CALCULS CHOLESKY CALCULS CHOLESKY CALCULS CHOLESKY CALCULS CHOLESKY 16 dec 2010 I Calculs CASDI I.1. Les integrales bi-electroniques sont obtenues dans motra. ========================================================= La seule difference dans les fichiers de donnees est d'ajouter CHOL ou HIGH ou LOW dans les donnees de seward. - Le calcul motra est tres long, et cette methode n'est pas la meilleure. I.2. Motra transforme les vecteurs de Cholesky, qui sont transformes en integrales par un programme ulterieur (chol_X). ========================================================= chol_X ne les calcule pas toutes. Il commence par calculer les integrales d'echange, puis, des seuils etant donnes, ne calcule que les integrales entre orbitales en "interaction forte" seward donnee supplementaire "CHOL" ou "HIGH" ou "LOW" scf (rasscf) motra donnees supplementaires (2 lignes): CTONLY (dans cet ordre !) KPQ (Cholesky Transformation ONLY ; kpq : dans les vecteurs cholesky V(k,pq) k sont les lignes et pq les colonnes PAS DE GEL EN DONNEE ! molcost donnees supplementaires : ychol=T frozen, delete, fermi (apres gel) sont donnes ICI si on veut reordonner les orbitales en Occ Act Virt (pour Nevpt2) donner ICI act, ninact chol_X donnees : &chol sli1=1.d-7,sli2=1.d-7 / dans l'integrale (ij|kl): sli1 : seuil pour considerer la distance i-j sli2 : seuil pour considerer la distance ij-kl casdet casdi donnee obligatoire : itest(63)=1 (les integrales sont lues sur ijcl1,ijcl2,ijcl3) II. Calculs en Orbitales Localisees II.1. Calculs CASDI seward donnee supplementaire "CHOL" ou "HIGH" ou "LOW" scf (rasscf) dolo donner &smu ychol=T dans DOLOIN (proj_scf) schmudort cp LOCORB INPORB motra DOLO_MOTRAIN DOLO_MOTRAIN a ete cree dans dolo par rapport a motra, il a les 2 lignes supplementaires : CTONLY KPQ (Cholesky Transformation ONLY ; kpq : dans les vecteurs cholesky V(k,pq) k sont les lignes et pq les colonnes pas de gel ni de del en donnee molcost < DOLO_MOLCOSTIN DOLO_MOLCOSTIN a ete cree dans dolo avec la donnee supplementaire : ychol=T frozen, delete, fermi (apres gel) sont donnes ici chol_X donnees : &chol sli1=1.d-7,sli2=1.d-7 / dans l'integrale (ij|kl): sli1 : seuil pour considerer la distance i-j sli2 : seuil pour considerer la distance ij-kl casdet casdi donnee obligatoire : itest(63)=1 (les integrales sont lues sur ijcl1,ijcl2,ijcl3) II.2. Calculs CASDILOC Motra transforme les vecteurs de Cholesky. Puis molcost les reecrit dans un fichier lu par ijkloc. ijkloc transforme les vecteurs de Cholesky de la base atomique a la base moleculaire, puis calcule les integrales en bas locale, conformement a ds seuils en donnee. seward donnee supplementaire "CHOL" ou "HIGH" ou "LOW" scf (rasscf) si localisation dolo : dolo donner &smu ychol=T dans DOLOIN (proj_scf) schmudort cp LOCORB INPORB si localisation lewis : lewis cp LOCORB INPORB donner ychol=T dans &lewis motra DOLO_MOTRAIN (DOLO_MOTRAIN a ete genere dans dolo ou lewis) DOLO_MOTRAIN a ete cree dans dolo (ou lewis) par rapport a motra, il a les 2 lignes supplementaires (a cause de la donnee ychol=T dans dolo ou lewis) : CTONLY KPQ (Cholesky Transformation ONLY ; kpq : dans les vecteurs cholesky V(k,pq) k sont les lignes et pq les colonnes pas de gel ni de del en donnee molcost < DOLO_MOLCOSTIN (DOLO_MOLCOSTIN a ete genere dans dolo ou lewis) DOLO_MOLCOSTIN a ete cree dans dolo (ou lewis) avec la donnee supplementaire : ychol=T frozen, delete, fermi (apres gel) sont donnes ici ijkloc donnee supplementaire : ychol=T sli1 : seuil, dans (ijkl) pour les distributions i-j et k-l sli2 : seuil d'interaction de ij avec kl casdiloc exemple de fichier casdiloc #!/bin/bash Project='acetone' CurrDir=$PWD WorkDir=$CurrDir/TMP export Project WorkDir CurrDir export PATH=$PATH:/home/daniel/cost2/bin export MOLCAS=/home/daniel/7.7.dev echo 'Start of job:' $Project echo 'Current directory:' $CurrDir echo 'Scratch directory:' $WorkDir cd $WorkDir #------------------------------------------------------------------------------# # Start executing molcas job # #------------------------------------------------------------------------------# ######################seward scf############ rm -fr $WorkDir mkdir $WorkDir cd $WorkDir molcas $CurrDir/sewin molcas $CurrDir/scfin cp ../TMP0/acetone.ScfOrb . ############################################ ##############interface##################### molcost << EOF &cost prefix='acetone.', ymo=f / EOF ########################################### ######## LOCALISATION ################################### dolo proj_scf << EOF &pscf prefix='acetone.' / EOF mv NONORLOC_scf NONORLOC schmudort << EOF &ort / EOF ########################################### ############# motra ######################## cp LOCORB INPORB molcas DOLO_MOTRAIN ########################################### ############# molcost ######################## molcost < DOLO_MOLCOSTIN ########################################### ############# ijkloc ######################## ijkloc << EOF &ijkloc prefix='acetone.',ychol=t,nprint=1 symm='XY X',sli=0.d0 / EOF ########################################### ############# casdiloc ################## casdiloc << EOF &locci prefix='acetone.',gener='CAS+SD' / EOF ########################################### 1,1 Haut DOLOIN: &smufil prefix='acetone.' / &smu nprint=0,ychol=t orb='acetone.ScfOrb' / / &oao / C* 1s(1) pr=1 O* 1s(1) pr=1 C* 1s(2) pr=2 O* 1s(2) pr=2 H* 1s(1) pr=2 C* 2p(1) pr=2 O* 2p(1) pr=2 fin &orb symm='XY X' / &smufil prefix='acetone.' / &smu nprint=0,ychol=t orb='acetone.ScfOrb' / / &oao / C* 1s(1) pr=1 O* 1s(1) pr=1 C* 1s(2) pr=2 O* 1s(2) pr=2 H* 1s(1) pr=2 C* 2p(1) pr=2 O* 2p(1) pr=2 fin &orb symm='XY X' / OLD_DATA: BOND_ BASREF='O:1S(2) 2P(1),C:1S(2) 2P(1),H:1S(1)' BOND_ CHAIN='C1=O1(LP2)' BOND_ CHAIN='C1-C2' BOND_ CHAIN='C2-H1' BOND_ CHAIN='C2-H2' CORE_ C* 1S(1) label='G' CORE_ O* 1S(1) label='G'