ -1187,24 +1297,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
i(1)j(2) 1/r12 k(1)l(2)
|
||||
i, j for k,l fixed.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`i2radix_sort`
|
||||
* :c:func:`i8radix_sort`
|
||||
* :c:func:`iradix_sort`
|
||||
* :c:func:`map_get_many`
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index`
|
||||
* :c:func:`get_mo_two_e_integrals`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: get_two_e_integral:
|
||||
|
|
@ -1224,9 +1322,10 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`banned_excitation`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_cache_min`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -1306,7 +1405,6 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`add_integrals_to_map`
|
||||
* :c:func:`add_integrals_to_map_erf`
|
||||
* :c:func:`add_integrals_to_map_no_exit_34`
|
||||
* :c:func:`add_integrals_to_map_three_indices`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -38,7 +38,7 @@ EZFIO parameters
|
|||
Nuclear coordinates in the format (:, {x,y,z})
|
||||
|
||||
|
||||
.. option:: disk_access_nuclear_repulsion
|
||||
.. option:: io_nuclear_repulsion
|
||||
|
||||
Read/Write Nuclear Repulsion from/to disk [ Write | Read | None ]
|
||||
|
||||
|
|
@ -255,10 +255,7 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_local`
|
||||
* :c:data:`ao_pseudo_integrals_non_local`
|
||||
* :c:data:`ao_spread_x`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_erf_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_schwartz`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_erf_in_map`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`center_of_mass`
|
||||
* :c:data:`inertia_tensor`
|
||||
|
|
@ -498,7 +495,7 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`disk_access_nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`io_nuclear_repulsion`
|
||||
* :c:data:`mpi_master`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
|
|
@ -512,11 +509,7 @@ Providers
|
|||
|
||||
* :c:data:`ci_energy`
|
||||
* :c:data:`core_energy`
|
||||
* :c:data:`core_energy_erf`
|
||||
* :c:data:`hf_energy`
|
||||
* :c:data:`psi_energy_with_nucl_rep`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: slater_bragg_radii
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -218,10 +218,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`h_apply_buffer_allocated`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -252,11 +254,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -287,11 +290,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -322,11 +326,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -357,11 +362,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
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* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -392,11 +398,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
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* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
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* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
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* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -427,11 +434,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
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* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -461,11 +469,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -497,11 +506,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -533,11 +543,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
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* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -569,11 +580,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -605,11 +617,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -641,11 +654,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det_generators`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -676,11 +690,11 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -721,11 +735,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -766,10 +781,11 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -811,11 +827,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -856,12 +873,13 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`ref_bitmask`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -902,11 +920,12 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_det_selectors`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors`
|
||||
* :c:data:`psi_selectors_size`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -944,16 +963,16 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`n_det_generators`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
* :c:data:`psi_det_size`
|
||||
* :c:data:`psi_det_sorted`
|
||||
* :c:data:`selection_criterion`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -178,9 +178,11 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -206,8 +208,8 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -221,8 +223,10 @@ Providers
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`dgecon`
|
||||
* :c:func:`dgemm`
|
||||
* :c:func:`dsysvx`
|
||||
* :c:func:`dgesv`
|
||||
* :c:func:`dgetrf`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:var:: fock_matrix_ao
|
||||
|
|
@ -297,8 +301,10 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
|
@ -346,8 +352,10 @@ Providers
|
|||
* :c:data:`fock_matrix_mo_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo_beta`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`list_core`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
||||
Needed by:
|
||||
|
|
@ -637,18 +645,18 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`n_it_scf_max`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`scf_density_matrix_ao_beta`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
* :c:data:`thresh_scf`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -690,14 +698,15 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`ao_overlap`
|
||||
* :c:data:`ao_two_e_integral_alpha`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -711,6 +720,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`orthonormalize_mos`
|
||||
* :c:func:`restore_symmetry`
|
||||
* :c:func:`save_mos`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
|
@ -740,34 +751,27 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
* :c:data:`ao_md5`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`thresh_scf`
|
||||
* :c:data:`scf_algorithm`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`eigenvectors_fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`n_it_scf_max`
|
||||
* :c:data:`threshold_diis_nonzero`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_ao`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
* :c:data:`fps_spf_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`frozen_orb_scf`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`max_dim_diis`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
* :c:data:`n_it_scf_max`
|
||||
* :c:data:`scf_algorithm`
|
||||
* :c:data:`scf_energy`
|
||||
* :c:data:`thresh_scf`
|
||||
* :c:data:`threshold_diis_nonzero`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -777,6 +781,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`extrapolate_fock_matrix`
|
||||
* :c:func:`initialize_mo_coef_begin_iteration`
|
||||
* :c:func:`mo_as_eigvectors_of_mo_matrix`
|
||||
* :c:func:`nullify_small_elements`
|
||||
* :c:func:`orthonormalize_mos`
|
||||
* :c:func:`reorder_core_orb`
|
||||
* :c:func:`save_mos`
|
||||
* :c:func:`write_double`
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -33,6 +33,76 @@ Programs
|
|||
Subroutines / functions
|
||||
-----------------------
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_energy:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`print_energy.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_energy
|
||||
|
||||
|
||||
Prints the energy of the wave function stored in the |EZFIO| directory.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: print_hamiltonian:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`print_hamiltonian.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine print_hamiltonian
|
||||
|
||||
|
||||
Prints the Hamiltonian matrix defined in the space of determinants
|
||||
present in the |EZFIO| directory.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`run`
|
||||
|
||||
Touches:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: routine:
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -80,8 +150,8 @@ Subroutines / functions
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
|
|
@ -138,3 +208,41 @@ Subroutines / functions
|
|||
* :c:func:`ezfio_set_aux_quantities_data_one_e_dm_beta_ao`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_aux_quantities_data_one_e_dm_beta_mo`
|
||||
|
||||
|
||||
.. c:function:: run:
|
||||
|
||||
|
||||
File : :file:`print_hamiltonian.irp.f`
|
||||
|
||||
.. code:: fortran
|
||||
|
||||
subroutine run
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_det`
|
||||
* :c:data:`n_int`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
|
||||
Called by:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`print_energy`
|
||||
* :c:func:`print_hamiltonian`
|
||||
* :c:func:`pt2`
|
||||
* :c:func:`scf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`i_h_j`
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -29,7 +29,7 @@ be used. In addition, all the shell scripts should be under
|
|||
|
||||
The exit code of the script should be 0 upon success only.
|
||||
|
||||
Bash and Python2 are the only shell scripting language permitted for
|
||||
Bash and Python3 are the only shell scripting language permitted for
|
||||
executables.
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -73,11 +73,10 @@ Bash
|
|||
Python
|
||||
------
|
||||
|
||||
Only Python2 is supported. The reason is that some dependencies use Python2,
|
||||
and we do not want yet to add an extra dependency to Python3.
|
||||
Only Python3 is supported.
|
||||
|
||||
Python scripts should start with ``#!/usr/bin/env python2`` to mention
|
||||
explicitly that Python2 has to be used.
|
||||
Python scripts should start with ``#!/usr/bin/env python3`` to mention
|
||||
explicitly that Python3 has to be used, possibly from a conda installation.
|
||||
|
||||
:command:`pylint` should be used to increase the quality of the source code.
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -22,7 +22,7 @@ cisd
|
|||
* **Ground state calculation**: if even after a :c:func:`cis` calculation, natural
|
||||
orbitals (see :c:func:`save_natorb`) and then :c:func:`scf` optimization, you are not sure to have the lowest scf
|
||||
solution,
|
||||
do the same strategy with the :c:func:`cisd` executable instead of the :c:func:`cis` exectuable to generate the natural
|
||||
do the same strategy with the :c:func:`cisd` executable instead of the :c:func:`cis` exectuable to generate the natural
|
||||
orbitals as a guess for the :c:func:`scf`.
|
||||
|
||||
|
||||
|
|
@ -57,6 +57,7 @@ cisd
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`n_states`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -48,10 +48,10 @@ fci
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`is_zmq_slave`
|
||||
* :c:data:`do_pt2`
|
||||
* :c:data:`is_zmq_slave`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`psi_coef`
|
||||
* :c:data:`psi_det`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
@ -87,9 +87,11 @@ fci
|
|||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
* :c:data:`pt2_match_weight`
|
||||
* :c:data:`pt2_overlap`
|
||||
* :c:data:`pt2_stoch_istate`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
* :c:data:`selection_weight`
|
||||
* :c:data:`state_average_weight`
|
||||
* :c:data:`threshold_davidson_pt2`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
* :c:data:`variance_match_weight`
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -31,15 +31,16 @@ fcidump
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator`
|
||||
* :c:data:`elec_num`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`list_inact`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`core_energy`
|
||||
* :c:data:`core_fock_operator`
|
||||
* :c:data:`elec_alpha_num`
|
||||
* :c:data:`elec_beta_num`
|
||||
* :c:data:`elec_num`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`list_act`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_map`
|
||||
* :c:data:`mo_integrals_threshold`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`n_act_orb`
|
||||
* :c:data:`n_core_orb`
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -19,10 +19,10 @@ ks_scf
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mu_erf_dft`
|
||||
* :c:data:`density_for_dft`
|
||||
* :c:data:`io_ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mu_erf_dft`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -16,21 +16,21 @@ molden
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`nucl_list_shell_aos`
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_coef`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`ao_l`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`ao_expo`
|
||||
* :c:data:`ao_l`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`ao_power`
|
||||
* :c:data:`ao_prim_num`
|
||||
* :c:data:`element_name`
|
||||
* :c:data:`ezfio_filename`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
* :c:data:`nucl_charge`
|
||||
* :c:data:`nucl_coord`
|
||||
* :c:data:`nucl_list_shell_aos`
|
||||
* :c:data:`nucl_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -30,8 +30,8 @@ pt2
|
|||
* :c:data:`is_zmq_slave`
|
||||
* :c:data:`mo_two_e_integrals_in_map`
|
||||
* :c:data:`psi_energy`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
* :c:data:`threshold_generators`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
@ -46,12 +46,7 @@ pt2
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`distributed_davidson`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`pt2_e0_denominator`
|
||||
* :c:data:`pt2_stoch_istate`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -19,8 +19,8 @@ rotate_mos
|
|||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -19,10 +19,10 @@ rs_ks_scf
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mu_erf_dft`
|
||||
* :c:data:`density_for_dft`
|
||||
* :c:data:`io_ao_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`mu_erf_dft`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -32,8 +32,8 @@ save_natorb
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_e_n`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_kinetic`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_n_e`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_integrals_pseudo`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_one_e_ints_io_mo_one_e_integrals`
|
||||
* :c:func:`ezfio_set_mo_two_e_ints_io_mo_two_e_integrals`
|
||||
|
|
@ -45,5 +45,6 @@ save_natorb
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_occ`
|
||||
* :c:data:`read_wf`
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -17,6 +17,13 @@ save_ortho_mos
|
|||
|
||||
Thanks to the Lowdin orthonormalization, the new MOs are the most similar to the guess MOs.
|
||||
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -58,9 +58,5 @@ scf
|
|||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_ao_alpha`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`level_shift`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_label`
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -18,10 +18,10 @@ sort_by_fock_energies
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`ao_num`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
* :c:data:`fock_matrix_mo`
|
||||
* :c:data:`mo_coef`
|
||||
* :c:data:`mo_num`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -10,10 +10,9 @@ test
|
|||
|
||||
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
Needs:
|
||||
|
||||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index`
|
||||
* :c:func:`two_e_integrals_index_reverse`
|
||||
* :c:data:`mo_one_e_integrals`
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -17,8 +17,8 @@ write_integrals_erf
|
|||
.. hlist::
|
||||
:columns: 3
|
||||
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_ao_two_e_integrals`
|
||||
* :c:data:`io_mo_two_e_integrals`
|
||||
|
||||
Calls:
|
||||
|
||||
|
|
|
|||
|
|
@ -1,493 +0,0 @@
|
|||
%%% ARXIV TO BE UPDATED %%%
|
||||
@article{Loos2020Jan,
|
||||
author = {Loos, Pierre-François and Scemama, Anthony and Jacquemin, Denis},
|
||||
title = {{The Quest For Highly Accurate Excitation Energies: A Computational Perspective}},
|
||||
journal = {arXiv},
|
||||
year = {2020},
|
||||
month = {Jan},
|
||||
eprint = {2001.00416},
|
||||
url = {https://arxiv.org/abs/2001.00416}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Loos2019Dec,
|
||||
author = {Loos, Pierre-François and Lipparini, Filippo and Boggio-Pasqua, Martial and Scemama, Anthony and Jacquemin, Denis},
|
||||
title = {{A Mountaineering Strategy to Excited States: Highly-Accurate Energies and Benchmarks for Medium Size Molecules}},
|
||||
journal = {arXiv},
|
||||
year = {2019},
|
||||
month = {Dec},
|
||||
eprint = {1912.04173},
|
||||
url = {https://arxiv.org/abs/1912.04173}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Loos2019Oct,
|
||||
author = {Loos, Pierre-François and Pradines, Barthélémy and Scemama, Anthony and Giner, Emmanuel and Toulouse, Julien},
|
||||
title = {{A Density-Based Basis-Set Incompleteness Correction for GW Methods}},
|
||||
journal = {arXiv},
|
||||
year = {2019},
|
||||
month = {Oct},
|
||||
eprint = {1910.12238},
|
||||
url = {https://arxiv.org/abs/1910.12238}
|
||||
}
|
||||
|
||||
%%%% PUBLISHED PAPERS
|
||||
@article{Hollett2020Jan,
|
||||
author = {Hollett, Joshua W. and Loos, Pierre-Fran{\c{c}}ois},
|
||||
title = {{Capturing static and dynamic correlation with {$\Delta$}NO-MP2 and {$\Delta$}NO-CCSD}},
|
||||
journal = {J. Chem. Phys.},
|
||||
volume = {152},
|
||||
number = {1},
|
||||
pages = {014101},
|
||||
year = {2020},
|
||||
month = {Jan},
|
||||
issn = {0021-9606},
|
||||
publisher = {American Institute of Physics},
|
||||
doi = {10.1063/1.5140669}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Giner2019Oct,
|
||||
author = {Giner, Emmanuel and Scemama, Anthony and Toulouse, Julien and Loos, Pierre-Fran{\c{c}}ois},
|
||||
title = {{Chemically accurate excitation energies with small basis sets}},
|
||||
journal = {J. Chem. Phys.},
|
||||
volume = {151},
|
||||
number = {14},
|
||||
pages = {144118},
|
||||
year = {2019},
|
||||
month = {Oct},
|
||||
issn = {0021-9606},
|
||||
publisher = {American Institute of Physics},
|
||||
doi = {10.1063/1.5122976}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
@article{Burton2019Sep,
|
||||
author = {Burton, Hugh G. A. and Thom, Alex J. W.},
|
||||
title = {{General Approach for Multireference Ground and Excited States Using Nonorthogonal Configuration Interaction}},
|
||||
journal = {J. Chem. Theory Comput.},
|
||||
volume = {15},
|
||||
number = {9},
|
||||
pages = {4851--4861},
|
||||
year = {2019},
|
||||
month = {Sep},
|
||||
issn = {1549-9618},
|
||||
publisher = {American Chemical Society},
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.9b00441}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Dash_2019,
|
||||
author = {Dash, Monika and Feldt, Jonas and Moroni, Saverio and Scemama, Anthony and Filippi, Claudia},
|
||||
title = {{Excited States with Selected Configuration Interaction-Quantum Monte Carlo: Chemically Accurate Excitation Energies and Geometries}},
|
||||
journal = {J. Chem. Theory Comput.},
|
||||
volume = {15},
|
||||
number = {9},
|
||||
pages = {4896--4906},
|
||||
year = {2019},
|
||||
month = {Sep},
|
||||
issn = {1549-9618},
|
||||
publisher = {American Chemical Society},
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.9b00476}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Ferte_2019,
|
||||
doi = {10.1063/1.5082638},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.5082638},
|
||||
year = 2019,
|
||||
month = {feb},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {150},
|
||||
number = {8},
|
||||
pages = {084103},
|
||||
author = {Anthony Fert{\'{e}} and Emmanuel Giner and Julien Toulouse},
|
||||
title = {Range-separated multideterminant density-functional theory with a short-range correlation functional of the on-top pair density},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Caffarel_2019,
|
||||
doi = {10.1063/1.5114703},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.5114703},
|
||||
year = 2019,
|
||||
month = {aug},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {151},
|
||||
number = {6},
|
||||
pages = {064101},
|
||||
author = {Michel Caffarel},
|
||||
title = {Evaluating two-electron-repulsion integrals over arbitrary orbitals using zero variance Monte Carlo: Application to full configuration interaction calculations with Slater-type orbitals},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Loos_2019,
|
||||
doi = {10.1021/acs.jpclett.9b01176},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1021%2Facs.jpclett.9b01176},
|
||||
year = 2019,
|
||||
month = {may},
|
||||
publisher = {American Chemical Society ({ACS})},
|
||||
volume = {10},
|
||||
number = {11},
|
||||
pages = {2931--2937},
|
||||
author = {Pierre-Fran{\c{c}}ois Loos and Barth{\'{e}}l{\'{e}}my Pradines and Anthony Scemama and Julien Toulouse and Emmanuel Giner},
|
||||
title = {A Density-Based Basis-Set Correction for Wave Function Theory},
|
||||
journal = {The Journal of Physical Chemistry Letters}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
@article{Garniron_2019,
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.9b00176},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1021%2Facs.jctc.9b00176},
|
||||
year = 2019,
|
||||
month = {may},
|
||||
publisher = {American Chemical Society ({ACS})},
|
||||
author = {Yann Garniron and Thomas Applencourt and Kevin Gasperich and Anouar Benali and Anthony Fert{\'{e}} and Julien Paquier and Barth{\'{e}}l{\'{e}}my Pradines and Roland Assaraf and Peter Reinhardt and Julien Toulouse and Pierrette Barbaresco and Nicolas Renon and Gr{\'{e}}goire David and Jean-Paul Malrieu and Mickaël V{\'{e}}ril and Michel Caffarel and Pierre-Fran{\c{c}}ois Loos and Emmanuel Giner and Anthony Scemama},
|
||||
title = {Quantum Package 2.0: An Open-Source Determinant-Driven Suite of Programs},
|
||||
journal = {Journal of Chemical Theory and Computation}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Scemama_2019,
|
||||
doi = {10.1016/j.rechem.2019.100002},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1016%2Fj.rechem.2019.100002},
|
||||
year = 2019,
|
||||
month = {may},
|
||||
publisher = {Elsevier {BV}},
|
||||
pages = {100002},
|
||||
author = {Anthony Scemama and Michel Caffarel and Anouar Benali and Denis Jacquemin and Pierre-Fran{\c{c}}ois Loos},
|
||||
title = {Influence of pseudopotentials on excitation energies from selected configuration interaction and diffusion Monte Carlo},
|
||||
journal = {Results in Chemistry}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
@article{Applencourt2018Dec,
|
||||
author = {Applencourt, Thomas and Gasperich, Kevin and Scemama, Anthony},
|
||||
title = {{Spin adaptation with determinant-based selected configuration interaction}},
|
||||
journal = {arXiv},
|
||||
year = {2018},
|
||||
month = {Dec},
|
||||
eprint = {1812.06902},
|
||||
url = {https://arxiv.org/abs/1812.06902}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Loos2019Mar,
|
||||
author = {Loos, Pierre-Fran\c{c}ois and Boggio-Pasqua, Martial and Scemama, Anthony and Caffarel, Michel and Jacquemin, Denis},
|
||||
title = {{Reference Energies for Double Excitations}},
|
||||
journal = {J. Chem. Theory Comput.},
|
||||
volume = {15},
|
||||
number = {3},
|
||||
pages = {1939--1956},
|
||||
year = {2019},
|
||||
month = {Mar},
|
||||
issn = {1549-9618},
|
||||
publisher = {American Chemical Society},
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.8b01205}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{PinedaFlores2019Feb,
|
||||
author = {Pineda Flores, Sergio and Neuscamman, Eric},
|
||||
title = {{Excited State Specific Multi-Slater Jastrow Wave Functions}},
|
||||
journal = {J. Phys. Chem. A},
|
||||
volume = {123},
|
||||
number = {8},
|
||||
pages = {1487--1497},
|
||||
year = {2019},
|
||||
month = {Feb},
|
||||
issn = {1089-5639},
|
||||
publisher = {American Chemical Society},
|
||||
doi = {10.1021/acs.jpca.8b10671}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@phdthesis{yann_garniron_2019_2558127,
|
||||
author = {Yann Garniron},
|
||||
title = {{Development and parallel implementation of
|
||||
selected configuration interaction methods}},
|
||||
school = {Université de Toulouse},
|
||||
year = 2019,
|
||||
month = feb,
|
||||
doi = {10.5281/zenodo.2558127},
|
||||
url = {https://doi.org/10.5281/zenodo.2558127}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Giner_2018,
|
||||
doi = {10.1063/1.5052714},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.5052714},
|
||||
year = 2018,
|
||||
month = {nov},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {149},
|
||||
number = {19},
|
||||
pages = {194301},
|
||||
author = {Emmanuel Giner and Barth{\'{e}}lemy Pradines and Anthony Fert{\'{e}} and Roland Assaraf and Andreas Savin and Julien Toulouse},
|
||||
title = {Curing basis-set convergence of wave-function theory using density-functional theory: A systematically improvable approach},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
@article{Giner2018Oct,
|
||||
author = {Giner, Emmanuel and Tew, David and Garniron, Yann and Alavi, Ali},
|
||||
title = {{Interplay between electronic correlation and metal-ligand delocalization in the spectroscopy of transition metal compounds: case study on a series of planar Cu2+complexes.}},
|
||||
journal = {J. Chem. Theory Comput.},
|
||||
year = {2018},
|
||||
month = {Oct},
|
||||
issn = {1549-9618},
|
||||
publisher = {American Chemical Society},
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.8b00591}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Loos_2018,
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.8b00406},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1021%2Facs.jctc.8b00406},
|
||||
year = 2018,
|
||||
month = {jul},
|
||||
publisher = {American Chemical Society ({ACS})},
|
||||
volume = {14},
|
||||
number = {8},
|
||||
pages = {4360--4379},
|
||||
author = {Pierre-Fran{\c{c}}ois Loos and Anthony Scemama and Aymeric Blondel and Yann Garniron and Michel Caffarel and Denis Jacquemin},
|
||||
title = {A Mountaineering Strategy to Excited States: Highly Accurate Reference Energies and Benchmarks},
|
||||
journal = {Journal of Chemical Theory and Computation}
|
||||
}
|
||||
@article{Scemama_2018,
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.7b01250},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1021%2Facs.jctc.7b01250},
|
||||
year = 2018,
|
||||
month = {jan},
|
||||
publisher = {American Chemical Society ({ACS})},
|
||||
volume = {14},
|
||||
number = {3},
|
||||
pages = {1395--1402},
|
||||
author = {Anthony Scemama and Yann Garniron and Michel Caffarel and Pierre-Fran{\c{c}}ois Loos},
|
||||
title = {Deterministic Construction of Nodal Surfaces within Quantum Monte Carlo: The Case of {FeS}},
|
||||
journal = {Journal of Chemical Theory and Computation}
|
||||
}
|
||||
@article{Scemama_2018.2,
|
||||
doi = {10.1063/1.5041327},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.5041327},
|
||||
year = 2018,
|
||||
month = {jul},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {149},
|
||||
number = {3},
|
||||
pages = {034108},
|
||||
author = {Anthony Scemama and Anouar Benali and Denis Jacquemin and Michel Caffarel and Pierre-Fran{\c{c}}ois Loos},
|
||||
title = {Excitation energies from diffusion Monte Carlo using selected configuration interaction nodes},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
@article{Dash_2018,
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.8b00393},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1021%2Facs.jctc.8b00393},
|
||||
year = 2018,
|
||||
month = {jun},
|
||||
publisher = {American Chemical Society ({ACS})},
|
||||
volume = {14},
|
||||
number = {8},
|
||||
pages = {4176--4182},
|
||||
author = {Monika Dash and Saverio Moroni and Anthony Scemama and Claudia Filippi},
|
||||
title = {Perturbatively Selected Configuration-Interaction Wave Functions for Efficient Geometry Optimization in Quantum Monte Carlo},
|
||||
journal = {Journal of Chemical Theory and Computation}
|
||||
}
|
||||
@article{Garniron_2018,
|
||||
doi = {10.1063/1.5044503},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.5044503},
|
||||
year = 2018,
|
||||
month = {aug},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {149},
|
||||
number = {6},
|
||||
pages = {064103},
|
||||
author = {Yann Garniron and Anthony Scemama and Emmanuel Giner and Michel Caffarel and Pierre-Fran{\c{c}}ois Loos},
|
||||
title = {Selected configuration interaction dressed by perturbation},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
@article{Giner_2017,
|
||||
doi = {10.1063/1.4984616},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.4984616},
|
||||
year = 2017,
|
||||
month = {jun},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {146},
|
||||
number = {22},
|
||||
pages = {224108},
|
||||
author = {Emmanuel Giner and Celestino Angeli and Yann Garniron and Anthony Scemama and Jean-Paul Malrieu},
|
||||
title = {A Jeziorski-Monkhorst fully uncontracted multi-reference perturbative treatment. I. Principles, second-order versions, and tests on ground state potential energy curves},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
@article{Garniron_2017,
|
||||
doi = {10.1063/1.4980034},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.4980034},
|
||||
year = 2017,
|
||||
month = {apr},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {146},
|
||||
number = {15},
|
||||
pages = {154107},
|
||||
author = {Yann Garniron and Emmanuel Giner and Jean-Paul Malrieu and Anthony Scemama},
|
||||
title = {Alternative definition of excitation amplitudes in multi-reference state-specific coupled cluster},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
@article{Garniron_2017.2,
|
||||
doi = {10.1063/1.4992127},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.4992127},
|
||||
year = 2017,
|
||||
month = {jul},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {147},
|
||||
number = {3},
|
||||
pages = {034101},
|
||||
author = {Yann Garniron and Anthony Scemama and Pierre-Fran{\c{c}}ois Loos and Michel Caffarel},
|
||||
title = {Hybrid stochastic-deterministic calculation of the second-order perturbative contribution of multireference perturbation theory},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
@article{Giner_2017.2,
|
||||
doi = {10.1016/j.comptc.2017.03.001},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1016%2Fj.comptc.2017.03.001},
|
||||
year = 2017,
|
||||
month = {sep},
|
||||
publisher = {Elsevier {BV}},
|
||||
volume = {1116},
|
||||
pages = {134--140},
|
||||
author = {E. Giner and C. Angeli and A. Scemama and J.-P. Malrieu},
|
||||
title = {Orthogonal Valence Bond Hamiltonians incorporating dynamical correlation effects},
|
||||
journal = {Computational and Theoretical Chemistry}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Giner_2017.3,
|
||||
author = {Giner, Emmanuel and Tenti, Lorenzo and Angeli, Celestino and Ferré, Nicolas},
|
||||
title = {Computation of the Isotropic Hyperfine Coupling Constant: Efficiency and Insights from a New Approach Based on Wave Function Theory},
|
||||
journal = {Journal of Chemical Theory and Computation},
|
||||
volume = {13},
|
||||
number = {2},
|
||||
pages = {475-487},
|
||||
year = {2017},
|
||||
doi = {10.1021/acs.jctc.6b00827},
|
||||
note ={PMID: 28094936},
|
||||
URL = {https://doi.org/10.1021/acs.jctc.6b00827},
|
||||
eprint = {https://doi.org/10.1021/acs.jctc.6b00827}
|
||||
}
|
||||
@article{Giner2016Mar,
|
||||
author = {Giner, Emmanuel and Angeli, Celestino},
|
||||
title = {{Spin density and orbital optimization in open shell systems: A rational and computationally efficient proposal}},
|
||||
journal = {J. Chem. Phys.},
|
||||
volume = {144},
|
||||
number = {10},
|
||||
pages = {104104},
|
||||
year = {2016},
|
||||
month = {Mar},
|
||||
issn = {0021-9606},
|
||||
publisher = {American Institute of Physics},
|
||||
doi = {10.1063/1.4943187}
|
||||
}
|
||||
@article{Giner_2016,
|
||||
doi = {10.1063/1.4940781},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.4940781},
|
||||
year = 2016,
|
||||
month = {feb},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {144},
|
||||
number = {6},
|
||||
pages = {064101},
|
||||
author = {E. Giner and G. David and A. Scemama and J. P. Malrieu},
|
||||
title = {A simple approach to the state-specific {MR}-{CC} using the intermediate Hamiltonian formalism},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
|
||||
@article{Caffarel_2016,
|
||||
doi = {10.1063/1.4947093},
|
||||
url = {https://doi.org/10.1063%2F1.4947093},
|
||||
year = 2016,
|
||||
month = {apr},
|
||||
publisher = {{AIP} Publishing},
|
||||
volume = {144},
|
||||
number = {15},
|
||||
pages = {151103},
|
||||
author = {Michel Caffarel and Thomas Applencourt and Emmanuel Giner and Anthony Scemama},
|
||||
title = {Communication: Toward an improved control of the fixed-node error in quantum Monte Carlo: The case of the water molecule},
|
||||
journal = {The Journal of Chemical Physics}
|
||||
}
|
||||
@incollection{Caffarel_2016.2,
|
||||
doi = {10.1021/bk-2016-1234.ch002},
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url = {https://doi.org/10.1021%2Fbk-2016-1234.ch002},
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year = 2016,
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month = {jan},
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publisher = {American Chemical Society},
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pages = {15--46},
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author = {Michel Caffarel and Thomas Applencourt and Emmanuel Giner and Anthony Scemama},
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title = {Using CIPSI Nodes in Diffusion Monte Carlo},
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booktitle = {{ACS} Symposium Series}
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}
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@article{Giner_2015,
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doi = {10.1063/1.4905528},
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url = {https://doi.org/10.1063%2F1.4905528},
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year = 2015,
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month = {jan},
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publisher = {{AIP} Publishing},
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volume = {142},
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number = {4},
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pages = {044115},
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author = {Emmanuel Giner and Anthony Scemama and Michel Caffarel},
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title = {Fixed-node diffusion Monte Carlo potential energy curve of the fluorine molecule F2 using selected configuration interaction trial wavefunctions},
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journal = {The Journal of Chemical Physics}
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}
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@article{Giner2015Sep,
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author = {Giner, Emmanuel and Angeli, Celestino},
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title = {{Metal-ligand delocalization and spin density in the CuCl2 and [CuCl4]2{-} molecules: Some insights from wave function theory}},
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journal = {J. Chem. Phys.},
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volume = {143},
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number = {12},
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pages = {124305},
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year = {2015},
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month = {Sep},
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issn = {0021-9606},
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publisher = {American Institute of Physics},
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doi = {10.1063/1.4931639}
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}
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@article{Scemama_2014,
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doi = {10.1063/1.4903985},
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url = {https://doi.org/10.1063%2F1.4903985},
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year = 2014,
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month = {dec},
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||||
publisher = {{AIP} Publishing},
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volume = {141},
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number = {24},
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pages = {244110},
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author = {A. Scemama and T. Applencourt and E. Giner and M. Caffarel},
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title = {Accurate nonrelativistic ground-state energies of 3d transition metal atoms},
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journal = {The Journal of Chemical Physics}
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}
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@article{Caffarel_2014,
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doi = {10.1021/ct5004252},
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url = {https://doi.org/10.1021%2Fct5004252},
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year = 2014,
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month = {nov},
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publisher = {American Chemical Society ({ACS})},
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volume = {10},
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number = {12},
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pages = {5286--5296},
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author = {Michel Caffarel and Emmanuel Giner and Anthony Scemama and Alejandro Ram{\'{\i}}rez-Sol{\'{\i}}s},
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title = {Spin Density Distribution in Open-Shell Transition Metal Systems: A Comparative Post-Hartree-Fock, Density Functional Theory, and Quantum Monte Carlo Study of the CuCl2 Molecule},
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journal = {Journal of Chemical Theory and Computation}
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}
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@article{Giner_2013,
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doi = {10.1139/cjc-2013-0017},
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url = {https://doi.org/10.1139%2Fcjc-2013-0017},
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||||
year = 2013,
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month = {sep},
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publisher = {Canadian Science Publishing},
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volume = {91},
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number = {9},
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pages = {879--885},
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author = {Emmanuel Giner and Anthony Scemama and Michel Caffarel},
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title = {Using perturbatively selected configuration interaction in quantum Monte Carlo calculations},
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journal = {Canadian Journal of Chemistry}
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}
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@article{Scemama2013Nov,
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author = {Scemama, Anthony and Giner, Emmanuel},
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title = {{An efficient implementation of Slater-Condon rules}},
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journal = {arXiv},
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year = {2013},
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month = {Nov},
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eprint = {1311.6244},
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url = {https://arxiv.org/abs/1311.6244}
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}
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