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CALCULS CHOLESKY CALCULS CHOLESKY CALCULS CHOLESKY CALCULS CHOLESKY
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16 dec 2010
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I Calculs CASDI
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I.1. Les integrales bi-electroniques sont obtenues dans motra.
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=========================================================
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La seule difference dans les fichiers de donnees est d'ajouter CHOL ou
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HIGH ou LOW dans les donnees de seward.
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- Le calcul motra est tres long, et cette methode n'est pas la meilleure.
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I.2. Motra transforme les vecteurs de Cholesky, qui sont transformes en
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integrales par un programme ulterieur (chol_X).
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=========================================================
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chol_X ne les calcule
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pas toutes. Il commence par calculer les integrales d'echange, puis,
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des seuils etant donnes, ne calcule que les integrales entre orbitales
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en "interaction forte"
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seward donnee supplementaire "CHOL" ou "HIGH" ou "LOW"
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scf
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(rasscf)
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motra donnees supplementaires (2 lignes): CTONLY
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(dans cet ordre !) KPQ
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(Cholesky Transformation ONLY ; kpq : dans les
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vecteurs cholesky V(k,pq) k sont les lignes
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et pq les colonnes
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PAS DE GEL EN DONNEE !
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molcost donnees supplementaires : ychol=T
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frozen, delete, fermi (apres gel) sont
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donnes ICI
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si on veut reordonner les orbitales en
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Occ Act Virt (pour Nevpt2) donner ICI
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act, ninact
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chol_X donnees : &chol sli1=1.d-7,sli2=1.d-7 /
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dans l'integrale (ij|kl):
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sli1 : seuil pour considerer la distance i-j
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sli2 : seuil pour considerer la distance ij-kl
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casdet
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casdi donnee obligatoire : itest(63)=1
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(les integrales sont lues sur ijcl1,ijcl2,ijcl3)
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II. Calculs en Orbitales Localisees
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II.1. Calculs CASDI
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seward donnee supplementaire "CHOL" ou "HIGH" ou "LOW"
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scf
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(rasscf)
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dolo donner &smu ychol=T dans DOLOIN
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(proj_scf)
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schmudort
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cp LOCORB INPORB
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motra DOLO_MOTRAIN
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DOLO_MOTRAIN a ete cree dans dolo
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par rapport a motra, il a les 2 lignes
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supplementaires :
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CTONLY
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KPQ
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(Cholesky Transformation ONLY ; kpq : dans les
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vecteurs cholesky V(k,pq) k sont les lignes
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et pq les colonnes
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pas de gel ni de del en donnee
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molcost < DOLO_MOLCOSTIN
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DOLO_MOLCOSTIN a ete cree dans dolo
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avec la donnee supplementaire : ychol=T
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frozen, delete, fermi (apres gel) sont
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donnes ici
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chol_X donnees : &chol sli1=1.d-7,sli2=1.d-7 /
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dans l'integrale (ij|kl):
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sli1 : seuil pour considerer la distance i-j
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sli2 : seuil pour considerer la distance ij-kl
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casdet
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casdi donnee obligatoire : itest(63)=1
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(les integrales sont lues sur ijcl1,ijcl2,ijcl3)
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II.2. Calculs CASDILOC
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Motra transforme les vecteurs de Cholesky. Puis molcost les reecrit
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dans un fichier lu par ijkloc. ijkloc transforme les vecteurs de Cholesky
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de la base atomique a la base moleculaire, puis calcule les integrales en
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bas locale, conformement a ds seuils en donnee.
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seward donnee supplementaire "CHOL" ou "HIGH" ou "LOW"
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scf
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(rasscf)
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si localisation dolo :
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dolo donner &smu ychol=T dans DOLOIN
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(proj_scf)
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schmudort
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cp LOCORB INPORB
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si localisation lewis :
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lewis
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cp LOCORB INPORB
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donner ychol=T dans &lewis
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motra DOLO_MOTRAIN (DOLO_MOTRAIN a ete genere dans dolo ou lewis)
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DOLO_MOTRAIN a ete cree dans dolo (ou lewis)
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par rapport a motra, il a les 2 lignes
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supplementaires (a cause de la donnee ychol=T
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dans dolo ou lewis) :
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CTONLY
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KPQ
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(Cholesky Transformation ONLY ; kpq : dans les
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vecteurs cholesky V(k,pq) k sont les lignes
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et pq les colonnes
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|
pas de gel ni de del en donnee
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molcost < DOLO_MOLCOSTIN (DOLO_MOLCOSTIN a ete genere dans dolo ou lewis)
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DOLO_MOLCOSTIN a ete cree dans dolo (ou lewis)
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avec la donnee supplementaire : ychol=T
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frozen, delete, fermi (apres gel) sont
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|
donnes ici
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ijkloc donnee supplementaire : ychol=T
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sli1 : seuil, dans (ijkl) pour les
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distributions i-j et k-l
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sli2 : seuil d'interaction de ij avec kl
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casdiloc
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exemple de fichier casdiloc
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#!/bin/bash
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Project='acetone'
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CurrDir=$PWD
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WorkDir=$CurrDir/TMP
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export Project WorkDir CurrDir
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export PATH=$PATH:/home/daniel/cost2/bin
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|
export MOLCAS=/home/daniel/7.7.dev
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|
echo 'Start of job:' $Project
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echo 'Current directory:' $CurrDir
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|
echo 'Scratch directory:' $WorkDir
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cd $WorkDir
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#------------------------------------------------------------------------------#
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|
# Start executing molcas job #
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||
|
#------------------------------------------------------------------------------#
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######################seward scf############
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|
rm -fr $WorkDir
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mkdir $WorkDir
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|
cd $WorkDir
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|
molcas $CurrDir/sewin
|
||
|
molcas $CurrDir/scfin
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|
cp ../TMP0/acetone.ScfOrb .
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############################################
|
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|
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|
##############interface#####################
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|
molcost << EOF
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|
&cost prefix='acetone.', ymo=f /
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|
EOF
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|
###########################################
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######## LOCALISATION ###################################
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dolo
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|
proj_scf << EOF
|
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|
&pscf prefix='acetone.' /
|
||
|
EOF
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||
|
mv NONORLOC_scf NONORLOC
|
||
|
schmudort << EOF
|
||
|
&ort /
|
||
|
EOF
|
||
|
###########################################
|
||
|
|
||
|
############# motra ########################
|
||
|
cp LOCORB INPORB
|
||
|
molcas DOLO_MOTRAIN
|
||
|
###########################################
|
||
|
|
||
|
############# molcost ########################
|
||
|
molcost < DOLO_MOLCOSTIN
|
||
|
###########################################
|
||
|
|
||
|
############# ijkloc ########################
|
||
|
ijkloc << EOF
|
||
|
&ijkloc prefix='acetone.',ychol=t,nprint=1
|
||
|
symm='XY X',sli=0.d0 /
|
||
|
EOF
|
||
|
###########################################
|
||
|
|
||
|
############# casdiloc ##################
|
||
|
casdiloc << EOF
|
||
|
&locci prefix='acetone.',gener='CAS+SD'
|
||
|
/
|
||
|
EOF
|
||
|
###########################################
|
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1,1 Haut
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DOLOIN:
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&smufil prefix='acetone.' /
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||
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&smu
|
||
|
nprint=0,ychol=t
|
||
|
orb='acetone.ScfOrb' /
|
||
|
/
|
||
|
&oao /
|
||
|
C* 1s(1) pr=1
|
||
|
O* 1s(1) pr=1
|
||
|
C* 1s(2) pr=2
|
||
|
O* 1s(2) pr=2
|
||
|
H* 1s(1) pr=2
|
||
|
C* 2p(1) pr=2
|
||
|
O* 2p(1) pr=2
|
||
|
fin
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|
&orb symm='XY X' /
|
||
|
&smufil prefix='acetone.' /
|
||
|
&smu
|
||
|
nprint=0,ychol=t
|
||
|
orb='acetone.ScfOrb' /
|
||
|
/
|
||
|
&oao /
|
||
|
C* 1s(1) pr=1
|
||
|
O* 1s(1) pr=1
|
||
|
C* 1s(2) pr=2
|
||
|
O* 1s(2) pr=2
|
||
|
H* 1s(1) pr=2
|
||
|
C* 2p(1) pr=2
|
||
|
O* 2p(1) pr=2
|
||
|
fin
|
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|
&orb symm='XY X' /
|
||
|
|
||
|
|
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OLD_DATA:
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BOND_ BASREF='O:1S(2) 2P(1),C:1S(2) 2P(1),H:1S(1)'
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BOND_ CHAIN='C1=O1(LP2)'
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|
BOND_ CHAIN='C1-C2'
|
||
|
BOND_ CHAIN='C2-H1'
|
||
|
BOND_ CHAIN='C2-H2'
|
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|
CORE_ C* 1S(1) label='G'
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CORE_ O* 1S(1) label='G'
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