mirror of
https://github.com/triqs/dft_tools
synced 2024-12-21 11:53:41 +01:00
[transport] Added new test case for transport code, some other minor changes
This commit is contained in:
Manuel Zingl
Priyanka Seth
parent
e1b8c4757b
commit
5c1783f692
32
test/SrVO3.oubwin
Normal file
32
test/SrVO3.oubwin
Normal file
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test/SrVO3.outputs
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625
test/SrVO3.outputs
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Title
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Bravais Matrix:
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ATOMIC POSITIONS:
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PGLSYM: THE CRYSTAL SYSTEM IS CUBIC
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PGLSYM: ORDER OF LATTICE POINT GROUP (NO BASE) = 48
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PGBSYM: ORDER OF LATTICE SPACE GROUP (WITH BASE) = 48
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PGBSYM: SPACE GROUP IS SYMMORPHIC
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PGBSYM: SPACE GROUP CONTAINS INVERSION
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Symmetry operation 1
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this is operation 1 in struct file
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Symmetry operation 2
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this is operation 2 in struct file
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Symmetry operation 3
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Symmetry operation 5
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Symmetry operation 6
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this is operation 6 in struct file
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Symmetry operation 7
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this is operation 7 in struct file
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Symmetry operation 8
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this is operation 8 in struct file
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Symmetry operation 9
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this is operation 9 in struct file
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Symmetry operation 10
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Symmetry operation 11
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Symmetry operation 12
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Symmetry operation 13
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this is operation 13 in struct file
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Symmetry operation 14
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Symmetry operation 15
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Symmetry operation 16
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Symmetry operation 18
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Symmetry operation 23
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this is operation 24 in struct file
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Symmetry operation 25
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this is operation 25 in struct file
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Symmetry operation 26
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this is operation 26 in struct file
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Symmetry operation 27
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this is operation 27 in struct file
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Symmetry operation 28
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this is operation 28 in struct file
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Symmetry operation 29
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this is operation 29 in struct file
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Symmetry operation 30
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this is operation 30 in struct file
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Symmetry operation 31
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this is operation 31 in struct file
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Symmetry operation 32
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Symmetry operation 33
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Symmetry operation 34
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Symmetry operation 35
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this is operation 35 in struct file
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Symmetry operation 36
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this is operation 37 in struct file
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Symmetry operation 38
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this is operation 38 in struct file
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Symmetry operation 39
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this is operation 39 in struct file
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Symmetry operation 40
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this is operation 42 in struct file
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Symmetry operation 43
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Symmetry operation 45
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this is operation 48 in struct file
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|
DETERMINATION OF POINTGROUP FOR ALL POSITIONS
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Title
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1 3.6302500 3.6302500 3.6302500
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2 10.8907500 3.6302500 3.6302500
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3 3.6302500 10.8907500 3.6302500
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4 3.6302500 3.6302500 10.8907500
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|
Sr : 4 Atoms, Index 1 to 4
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6 7.2605000 0.0000000 0.0000000
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7 0.0000000 7.2605000 0.0000000
|
||||||
|
8 0.0000000 0.0000000 7.2605000
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|
V : 4 Atoms, Index 5 to 8
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9 3.6302500 0.0000000 0.0000000
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10 10.8907500 0.0000000 0.0000000
|
||||||
|
11 3.6302500 7.2605000 0.0000000
|
||||||
|
12 3.6302500 0.0000000 7.2605000
|
||||||
|
13 0.0000000 3.6302500 0.0000000
|
||||||
|
14 7.2605000 3.6302500 0.0000000
|
||||||
|
15 0.0000000 10.8907500 0.0000000
|
||||||
|
16 0.0000000 3.6302500 7.2605000
|
||||||
|
17 0.0000000 0.0000000 3.6302500
|
||||||
|
18 7.2605000 0.0000000 3.6302500
|
||||||
|
19 0.0000000 7.2605000 3.6302500
|
||||||
|
20 0.0000000 0.0000000 10.8907500
|
||||||
|
O : 12 Atoms, Index 9 to 20
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|
number of atoms: 20
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|
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|
ATOM: 1
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|
Sr operation # 1 1
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|
Sr operation # 2 -1
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|
Sr operation # 3 2 || x
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|
Sr operation # 4 2 || y
|
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|
Sr operation # 5 2 || z
|
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|
Sr operation # 6 m n z
|
||||||
|
Sr operation # 7 m n y
|
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|
Sr operation # 8 m n x
|
||||||
|
Sr operation # 9 4 || x
|
||||||
|
Sr operation # 10 4 || y
|
||||||
|
Sr operation # 11 4 || z
|
||||||
|
Sr operation # 12 m n 110
|
||||||
|
Sr operation # 13 m n -110
|
||||||
|
Sr operation # 14 m n 101
|
||||||
|
Sr operation # 15 m n 011
|
||||||
|
Sr operation # 16 m n -101
|
||||||
|
Sr operation # 17 m n 0-11
|
||||||
|
Sr operation # 18 2 || 110
|
||||||
|
Sr operation # 19 2 || -110
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|
Sr operation # 20 2 || 101
|
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|
Sr operation # 21 2 || 011
|
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|
Sr operation # 22 2 || -101
|
||||||
|
Sr operation # 23 2 || 0-11
|
||||||
|
Sr operation # 24 3 || 111
|
||||||
|
Sr operation # 25 3 || 11-1
|
||||||
|
Sr operation # 26 3 || -111
|
||||||
|
Sr operation # 27 3 || 1-11
|
||||||
|
Sr operation # 28 S6 || 111
|
||||||
|
Sr operation # 29 S6 || -1-11
|
||||||
|
Sr operation # 30 S6 || 1-1-1
|
||||||
|
Sr operation # 31 S6 || 1-11
|
||||||
|
Sr operation # 32 S4 || x
|
||||||
|
Sr operation # 33 S4 || y
|
||||||
|
Sr operation # 34 S4 || z
|
||||||
|
Sr operation # 35 4 || x
|
||||||
|
Sr operation # 36 4 || y
|
||||||
|
Sr operation # 37 4 || z
|
||||||
|
Sr operation # 38 3 || 111
|
||||||
|
Sr operation # 39 3 || 11-1
|
||||||
|
Sr operation # 40 3 || -111
|
||||||
|
Sr operation # 41 3 || 1-11
|
||||||
|
Sr operation # 42 S6 || 111
|
||||||
|
Sr operation # 43 S6 || -1-11
|
||||||
|
Sr operation # 44 S6 || 1-1-1
|
||||||
|
Sr operation # 45 S6 || 1-11
|
||||||
|
Sr operation # 46 S4 || x
|
||||||
|
Sr operation # 47 S4 || y
|
||||||
|
Sr operation # 48 S4 || z
|
||||||
|
pointgroup is m3m (pos. iatnr!!)
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||||||
|
axes should be: any
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|
z-rotation vector: 0.0000 0.0000 1.0000
|
||||||
|
y-rotation vector: 0.0000 0.0000 0.0000 0
|
||||||
|
LOCAL ROT MATRIX: NEW OLD
|
||||||
|
1.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000
|
||||||
|
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|
||||||
|
0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000
|
||||||
|
lm: 0 0 4 0 4 4 6 0 6 4
|
||||||
|
==============================================
|
||||||
|
|
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|
ATOM: 2
|
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|
V operation # 1 1
|
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|
V operation # 2 -1
|
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|
V operation # 3 2 || x
|
||||||
|
V operation # 4 2 || y
|
||||||
|
V operation # 5 2 || z
|
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|
V operation # 6 m n z
|
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|
V operation # 7 m n y
|
||||||
|
V operation # 8 m n x
|
||||||
|
V operation # 9 4 || x
|
||||||
|
V operation # 10 4 || y
|
||||||
|
V operation # 11 4 || z
|
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|
V operation # 12 m n 110
|
||||||
|
V operation # 13 m n -110
|
||||||
|
V operation # 14 m n 101
|
||||||
|
V operation # 15 m n 011
|
||||||
|
V operation # 16 m n -101
|
||||||
|
V operation # 17 m n 0-11
|
||||||
|
V operation # 18 2 || 110
|
||||||
|
V operation # 19 2 || -110
|
||||||
|
V operation # 20 2 || 101
|
||||||
|
V operation # 21 2 || 011
|
||||||
|
V operation # 22 2 || -101
|
||||||
|
V operation # 23 2 || 0-11
|
||||||
|
V operation # 24 3 || 111
|
||||||
|
V operation # 25 3 || 11-1
|
||||||
|
V operation # 26 3 || -111
|
||||||
|
V operation # 27 3 || 1-11
|
||||||
|
V operation # 28 S6 || 111
|
||||||
|
V operation # 29 S6 || -1-11
|
||||||
|
V operation # 30 S6 || 1-1-1
|
||||||
|
V operation # 31 S6 || 1-11
|
||||||
|
V operation # 32 S4 || x
|
||||||
|
V operation # 33 S4 || y
|
||||||
|
V operation # 34 S4 || z
|
||||||
|
V operation # 35 4 || x
|
||||||
|
V operation # 36 4 || y
|
||||||
|
V operation # 37 4 || z
|
||||||
|
V operation # 38 3 || 111
|
||||||
|
V operation # 39 3 || 11-1
|
||||||
|
V operation # 40 3 || -111
|
||||||
|
V operation # 41 3 || 1-11
|
||||||
|
V operation # 42 S6 || 111
|
||||||
|
V operation # 43 S6 || -1-11
|
||||||
|
V operation # 44 S6 || 1-1-1
|
||||||
|
V operation # 45 S6 || 1-11
|
||||||
|
V operation # 46 S4 || x
|
||||||
|
V operation # 47 S4 || y
|
||||||
|
V operation # 48 S4 || z
|
||||||
|
pointgroup is m3m (pos. iatnr!!)
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|
axes should be: any
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|
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|
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|
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|
||||||
|
LOCAL ROT MATRIX: NEW OLD
|
||||||
|
1.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000
|
||||||
|
0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000
|
||||||
|
0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000
|
||||||
|
lm: 0 0 4 0 4 4 6 0 6 4
|
||||||
|
==============================================
|
||||||
|
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||||||
|
ATOM: -3
|
||||||
|
O operation # 1 1
|
||||||
|
O operation # 2 -1
|
||||||
|
O operation # 3 2 || x
|
||||||
|
O operation # 4 2 || y
|
||||||
|
O operation # 5 2 || z
|
||||||
|
O operation # 6 m n z
|
||||||
|
O operation # 7 m n y
|
||||||
|
O operation # 8 m n x
|
||||||
|
O operation # 9 4 || x
|
||||||
|
O operation # 15 m n 011
|
||||||
|
O operation # 17 m n 0-11
|
||||||
|
O operation # 21 2 || 011
|
||||||
|
O operation # 23 2 || 0-11
|
||||||
|
O operation # 32 S4 || x
|
||||||
|
O operation # 35 4 || x
|
||||||
|
O operation # 46 S4 || x
|
||||||
|
pointgroup is 4/mmm (neg. iatnr!!)
|
||||||
|
axes should be: 4 || z, m n z, m n x
|
||||||
|
z-rotation vector: 1.0000 0.0000 0.0000
|
||||||
|
y-rotation vector: 0.0000 1.0000 0.0000 2
|
||||||
|
LOCAL ROT MATRIX: NEW OLD
|
||||||
|
0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000
|
||||||
|
0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000
|
||||||
|
-1.0000000 0.0000000 0.0000000 -1.0000000 0.0000000 0.0000000
|
||||||
|
lm: 0 0 2 0 4 0 4 4 6 0 6 4
|
||||||
|
==============================================
|
||||||
6341
test/SrVO3.pmat
Normal file
6341
test/SrVO3.pmat
Normal file
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
217
test/SrVO3.struct
Normal file
217
test/SrVO3.struct
Normal file
@ -0,0 +1,217 @@
|
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|
Title
|
||||||
|
P LATTICE,NONEQUIV.ATOMS: 3221_Pm-3m
|
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|
MODE OF CALC=RELA unit=bohr
|
||||||
|
7.260500 7.260500 7.260500 90.000000 90.000000 90.000000
|
||||||
|
ATOM 1: X=0.50000000 Y=0.50000000 Z=0.50000000
|
||||||
|
MULT= 1 ISPLIT= 2
|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
0.0000000 1.0000000 0.0000000
|
||||||
|
0.0000000 0.0000000 1.0000000
|
||||||
|
ATOM 2: X=0.00000000 Y=0.00000000 Z=0.00000000
|
||||||
|
MULT= 1 ISPLIT= 2
|
||||||
|
V NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.91 Z: 23.0
|
||||||
|
LOCAL ROT MATRIX: 1.0000000 0.0000000 0.0000000
|
||||||
|
0.0000000 1.0000000 0.0000000
|
||||||
|
0.0000000 0.0000000 1.0000000
|
||||||
|
ATOM -3: X=0.50000000 Y=0.00000000 Z=0.00000000
|
||||||
|
MULT= 3 ISPLIT=-2
|
||||||
|
-3: X=0.00000000 Y=0.50000000 Z=0.00000000
|
||||||
|
-3: X=0.00000000 Y=0.00000000 Z=0.50000000
|
||||||
|
O NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.70 Z: 8.0
|
||||||
|
LOCAL ROT MATRIX: 0.0000000 0.0000000 1.0000000
|
||||||
|
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|
||||||
|
-1.0000000 0.0000000 0.0000000
|
||||||
|
48 NUMBER OF SYMMETRY OPERATIONS
|
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|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
0-1 0 0.00000000
|
||||||
|
0 0-1 0.00000000
|
||||||
|
1
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
0-1 0 0.00000000
|
||||||
|
0 0 1 0.00000000
|
||||||
|
2
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
0 0-1 0.00000000
|
||||||
|
0-1 0 0.00000000
|
||||||
|
3
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
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|
||||||
|
0-1 0 0.00000000
|
||||||
|
4
|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
0 1 0 0.00000000
|
||||||
|
5
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||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
0 0 1 0.00000000
|
||||||
|
0 1 0 0.00000000
|
||||||
|
6
|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
0 0-1 0.00000000
|
||||||
|
7
|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
8
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||||||
|
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|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
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|
||||||
|
9
|
||||||
|
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|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
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|
||||||
|
10
|
||||||
|
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|
||||||
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-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
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|
||||||
|
11
|
||||||
|
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|
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|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
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|
||||||
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12
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||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
13
|
||||||
|
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|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
0 1 0 0.00000000
|
||||||
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14
|
||||||
|
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|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
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|
||||||
|
15
|
||||||
|
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|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
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|
||||||
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16
|
||||||
|
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|
||||||
|
0 0-1 0.00000000
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
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17
|
||||||
|
0-1 0 0.00000000
|
||||||
|
0 0 1 0.00000000
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
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18
|
||||||
|
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|
||||||
|
0-1 0 0.00000000
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
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19
|
||||||
|
0 0 1 0.00000000
|
||||||
|
0-1 0 0.00000000
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
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20
|
||||||
|
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|
||||||
|
0 1 0 0.00000000
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
21
|
||||||
|
0 0 1 0.00000000
|
||||||
|
0 1 0 0.00000000
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
22
|
||||||
|
0 1 0 0.00000000
|
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|
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|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
23
|
||||||
|
0 1 0 0.00000000
|
||||||
|
0 0 1 0.00000000
|
||||||
|
-1 0 0 0.00000000
|
||||||
|
24
|
||||||
|
0-1 0 0.00000000
|
||||||
|
0 0-1 0.00000000
|
||||||
|
1 0 0 0.00000000
|
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48
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BIN
test/SrVO3_Sigma.h5
Normal file
BIN
test/SrVO3_Sigma.h5
Normal file
Binary file not shown.
BIN
test/srvo3_transp.output.h5
Normal file
BIN
test/srvo3_transp.output.h5
Normal file
Binary file not shown.
43
test/srvo3_transp.py
Normal file
43
test/srvo3_transp.py
Normal file
@ -0,0 +1,43 @@
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# TRIQS: a Toolbox for Research in Interacting Quantum Systems
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# Copyright (C) 2011 by M. Aichhorn, L. Pourovskii, V. Vildosola
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# TRIQS is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
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# terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
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# Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
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# version.
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# TRIQS is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
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# WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
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# FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General Public License for more
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# details.
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# You should have received a copy of the GNU General Public License along with
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# TRIQS. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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from numpy import *
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from pytriqs.applications.dft.converters.wien2k_converter import *
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from pytriqs.applications.dft.sumk_dft import *
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from pytriqs.applications.dft.sumk_dft_tools import *
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beta = 40
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Converter = Wien2kConverter(filename='SrVO3', repacking=True)
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Converter.convert_dmft_input()
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Converter.convert_transport_input()
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Converter.convert_parproj_input()
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SK = SumkDFTTools(hdf_file='SrVO3.h5', use_dft_blocks=True)
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ar = HDFArchive('SrVO3_Sigma.h5', 'a')
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Sigma = ar['dmft_transp_output']['Sigma']
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SK.put_Sigma(Sigma_imp = [Sigma])
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del ar
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SK.transport_distribution(dir_list=[(0,0)], broadening=0.0, energywindow=[-0.3,0.3], Om_mesh=[0.00, 0.02] , beta=beta, DFT_only=False, save_hdf=False)
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SK.hdf_file = 'srvo3_transp.output.h5'
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SK.conductivity_and_seebeck(beta=beta, read_hdf=False, res_subgrp='results')
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